EMLSAT00000003879, EMLSAT00000003879-699726 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003879
Unique NameEMLSAT00000003879-699726
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s210supercontigLSalAtl2s210:105242..137220 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003879 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003879EMLSAG00000003879-686645Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016861EMLSAE00000016861-725789Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016862EMLSAE00000016862-725790Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016863EMLSAE00000016863-725791Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016864EMLSAE00000016864-725792Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016865EMLSAE00000016865-725793Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016866EMLSAE00000016866-725794Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016867EMLSAE00000016867-725795Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016868EMLSAE00000016868-725796Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772268auto772268Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003879EMLSAP00000003879Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003879

>EMLSAP00000003879 ID=EMLSAP00000003879|Name=EMLSAP00000003879|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=737bp
MLHARGRYFYNQDYHEYYYYYCSRVNPLPTIVASLLLFPLFVESYLLSRL
WRNNPGLEAECDGDCRYSMSCWMSGGVATQSCGAVFQYCCERSSYGASAR
YWTNNEYGNGIGVHDDPPDIPFGPVVNDPSCGVPTISSRRIVGGXEAGFG
NFPWQALIRIGTSRCGGALISPYYVVTAGHCINSAKASSIRVYLGEYTLY
RRIEPLPREKYGVSEIELHPYYRFTPQADRYDVALLRLNTRVNYQPHISP
ICLPLKNEVYKEGTIGTVAGWGALSPTSTIRPNKLQAVDVQIINSDRXEM
WHRQKGIHVRIFSDMFCAGYKEGKRDACQGDSGGPLVVKDIRKGRWVLIG
LVSAGLPLIFALILVSSLKFTTTSFLDDPELSSHCRSQGGTCGPMLSCLL
KMGFVAGSCGGVFSVCCAQPSTVSRWIRENNHGSNHIGGGDSSSQYRSNH
KKIKFLGSRYGPVVNDPHCGRPVELTANRRVLDGKPAGFGSFPWQALIRI
GKGKCGGVLINRRHVVTAGHCVKNKPLSSLTVTLGEYHLKLANEPYPSEK
FRVTRAVVHPRFQFSPAADRYDVAVLTIDRPVQYAPHIAPICLPEAGRXP
APGTNAYVAGWGALIPDDVAGPLIPFLLPEIKRPSVLQVVNVPVLDNERC
ETWHKDKGFNIKIWPEMVCAGYRQGGKDSCKGDSGGPLMVQQRDGRWVLV
GIVSAGFSCGKPGQPGIYHRISSTSDWVTYYANPGFF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s210:105242..137220+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003879-699726 ID=EMLSAT00000003879-699726|Name=EMLSAT00000003879|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31979bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s210:105242..137220+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTACATGCTCGCGGGAGATACTTCTACAATCAGGACTACCACGAGTA TTATTATTATTACTGCAGCAGAGTTGTAAGTTGTAACTCACAAGAACGGA AGAAGGAGAATTAATACGACTCCTGCTCCTTGTATGCACAAGGAACATTC ATCATCAATAGGAGTGAGCAGTGTGTTCGTCCTGATCTCTACCAAAAGAA GACTCCTTCATTTTTTGATCCCTTGCAGCTTGTTTCTTTGTGTTGCCATC ATTTAAAATATATTGAAAGTGTGTGAGTTGCTCAGTGATCCTTCTGTGAC AAATAATCTCATCGTTGGGGTTCGATTATGACATTTTTTCATCATGTTCA CAGGTAAGGAGATACTATGTATGTATGAAATTAAGGCCCNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGATCTGTGGTTCATCAAGGAAA TATTATTCATTAGAAGGTGCATCTTCAATTGCGATAATTAAGTCAAATAC CTCCTCTGTTGACAAAAGAACTCATTGTACAACTTGAAACTCTCGTCTCG CAGATTATTTACAAGTAAATTAGGCTGAAAGACACTTTCCTGCAATAATC TATGGATTTAGGTATTTCAAGTGGAAATACTTTGTGACATCATTTGTAGA CAAACCATAAAGTATTTATTTCTCCATGTATGTAAATAATATCTTATTAT GTAGTATTTATGGTAGCACAATCGAAATCCTCCTCAAAAACGTCCCTGAG TTAGTTACTACGTCACTTATTCCTAAGCTGTTAGTCGTAATTTTTATTCT CCTTCGTGTTTTCTGCTTCTACCTTCTTGGCTCAAGGATATTATTTAGAG GCAGAGGAAATAATTGAGAGGTATAGCAACTTTTCATCAATTCGCCCACT CTCTTTTCACTGGCTCTCTCACTCACTAACACACTCAATAATATTGAGTT TTCCCCCTTTTTTTTGGGCGGAGGTCATTGTTTATTTATGCATATTAATC CAAGGTTTAATCAAAATAATTTTTTTCTTTCTTATGTGTGTATTATATTT AAAAGAACKCCATTTTGAGTCAGGGGCATCCACAAAATTATATTGAGGGG GGGTGGCGGGTTTGATTTTTGAAAAAAATCAAAATATTTTTTTTTTTTTT TCAAATATTTAATATCCACAGTTCTTCACAAAAAAATTTGAAAAATTAAA TTTCAAGTAATACATTTTTCGGAGAGAAATTTCAAAAATCCATCGCTTTT AAAAGAAAATTAAATTTTTGGAAAAACAATTGAAAAATTAAATTAAATTT CAACTATTAAATTTTTGAATTTTTTTCAAATATTAGTTAATTGAAGGCGG GCTACAGTCCTCCTGCAGACGCCCCTGTGAGTAGTGTTGAGTCAATCTTT ATTTTGAACAGAACCCTCCAGTCCTGTCCAGTTCAGTCCCTAAAACTTGT AAAGTGCGTTCCTTGATCACGTCTCTCAAAATTATTTCTTCTTTTCTTAA TCAGTTCTAATACTGAAAGTTCGAACAACCCGTCCTAGGATTGTACTGGA TCGAAAAAATAAGGACTGACACAACACTAATCTTATGTATATGGAGGAGT ATCAATTCAATTCGGAACTATTTCTTAAAGAATATATTTATATCACATTG TTATGTTGTTACAGACCTTGAAATAAAGTTAATACTATACTTCATTTCAA ATAATAAAGGATGGCCATCAACGACTGCAGGGGAAGTTTAAAGGGGATGT AGCCCCCCCCCAAGAAATATTTCAATGTTACTAGAAAATTTAAAATTTGA CTTAATATTTTAATAAMTTTKTGTGAWTAYCWATGGATANNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAATTTTTGRAAAAAAAATTSAAAAATCCA 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TCACCATGAAATAACAATGATGCTAAGGCTATCATAAAGGTTACAAAATA CACCAGGAACACCGTCTATGACGTCGGTAAGCAATTGAAGGCGGGTATGG TGCTTTCCCATTATTTGATGTGGTAGGAATTTATTTGTTGTGTAGGAAAT GTACATAGTGATAGGTTAACAAGATATAATTCGAACTCAGTATATTAACG ATCAAAACAATCAAAAAAAGTTTTTCGATTGAAAAAAAGCAAAAAAAAAA AAAAAACTAGTTTCGATTGGCTATTAGAATATGGCATTAGGAGTGTTATG ATATCTCTTCGCCATCTTGCCACTATTAATGTCTTGTTAAAGGTGTGAGG ATTGTACATAAAGGGATGCCCTTAGAGTTATGCCTTTAAAATAGATCTTA AATAATAATAAGAAATACTTAAATGGGTAGAAATAAACTTTGTATGATGG AGAGTTAAAGAACCTTCAGACAAGATAATGCATAGTACAAGTGCAAAGAT GGAGTAGNTCACTGATTTGTCAAATATAATGTTTTCTTCTTCTTCTTTTT TATCATGGACAAAATTAGTAGCCTTATTCCAATTAAAAAAGTAAGGTCAT CAACTTTTTACACTTATTTCATAACAACAATATTTTTATCACGAGTGCAT ATTGTTTTTTTTGTTTTTTTTGGGTAGGGTGATTATTTTTAAAGTACGTT TCCTGGACCAAAATGTGGATACGTATATAGTAAGGTTACTCATTACCTAG GAAAGTGTCTTTGAGCGGGATCCCGTTTCTTAGGTAATAAATACTGTGAA ATATAAGTCATTATTTTTAATGCAGTCTGACTCATGTGTTCCGTATCCTT ATTCTACCCATTTTTATCATTATCAATAAAAGTGATTATAACTTTTTTTT GTTGGGTTCGGAAAACTATTACCCACTCCGGCTACGAAAACTGTTATAAT TTATGTAAATATATTTATTTATAATTAGNNNNNNNGTATAATTAAATAAA CATTTCTACATTTAAACTAGCATTAGTGCTAGGAAAATATCCTATTTATA TTTAAAAACATATATATCTATTTTATTAGGTATTTGTAAATAATAGGTTT AGTTTATTAAGTACTATTAAACTTGAAAGTTGAAAATAATTCATAAGTTT ATTTAAAAAAATTCAAAACGTGTTTTATAGTCCATACAATCGCCATTMTT GAACACCACTAAATTATTATGTTGTGTCGAGTGTAACCACTTGCATTGAG TTTATACTTAAATTTGTGAATAATCAATGGCATCAGTGCAATGTGTAACG TTGCAGTGAAAGATTATTTGTATTGTCGTTCCTCGGTTACAAGTGCATAA ATTATGCTTTGAATCTTATAACTATAGATATAAGTCATATATCTATAGAT TTATTTAATTTGCTGTTCATCATGTTAAATATTTTGTATTCCATATATTT TCTTTATACCTGGAATAATTATTCACTACATATAGACATAGCTATAAATT AAATGTTTATAGCCTCTACACTCAAATGACTCAATAATAATTATATAGGG TATAAACTTTATTATTATTGTACAATCGTGTGTTGGAATTAGAGTCGGTG ACATTCAAAATACTGGAGTCGGACATTTTATATACCAAATCCGCACGCCT TCTTAAAACAAAGCTTAAATTTTAAGTGATTTTGGTGAAGCTCTGGGGAT TGTATAATTGTGAAATACACTTTACGATATGTGGGCTAAAAGTAAATTCG CGCATTACTATAATCCTTGTAACTCATTTGCTAAAAATACGAAACATCTG AAATGTCACATCTCATACTACTTCAAAAACACAGATCATATTCCCTTATT GAACAATTTAAAAATAATTTATTTGACCCATTCAACAATTTTTGGGTTGA 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ATATCCGGTTTACAGGAAGTATTATAGGAAATTTGTAGTGGTTTGAACTA TTATACGAAATAAAAGAAAAAATCTTCTGTTTTTTTAAATCATTAAAAAT AAGTCCTGTTATTAATAACCTCATTATAATCACAGCACTCTCATAAAAAT GGTTACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATGTCACATCGACGATAAAA AAAGCCTTTATATTTTAAGTAGGTATAAGGAAGTATTATTTTTAAATTTA TTTAATTAACAAATTGTTACTTTTATTGTATATTGCAACCTTTCCTCCCA AAATAAACATAAAAAAGACCCAAAATCATTTAGCAGTTTTTCAATTATTC CTTAATAAATAATTATTATTTAATAAATATTGTAAGTTGTACAAAACTTG AAGAAAAAAAACCGCGTTAAAATTAAGCCAATCACCATTCAGAACACAGA TAAGAAAGGAAAAATGTAGTATAGTGTCATCCATTGTAAGACACATAATT TCAAAAGTTTAGTCAAGAGATTCCATATTTTGTTCCAATTATTGAACCAA ATATGATCTGTTTGACTTTATTAAATTTCCATCGTAATCCTAACTTTAAA AGAAAAAATACAAACTACGTGGAGTGAATGAAGACATATAGTCCTAAAAT ATGATATCTTTTGATAATTAGATCTAACCAAAATTATCAGTATTTAAGAT ACGTATATATTTAAATTACGTTGAAATGATACTGTGCCTAAAAGAAGCAT GCTAAAATGTTCTACGTCAAATATATGCTGGACCAAAAAAAGTGCAACCA AATGATTTTTTTTTTGGCTAATGTTAGGAACTTCGATCATTTTCAAATGA GTAGGTAATTTGAAATAAGATGAATATCATTGAATCAGAAATTCATATAA TAAAGTGATGATTTTTCAATGATGAATAATCTTGAACTGTTTACCGAGTT ACACAATGCAATGAAATGCAGACTTATGGTAAATAACAGCATTGAANNNN CATGGTGAAGGCTAAAATTATAATAATGTATTTTTTACAATAGCAAAATG AATGGCCTTGCCATRATTAAAAAGTCACAACTTAAGATACCACAGTTTTT TAATTATTTTTTAGTGCATTGATATACAATATACATACATAACGGGGCGT GGATTCAAACTATAAAAGTCATCGATGGTAGTTTAACTTTTCATGAAAAA AAACAAACAATTAAAAATCCCTTGTTTTTGAGGTCAAATTACAAAGAACA AAAAGCTGTTTATTTGTGTAATGAAGGCGTTTATCTTTAGGAAGTCATGA CTTAATCTATGTATGTATGTTAGTAGAATGAAGGTTTGATGATGAAATGT TTTTTTAAACCTCTGTCTTACATTAGCTTAAGGTCACGACTTTAGAATTC AATTTTTATAGAATTTCATCTTTAAATGAGTTATAGCTCATTGCAATCCT TTTGTGAACTCAGAAGAGTATCATATTTTGCCTTAAAAATTTAAAATTGG TACAAATATTGTAGATATAACATAATATCTATAGTGTTGTATTGGTCCTA ATATATTCGGTCCTGTCTAGTTTTAGGAGCAGTTCTATTGGTCCTTGTTA CCAGTGTTTAAGACCGTCGGTTTATAAGTTTGTCAGTACTAGAACTGATT AAAAAAGAAGAAATAAAGTTAAGTGACTTCATCAAGGACCGAATTTTATA GGTTTTTTGAAAGGATTTGCAATACTTAACTGGGCTGGGACTTATACAGA ATTGCAGTCTTTAGTCCAAAACAAGGACATATATGAGTACATTTAGAATC CTTCATAAAAGGGACATTTCATTAATTATAAAAAAGTCGCTGGGCGCCAC AGAGAGAATGTAAAAAGATACATGTCCGGAGAAAGAAGAAGAATGATCTC 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