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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s210 | supercontig | LSalAtl2s210:105242..137220 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003879 >EMLSAP00000003879 ID=EMLSAP00000003879|Name=EMLSAP00000003879|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=737bp
MLHARGRYFYNQDYHEYYYYYCSRVNPLPTIVASLLLFPLFVESYLLSRL WRNNPGLEAECDGDCRYSMSCWMSGGVATQSCGAVFQYCCERSSYGASAR YWTNNEYGNGIGVHDDPPDIPFGPVVNDPSCGVPTISSRRIVGGXEAGFG NFPWQALIRIGTSRCGGALISPYYVVTAGHCINSAKASSIRVYLGEYTLY RRIEPLPREKYGVSEIELHPYYRFTPQADRYDVALLRLNTRVNYQPHISP ICLPLKNEVYKEGTIGTVAGWGALSPTSTIRPNKLQAVDVQIINSDRXEM WHRQKGIHVRIFSDMFCAGYKEGKRDACQGDSGGPLVVKDIRKGRWVLIG LVSAGLPLIFALILVSSLKFTTTSFLDDPELSSHCRSQGGTCGPMLSCLL KMGFVAGSCGGVFSVCCAQPSTVSRWIRENNHGSNHIGGGDSSSQYRSNH KKIKFLGSRYGPVVNDPHCGRPVELTANRRVLDGKPAGFGSFPWQALIRI GKGKCGGVLINRRHVVTAGHCVKNKPLSSLTVTLGEYHLKLANEPYPSEK FRVTRAVVHPRFQFSPAADRYDVAVLTIDRPVQYAPHIAPICLPEAGRXP APGTNAYVAGWGALIPDDVAGPLIPFLLPEIKRPSVLQVVNVPVLDNERC ETWHKDKGFNIKIWPEMVCAGYRQGGKDSCKGDSGGPLMVQQRDGRWVLV GIVSAGFSCGKPGQPGIYHRISSTSDWVTYYANPGFF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s210:105242..137220+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003879-699726 ID=EMLSAT00000003879-699726|Name=EMLSAT00000003879|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31979bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s210:105242..137220+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTTACATGCTCGCGGGAGATACTTCTACAATCAGGACTACCACGAGTA
TTATTATTATTACTGCAGCAGAGTTGTAAGTTGTAACTCACAAGAACGGA
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AAAAAGTTACTACCGGATATTTACAAAAAAATGCTTACGAAACCTCTTAA
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GACAGCTTGTATTTCATTATGTGAATAGTATAGTCCAAGGAATCCTTGGT
ATTTTCAAAGAAAAAACAACAATTTAGCTGTAGCGAGTAAAGCTATTACT
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ATGACTTAAAAAAATGGACAACTAACAACAACATACAGTGTACAATTTTG
TGTTTCTGAGATGACTATGTAATATTTATGGGGGTTCTAAAATATCTCAA
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GAATAAAAAATATTTGCATTGTATTTTCATGGCAGSTGCCTCCACAAAAA
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CAAATATGTGATTATATTTAAAAGTTAAACATCCATACTTTTTAAATGTT
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GCTAAACTTTTATTAAAGTACTAATGATCCAACTAACTCCATAATTTGAA
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TGGAACGGATTTGCATGCTGCACGCACCATGTACATGGGGATCGAGTCCT
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AAATTGAACTCACACAACTGCTGCGTCTCTCTGGATGAGGTGGGTGGGGC
ACTTTTCTTTTCGAAGATCTATGGCTCATTCTGGAAGTGCTGTTGGTCCC
AGGGAACGAGAAACTTCCTCCAGGATGATGCTGATGTACTCCTTTGTGTT
GATCTTCAACACACCGGCACAAAACCAAGGAGGACTTCCCTTTCTCAATC
ATGGCCACCCAAACCATCACAGACTGTGGCTTYTKCACTMTGTTGACTCC
ATGGTAACCCAGCTTACCTTTTTTGGCCAGAATCCGATCATTTTGGGGCT
TAAAATCCTGCTCTMCCCTGAAAATCTTCTAATTACTGAACACAATGTGA
GAAGCCGTACCATTCTTCAGCTCCTGAATAATGACATTGCTTCTCTCATG
GATTTTCGATTGACCTCGCTTGACAGGCGCTGTTGCTTCTTCAATTTGTA
GGGATACATCCCAAGGTTATCCCGGATAAGGTCTCTCATTGTTGTTGCAC
CCATGTTGAAATCTTTGGCCATCATGTTGAGGTTCCTCCTCCGATTGGTT
GCAATCCTTGCCTTGACGACTCTGGGCGTCCTTTTTGACCTTGGTACCCT
GGTCTCCCCGTGCCTCTCAATCTTTATTTGATGAGCATATGGGTACTTCA
GGTACTCCTTGATTATTGCCTCTCTCTTGGCTTCCATTGTGGTTAACAAG
ACTGTTATTTTATTCAAAACTGTTTGTTTTGATCTAGTTTTGACTTAACT
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AGTTCATTTAACAGGACTTTCCGTCGACCTTGTATATTAAAAGTATGCAT
TGCTTTCTTATTTATATTTGAAATTATTTATTTCCTTTTTTAAACAATAT
AATTCAAAATCTTATGAAATTTCAATTCTTAACTTCGATATATTTCGTCT
TAAAAAAAGTTCAAATTACTATTGCAGCTGAACTAGACCTTCTAGAACCA
AATACTCTTTTATAAATGAAACCCGTATTATATATGCTGAAACCGAACTT
TTTTTTAATTTAATTAATTAAAGGGATATTAATTAATTGTACCATTTTAT
TGGAAAATATTCATTATTATTATTATCCATTAGCGACTAACATGTTTTAT
TTCAAATTAAATNAACAAGAGGTTGTGTTGTCGACATGAATTAAAGTTCC
GTTATGGTTGACTCCAAATAAAATTGAATAAGAGTTCGATAGATGGTTAA
TATTTTACCATTTTTTTTTTTTTAATGAAAAAATAATGATTTTTTTGAGG
TAGTCTTCATCTTATGTATCTTTAAATGAATGTCAATAATTCTATTTCGA
TCATATGTTGTTTCTGATAAAGCATATGACTTCCAGGAAATTTACTCATA
GTTCAACTTGAATTAAATCATCTTTATTATCAAATGTTTGAGAATTCCTT
AGAAAATCGATTTATTTTTAATTTTATGCATAATTTTGCGCCTCTATTTG
TAGAGTGTGGACTTATTATTTGAGAGAAAAAACACGAAATAAGTTTAAAA
ACTAACTGTTTTTATCTCTTTAAATTAATAAAGTCATGTATTCATTTGAC
TTTATTAGTTTAGAGTGATCATCACATAGGAACAGCTCTTATTTTCCTTA
AAATTGAGTCCAGATACATTTGGAGATATAACTTTGATAAAATTTCTTGG
AATTAACACATTAAAATACTAAGTGTCATGTCTTTATCATCATCCTTAAT
GATGTCACAATAAATTTAAAAGATCAAATTCCATATTTTATATTTGTATA
TGCCGTGTACAAGTTGTAACTTGTATAAGTAGATTGGTCAAGGTCTTTGA
ATGGTCAATTATGCATGTAATTTCTGATGTATTCTATATCACATTATTGT
TGAAATGCCCAAATATATATTACTCGTAATAGTATAATAATGTATGATGT
TAATAGATCAAAATGAAATGATGGCGTACTTGTTTAAGAAAAAAAATTTG
AAAAATTAATTTTTTTGGAAAAAAATATCAAAAATCTACAGCTATTCACA
AAAAATTTAACTCGTTGAAAAAAAAAATTTAAAAATTATAGCTAGTATCA
AAAAATTTAATTTTTTAGAAAGAAATTTCTAAAACCCTTTTAGATATTCT
CTAAAAAAAAAAAAATTTGGACAAAAAATTTAATTTCAAAAATCCATAGC
TGTTCTCAGAAAGTTAATTTTTTTGGAAAAATAATTTCAAATATTCCATT
TTTGGAGAAAAATTTCAAGTATCCTGTAGCTATTTAAAGAAAATTTAATT
TTGAGAATTATACTTTTTTGTAAAAAAAAATGTATATTAATTTTTCTGGT
AAAAAGAAAAAAAATCCTTAATTTGGAACAGAACAGAAATCGCAACTTGT
ACACACCATATATTATACAGTAAATAGACTTAATCAATGTGTAATTGTTT
CAACAGGTACAACAAAGAGATGGTCGATGGGTACTCGTTGGGATCGTATC
AGCTGGGTTTTCCTGTGGAAAGCCCGGACAACCTGGTATCTATCATCGCA
TATCTTCTACCTCAGATTGGGTGACATACTATGCTAATCCTGGATTTTTT
TAGCTGAATCATTCTACTATAAACATATCAACATCATGTCTATATACATT
GATATAACCGCAAAAAAATATTATTATCAAAACAGAAAGACGAGTTTTTT
TTTGTTTTTTTTGGTAAATTCATACAGAATATTATGACTTTATAATGATT
TGATTTTTTTTAAATTAATCTGTCTATAATTATATTATACACACTTATAA
AATGTATATTTTACACATTATCCTTGTAGAGTTACGATGTATCTTTTCTT
AGTAGATTCATGGATTTGATTATTTACTACTCAATATCTATTTGTGTAAC
TATTTTTCAGATAATGCCTCAAGTACTACATGTCTTATCTTTTATATTAA
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