EMLSAT00000004761, EMLSAT00000004761-700608 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004761
Unique NameEMLSAT00000004761-700608
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s250supercontigLSalAtl2s250:597231..620234 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004761 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004761EMLSAG00000004761-687527Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000020832EMLSAE00000020832-729760Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020833EMLSAE00000020833-729761Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020834EMLSAE00000020834-729762Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020835EMLSAE00000020835-729763Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020836EMLSAE00000020836-729764Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020837EMLSAE00000020837-729765Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778806auto778806Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004761EMLSAP00000004761Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004761

>EMLSAP00000004761 ID=EMLSAP00000004761|Name=EMLSAP00000004761|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=429bp
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ELNENIRSHNIYIIQTAGRGRNPNDDFMELMLFINACRLASASKITLILP
MFPYSQGNKKNGIRVPITCRLMADLLQKAGASHIMILDPRTPQLEGFFGL
TVDSLKMEALICDWIRKNIVHWQNCIVVSPDEDSVHQGVSLANTLGVSYT
FIHNRNKKPREYTNENGEEIPKILISEVFHDSSKDSEEEGIKNLKINYKY
DNESEEDTQSSEEEELSQSEKGGHSFYQNEDECFISPKLKKAGAEKIYVF
ATHAIFSGNAIDRIFAFEEILEAVVVSNSLPQEEEYYSKYPKFHSIDVSG
LISEFIRRHHYCESVSVLSNFCSIRNDDQMRLPLREEEYMIHPEYNGVIK
GDPKQGKKICKDPLTSLRKGFRLSSVCWD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s250:597231..620234-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004761-700608 ID=EMLSAT00000004761-700608|Name=EMLSAT00000004761|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23004bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s250:597231..620234- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAACAATAACAATGTCAGAAATCGATCCACACTGCGAATTTTTAGTGG CTCAGCTCACCCGAAATTAGCAAAGGACATTGCAAAAAAAGTCGGAGTGC GTGTGACAGCCATGGAGTCTAAAAAGTTTTCTAATAAAGAATTGAGAGTG GAATTGAACGAAAATATCAGATCTCATAATATATATATAATTCAAACTGC TGGAAGAGGACGTAATCCAAATGACGATTTCATGGAATTAATGCTATTTA TTAATGCTTGTCGACTTGCCTCAGCCTCAAAAATAACACTCATTCTCCCC ATGTTTCCTTATAGGTAGGTAATGCATCTTTCAAAGTTTTTATTTATTCA GTCCTTTGACGTCTATCTCGGACATTTGTACATGATTTATTTACAAATGT CAGTATATGGAATAGAAACGGATTTTTTTGAAATTTTTTGACAAGAGATG TAGACTTCTTAATTTTTTTTTCTACATGTTTAATTTTTTGTGAAGAGCTA AAGATTTTTGAAATTTTTTTTAGATAAATTATTTTTTTTGTGAATGCCAA TGGATCTTTGATTTTCTTTGAAAAAAATGTAATGGTTTGAAATTTTTGAT TTTCTTTGAAAAAAATGTAATGTTTTGAAATCATTTTCGAAAAAAGTGTA ATATTTTGAAATTTTTTTCCAAAAAAATGTAATATTTTGAAATTTTTTTC CAAAAATTTTCTTTTTTGGATTTCTTTTAAAAAAACTACAAAAAACCCAG TTCCCCTCCAAAATATAATCCCGAGGACGCCCTTGTCGTTGAACCTCAAC ATTTTTTGTTCTGGTTAGAGGGTAATTGTGTTAAATAATRTTTTATTAGT GGTACATCGCTAAAAAAAGGTTGAGAATCCCTGCAATATAAACTATTTAT ATATATGTATATATTATAATTAACGTACAAATTAGGGTTAATTGAGGGAC 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