EMLSAT00000005065, EMLSAT00000005065-700912 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005065
Unique NameEMLSAT00000005065-700912
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s265supercontigLSalAtl2s265:304314..332408 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005065 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005065EMLSAG00000005065-687831Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000022138EMLSAE00000022138-731066Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000022139EMLSAE00000022139-731067Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000022140EMLSAE00000022140-731068Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000022141EMLSAE00000022141-731069Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776428auto776428Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005065EMLSAP00000005065Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005065

>EMLSAP00000005065 ID=EMLSAP00000005065|Name=EMLSAP00000005065|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=221bp
MSGMRYEPPSSGRRELEEVRQKTSVSSNLSEGSKTLPSRRKSSSATLNKK
PFKSSSTNLSTSNTNLNQTRRSIFQPKARDDLDQCTSCGRNFASDRIEKH
TSICQNRVTRKRKKFDMTKKRVQGTEAEAFLKKASKSKKPQKEPKKTDWR
KKREEFIAALRAAKEAQRHVAAGGKISDLPPPPPMDTSXYITCPHCNRRF
NEAVAERHIPKCKDIRCNKRR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s265:304314..332408+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005065-700912 ID=EMLSAT00000005065-700912|Name=EMLSAT00000005065|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28095bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s265:304314..332408+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATAGGTTGCAAGTATACCCATAAATAATAATTCTAATACTTCTGGGGGAA ATGAAAAACGACAGAAACCATCAAGAGTAGATCTGGTAAGAGATATATGT CATAAAACTAACAAAAAAATTAGTTGTATTTTCATCAAAGGATAATAGAT TGTAGTCAGAAAAATTATTTAATTAGTTTTTCCATATCAATTTAGATTTT TAAGCATTGTTTTTTCGTTTGTTTTTTTGTAAGATTGATAAAATTCTTAT ATAAGATTAGTGTTGTTTCAGTCCTCATATGTTTGGTCTAGTCCAGTCAT TAGACTGTTTTTATCAGTCCTTCAAACCATAAGTCGGACTGTCAGTATTA GAACGAAAAAGAAGAAATAAAGTTAATTAACATAATCAAAAACCAAACTT TATAAGTTTTACGACCGATATGCAGTACTGAGCTGGAATGAACCGAAACT GAATTGGACGGGACGGCAGACTTCAGTCTTCAATAAAGAACAGCTCAACA CGATAAACGATATTTATTATTCATGTTGAGATACAAAGGTTTAATTGATT TATTAAGAAAGTGTCAACAGACATTTGTTAGCTTTTACGTGATTTCCTTG GCTACAAAAACCTTCCCCCTTTTACCCCTGCTAGATCTGCTTTTATAATA CCACAGATGACATTGTGTTCTTATTTCTCCCCTTCCCCCCCCCCATGATG TTTGCAAATTAACACTTACTTTGCAAAATGTTCATTGTTAAATTTAAAAG TATGAAATCATGGACACTGTGTATTTAGTTAGGGGGTAATTCACGGCACT TTCAGCGCCTCTAGCGAGCAAAAAGTATTTTTGTAGCCTTCTATATTTGA CAAAAACATAGAGCCATATAGATTAAAATGTCTAAATAATCAGTCATGAG TCTAATTACATATTTAATGGAGCGATATGACTCAGTGACCAACCCAATTA GGTGAAATTATTCTCTTGAACTCGATGTAAAAAGGTTTACTTAAAGGTTG CTTTTAGAAAAGGACTTTAAAGACAATTCCTAGGTCAAATTAAGGAGTTA TAATCCTAGAATATTTACTTATACTTAATCAGTRCAACTCAATTTGACTA ATTAAGGGAACGTTTAAAAAAATATATATTTGTTTCAAGGAGTNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACAT TAAGGACATTAAAATAAAAAATGATCGGTTTCTCCATATATTGAACTCAC ACAATTATTTTTAAGCATTAGTTTAATATTTCAACATAAACATAGGTTAK GTTAATGTTTAATCAATAGACTCATCCTTAATTTTTGTAATAAAATAACT TTTTATTTTGTCACTTTATATATTGGAGTATATATTTTGTAATAAATTTT TTACACTCATTCTTTCCAACAACCACAGTTTTCATAGCAAGTAAAATTTT ACAATAAATACATTTTTAAGATAAGTGTTATGAGATTGGTCAAAAAGTAT TTGTTGTTCCACAAAAAATAAATTATTTATGTATTGAATCATCTAAAAAG TTTGTAGGCTGACATATATACGGTTCTACTAGAACTGAATAATATTAGTT TTAGTGAGTGTTTCTGTTTGTGGTTGTTATTGGTCTTTTATGTATATTAT 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