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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s310 | supercontig | LSalAtl2s310:459610..478469 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005783 >EMLSAP00000005783 ID=EMLSAP00000005783|Name=EMLSAP00000005783|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=20bp
MAVERIVEMEMGIRHYIMQH back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s310:459610..478469+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005783-701630 ID=EMLSAT00000005783-701630|Name=EMLSAT00000005783|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18860bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s310:459610..478469+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCTAAGACGAGCTAATGGCAGTGGAACGAATTGTAGAGATGGAAATGGGT
ATACGGCATTACATTATGCAGCATTAAATGGATACAAGTAAGAGTTTATT
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TTTTATATAGGTTTTAAACCGTCGGAAGATCTCCTATTCAATGATATATA
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GTATTCCAACACTTTTGTAAAGTCATTCTACAAAACTCTTATTTGTTTTT
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TCTCTTAGCGTCGTGAATAGTGATTTTTACCTACCCCAATGAATTTATAT
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GAGAAGTAAAAATTGAAGATCAGACAAACGTTAAATACTAAAACATTTGA
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AAAATTTATTTAAATTCATTCTACCAAAGATTTATATATTTATATGGTAG
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TATTTACATATAGAGGTTTGCATGTTACTTTAAAAACTGTCAAAAATAAT
TCAAACATCCATTAAAAGATTATATATATACATACTATTGTTTTTTTCCC
GAGATTCTGTTTTCACGGGGTTTCCGTGGGTTATTTTTTTTTTTTTCTGG
TAAATCACGTTATTTATTTCATAATCTGAATTGAATTAAAATTAATCACA
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ATTATTCTCATCAGAGAAGAACCAGAGCATGTTTGGCGATTTTGGGTTCT
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TCTTCAGTCATAAGTTGGGCTGTCTGACGCCTGTAGGACTTCCACCTTAA
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GGAACGCTGGGGGTCCTCGTCGATGATGTCCCTGACCTTGTTGATAAAGG
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ACGTCCATAATAATGTCACATTTTGATGTATGTTCGTACATATATAAAAA
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CCTTTACACAATATCTATGTCCCTACAAAAGATCTACAATAAATTATATG
TACATGTATTTGTTTGATTCAAGAATAAAAGTCTTCATGGATCTCCTTTC
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AAGACACACTCTTTTTTCTCTTCTTATTCTGACCAATTAAGACCTATTTT
TAGAGTCAAATATGTATAAAATGAAAGATGAAATTGACTTAAAACAATTA
CATAATAAATACCTGAAGGAATGAAAATATTTTTTTTGGTTTATTTATTT
ATTTTATATTATATCAATTAATAAATAATGTTCCGTAATACATTTATTAA
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AATAGAAAAAATAACCTTTAGTTGGTCAAAAAGGGAAGGAAAAGAAAGAA
TGTGCGGCTGATGTATACTAAATTAGGTGTTCCCGGCGTTGTCCCTAATA
TTTAAAATTAAAATCAATTCTAAACTCTTGTGTTTCATATAAAACAAAAA
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TTTACATTACTTTTTTTAAAGTAGACTATAGGCTTAAGAGAAGAAATAAC
ATTCAAGTGCCGACCGTTGAACTGTCATTTGCTCAAATTTCATAGTATTG
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AGTGTGCAGAGATACATACCATAATGAAGAAAGTATAATTCTTAGAATTT
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GTTTGTTTTAATACATATGGTAATGTAGTTTAAAGTTTATTTTTAAAAAT
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GTTATAGAGATGAGAATCTTCTACATTTAAAATAACGCTAGAGGATGGTT
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TTATTTATCAATACCTTTTGCTCAGCTCTAGCTATAAGTAGGACATTTAG
ATGTTAATCAGATTTATATTATTGATCAGTATTAAAAATAAAAGAAATTC
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TGCAATTGACCCCTTTGCATGGAGCTTTAAAATATCTCAAATTTTTCTTT
AATAAATAAGAATTGAATTTTAATTAATTAATTATCAATTAATTGCAAAA
TACTCCATAATTCAAATGATATCAGTTAAAAAGAAATCAATGAAAACTGA
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ATTACTTTTAAGCCTCAAAACCAAATTTTATTCAATATCTCAAAGAAAAG
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AATATTGCCCCCAACAAAAAAAAATATTGACTCGGACTTAGAGTAATATT
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TTTATTTGAGAAAAAGGGCCTGTTGAGGATTTTCCCGGTCTACCCTACAT
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TGGAATATTTGCCTATCAAAGTCATTATTCTCAAACAATAGGTAATATCA
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CTTTTTATCAAGATATGTGTTGCTCTATTACGTTTTAACATACTAATTGG
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ATTTTGTCTGCCCAACATATTAACTTTTAACTTATTATAGCAAATTAAGA
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TTATACTCAATGAGTTACTTCTGGATTTTTTTGAAGAATAGTCGATAAAA
GTTATTGATTGATTTTTTTCATAATAATTATACTCTTGTGATGTTTGAGA
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ATCTTTGAGTGCAAAATCCAAAATTGATCTCTGTTTTTCTCTCAGTCATC
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ACACTCTTCTTAAGACCCTTATAATATATTCATAATACATAGTGATGAAG
AATATCATACATAGCCTATATTATAGAAAAATATTTCATGTATAATTTTA
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ATTTATCTTTTTGATCCTGGTATCTCATCCAAAAGGAAGGAATCCACTCT
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ATATGACATCATGAAACTAGCTTTGAAATCGGGAAAAAATATGATGATAA
TGGTGACTATTTTTTAGTACMCCCCGCCCCCCCCCCTCCCCCATAAAAAT
AATCAATTAAAAATACAAAAAACCTTGTAGATGCATATATTTTAAATAGA
TCTTTCATTAAATTATACATTGAATATTTATCAATAACATAAGCTATGAT
ATTTTTCATCACTATGCATTATGATTAAGTTATAAGGATCTAAAGAATAG
TGTCATTTTTCATCATTTTTCAGCCTAAAAATGGTAATATATCGAGTTCA
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GTTTACAGAAGTTTTAATAACCCTACGTTTAATTTGAGGATTTTTTTAAG
GGTAAAAAATGACTTTGAACGATAATATTCCAAAAATACTATAATCACAG
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TCTGCACTTACAAATATATTTGATTATTTTCTTCAATTCATTTGTACAAA
TCCCTCGCCCCCCTAATTGTTCCCCTATGTTATATATATCAATTAACGAG
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CTACACCTTTAAAGACTTCCTCAACTCTTCTATATACATAGAAAAGTTTT
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ACAGTAATCGTATTGACAGAATTATTTAACTTTTTTTATTTATCTACTTA
TGTGTAAATAGATTTAATTAATTGTACAAGCATGGAATAAAGTATATAAT
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GATTCACTGTCTACATATTTTAAATTCAAAAATTAAACTAATTATATTTT
TCATGAATTAATACTCAATTCTATTCCATATTTCAATCATCAAGACGCAA
CAAAATGTGTTTTTGTTTTTTTATTTCTATAACTAACAATATTACATTTT
AGATTTGGTACCTATTATGTTTTTGACGTGTTTATCACAAATTTCTATTC
TTTTTTTTTTCAAATTTAGACCCCTTTACAATATTTGTTCTTTTCTGTAA
ATTTTTTGTTCTAATATTCCATTTTATAAGAAAATTAATGGCCATATGCT
CAATTTTTGTCCAAATTTAGCTTGATACAAAAAAACACTTTTTTTAGCAA
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ATTATTTCCTTTTTTTTAAACTTAACATCGAACAAGTTATACACCACAAA
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AAATAACTTTCATTTATATTACTGATTTATCTAATAGATCTAATTAACTG
AACACTACAAATTTGAAATCAACATATTATTTACAATAATTTACTTACTC
GCAAATATGAAACTTGACGAAATGTTCTTTCTCATAAATCTTTTAAGTCT
CCTTTTTTTCGGCCTCCTTCAATAAAAATAACTTTACTATTTTATATATA
ATTTTTCTTTGAGTTTCTCTTGAACGTCATCAAAGTGTACACTGTTTTGG
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ACAACGGCTTKGCTCATTTCTTTAACCAGGTTTCTTATTTTGTAGCAGTT
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AATATTGACTACAAATGTATTATAGATGTTGGGTTGTTCGGCTCACGTTA
GAATTTGAAGGGAAGGTAATGTTGATTTCAATATGGATATTTAAATATTT
TATGACAAGGTTTTTCAAAGAGTATATAATAATATGTAGAATGTTTATAG
TATAAAAACAAAATCTTTTTTTGAAGTGAAAACACATTCATAAAGAGAAA
AAATATTTAAATAAAAAGTGTGTGAAAGACTGAGCCATTAGCTTCAATGG
ACGATAGAGGKCTGTTAAAGAGTGGTCAATGAATTTCATTATATTTGTTT
TTAAAGATATTAAGATATTCCAACTTGAAAAAAAATAACTAATTTCGAAC
AGAACGGATAATTGATTCCGTCGGTATACTGTGCTGTTTAAATCCAGATT
GTTTGAGGCTGTGAATTAGTACAAAAATGGTGGAGTTTATTTTTATAATG
ATCTTAAAATAAAAAAATACACTAAGTCAAAATCGGACGGATCAAATTAG
TTGCATTATAATCCCATTAAATGCTTGTATCCTGTAATTGAATTTATGAT
ATCTAAATAAGATTTTAAATCATCACTATTACCAAATTATAGCAAAGTGA
TTAAACATAGCATTGTGGAATTATGATTCTATCATAAAAATTATACTTTA
TTATGTTGACTGCTAACGATTTTTCTAGTATTATACTCCACTCCATGGTA
GTCTTCTGAATTAGCTCTTGTTATAATTTTCTCCAATTAAATAAAGAATA
ACTTCAGAATTGTGAGGGACTAGCTAACTACTACCAACTAATTTAAAGTC
AAAAGAGAAATCAAAGTGAGGGAGTGCAATTTAAAATCTTATCGAGGGTT
TTGACCAATTTGAAGACTCCTAGCCTATTACAAGAATAGAAAAACTAAAT
TTATGGGATTTGGATGATTCCACTAGGGGATTTTGGCGTTTTCAATTTTT
TTTTCTAGAAAAGTTGAAAAATACGATAAGATAATAATTGTAGATAGCTT
AAAAACTATGGCCTAAATACATCCAAATTTTCATAAATATCCAAATCACG
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