EMLSAT00000006377, EMLSAT00000006377-702224 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006377
Unique NameEMLSAT00000006377-702224
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s34supercontigLSalAtl2s34:427505..445052 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006377 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006377EMLSAG00000006377-689143Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000027846EMLSAE00000027846-736774Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027847EMLSAE00000027847-736775Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027848EMLSAE00000027848-736776Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027849EMLSAE00000027849-736777Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777568auto777568Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006377EMLSAP00000006377Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006377

>EMLSAP00000006377 ID=EMLSAP00000006377|Name=EMLSAP00000006377|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=350bp
YESKKEEIVSQEAVVNQYNGEFPAISICPWDPYYKVDVLKEDYNLTSVGH
FNKMTEKQENLIWHNKYGQDIICNITFHLDDLLSDLKIRALRTLNDTLSQ
TIHPKIQNLKYKEKLHRKFGKCYSLNLSNETGDRGIYYVKMKLKKNIKLY
IHADDQFLDLSGRMGYEIRLGETTKAQVNYQVINTIPGGTNRFNCSYNSF
DDCMYNSMKERMLSEYGCIAPWIPHTDPRDKTCYTTKDKLGVYKIIYNRW
NDCLDPCHYMIVNVGGKTVNPATKDTYVYLYFAHRVLVTKEHYLYDLLSL
FAEIGGYCGLFLGYSAYHIALVLGSIINTAIKDYEKRHRKHSTVKQTIKL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s34:427505..445052-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006377-702224 ID=EMLSAT00000006377-702224|Name=EMLSAT00000006377|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17548bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s34:427505..445052- (Lepeophtheirus salmonis)
TATGAAAGCAAAAAGGAAGAGATAGTCTCGCAAGAAGCAGTTGAGTATAT TTTCATTATATTGTATACGCAGAGTAATCATTAAATGTACTTATGAATGA AATCTATTTAAACCAAAGGTATGAACATGAATGTTCTTGGACAATATGCC AAAAAAAAAAAAATACCACAAAATACAGTATGACAAAGATTTATTCACAG AAAGGCATTTTGCCAAATGAACTTTTAGCCGCAAAATATAATTTATGTAA TATATGGACATAGTTAGTGTTGTATATGTTCTAATCTAGGACTGAAGACT GGCATGACATCCAGTTCAGTTTCAGTCCGGTCCAGTTCAGTCCTGTATAT CATGATAAGGGAGGGAACAAGAAGCTGTTATCATTTAACTGTTATATCAC AGAGTAGGCGTTCTTTAATCTAATGAAAATGAATTAAGAATACATTTTCC ATAATAGGTGTATTTTGTGACGTATTTCATTGAGTAGGTTATAATTTATT CATTATTTTACCTAATTTTTAACATCAAAACATATCACTACAAAACAGAT GCCTACTCTATGAGAATTGAGAAATAATAATGACAAGTTTAAATAAATTA AAAATATAACATAGCTTGTCAGTAGTCAACTACAGAGATTTAGGAATAAT TACAAGCGCTCAACACTCGCAGTGAAGGACTATTTTATAACATCTCCGGC AAAAATACAGCGCTTTTATGTGATGTCATCAATTTGGAAGTGTTCTCTTG GAACCGTTGCCGTGGATTTGGATGTCAAAATGGGACAGACAAATAAAAGA CCATCAGCCTTTACCGCAGCTCTCAAATATATAATGAACACCTGGCTCAA CTTTCAGAAGGGGCCTTGTGTAAATATTGCCAACGATATAGTTACAGAAT TACAAAATTGGTTATCACTCACATTTTTTTAACGGGAAGAATTTTGATCT 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AAAAAAAAGGAAAAAGGGCAAACGCAACAACTGTTTTTCGTTTTTTAATT GTAAAATTAGTACAAAACAGTTTTTTCCAATTTTCTTTGCGAATTTCGAT TTGGCATTTTTTTAATTTTGATTTATTATAAATAAGTTATTTTAGTATAT GCTGCAATGTTTTTATTAATTAATTTTAATTCTCAAATTTAGCTAGACAT AGTTTTTTACCCTCATAACCTGGCTCTGAACTCAAAAAAAAATTAAAAAG GGTTTAAAGCCCAAACCTACAGCAATGGAAAATTTTAACGATCATTTTCT TGTTTTATGACTTAAATAACAATAATTAATGTAGGTTTTAGCCGAAATGC GTTCCAAGATCTGAATTTTTGTAGCATACTGTGATAATCTTTTTTTAAAC AGGATAAGAGAAGGAGAATAATGAAACCTCAATCGTAAGGTTTAAAAACA TTACGATTGAGAGTTTTAGATCATTTTAATGTTATATTACATAATCACTG GAAAACGGAACAATATATTCTACACTGATTAATCAATATTCTTTAAAGGA TTTGTTGTAAAGAGTGTTAATTACATAGAATTTTTATTGCAAGTTACTTT GTTTTTCCCCTCAAATCCACTAAATTAATTTAAATNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGATGTTACAAAAAAGGTACATTTTAAA GTCTATTTAATGTTCCATATCTTCAAGCATGTTAACTAACTTTTTCGTTT TACTCAAATTCTACCCAAATCCTAATTATTTACAGTCTTAGTAGGGCAAT TAATTTTTTTTAAATTCGAGTCAAAATTATGGATATGGTTGAGTTTGAGT CTTTGATAATTTTTTCAAAATATTTAATGTGATTCTTTCTCCTTTTTGGT GATAAACTATTCTTCGAATAAGAAAGCAGCGTCTGTAGTTTTTACTGTCT TTTAGGACCCTAAAGAGCCCCTAATTTGATAAAAAACACTCCAAATTTAT TTTCTAAAAGAAAACCAAAGAAAAATCAGATAATAAAAGGCCTCATATTA CATTTTCTAAAGAAATAAGAGTCAAAATAAAATTACCAAAGAGCCCCACA AAAAAATAAGATTCAAAATTTCGGTTCTAAAAAAAACACACAAAATTCAA TTTCTCAAAATGGAAAGAAAGAACATAGTACTGCCCTTTTAACTTTTCCT GGGTCCCCGCTCACGTTGAACCCAGACCCTACAAATATGAATAATCATTA CCCGAATATTTGTTCAGATACAGTGAATCTTCCCAAAAAATACGTGCAGA ATTATTTACCGATTTTTGTTCAGAACATATGGCGGACAATAATGACATTT GAATGACTTGAGAAACAATTTATTCATACATTTTTAGAATAATAAAATAG TTTGTGATCAAATTTAATCAATGTASCCKCCWTTTGACTCAATGAAACTG GTCYGGCGKCGTCTGAASCTGCCACAGACTTGCTGGATGTAATCGACGTC CATGGAGGCCCAGTCCTTGTTGACAGCAGCCTTTAAGGCATTTATGTTCT TGTGCCGTTTTTTGCAGGCCTTGATCTCCACGTGCGCCTAGATAGAGAAG TCTAGTGGGTTCAGATCTGGGCTCTGAGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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