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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s34 | supercontig | LSalAtl2s34:427505..445052 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006377 >EMLSAP00000006377 ID=EMLSAP00000006377|Name=EMLSAP00000006377|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=350bp
YESKKEEIVSQEAVVNQYNGEFPAISICPWDPYYKVDVLKEDYNLTSVGH FNKMTEKQENLIWHNKYGQDIICNITFHLDDLLSDLKIRALRTLNDTLSQ TIHPKIQNLKYKEKLHRKFGKCYSLNLSNETGDRGIYYVKMKLKKNIKLY IHADDQFLDLSGRMGYEIRLGETTKAQVNYQVINTIPGGTNRFNCSYNSF DDCMYNSMKERMLSEYGCIAPWIPHTDPRDKTCYTTKDKLGVYKIIYNRW NDCLDPCHYMIVNVGGKTVNPATKDTYVYLYFAHRVLVTKEHYLYDLLSL FAEIGGYCGLFLGYSAYHIALVLGSIINTAIKDYEKRHRKHSTVKQTIKL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s34:427505..445052- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006377-702224 ID=EMLSAT00000006377-702224|Name=EMLSAT00000006377|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17548bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s34:427505..445052- (Lepeophtheirus salmonis) TATGAAAGCAAAAAGGAAGAGATAGTCTCGCAAGAAGCAGTTGAGTATAT
TTTCATTATATTGTATACGCAGAGTAATCATTAAATGTACTTATGAATGA
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GGCATGACATCCAGTTCAGTTTCAGTCCGGTCCAGTTCAGTCCTGTATAT
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GCCTACTCTATGAGAATTGAGAAATAATAATGACAAGTTTAAATAAATTA
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TGATATTTTTCTCAGATTATCCTACTTTGCTAGTGACTAATTCATCCGGA
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ATTGAAAGTGAGTCGTGTTGACTGTACAGAATAAATCGAATCAAAATCGT
GGAAAGACGTAAATGTTGGCTGGAAAGATTATCGCATCGGTAGTCTGGGA
TGTGTATGGTATAATATTCATTGATTACCGCGAAAAGAGAAAATCTTCAA
CAGTACTTTTGGAGTGTTTGAAGGATGAAATCACGAAAAATTGTACCATT
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TCCCTGTCCACCATATTCTTCAGACCTAGCCCCGTTAACTTTTGAATGTT
TGTAGAACTCAAAAGAAACCGAAACTGAGGCTCATTTTGAGACAAAAGAT
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TACCACGAACTTTTTAGCCAATCTGTTTTATATAACAAAATTATGAATAA
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TTTACCATTTCAATTAAAAAGACAAATCCTAATTTGTATAAACTTTTATA
GGCATAAGGATTTAATATAAATGAAAAAACATCAAAAATATTCTTTAATA
AGAAAAATATATATTAACAAGACTCTGAGATCCACTTGGTCACATAGCAT
ATTCATGTACCATGGTTTGGAAAGACTTAAATTAATGCTTTGAAGTACAT
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TCTATTATAAATAAAACCCTTAGCCAATCAAATTTAAAGAAATGGAATTT
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ATATAATTTTTCCTAATTATTTATTTATTTTCATTCTTTGAGAAAATTTC
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TTAGAAAGGAAATAACTCAATCCAGCTTTTAGTTCTGAGGCTTTAATGAT
GAATAAATTAGTATTTTGATAAATATTTGATACATCGTAAACATAATCAA
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GTTGACCTCAGTGTTTAGATTATTTTTAAATTTTCACTCAGGTAGAACTC
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AAAAAAAAATTCATCAAACATAACTTATTATAAGTAGTCTTTGATCGGAA
ATTCAGTCTTTTCTCTTGTAAGTGACCTTTTCTCTTGTAAGTGACCTTTT
CTCTTGTAAGTGACCTTTTCTCTTGTAAGTGACCTTTTCTCTTGTAAGTG
ACATTTTCTCTTAAAAGTGCCTCTTCTTTGCATTGCCAAGTCATATTTTT
AGAAACTGTCTCCAGCTCATGATTACATCATGTGTGTATTTTAAATTATT
TGTAGTTACCGTCTTGAATCAATTTTAGATCATATATGGGTAATATGNCA
ATAGACTGTCCTTGGGATAATATTTCAATATATTTTTTGTAAAAATACAT
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TCAGATAATCTTTGTTGTAGCATAAATAATGTTCATCCATTTTGTTCAAG
ATCTATAACTTTAAATAGGGGTTAAAAAATTTCTATATTAATTTTAATTA
AAAAGGAAAATCGCAGATCATTGAGTACATGTTAAACCCATAATATAAAT
TACAATGTTTAACTCATAGTTTAATATTTGGGAAAATAAAAGAGGACTAA
ATATGTGCAATTTCAACCTATAAATCCATTTTTTGGTATCACAAGTCTAA
AATAGTCTGAGAGGTCTCAAACTTTGGTTAAGTGTAGTTTTTTTTATCGC
CTCCAGCAGAAAGGTATTTGTGCAAGAAGAAAAAATGTGAACTCTAAAAC
ATGAAGATCTAACGTGTAATGTTATCAGCGTTTTTAGGTTAGCTACAGCA
GTATTACTTMCCTGACCTTTCTCTCTCTCCCTTTTAGCCTCTCAAAAAAT
TGCAAACATTCCTCACCTCAAGGCATTGTTTTTTATCAAGCTTAAAAACA
AGACATTTAAAAAAAATATTACTTAGCAAGTTTTCATTCAAAATTAGTGG
TGCTATTATTAGTAAACTTATAAGTCCTCCAAAAAAACAAAGGTATATTA
ATATATTTTTACCCAATATTAAAATCTATGTAAAACATTCCTTTGAATTG
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AAAATAAAGCATTTATCTGCCTTAAACAATTTACCGGTGTTATAACATCT
TTTTAGATTCAATGTCAAACTATTAGAAATACTTATGAATTTATTTAAAC
AAATTAAGTAGGGTAAAAACATTTTAACGAAATAATAATAAATCAATCAA
TATTAAATGTTTTAATACACTAATATTTATATCCAGCTTTGATAATACCC
AAAATTTAAAAAAACTTGTCTGCTTGTTTTACCTTCTGCATTAATTATTT
ATAAACATATTGTAGGTATAAAATAAGAAGATGACCTATTGATATTAGAG
TCTTCTTCTTTTATTTCTATTCATCTTGTAGTTTAATCAGTCTTTGTTTG
TCTTCTTTAGTGTCAAGAGATGTTGTGCATCAAACCAAGGAGAGAGTTGA
CCGAAGAGCAACTCCAAGAACGGATTCATCTCCTCCTGCTGATTAAAAGA
ACTCTCTATACACTCATCACCATAACTCTTGGAATACTTCTAATTGTTCA
AGTTGTGCAATGTATCATCAAGTATATAAATAAGCCAACATACATGTCAA
GCAAGGAAAATAGTTTAAATTTTTTTAAGTCGTTCCTATTTATATAATTT
AAATATTCATTGGGTGATGTGTCTCAAACTTGCAATTAGTTTTGATTTGG
CAAACCTTACGTACAAGAAATGGGGAAACTAATTTAATATTTAGTAATTA
AAAAATAATAATAGTCCAACTGTAGGGCTATTTCAGTAAGCCATATTTTT
GTACATTGCTTTTAAAATCATTAATCAATATTTTTTAATGGATTTGTGCT
AAAAGAGTCCTCTCTCAACCCAAGGGTTGTGTGTATGGGTGAACGCAAGG
ATAGGACAGGAGTGAGACATATAATACTAATTATTAAAGTTTATTTTTTT
TAAATAAGCTGCATTATTATGTTATTATTTTAGAGTAGACAATATAACAT
GTTTCTGCTCTAGAAATGAAAATCTTCTTTATTTCAAATAACCCTAGAGG
AGAGTTATTATAAAAATAGTTTCAATATTATTAGTCATTTCACAAATAAT
ATTAGACAAAGGTAAGCGGCAAACTGTAGATTCTGGCAAAGAATGAAGAA
AAAAAAAAGGAAAAAGGGCAAACGCAACAACTGTTTTTCGTTTTTTAATT
GTAAAATTAGTACAAAACAGTTTTTTCCAATTTTCTTTGCGAATTTCGAT
TTGGCATTTTTTTAATTTTGATTTATTATAAATAAGTTATTTTAGTATAT
GCTGCAATGTTTTTATTAATTAATTTTAATTCTCAAATTTAGCTAGACAT
AGTTTTTTACCCTCATAACCTGGCTCTGAACTCAAAAAAAAATTAAAAAG
GGTTTAAAGCCCAAACCTACAGCAATGGAAAATTTTAACGATCATTTTCT
TGTTTTATGACTTAAATAACAATAATTAATGTAGGTTTTAGCCGAAATGC
GTTCCAAGATCTGAATTTTTGTAGCATACTGTGATAATCTTTTTTTAAAC
AGGATAAGAGAAGGAGAATAATGAAACCTCAATCGTAAGGTTTAAAAACA
TTACGATTGAGAGTTTTAGATCATTTTAATGTTATATTACATAATCACTG
GAAAACGGAACAATATATTCTACACTGATTAATCAATATTCTTTAAAGGA
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GTTTTTCCCCTCAAATCCACTAAATTAATTTAAATNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGATGTTACAAAAAAGGTACATTTTAAA
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TTTAGGACCCTAAAGAGCCCCTAATTTGATAAAAAACACTCCAAATTTAT
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AAAAAATAAGATTCAAAATTTCGGTTCTAAAAAAAACACACAAAATTCAA
TTTCTCAAAATGGAAAGAAAGAACATAGTACTGCCCTTTTAACTTTTCCT
GGGTCCCCGCTCACGTTGAACCCAGACCCTACAAATATGAATAATCATTA
CCCGAATATTTGTTCAGATACAGTGAATCTTCCCAAAAAATACGTGCAGA
ATTATTTACCGATTTTTGTTCAGAACATATGGCGGACAATAATGACATTT
GAATGACTTGAGAAACAATTTATTCATACATTTTTAGAATAATAAAATAG
TTTGTGATCAAATTTAATCAATGTASCCKCCWTTTGACTCAATGAAACTG
GTCYGGCGKCGTCTGAASCTGCCACAGACTTGCTGGATGTAATCGACGTC
CATGGAGGCCCAGTCCTTGTTGACAGCAGCCTTTAAGGCATTTATGTTCT
TGTGCCGTTTTTTGCAGGCCTTGATCTCCACGTGCGCCTAGATAGAGAAG
TCTAGTGGGTTCAGATCTGGGCTCTGAGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GCCTACCTTGATAGTAATTAAATAAGTGCAGGAGAACAGCTAAATAAGTC
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AATGATCGAGAGATACAATGACTATGTATTTGAGGGACTATCTGAGAGTA
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ACGGGGTACCGTGAAAAAAATATTTACACTTTCAATCCACAATTTTATCA
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ATCAAAAATTTGAGAGATCAATAATAATTTAAAAGATTACAAGTATAAAC
TGTTGAAGTTTGGTCTCAAGATGGGCTAAAATCCTTTTTTTTGTTTTTCA
TATTGTATCTGTAACTTTATGCCGATTAGGTTGACGAGTGTGCCTCTCAT
GTAGATGGCCACTCTAAGAAAACTCAGATATCGGTTCCCTCAGAGACACC
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GTTTACGAATTTTCCCAGCTTAAATACATTTTTCTAATATTTTTATCTAG
TAAATTGACATAAGATCTCAAAATCTCACACAAATATAAGTTCAAAAACT
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TGCTTAATATTTTGCAAATCATTATATTTGTCGTTTATAACAAATTGTTA
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TGTCAGCAACCTTTTTACCACAATCATTTTGCAGTGAACCCAGTTTTTTA
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AATTAGATTTTTAAAGTAATTACTTAAGTTTTTATAAGTAATTCCCTATA
GTTGATATTTTACATATTTATGTATACTATTTTTCATTTATTTAGTCATA
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TGATTGGATAATTTGCCTTTTTTTAAAAGATAATATTAAAACAATTTGTC
AATATCCTTAATAAATCTAATAGTATCACATTACAAAATGAGAATAGGCT
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ATGTGATCAGGATTTCCAGTGTTTTTTAGGTTCCAGGACACTTTGCCGAA
AATCTTTTTCCCCAAAAGCTACTTGCCGTCAGACACTTTGCCGATCCTAC
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GTCTCTGACTCTATGTATAATTCTCAAGTTGGTTTTGTCATTATACGAGA
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GTTAGAGAATATGGCGAGACCTTTTTAAAATCTTAATCACTAGATGGCGC
TCACATATTAAAAAACTTTAATAACTGATTTTAGATGTCATACTTATGAT
AGAAGTGTGATTTTGTAATCAAATTATATGTTTTCAGGGTAAGGAGCTTG
AATTTGATGGTACAGTTAGTATAAAACTAAGAAAAAATAATGAGTTTTAA
TATTTTTATCTTTCGAGAGGCATATCCTTGGGGCCCAATTTGAGGATGAA
GGATTGCAAGATATTTTGAAAAAAATAAATAAATATTTTTGATTTCTTCA
GGAGTTCCATATTCCAATAAAAAAAGTATTTATGCTAGTTACTTCATTCA
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AAAATCGTTGCTTTTCCTTAGTTTTACACTGATTATACCATCAAATTCAG
GCTCTTCACCCCGAAAAATATATAATTTGATAACAAAATCTCACTTCTAT
CATAAGTATGTATGATCTCTAAAATCGTTTATTAAAGTTTTTCAATATGT
GAGCGCCACCTAGTGGTTAATATTTTAAAAAGGATCATATCTCGCAAAAC
ATTTGTCTGATTTTGAAATGCTTTTTTGGAAGTGTAAGTTTAACTACATA
CATGCTATTTTTAAATATTTTTTACATAACTCAAGCATGGATATATTGTA
TTTTTTGGAATATAATTGAAATACTCCATACCTTAATTTATTGGGCGATT
GTTACAACGGTTCTAATAGTGGTTCGAGCCACCTTCTAAAACATCACCAT
AATGAATTGAATCAAGTATTAATTAATTAACACTTAATCATAGCAATTTA
GAATAAATTATTTTACATTTTATCTTTTAAAATTAGTGTAACATCAATAG
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AACTTACTAGGAAGATAATGCAAAAATTCAATATTATTTGGATTGCTGAT
TTTTTATATATTTATTATGTAGTTTATGACTTTTTAATAAAAAACACTAA
TTGATAAGTATTATGCAGCACATTTAATTTAAGATGCCCACAATTATGTA
TAAAAATCAATTAGAAATTTGTAACTAATATGACTAATGTAGTTATTAAA
TAAAGCACACTACTATAGAATATAGATGGAACCTTCACTCTTTTTCCACC
GCCTCTATTTTTTTTTTACCAACTAGCGTTTTTTTTTAGATTAGAATCGT
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TTTTATGGAATCAGAAGATTTTTTTAATATTTTCTATATAATTTAGGCTA
TAAGAATAATGATTAATAAATAATGTTTTTTTAAATACTTTGAGATATTC
ATTACACAATTGTTTTAATAAGTCAGTTTTTTCTTGAATTTCATAACCCT
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AAAAAGAAGTTCCATGTCGCGGAGTTACCACACTAATACTAAATAAACAC
TGTTTTTTAACAGGGKTGTCCACAAGAGTGGACTGTAGCCCCCAACTGAA
GCAAATTTTGCTTTTTACTAGAAAATTTAAATTTGAAATTTAATATAATT
TTTCATTTTTTTTTCCAAAAAATTAAATTTTTCATGGTTTTCCAAAAAAA
TTAACTTTCTGTAAAAAGCCATGATTTTTTGATTTTTTTCTCAGAAAAAT
TTAATATTAGAAATATTTTTCCAAAAAAAATTTATATTTTAGCTTACTTT
TKAAATTWTTTTACAAAAWATATAACTTTTGTAANNNNNNNNNNNNNNNA
TATTTCCGTTTTTTTTTATACATTTCATATTAAAAAAATGTTTATTTTTC
AAATATGTTTTTCAATATTTTGTCCAAAAAATTTTATAATTTTATTTTGG
AATTTTTTTTCAAAAATGAATCTAAAAACCATAGACCCCCCCCCCCCTTT
CCTTWTATATAAATGTACTATTTAATTATTATTTTATGATTATCAAAAAA
TCTCAGTGCTTTATAATGAGTATCTAATTTTAAAATATATCACAATAGGT
TGTAAATCAGTATAACGGAGAGTTTCCGGCCATATCAATATGTCCATGGG
ATCCTTACTACAAAGTGGATGTTCTCAAAGAGGATTATAACCTTACTAGC
GTAGGTCATTTTAACAAAATGACGGAGAAACAAGAAAATTTAATTTGGCA
TAACAAATATGGACAAGACATCATTTGTAATATAACATTCCATCTGGATG
ATCTTTTATCTGACCTAAAGATTCGGGCCTTACGAACCTTAAATGACACA
TTGTCTCAAACGATCCACCCAAAAATACAAAATCTCAAGTATAAAGAGAA
ACTTCATCGTAAGTTTGGTAAATGCTACAGTTTGAATTTATCTAATGAAA
CGGGCGACAGAGGAATTTATTATGTGAAAATGAAACTGTGAGTTCAATAG
AGATATTAGGATATAAGGATTCATATGCCCTTTTCTTATTTAAATTTCAG
AAAGAAGAACATCAAGCTCTATATTCATGCTGATGATCAATTTTTAGATC
TATCTGGACGTATGGGATACGAAATTAGATTGGGAGAAACGACAAAGGCC
CAAGTCAATTATCAAGTCATTAACACTATCCCAGGAGGAACAAATAGATT
CAATTGTAGTTATAACTCCTTTGATGATTGTATGTACAACTCAATGAAAG
AAAGGATGCTCTCAGAGTACGGTTGTATTGCTCCCTGGATACCTCATACC
GATCCAAGAGATAAGACCTGCTACACCACGAAGGATAAACTGGGAGTTTA
TAAAATCATCTATAACAGAGTCACTAACCAGGAAAAAAATTATAAGGCTG
AATAACAGAAGTTGTGGGAACTAAATGAATATAAATATGTATGTATGTAG
TGTTAGATCCGTTTGAAAAGCAGTAGACATAACAAATACAGTCCCAATCG
ATCCAGTACTGAATAATTTTTCAGTCCTTACGTTAGGGTTATGTTAACAA
ATTATTGTTTTAAAATTCATCAAATAAGTCACTTTTTATAAATTTATTTT
ATTGAATCACAAAAAAATCTCCCATGCATAGTACAGCATACCTCAAAATA
TATGTATACCATGACATTACCTTTACAATATCATGCAACCTTTCATCCGA
AAGGAAACATTAACATCACCCAAATTAAAGTTTCTGAAACTCAAATAAAA
AAATAAGGTTAGATTTACTTTTATATAGGATTATGCAATAGATCATTTTC
ACAGACGTCATCAATTGAATTGTGGGGGGGGGGGGGGGTCAAAATTGATA
TRTTTACTACATAAAATGAACAAATTTACAATAAATCGTGATGGAACTTC
GTCGAATTCCTTTAAAAAAAACGTAACATCTGCATTGGATATTACTTGAT
GTAAATAACAATCACTGATATTTGAATTAAGTCTGCGTAATATCTACTAA
AAATCATTAAAAATTATCAATTAGGCACGAGAAAATTAGGATAATTAGAG
AAAAATATCAAATTATTTTTATTGGAATAATCACTTCACAATAATTATGT
TCCCTGGGCTATTATTTTACAAAAAAGTCCCATCTCAAATGATTGAAATT
GAACTGAATTATATAATATTATAACGACCTTAGACTGGTCTAGGATTTCC
AAACTACTACTCAACATGAATATTTCATTATTTATATGTATTTATTGTAT
GTATTTTATGCTATAGGAAAAATTAAGCCGCGTTTTTACCACTATCTGCA
TCGCACCTTAATTTTTTGAACTAAAAATTGAATTTTGAATAAATCTTCAT
TTCAATTTACAAAATCAAATATTCCTTCCTTAATCCAGATATAAACCTGC
TGTTAATTGAAAACAACGCATGTAAAGATGAATTGACACATGTTGACGTC
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