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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s462 | supercontig | LSalAtl2s462:411001..459523 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007875 >EMLSAP00000007875 ID=EMLSAP00000007875|Name=EMLSAP00000007875|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=367bp
MISTVLLLLFSITGSLCSTEIWNKKPIYKVGCSSNSMVSQNVSQELKTIX ATFSLNLDNIYECMMTRVKDQETGQTAYFHKVIMEYESNPKQIFLVKCDI GGMFDNSTLNDDEYEELSKISKRSAQVPITFDEPDYEIEITKEVSGRAPI PVLNVEVRQAGLLVNNELTVKPGTPLSMDIFLDDESLDIYGVMVSNMLVS DMSEQEEILILNGCTVDPYLFENFQTEKGDLLRAGFKAFKFPSTNVVLFK ANVNVCLDKCEGIECANDEIGYGKKRKRRNVPLASPRRNKVYEVSMSTLV RVSDDEEITEILDIXEHQGQPVEFSSDFGAEKYVDFEGYSSASSSPIHLL SASALALLISFLLTLAR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s462:411001..459523- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007875-703722 ID=EMLSAT00000007875-703722|Name=EMLSAT00000007875|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=48523bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s462:411001..459523- (Lepeophtheirus salmonis) ATGATTTCTACAGTCCTGCTTCTCCTGTTTTCGATAACAGGGTCGCTCTG
TTCAACAGAAATTTGGAATAAAAGTAAGATGGTCATACCATTTTTTGCTT
CTTTTTTTCCTTTTTATTATACTTCATGATGGGTCTACCTGTTTGAATAC
TCCCACACTTTTCTTTTGAGATTGTCTATTTATAACGATGGCATAATCTA
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AGGAATCAAATAATAATGAAAAAAAGAAAATTTATTCTTCAGATTATTCC
AAAAATAAAAAAATGGGCTGCCTACAAAATTCAAACGATTTTTATCACTA
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TTTTATGACATCCCTTCTGGCATTGGTCTGATATTAATGAAGTTCTTCAC
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ATGTGTTTCTTTCTCAGAGGGATTTTGCTTATTCTCAATAATATTGGATG
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ACGTAAATAATACTCATTCTCTATTGGTTGCCGGTAGAAATAATGACGTA
ATTGATTAACGTCAATCGATAGAAATGTAACATTCAAAAAAATTTTATTT
CCTGTTCTGTCCTAAATCTAAAAATTCGTCCGAATTGGGAGAAAAGGCCG
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TTAAATAGGCTTAAATAAATAATAATGAAAACTACTATTGTGCATGAAAG
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ATTTCTTTTTGAAAGAAAGGGTATGGCAAAAAAGTATTTACCTTTTCAAT
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TGAGGTTGTTGATATTTGGAAGACGGACGGTGCAGGCCTTGGACTCAAAA
TGTACCCAAAAAGTGAAGTCAAATGGCTTGGTATCTGATGAGTAAGGGGG
TAACATTTTCTTTGGCCAGAAAAGGAAGTTGTCCTCAAACCACTTCTGGG
TCTTTTTGGACGTGTGTGCAAACGCACCATCCTGCTGTAACACCACATTC
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GTCCAAAAGTGCACTGGCTGAAATTCGTTGGTCAAGTTCAGATGGTATAT
TCTCGGCTTCTAAGACACTTAGGAAGATCTAGTTTTTTTGTTTAATTTTA
GTATATGACCGGAAATTTTTTACTGCGTTCACAAAAACCTTGACTTATGT
AGCAAAAAAGAAGTGTTAAGATTTTTTCGCCGCACCCAGTACAATAAAGA
TCCCTTTATCGTGGCTTATCGTTTGAATGTTGATCTATAATTATCACAAA
GTAAATCAAATAAGGCAGTCAAAATATGCTCAGTACTTTATAAAGATTAG
TGCAACAGTTGGCAATATGGGGCGTAATTGGCTACTTATCAGTTATTTTT
CTCTTTCTATCTTTGAAATAAATGAAGAGAGTTATATAACATCTTTGAAG
AATGAAACTTGCATATAAATTATAAGTTAACCCTGTTAGATATTCACATT
TCCTTGAAAGGGAGTGGACGAAGGAATTAATTTCTATGTACAGGATGAGT
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AAGATCAATGACTTCCATTTAAATAAGTGACGTAAAAGACCATAGTAGTG
TCTAGGAGCATACACGTTGATTCTTTGATTCTAAGATTATTATAAATATT
ACCGTTTTTACTCAACATATGTTGTTGCGTTCTTTTTTTTTAATATCTTT
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GGAATTATGAGTCTATTGCGATTGATTGATTCAAACAGGATGAAAATTAC
ATGCATTGAGAATAACAACCTAACTCCCATAGAGAAAAAATATACATAGA
GATGAAAAAACAGGGGTGTCCGCAGGATTATATTTTGGGAGGAGCTTGGT
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TTTTGGGAAAAAATTTCTAAAGTTACTTTTTAAATATTAAAAAACCCACA
GCTATTTACAAAAAATTAAAACTTTGGAAAAATAATTCAAAAACGATTTT
TCTAATATGAAATTTCAAAAAAAAAAATATTCTAAAATCTACAGCTATTA
TTTTTAAAAATTAAATTTTGGTAAAAAATTTCAAAAATGCATGTTTGTTC
ATAAGAAATTTAATTTTTTGGAAAAAAAAAACAACTTGCTTTTGTAAATA
AACAAAGATGAAAAGTGCATTTTCCTTTAGCTATAACGATTTAAATCATA
TACATATTGAGAACATAAATAAAAGGGTTTACATAAATAGGATTTTGATT
TTTATATTAATTTTTCAGGTGGCGTATTTAAGAATTCCTGTCATTTCATA
CTCTGTCATTGATAAGATTATCAACTTATGTAATGTAAACATTTAATTAT
TAAAAACTATTCTTTAAATAATAATAAACAGTTGGCAACAAAAAAAAAGG
AGAAAACTAGCTACCATATATGTTTTCAAATTTTTCCTTTCCCCTTTGAT
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ATTGTCTCTAATAGTCTAATAAAGAATTAACTAATCAACTAATTTCCTTC
AGTTTACGTATAAATTATTATATCCTTTGCCATAGCAAATGGTAATCAAT
GGTGCAAACTGAAGATTTTAATCGTTTATAACCTTATTAAGCAGAKCTGC
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TCTATTTGTATAAATATGTTTTCAGGAAATATTCCTTAACAAATTATTTA
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ACCTTCAAAACTTGAAAAATTTCCATGGTAAGTTACCCACCATAATGTAA
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TTTTCGATAACTTGGAAGATTTAATTTACTACTTAGTTACAGTTTGAAAA
AACCTCATAGCAGAAGATTTTTTTAAAATATATAACAGTTTGTATCTGTG
GGCATATGTATATTTGGGTTTTACACCTACAATAAGAAAAGCCATTAAGC
CCACTCTTTGCTTGAATGCTTCTTATATGATTATGTTTTGTAATATTAAA
ATTGGATCAAATGAGTATATATATTTTTTTCTTCATTTAATTAAGTAGTA
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TACTCACTATACTCTAACAAGTTTGTTTAATGTCAGATTCCTTAATTATT
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ATTATATGAGCCAAATTTATATTTCATAAACTTCATTCTTGGCTTCTACA
TCCAATAATTTAGCACTGATAGACATAGAAATAGTAGATGAAATTATTAA
AAGTGCTCTTTAATCTCTTTGGAATTATTTTTTAGGTGAAAAATTTTTAA
ATCATATTTATCACTCTTTCAAAATGATTCCATGGCAATAATAGTTAATA
TAAAATGGCTGAATGAACTGATATGTTCTCGACCTCAATTGATAATAATT
TCAGAGAAGAATTGAGTAAAAAAACGTACAACCTCGAACCAAACAAATAG
CAAATGAAGTGATTTGATACTTGAAACAATTGTTAGTAATAACTTCTTAT
CTACCTACTAAAAATTAAGCCTTTCAAACTTTTGAAGAGCTCCATATCTA
ACAATGATTCACTAATTGGTAATCACAGCTTTGCTATAAACAATTGAACC
TTTGAAACTCGTTTTTCGGTTTGAATACTTTTTGGACTAGGTCCTTGGAA
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TTTTGTTCCATTCCGTACTATATTTATTAACAAAGTGCTAGATTGCCAAG
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TTGTTTATTTTTATAGGCGTGGAATCATTCTGTTGAACTTTGAATGATAT
TTGAATATTACTGATCCCCTCACATTGCGATTAGTATAATTTTTCTACAC
CTACTTTTAAAACACAAATTTTCCCTTAATATAATCAATTCATTATTGTG
TTATGGATTTATCTTTTAGAGTAAGAAGTTGAAATTGATCACTAATTAAT
TTTATGTATTCTATAAATCATACAAATCTATGAGAATAAATGACTAATAA
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ATAGTTACGAACCCTCAATACTACGTGCCAAAGGTAAAAGAGATGTCATT
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ACATGCAGAACGCCTACGATATTTGATTAATATGACTACATTTTTATTTT
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AATGATTTGTNNNNNNNNNNNGTTGGTATCTATCTTGTCTTTGTTCTTGC
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TTTCTATCCTTTTTTTTACAAATCATATATATCAAATATGGATTAAAAAA
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GGAAAATAAAGTAACTTACTATTTAAGACGCTGTACGTAGGAAATTTCTT
TTATCATTAAATATTTATGGAAAAAAAGTGTACATAAAATAAATTAGATG
ATCATTAGAACTTCATTGACGTAGAGCAATTATGTTTACGTCAATTGATA
TTATTTAAACAATAATAATTATTAATTCAAGACATATATGCAAAAAAAAA
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TTTGCACATGGTTTCTGTTCATTTTTGAAGGGTTGAGCATTGAATAGAAA
AAATCTTTGAACCATTTTTGTAGCCGTTTATTTCGCTAATTTTTTCATTG
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ACGGACATTTCGGATTAGTTACTCAGTAATTGATGCCTTTTGAAGAAAAT
AAAAAAGCCATATACCTATTTTTGCAAAAAATCACTTTTTAATATTAGAT
AAATATATTAATTTTAAAGAAAAACAAAATAAATAAATAAAATATTTACA
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TAATTGAATATAAACTAAAAAGCAATGGAACGACGTATATAAATGGACAA
CACGCTTGGGAGAAATTATTCTCTTGAATGCAATGGGCATAGGTTGGATT
CCCCGTCGCTTCTAGAGAAGGAAATATACATTATGTATATGGACTTCAAA
GAAAATTCTTAGGTTAGATGGAGTAATTGTAATACTATAATGTTAACTTA
TATTATTCAGTGCAACTCCATCTAACCTATTAAAAGAACATTAAATATTT
ATACATATATCCTTTGATTAAAAATGAACTAAATTATGTATTACCGTTTC
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AAAGTCCTCTCATATTTGTGTCATAAAAAATAAAATGTCTGTAAGAGCAT
TTTTTTTTTAATAATCAAAATTACACCGAAAGAAATATTCCATCAGCGGC
TCTGTTGTTCACCAAAAATATATTTCACTCAGGACCAAAGATACAACCAA
ATTGCGAATCGAAGACCATATGATCAGTTATTGCCCAAATTTATATGGAT
ACTATAATACTTTTTATTCCATAGGTTGTGTTACAGTGCTGATAATTTTT
ATCTGAGGGTATCATAAATTATCACTTTAATTACGTAATATCCAAGGAAA
TTGAAAAAAAAAGTGATTTAAAAACATTTGAAGTTCTTTCAAATGGACAT
CTCGCAAAGAAAATTTTTTTTGTTGAACCACTAATTTTTGACAAAAAATT
TATTAAAGGTTCGTCGTTTTGTTTTTAGAAATGAAAGAAAGGAAGTTTAT
CAATGAGTGCCTAAACGGATTTTTTTCAAAAATAAACGGACACAGTGTGA
ACGTGACTCTGCATACAACTTTATTTCAATTAAGCATGCTCAAAGTGTGG
AATTAATTAATTACTAATAATAATGCATATACAGGGGTATCCACAAGTTT
TAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTACAAAGAAATTTTTTAGTCTTAGTA
GAAAATTTGATATTAGAAATTTAATTAAATTTTTTTGGAAAAAATTTAAT
TGTCTGTGGATAGCATTAAATTTGTAATAATTTTTCTCCGAAAAATTAAA
TGGTGTAATTTTTTTTCCAAAAAATTTTATAAATAAAATTTATAATCATA
AATTTTTTGTGAACGGCTCTGGATTTTTGAATTTTTTTAATAATAGCTGT
GGATATTGAAATGTTTTTTGAGAATAGTTATGGGTTTTGAATTTTTTTTT
TCCAAAAACTTTTTTGACTTTATTTTGATCATATCAAACTTAAATATAAT
ATGTATATCTTTTTTTTTTGGTCGGAGAACGGCGTATGTTTTTTTTCAAA
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TTTTAACCCCTTTTTTTTCATAATTTTTTTTCTTCCGGAGTGATAATTTT
TAAAGTCCAACCCCAAAAATTCGCTGGGGGGGGGGGCTMCAGCCCCTCCA
GCCCACCTCTGGGGAAGTCCCTGACTAGATTTGTCATGATACCAATGTTT
TTGTACCGGTTCCAAGGGTTGTATCCCTATTTATATTCTTTATAACTGAA
AGTATAAACCGAAATATCGTTTAGGGAGGTTAACAAGCACTTAATGTGGC
GTCCGAAGACTTTTGTTTGGAAGAGGGACTAGCATAAAAATGTGTTTATA
CCTAAAAGACAATTGCATTATTTTTTTATTTATATGAACATAGATGAAAG
TAATATTTTCCGAAAATCAATATGATAATCCTGGGAATTTGAGGAATGTT
TTAGATGAGTGCAGCTTAGCTCTTTTGACGTCTTATTAAATCAGCTTCGA
GGAGCTATGAGATGAATTAAATAAACACAAATCCCACTTCGTAGCTATTA
ATGATGTAGGAAGGAATTACACCATTATCGATCCTTAACTCTACTTCGAG
TCCAATAAGGACTTATTACTCCGCTACGAATCCTTGGTGTTACGATTCGT
CTTTTAAAGACTAATGATTACTTTATACATATAAACAGCCCTTTAAGCGT
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AAAATAAATTCGGGTTACAAGCAATATGTAAGTGTGAATTGGTATCTCTG
ATAAAAGATTATAAGATAATAGGGTGTTATTTTAAGAATATTTATAGTTT
GGAATGAATTTAGACCTATCCTAACTCATACTACTTTCTAGAATTGTATC
AAGTGAACTAATAAATTAGTTTTGATTAATTTGGTTCAAATATGGTGTTA
GGAATTAGTAGTCATGCTTTTAGTTCTAAGGTTGGTTGATAATAAAGGTT
TTAGTACAAGTTAATTTCATTTGTTACGATTTATACACATTTGTCCTATC
CAAACTCCAGAAAATAAAATTTTTAATAACACTTCAATGCATTCGTTCTA
GCTTAGCGTTGAACTACCCTGCTGAAATAATAATATTAATAGAAAGAAAA
TATATTGTCTAGCTTTCAAAAATGTGAAGTCGATGAATATTTCAACGACT
CAAGATTTAAAATTAGAATAGCCCTATTCAAATCCCTAAAAATTATTTAA
CCACGACTCAAGATTTCAAATAATTATATGCTTGTTCCATACCTGTTTAA
TTAAATAATATCAGGTATCTCCGGAGTAATTCGTTGAGACGTATATATTA
GTGATGTAGCACGGCATTGTTTCGCTAATACAAAAAGATACAATGTATTA
TGTTATCAGCTGTACATGGTGTTGCTTCTTTTTTTTTCTAATCAGTGTTC
TAAACATCGWTTGGTAGAATWTTCTGACAATCCGTTTCMCCGCCTATAAC
AAAATATAACCCCACACAATGGTAATCCTAACAATTTGAAGACTGTTTTA
GTGAAGAACAGCTTAGCTGTTATGACGTTTTATTAGATCAGTTACAAGCA
GCTATGAAAGGATGAAAATAAATAAGAACCCCCCCTCCATATCTTGTAAT
TGATCCTCAATTCTGCTCCCAGTCCAACCTGAACATAAACTTATAACTCT
TCAACAAATCATCAGTGATATTCTTCATCATTTATGAGTACAATCACTCG
TTGTTACACTCTTTTTTTATATGTTCTTTCTTCAAAAATAAAATAATGAT
AACAGCTTTAGAAAATAAAACTCTATGATAAAATCCAATATTTATATATT
TCAAAGTATTAACTCATTTCTTTCTGAGCAAGTGTTTTCTTTTTGGAAAT
CAAAATTTGTATTATATCCAAGCCCTAGCTTAGAAATTACTTTAAAATAT
AAGCTGATTGGACTTGATTGGGTTATCATATCAAAAATTTACTCATGACA
ATACATATTATAATTTTTCTCAAAATACATGTAATATAAAAATAAAGACA
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TGTTTTTCATTATGAAGAATTAAGGATTATTAAATCAATACTGGAAGGAA
AAAATAATCTTAGAGCTTAAACAATTTGAGTCAATGTAATTATAATTATT
ATTTCTGGTTTAGTAATTTAAAATAGAACCAACTCAAAAGGATAATATGA
GCGGCTTACAATTTAATTATCAACCAACAATTTGAATCGAGTTCCAATAA
TTAACAAATCAAGTCGAGTCAACGCATATTTAAAGTAATTATGTGCTTTT
TTGGAGTACTGTGCTCTACTTAAATATGTTCCTGGAGTTAGCACATATTA
TGAGAAGGACTTTCAGTTCAATAAAAGATTCATTGATTGATTTAGTATTC
TTTTTTATCATTATAGATCTGACTAATTTTCAGTTGTCTTCTTATCCACT
TTCAAAAAACGCGTCTGAAAAGGTTACTTCTCTAATTATATGTCTGAGAG
TTTTTGAATGGTTAGATGTATAAAGAAATTTGCTACAAATAAAGTAGAAG
TGAATTATTAATTATCTACGTACCTGTGTTCAATAACACATTGTTAATAA
TTGAATTTCTAAGCACAATGCTCTATATTTAGAAGTCTATATACATCACA
AGGGCATTTGATAAGATTTTTATTCCTAAAAATATGCACTTGACTAGAGG
TAACCATAATTAATATAAGGCGTCGTCGAGTCTAAAAGCCTTGTGGTTTT
ATACAGCATTTATATTTTAAACAAAAATATGTTTAAAGCAGCTCTTGTTC
CTTATGGGTTTATTGTTTTACATAATTAAACTTGAAGTTATCAATATCCC
TGTAGAGTCAAGTAGAGAGGGATTTAATTTAGGACGATCATTTGAAGGAT
ATGCAATAGATCGTGTATAAAATTTGGTCTTCAATAGTATTTAAGATAAT
AAGATTCAGTAATTTCCAGAAGAGGGAGCTATTATACTGTGAGACCACCT
GATTTTTAAGGGGACAAGGTCACCAACTGAGATATTTCTTTTCGTTATTG
AGTCGCTATTAAAGAGGTATCTCACTCTCCAGATCCAAATTCCAAAACAG
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CCCATGCATCCACTATGGGGACTTTAGCCAGTCAACATTTGGGTATGAGT
TACTGCCGTTTTCCCTCTCCATCGTACACCATATACAAAAGTCTTGGGTT
CAAATCTGGCAAAGAAGGGGCCATATCTCTTTGGATCAGAATCTAGCCAT
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CGTACTGAGTCCACACATAGTTCTCTTCGGGGTAGTTGGTTTTTAGTCAT
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GGTATGGTAAACCCCTTGTACTTCTTCTATTGTTCTGCAAGCCAGCGGTT
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