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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s565 | supercontig | LSalAtl2s565:344055..376006 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009008 >EMLSAP00000009008 ID=EMLSAP00000009008|Name=EMLSAP00000009008|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=604bp
MLIHFLQSSIFLIGIKGVFGQGTHEGIPSIPSSSDETRSVFIVNASQIRH TPVMSEGALKTAALKYTSNSPQYYPPGSSIPSSSNMECCKCYQQEVSSSF IQDKREITNIPSPNTISYSTTTKISTNPEPVLANDRVXSGAINLLLLQAL AQAQQTQEKPKVNPLEEKIQGYYNKIISIFNLDLEILRETIDLIRKANTT VLPLIQNVFLPLVNQAQSTSSSLNLENVIRPLSFRDSTNFTVPENAIREI SNMLTAEFDRSGLGFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHF IKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQ FKGGVRLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSV SRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTH QTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVK FFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGN EIAIPLLLVDENTKIVQSLLVKAITIASLKAELGRDIGELAGQLTTPEVP TYGG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s565:344055..376006+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009008-704855 ID=EMLSAT00000009008-704855|Name=EMLSAT00000009008|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31952bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s565:344055..376006+ (Lepeophtheirus salmonis) CCATTCATGTAGAAACCACCTTTGAATATACACTCATACCAATGTCGTGA
ACTTCTCCTCTTTTAATAATCTTTATACCCTATCCATATACAAGAATGTG
CCTTAGTTATTAAATCCTTTTCACAATACGTCATTATACATGAAAATTCC
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TGGCATTTCTAAGCCTCTAGCGGACAAAAAACTGTCTCATAGCCAGCTAC
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CAAAACATTGTGAATTAATGGAATTGCATAATTCCTTTTGCAAATATCAT
ATATGTTTTTCTCCAATTATCCTCTTTTTCTATTCACGAATCCATCCGGA
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ATTTTATTTCTTGAAATTTCTTCATTCCATTAAGCAAATACGCATATCAA
CTATATTTTTCCCAAATAGGGTCACTTTCTCTGTGTTCTTCAAACGGTGA
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TTTTTTCACTTTCCAAAGCTGTTATTATTATTATTGAACTTTTGAGAAGA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAAATATTACATTTTTGA
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CAATTAACTGTTCTAAACACGTTGCTGATTAGGTTAAATTAGAACTACCT
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TGAGCCCTTTTTTTCTTTATCTTTTTAGAAGAGAAAAAGATTTCTCAGAG
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ATATGTATATAGTTGTGAAAATCTGGAGTATTTTTTTGCACKCTCATTTT
TTTTTTTTTTTTTTTGGYGTTGCTTAGGGAAAACTGAATTTTCTTTTCCT
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AAGAAAATTTCAAAAAATAAATTTCATATGATAAACTTTTTCGAAAAATA
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TAAAAAAAAAATTTTAAAGTTCCAAAAATCAAAATATTTAGGAAAAACAA
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ATAATATATGGGTTAATAGNAATAWAAWATATKTATCATATTCCTCAACC
ATTATCTCTCTTTATACTCAGTGTCATTTTGGATCCTCTTTATATTGTTT
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TGACAACATATAGACATTAYCAGCCTCAAGAGAGCAATCTCTATCAATTA
AGACCAGCGTATCTGAGCATGTGGGGATCTTTTTAAGAATTTCCAAGGGC
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TTTTTGCTTTTTACATGAAAATTAAATATTTGAATTTTTTTTCCCAAAAG
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AAGAATCGGTTATCTTTTCTGGAATCGAGAAAATAATGTTTAATTAGCGA
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GAAGTTATGAAAAAACAAATAATCAACCCCCCACCCCTCCCCAAATAAAG
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ATAATTAAGGCTTTGATCTGTTTCTTGATGCTCTTCATTTAGAATGTAAA
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AACTATAGCCTATTCATTCATGCTTCAAAAATACTTGGTGCATTTACTTT
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CCATCGATGAAATCACTTTATAATTATTCTTAGTGAAATATATAGTTTCT
TCTTCCCTTTACTGAATTAATCTTGTTAATTCAATTATAAGGCTGAATTC
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CCCATTAATTGTTTAACTTTTGTACGCTGTGTTACTCAAAAATGAACGGA
AAGTATGAAAAGTCCTCATTTACTGCTCAATATCCAAGATTGCATTATAG
ATATTGATAGGCATCCTATTTTGAATATATTCTATTTACTATTTCAGTTC
GTCTATCTTTGATCACTGGAGGAGTAGTGGACTTAAATTTGGATTTAAAT
GCACGTGTTCATGCTCGCGTTGGTAAAAGATTATTTGGTAAATGTTTTGG
CAAAATGAGGAAGAACTTGCCTCTCCGATCCGTATCTAGGGGTAAAGCCC
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