EMLSAT00000009560, EMLSAT00000009560-705407 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009560
Unique NameEMLSAT00000009560-705407
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s615supercontigLSalAtl2s615:582639..600186 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009560 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009560EMLSAG00000009560-692326Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000042448EMLSAE00000042448-751376Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000042449EMLSAE00000042449-751377Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000042450EMLSAE00000042450-751378Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000042451EMLSAE00000042451-751379Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000042452EMLSAE00000042452-751380Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778731auto778731Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009560EMLSAP00000009560Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009560

>EMLSAP00000009560 ID=EMLSAP00000009560|Name=EMLSAP00000009560|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=199bp
MSDSSTTAETLSFHHNLLDKQLMIENVPVCGGRRFKRPFSKKDFPLLGDD
GEEEDPMKCIFLSSLARKEYSGGKSTSVLKMRDLLRDPITGRWRWPVNGA
DQVYPGIYLGDAYTAMCIKVLKELNITAVLNASQGVILVHCVAGISRSAS
MVLAYLIIKKKMTLEEAINTVKKKRSIAPNEGFLEQLIELNDTIHHLKK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s615:582639..600186-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009560-705407 ID=EMLSAT00000009560-705407|Name=EMLSAT00000009560|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17548bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s615:582639..600186- (Lepeophtheirus salmonis)
CAATTACTTTTTCCTTGCGTAACAGTTACATTCTATTTTGTTAAAGAGTC ACAAGTACTTAAGACCATGAGCGACTCATCTACCACAGCTGAAACCCTCT CTTTTCATCATAACCTTTTAGACAAACAACTCATGATAGAAAACGTTCCT GTTTGCGGAGGTCGACGCTTCAAAAGACCCTTTTCCAAAAAGGACTTTCC TCTTCTAGGTGATGATGGAGAGGAAGAGGATCCAATGAAGTGTATTTTTC TCTCTAGCCTGGCAAGGAAAGAATACAGTGGAGGGAAATCCACGTCTGTA TTGAAGATGAGGGATTTACTCCGGGATCCTATAACTGGTCGATGGAGATG GCCGGTGAATGGAGCAGATCAAGTATATCCTGGGATATATTTAGGCGATG CGTGAGTTTATTGAGTTAATTCGTATTTTAAGTTGAAAAGGGTATTACAA CTACTAGACTACTATGTAGTAGATTGTTAGATTATTTAAAGCAAAAACAA TATGTAGGGAACATAAATAAAGTTGGCCTAAAAAGAAGTAGATTGAAAGT AGTGTCAGCTTGCAGAGTCAGCTGTTGATGAATGCATGTATTATACCTAG GCTATACTCTAGTATTCCTTGACCTAGGCATGGATCACTATATACATGGA GAGTGCACTTCTTTTCAGAAAATACATACTAAGGAGGATTGTTTATGTCA ACCTATGTATTTTCTGAAAGGGAGTGCACTCTCCATGTATAAAGTCCTCC TCCCCTAGGCAATGAGTTCTAATGCTATAGTATAGTATTAGAACGCATTG ACCTAGAGTTGCATAAAAAATGACCTAAAAAGCTTTGTCATTATTATTTT GTTCTTGAAGATAGAACATCTAAGTATTAAGTAATAACTAGTGCGTGGGC TCTTGAACGACGGAGAGTAACACTGATGAGCTATAAGTGTAAGTCCTTTT TGGACTCGTAGTATAATTTCAGCCTATATGTCGTTGCAATATACGAAGTG GGATTTATGTTGACTTCCTTCCTCTTACAGCTGCTAGGAGTTGAACTAAT AAAATGTCATGTCAGCTAAGCTGCTCTTTTCCTAATCATTCTTCATATTG TCATGATTGCCATGGTTATTTTTGGTTTCATTTATTCTTACATACCGTCA GGTCTTACTTTATGTAACTCTAATTATTCATAAAGTCGCAGAAAATATGA CTTGTCCGTATGCTTTTTTTATATAGATAAAGCCGAAAATCAAAATAGTA ACCCTAACATTTTGAAGAATGCTTAGAAGGAGAGCAGTTTAGCTGTTATG ACGCAAGTAGCTATGAAATGACGGAAATAAGTGCAAATCCAACTCCATAT CTAGCAATGATCAAGATAGGAATTACTTCAATTTCAATCCTCAATTCTGC TCCGGGAAAATAATAAACACAGTTGCGGTTGCAATTACAAAAAATATCAT CCTTGTCTAAGGTCATATTTTTACAACTATAAGTCCTCGTTAGACTCTGA GTAGAATTGAGGATCGGCATAGTAGTAATTACAACCTATATCATTGCTAT ATTCGGAGTTGGATTTATGGTTTTTTCCTTCATCTGATAGCTACTTGCAG ATAATCTAATAAAACGCCATGACAGTTAAGCTGGTCTCCTCAAATAAAAT AAACCAAAAATTAACGTGGTAATCGTGACAATATAAATCAATATAAACAT CGTGGCTAATTCTTCTCCAATTAACATTACAATGAGTTCTTAATTAACAT TATATTGCAACAACCTATTAGATACTTTTAAGACTAAGAAAACAATAAAT AGCTTAAAAATGAAAGGATAGGCCTGACCTTCAGTGCTTAACTCTTAAAA AGTCTTTAAGATTTCCTTTTATGTAAGTTCTCATTGTATTGTAAGTGATT 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TCATACTTATTGCAAGCTCACAAAAAGAAAAAGAAAAATAACATTCTCAA GATTAAGTTGATGCATTCCCATGGGCTATGGCTATACCTTTAAGATTACT GATTATTTATCTATCATAATAATTAGAGGGTAATCTGATTTGCATACAGG GTCGGAGGAATTATGAGCGGACCCTGCTAAAATATAGATTTCGACTCTAA TCTATATTAATTAATCAAAGTTTGTCTGTATATGTGTATGTTGAAAGTAA GTCATTTTTGGAGCCTAGATACTTGATTTAAGAAATAATAATACATACGA TTGAGCTTGTGTGTCACAATTAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGTATTTGT ATAGAATTGTATAAAATTGATACGTAAAAATGTAAAAATGGCTATTTGGG TCAACTCATAATTACAAAATAGTATAAAGTAAGCCCTTTTTATAGATATA AAAAGGAATCTGACATTTGATGAAGTTTAGCAACGAGCTGAAGTACTCCG TGGCAGAACAAATTATAATATTTGTTTAAAGCTGTTATACGTATTATCAT TGAGGCGAGAACATCACAGTATTGAGTAACTGCACATGTAATTTTCTTAT GAAAAGCGGAGAATAACATTGAGGATTTGTTGGAAAGTTATCATTTATGT TATTGAGGCAAATTTTGTTTGCTCGTCGACGCCTAAAAACTCTGGGCAAT GCTGCTTACGACTGATGGTATGAAATTCATTTCCTTCCTGCCTATTTGTT AATAATTTCTTAGCAATACTTATGGAATTGGGAAGTAACAAACTTTTTTT TTATTATAGCCCAACCCTTCTTGTAAACTTTTTAATAAATGGCGTCCATA TTTAATTTTTATAGAAAAAAATACTTATGTTTATTAAAAAGACATTTTTT AAAGAAAAATGCCTATTTTTTTTTACAAAATACTATCTACATTTCTTCCA ACTCAAACATGAAATAATATCATTTCTTTAAGAAACGACTCAAATCTTTA CATAGATAATACAAATCACCCCTACCCCTCCCCTGTGTATAATATATTTA TTTTCGTATATGTAAATCGTTAGGTTTTTTTGGCTGGCCTGTTTTTCGGG AATTGGTAATATGAAGAATGGAATTTATTTTCCTCAACTTTTGTCATTAT TATTTAATTCCGCAGTAGTGAAATTAATTTCCTACGAGAGTCAATTATAT TCAAAATCTGATTGAACATTCGTGTGAGCTCATTAAAAAGAAGAGCACAC CTGAAAAAATGTGTTGCGGAGTTATATTTGTAAGTCCTTGTTGGACTCAG AGCAGAATTGAAGATCGATATCGGAGTAATTCTTGCCAATGTCCTTGTTT ATTTCCTTCTCCCTCTCCTCCCTTTTGACAGCTGATTATAGTTGCTCTCC TCCAAAACCTTCATGAAATTGTAAGGGTTACCATGTTGATTTGTGGTTTC TTTTTTTTAACATCCCCAAAAAAAACCACGATTTTTATCCCTATTTATAG TATTAGAGGTGTTAGATTTTTGCTCCTCAGTTAAAATTATTTCCTACGAC TTAGGAATAAGTAACTCTGACGTATTTGTGAGCATATTAGGCTATGATAT ACATATAGTCTCTTAATTTAATTATTTATATACTTAATAAGTGTTGTTTT TTAATCGACTATAAATATATTTGATAAATTAGTTCATTAAGTAATAAATA GTCCATCATTAATTTTCTTCTTGCTTCCAGACTCCATTTTAGATCTACAA CATACATATGGGGAATTTATATGTACCTACATAGCTATTAATCAACTTAT TTGCAATATAATAAATGTATGTCATGTACTAGTTACACGCAGTAAGCTGT GCTCAGAGTTCATCAGTTGTAAACACATAATAAAGAACTAATAATTAATT TTAATAGGTTTATCAAAACGGAATATTAGTGATAACTAAAAGACTCATAT TTGCTAAAATAATAATTATTAAGTAAAATGTCACTTAAATGGCCTCCTAT CCCATTTTTCTTCCCTAAAAAAAATATTTCAGGAATGAGTTTGTATATTT TTTCGTCAAAAAGAGATACTTTTATTTCTTAAATTAATTTTATCATGATT CCTCTTTAATAATGTATTTTATTTTCCCTTTAGGTATACAGCAATGTGCA TCAAAGTTTTAAAGGAGTTGAATATAACAGCAGTGCTTAACGCATCACAA GGTACCATGAGCGATTGGAACTATGTTAATACCAAGGTGACTAAATAGGT TTGCATTCTATCAATACATATGCCTTTATTCAATTTATGCGAATCTCCAA AATGATTTATATAATAGATAGAAATATGTGAATTGAGACGGTGCATAAAG GGAAATGATGGATCATAATTCATATAATATCTGGAGGGTCTCTTTATGTA CAGTGTGAGATTTATTTAGATTTACATCGTCTTCAACTCTGCAGAAACTA TATCCATATCAGTGAAAGGACGTAAATAATGATGAAATCAGATAGTTGAG TAAAGTATTTATAGTCTAATGTCTATATGACTTTAAAGATAAGATCTCTT GGCAGCCATATAATACATTACTACTAAACATACGTTGAACATATATTCTT GGATCAAAGTGTTGTTCCCCCTTATTTTAAAGTACTMCTCCTCGCCGCCA TTTTATGGAGTTGTGTCGCAATTTCAATTTTGTCCTGATGTGAGAGCTAA AAAGAATGAAGGATTCAAACTCAAAATATTGTTTTGTACGACGTTACAAG TTATATGAAATAAATTTTAGGTTTGAGGGCACTGTAATTAAAAAAAAAAA ATGAGATGAAAACTTGGAAATTAACAAAATGATTTTCAAACAAAACAAAA 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