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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s691 | supercontig | LSalAtl2s691:147201..171146 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010439 >EMLSAP00000010439 ID=EMLSAP00000010439|Name=EMLSAP00000010439|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=632bp
MRHHKVRFSDGRSWKNPDVVGLYITISLXYIVGLLCFQKYAGLLELNIMA PSSNSPLAWFHTNRHLLSTSFENETLNTSFSPLPNGTYDNKTSPRENGTK FGGGSKEKDASEDEADGALFPDDIFTVNELQHGAVIFYIIGMVYMFVALA IVCDEFFVPSLDVIIEVIGXSEXVAGATFMAXGGSAPELFTSVIGVFVAF SDVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSKTVLHLTWWPLFRDCTFYSISLV TLIVFFIDDTIEWYESGTLLGIYFAYVGFMKINPIAERTVKKLLFKNKVT RVRSTDHLVPTVSYICILHSGSHFRHGLLQLMIHTIDPLHDGKVDEKATQ LHAIASLKVLLDATKPQEGTNGTASNVLDLGPDGDINSSTNATHLSQVGS NKTLSSNKTTEQPLNGAVTTAGLSSDEDESHPLDLSWPDTTRERITYILF LPIILPLWLTLPDTRKSSARKYYPITFLGSILWIAAFSYLMVWWATISGK TFDIPPEVMGLTFLAAGTSIPDLITSVIVARKGFGDMAXSSSVGSNIFDV TVGLPFPWLLYSAIFQKPVTVSSAGMVCSITILFGMLLLVFFSILLFNWK MTKGMGLTMFVFYFAFVAVSLGFEYDLLTCPM back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s691:147201..171146- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010439-706286 ID=EMLSAT00000010439-706286|Name=EMLSAT00000010439|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23946bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s691:147201..171146- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGGCATCATAAGGTTCGATTCAGTGATGGCCGTAGTTGGAAAAACCC
GGATGTTGTGGGCCTCTACATCACGATATCCCTCGNCTATATAGTCGGAC
TCCTATGCTTTCAAAAGTACGCAGGGCTCCTGGAGTTGAATATCATGGCT
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CAAATGGAACTTACGACAACAAGACATCCCCTCGTGAGAACGGTACAAAG
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CTGTCATCTTTTACATCATTGGCATGGTCTACATGTTTGTAGCTTTAGCA
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GMTCTGCTCCTGAGCTATTCACATCCGTGATTGGGGTATTCGTTGCTTTT
TCTGATGTCGGAATTGGAACAATCGTTGGCTCTGCAGTCTTTAATATCCT
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GTTTCAACTTTCTGCTTCGGCGGTCTTCAATTTTGATATAGAAAGCTAAA
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TGTTTTTCGAATTTCGATTATGGAACGTTGGTGATAATCGTCATGCGGTA
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AGCACATCTAGCTCAAAGTTTGAAAGAAGACAAAAATTATTTATTTCGTC
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TATAGACATTATTCTAACCTATATAAAACATTAATAAGGTTTTTGTCTCT
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GTTCCATTCGAGAATTTTAATTAAAAATTTGTAACACTTTTTATAGGTTC
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GTAATGGTGTCATAGTGTTAGCTGATAGTGGCTTTGAGGGCCTGGGTGTT
TGGATGACGGACACATCAGGAATTCCTCTTGACATGCAATCAAAAGGTGT
AGTCGAGAGAGTTGGCATTAGGGCTGTTTGGGGACCAAAATTGTCAAAAA
AGAATTCAAAAGAGTTTTGCAAAGAAAGAGATGGGTTTCTTTTATTGCTG
GTGTCAAAGGTGGCCTCTCCACACTCAAAAAGCTCTTTCCACCCACTTTC
TTGATAGCTCTCTAAACAGTCTGGTGTGGAACCCCGAGATCTCTTGTATG
GGCACTCAGCACTCATGGACTTGAGGGGACTGGCCTGAGCTATTTTCTTT
AACGCCTCCTGATCCAGTTTGGCCTCTTTGACAGAGTTCTCTTTGAACTT
GCTGACGACGTAGATGGTAGTCCTTGAGACACCAACTACTTGGAGTGCCT
GAATAGAAATTGGTCGATCAAGTTCAAGTGTCATTTTCTCTCCTTGTACG
TAAGCTACAGTGCTCAGGTTTGTTCTGTTTTGTGACTAATTGCTTAAGAT
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TGACGTTCAACTCCCTGGAGAGGCTGCTGACGGTGACCTTGCCTCTCTTG
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TGTAAACAGTGGTGCGGCTGCAGTTCAGAACCTTGGCAATTTCAGTGGGA
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GACTTTAAACCTAAGACTCAGTGCTCGTCTTAAACTTTAAAGCTATTTTA
TATTGAAATCAAAAACATCCTTAACACTATTTAAGATCTATACTATAATT
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ATACTAAGACTTCCTATTTAAGGATCTCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATTTATATCTTAAATCATTTACATATATAATTATATCTCTTTTTTATGTC
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GAATTTGATCGAAAAACGTATTGAAGACCTTTGCGTTGGGATTGTAGTTC
GTTAAAAACGGAAAAGATGGAACCATTTGATACGTTATTGGACAGTTATT
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ATTGACCTCAACCATACCTTTTATCTACTTAAATATCTCCTCATATTCTC
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AAAAAATTAACATACTAAGGATTTTCCCATTTAAATGGTTCCAAACGGTT
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CTCGAATATTTCCATTATTTTATCGACATTTTCGACGTCCATATTACCAG
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AACGCAGTAACACAAAGCTGGTTTCAACAAACACAAAACTGTAAACGAAC
TTTTTTCAATGTGTACGCTTAACCTTTAAGCATACCTAAAGTTTTTTTTG
ATGTAATGTATTAATCGTGAGATACAGCTCACTAAAGACATTTAGCAAAA
AACGCACATAACTTTATACTTAACCTAATAATAAAATGGAAGCTTTATGT
ATAGTATGAGATGTTTAATTTTTTAATTAAATACATTGTGTTAGACAGTT
TTCACGTTTAATGGTTTATAAAGGGGGAATGTCTTATAATGAGCATAGAA
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TATCTATGGTATAAATTGAATATCGTTGTGAGCTTTTCGTAAAACAATAA
ATATATAGTGATTATTCACGTCTCAACATCAATTCTATTTACAAGCTGAT
GAAGCTTTTGTGAGTCAACTAACCCTTTTCTCTTCCTATAACTAATATTT
TATTCTGTAGCACGCTATAAAATTGAAGAGTTCATTTTGGATAAGTACTT
GTTAGAGTTGTAAATAGTGAACAAATTTCTCCATTTTTTAAACAANTCTC
TCACCCACACAAAAATCCTGCAAAGGCCCTATGTGGAAATGGATGTGAAT
TGGTCTTAATGTCAAACAAGTATCTTAAAGTACCTATACCTAGATCGGAA
CGCTATCCGGAGCACAACTATTTGGTATCTTAACGACACTACAGAGTATT
TGAAAATAATGATTAAAGTGACTACTGTTATATTTACATTTAAGTATGAT
TCTGAAATAATTAGAAATCCCAACTTGTACAAACTCCCAACTTGCACAGA
ATTGACTCTAAAATTATAATTCATTTGAACAAACATACATATTTGTCTCA
TGTCTTCATTTTTATACAAATTATTCTGCATGACATATTCATCTTCATCG
TTAAAACKTYWTGTCYTTTTTAATCAGGCCCTTTGGGGTAGGWAGRAWYT
TTTTTTTTWWAAACATACATAATATTTATAAAATATATTCTTTTTATCTT
ATTTATGTGAGTTTTTTTTATATGGTTATGGCATTAAATATCATAGTCAG
ATGAACAAAATGAGAGTTCCTACAGNATAAATTTAACTATATTTATTTAT
TTGTTATATAACGTATTTTTTCCGTTCTTTTATTTGTCTGAGCTTTTTTT
TCTATTTGAATTTATATTTTATTTATTTGATAGTGGTTGCATAAGGTCGC
TATGAAGGGATATTTAATTAATCCCTTCGGCTTCTTGATTGATTGACTAA
CATTATAATATTATTTCTACCATAGGCTGGRGKGACAGGKGCAGCTATGT
CAGGKACAGTAGCTGCAACTGGRGAAGGAACCCGGTCTCATACTTCTATT
CCAGTTCTTCATTCTGGATCTCACTTTCGTCATGGACTTCTTCAACTTAT
GATTCATACGATTGATCCTCTACATGATGGTAAGATATTTGAGTCACTTA
AGGTCTATTACCAGATCTATTAACGATAAAGTTTGGCAAAATACCCTCTG
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ACTTTTATCTTCCATAACCATTGCATAATAGGCAGTTTATAAAAAATATA
CTTTAATTAATAGTAAGATATGACTCGCTCACGTCCGCTCCTTGCGCTCA
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ACAATTTATTTTTAACAACTTTGCTTTTTATAATCATTAAACCTCAAGAA
TTCTCCCTGTCGAAATAAAATGGTTCCATGATTTAAAATGTGTCTTCCCT
GTAGGGATGAAAATACTATGAAATATTCAATTTTCGAAGCAGTAAAATGA
CAATCATAACATTTCCTCTCTCCCAAATAGAAAATATTGTTGAGGTTTGA
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ATGGATGTAGTAAGCCACAAGATTACTTTTCCTCCAATACTTCTATAAAA
TTAATGATTCATCATTTGAAGGCAATCATAAATGACACAACTCAACAAAA
ATATACTTTTTCAAAAATCTTTTAAATTCCATATTCCTTTTTATTAGTAG
TTGACGTGCGAATTACGAATCTGTAATTAGTGGGGTTTTTTTTGTATCAA
ATCTAGTTTTTGAGAATTTTCGATTTGAGTATTGTTAGAATTTGTATAGG
CCTTGTCCATCTTTGGAGTTAGACAAAAAATTAATGATCCACATGAAAAT
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TTGAAAAGGAAATAAAATATAATATGATGATAAAAGAGTTTATTTGAAGC
GTCAATAATTATATATTCTTTATAATTAGTTATAACACATTAATATGTGT
TAATTCCCCCACTGTAGGTAAAGTGGATGAAAAGGCAACACAACTCCATG
CTATTGCCTCTCTCAAAGTCCTCCTTGATGCAACTAAACCCCAGGAAGGC
ACAAATGGCACCGCCTCCAACGTTCTTGATCTTGGACCTGATGTAAGTAC
TCTTTTACCCACATATTGTTTTTAGAGTGCGAATACAAAGTCTATGCAAG
GTGTGATTCAATGGGTTTTTGATAACCCAACCCTCCACCCCACCCCACCG
CTCCTCCCTTGTGTTTTCTTTTTCCTTTCTTTCTTTCTCTTTGTTTTAGG
GCGACATTAATTCCTCAACGAATGCTACTCATCTGAGTCAAGTTGGATCC
AATAAAACCCTATCCTCAAATAAAACAACAGAACAACCATTAAACGTAAA
AAACAAAAATAAAACAATAAAAACCAGTTCTTGTTTTTTTTAAAAAAATC
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