EMLSAT00000010514, EMLSAT00000010514-706361 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010514
Unique NameEMLSAT00000010514-706361
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s699supercontigLSalAtl2s699:301238..318421 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010514 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010514EMLSAG00000010514-693280Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000046808EMLSAE00000046808-755736Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046809EMLSAE00000046809-755737Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046810EMLSAE00000046810-755738Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046811EMLSAE00000046811-755739Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046812EMLSAE00000046812-755740Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046813EMLSAE00000046813-755741Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046814EMLSAE00000046814-755742Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046815EMLSAE00000046815-755743Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046816EMLSAE00000046816-755744Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046817EMLSAE00000046817-755745Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046818EMLSAE00000046818-755746Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046819EMLSAE00000046819-755747Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046820EMLSAE00000046820-755748Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776078auto776078Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010514EMLSAP00000010514Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010514

>EMLSAP00000010514 ID=EMLSAP00000010514|Name=EMLSAP00000010514|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1041bp
MAYXFIICLLLLPIKVYSQGSETIELDPCSILDGGSHLIIAINESLQQDF
SQFSEPEELLISGEIGTEISLKITEDKSRLFKLDASMDADANINGQVEYT
LGDNGDDSPFAIESPYQGLVTLTKTLDYETTQRYFLQIKASDRALNTEDR
FTSTTTLTIKVQDSDDLPPVFNHPEGYTAEVISGYPVSTLHISPEKIHAE
DQDSLRTEVVYSLVDGIPINYDVYFGIDPNSGVISQRQVIDKAQYDRFEI
IDEGAEIGTYVTDINGNRIDFSITDDDIEDGVELQTLDSYDIELTTKYFQ
IDQEGYLIVNQSDIDRDPPFQPVLTFQIFAREKFDSFKSSSPVQLTISIR
DINDNSPVFAPISDITLTAGTTRRIVTHFNATDKDSDKFIVYKLLSVSNN
GRQKFFLNSKTGLLEVIAPIYDGEQYAITVEAKDNGGLSNIAVLRTIRAQ
DNGGKFSTVXLTITVLXEXDNTPEFQNLPFSFRVTEGTLREFVGEVSAVD
VDQSSNGKVFYYLNETEDTFSIEELTGRIYTLKSLDFEEQSVHYLVIGAK
DNGXPALSAXATATILVQDISDETPIFENPLYNISISENNEPELLLTTVQ
PSITYRIITGDRKRFRVNQTTGDVYATHKFDYEKEFYYSLVIGTEEGFFD
GELSGEAVTKVEIHIEDLNDVPPHFVKGFNMSSDGSTKNADKYFGVDPVK
GDILIVGNLTEDIIEEYQLEIVTYSIENPQLQSSILIRVVIKIVTSLYTG
PGLGFEELEVNEKKECDLILNTDEIDRERNDRYEILVELQSRPEFINTDR
NEVHIRVNIQDINDHSPLFEKKRYFGIVKKESLPNTPIVQVEATDRDSGS
NGKILXSFQSMNNETEDLFQIDSESGIISNILELMLTLPKINPTEFESHR
DDLINVLEDTTGYKVGIDRVDTAMIKYLNGTCCTAHYGTDVYFHVIDPIQ
YRILNSTENKVKTNILDSAPKLKEKVSKKLNLRVSDLHLPYNKAIPSTEV
VQKAGNGDELLTYYLIVIGLAVGLFVLTTMAXIYLXCARRR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s699:301238..318421-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010514-706361 ID=EMLSAT00000010514-706361|Name=EMLSAT00000010514|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17184bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s699:301238..318421- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCATACMCCTTCATAATATGTCTTCTNCTCCTTCCGATAAAAGTTTA TTCTCAAGGTAATCCCTAAAAAACATAAGACACCTTATTATTACTTTTAC AAACTAAATTATAGGTTCGGAAACAATAGAACTTGATCCTTGTAGTATCC TTGATGGAGGTTCACACTTAATTATTGCCATCAATGAATCCCTACAGCAA GACTTTTCACAATTTTCGGAACCGGAAGAATTACTTATTTCTGGAGAAAT TGGAACTGAAATATCTTTAAAGATAACGGAAGATAAATCCCGGCTTTTTA AGTTGGATGGTAAACAAATTAGACTGAATGGACCTCTTGATAGAGATGCA GCCGATTTATCATCTCTCTCTTTGAAGGTAAACAAATTGTATAGGTCATG GAATACTCTAGAACAAGCATTCTTTCTTGACCATCTAAATGCGTTTTTAT GGTATGGTAAGAGTTTTGAAATGAAAGATTGGCTTTGATTAATCAAATTA TGTAATAAATGTCCTGAGGAATTAAATATCTAAATAAGTGTATCATTGGG TTTTAGGGCAATTAGCTGGAAACATTTTTGCCAATTGACAATTTGCTGCG TGATGTTTTGCCTAAGGACAATTTGCCGAACGAATATTTGACTAAAGTAC CATTTGTGACATTTGACCGAAAAATAATATTTATTATGTTGATATATTCT ATGGATATTTTTATTCAATTTGAAATTATACTAAAATAAATAAGTATTGT TCATATCCTATATTTATCATATAAGTAAATTCATTAGTGTTGTTTTGGAG AAAACTATTTTTCTATTAATGTGATTCAAATATAGTTTGAAACTTCACTG TTGTAGTATTTCAAGTAAANCTAAATTATAAAAAAACAGGACAATAACTA AAAAAGAGAAAATATCATGTTTGTTTGTCAATCTATGAGTATGCTCCAAT ATGAAAAATCCATCATGTCGAATGATGTCGATATTTTTCCCAAAAGAGTT GCTGMCGTATAATGATCATTAAAAAATAAAATTAATCATTTTAAATTGAA CTAAAATATAAAATTGTATATATCAAATATCCTTTTTCGAGCTAATATCC CAAATGGTACTTGGGATGAAATGTACGTATGGCAAATTGTCTATCCGGGA AACGTTATTCGTCAAAATGAACAATTGGCAAATTTTTCTTTGGTGAAGTG TAATTCGTCAAAATGAACATTTGGCAATTATTTCATTGATGAAGTGTAAT TCAGTAAATTGTCTTTCGGAAATTATGATTCGCCCAAAAGTAATCTAATA GTATGGTTGATAGGATGGTTTACTTATATTCGTCTTTTTAGGTTACTTGT GAGTCATTATCTAATGGAAAGCGAAGAACTATTCCTCTCGTAGTCCGTGT ACTTGATCTCAATGATAATCCTCCTCTTTTCAAAGGAACTCCTTATATTA TCAGCCTACCAGAAGTTAGTTATTCTATAAATATTTTAATTTATGACAAA ATTACCGTATTTTTATTATAGAATACTCCGCTTAATTCAATTGTATTTTC AAAATTAGCATCTATGGATGCAGATGCTAATATAAATGGGCAGGTTGAAT ATACTTTAGGTGACAATGGTGATGATAGTCCATTTGCTATTGAATCACCT TATCAGGGACTCGTCACGTTGACTAAAACTCTTGATTATGAAACAACCCA AAGATATTTTTTACAAATCAAGGCGTCAGTAAGTAAATACAAAATGATAA CTTAATTGATTTAAATCAATATTTGTACCTTAGGATCGAGCCTTGAATAC AGAAGACAGATTCACTTCAACAACAACTCTAACAATTAAAGTTCAAGATA GTGATGATCTCCCTCCTGTTTTTAATCATCCAGAAGGATACACTGCAGAA GTAATAAGCGGTTATCCTGTATCGACTTTACATATAAGTCCAGAAAAAAT TCATGCAGAAGATCAAGATTCTCTTCGTACTGAAGTGGTTTATTCGTTGG TAGATGGAATACCAATCAACTATGATGTATATTTTGGTATTGATCCAAAC TCAGGAGTCATTAGTCAAAGACAAGTTATTGATAAAGCCCAGTATGATCG TTTTGAAATAATTGGTTAGAGGAACAGAAAAAACGGGTCGTCATATTGAT GCTAAACTGACTATTAATGTACTTGCTGAGGACAAAAGTCCTCCGGTCCT ACGTTCTTCGTCTAATAATGGGTATATAGATGAAGGAGCAGAAATAGGGA CTTATGTAACTGATATAAACGGCAACAGAATAGATTTTAGTATAACTGAT GATGATATTGAGGATGGAGTAGAACTTCAAACCCTGGACTCGTATGATAT AGAATTGACAACAAAGTATTTTCAAATTGATCAAGAAGGATATCTGATTG TGAATCAAAGTGATATTGATAGAGATCCCCCTTTTCAACCTGTGTTGACT TTTCAGGTAATGTAGTCAAATATGCAATTGTGGGGATAATTTTTTTATAA TATATTTTATATTTGTAGATTTTTGCCCGTGAAAAATTTGATTCATTCAA ATCATCTTCACCAGTACAATTGACTATATCTATTCGTGATATTAATGATA ACTCTCCCGTATTTGCTCCCATAAGCGACATTACACTAACAGCAGGAACC ACCAGGCGTATTGTAACACATTTTAATGCCACTGATAAAGATTCAGATAA ATTCATTGTGTATAAGTTGCTAAGTGTATCAAACAATGGTCGACAAAAGT TTTTCCTTAATTCTAAGACTGGGTTGTTGGAAGTTATTGCTCCAATATAT GATGGAGAACAATATGCTATAACTGTTGAAGCAAAAGATAATGGAGGCCT ATCAAATATTGCTGTTTTACGTGTTAACACACGTCCAATGCCAAATGTTC AGAAGCCAAAATTTGATCGATTTCTATACGATATTAAAATCAGAGAAGGA GTCCCAAAATTTACTTCTGTTGTTGAAACAATGGCAAAGGATCCAGAAAA TAGTCCAGTATTATATAGCATTATTTCAGGGAACGAATTGGAACATTTTG TGGTACGTGTTAACTCTAAATATTTCAGTGAAGTTGTAAATTATAGGCAT TTACTCGTACCTGATTTTTTTTGAATTTGGCAATCTCAAAAGTATTTTTT TAGTTATTTTTTAAAGCTGTTATACCGGGGGGGTCCATTAAAATCTGACC ACTTAATAATTAATGAAGGTTGAGGGTTTGGAATTAATTGATATTTTGAT ATATTAAAGCATACACAATCAGTTACAAAACAAAACAAATGTGAGCTATC TAGCCTTAGTACATGTGGAAAAAATAACATTTGAACGTTATCTAAGAATT TCCATGCCTGCACTKCGRCAGCCGTCAGCAAGTCTGAAACGTTGGAAGGG AAGGAGGACTCTGTCAAAAATGTCCAAACTGGACANGGAGGAGTTAAAAA AGCAACYGGGKAATCCGATGACGTTCATTAGAGCCCGTACAAGATATATC GGGGTTTCAAACCAGACTGACCATAGAGCCATCAAAAATTTGGATGGAAA GAATCAATAAACCTTCTCCTCCGTTGCAAAACTCTTCTAATTAAGTCATT TGAGTTCTTTGGAACTCTCTTTTCATACTCCCCCACCCCCCACACACACA ACCAGCCCTGATACCAAACCCTTCGACTTCCTCTTTTGGGTAAGTGGTCG AGGAGAAGGCCTTGAGTGTTCATCATCCAAAAACCAGACCCTCAAATTCC CTGTAAGGCGGCACTGGGATGCCATGACATATGKCTACTTTTGCAGTGGG TGGCAGKCCTTCCTCCACCACTCGGAAGCCATCATTACCGCTAAAGGCAG CAATACTAATTATTAAGAGAGATAAGACACTCATCTATGTATGGTATTAT CTTTATTTCAATTATATTCTTAATTAATAAATTATATATTGTTAAAGTTA AGAAATTCAAAGTGTTCAGATTTTAATGTACCACTTGGTAGTTTAATCAC TCAGGATATATAAGCTAATTACCAATGTATTCATAAATGGTGAAGAGTAA CATTGATGCATTCTGAGGCGTTATAAGTATATGTCCTTGTCAACTCTGAA TATGGACATTATAGTAAGCTCGACCTATGTCTTTACTGGATACCGAGTGT AATCTGTATATATTCCAACTTATTTAATGAAACGTCATAACAACTAAACT GATTTCCATATAAACATTATTCAGTATTACCAAGTAAATTATTGATATTT ATTTTTTAAAATACTTTTATTTTTGTACACAAATAGATGGAAGAGTCGAC TGGAATCGTCAGAGCAATGAGTGTATTAGATCGCGAGGCCCATTCAAGCT ACAATCTAGTAATTTAAAAATATATATATTACTAATAATTTTTGAATTGT AAATTTATATATTTTTTAATAGACAATAAGGGCTCAAGATAACGGTGGGA AATTTTCAACGGTAGCTCTTACCNATCGTCAGAGCAATGAGTGTATTAGA TCGCGAGGCCCATTCAAGCTACAATCTAGTAATTTAAAAATATATATATT ACTAATAATTTTTGAATTGTAAATTTATATATTTTTTAATAGACAATAAG GGCTCAAGATAACGGTGGGAAATTTTCAACGGTAGSTCTTACCATAACTG TCCTCSATGAAAAWGATAATACCCCAGAATTTCAGAATCTTCCTTTCTCG TTTCGAGTGACTGAGGGTACCTTAAGAGAGTTTGTTGGAGAAGTATCTGC 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TATCCGCGGGAATACTACCTCCTACATTGCTGAGGAATTCCTTGATCCTG ATCTTCCTGCAGTCCTCCAGGTCATACATCTTCCTCTTGACGACCTCCAG GGGGGTTTCACACTCCTTAAAGTTCGCTCTGATGCTTTTAACCGTTTGTT CTGAAATTAATGTTGTTAAAAGTTGGATGATCAAAAAATATACGTTGAAT AGCAGCGCATCTTTGATCTCACTCATTGAAAACATTATCCATTTTTTAAT GTTAGAGAGATGTTGTTGTCCCTGGACTTTTTTGTATCCAACCAAATCCT ACAACAACCCATAGCAACAGAAAAATCAGTGATACTACCAAAAAAAAAAG GTATAGTGGTGTTACAAAGTTCCCACAGATTTAATCTTTCCACCCTGTAT TATAATTTATAAGCAAAAAATGTCAGACTCTTACTCCAGCAATAGAATTT ACAGAATAACTAAATTCTTGATTCCGTTTCAAGATAACGGATACTTCCCA ATAATTTCCGGAAAGTGTAAAACCCTAATAAATCCCGTGATTTCGGAACA AAAACAATAGTAAATACAATTAATTATACTAGTAAAAATTAAATATTTAT CCTTCAAGCTATAATTATGAAGGATTATATGATGAATCATTATAAAATAT TTGTCTATACATAAAAAATTGGAGTGAGATCAAAAATAGGTATTGGAGCG TAACATTTATAATTAATATGTGCTTAGTACTAATATACCATTTATAAGTA TGTACTTTTCATCAAGATACAAAAGGTTTTTTGAGACTTTCGATGTTATC CATTTAAAGACAGTTATTAAGAGATGAGATGAAAATAATTAGGTAGATAT GACGTATTATATCTAACGTTAAAAATACTCTTCCATCATTCTTTGAAAAG ATTCCTAAGACGTTTTCTTTTTTTTCATTTATGAAACAAATTTATTACAA 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CCCTTTAATATAAGTTATATAGTTATTGGTCACTTCAATATTTATTTAAA AATAAGTTTTATATATGAAGATTTGGGTTGGGTGTATTTTGTAATTCAAT ATATGCAAAAATAGCAAAATAATAATATAAAATGTTGTATAAATAATTTT TTTCTTTAAATTTTTCTCTAAAAGTTGTTTTTTCCCCTATTTTTATCAAA TATGTCTTTTGACGTTTACCAAGTATCATTACTTGAAGACGGCTAAAATG AATTCCTCATTTTGACATACCTCTCAAGAAAATCAGAGGTAGTACTAAAA AAACGTATAAATAGCTCATTTATTTTATGATATCTAATGTATCAATAACT AGAGTTGTATAAAATATGACCTTAACCTTTTTGTAGTTAAAACTTGAACA GTATATTTTATTTTACTAAGGGGTTATGATTGAAGACAGACAAACAGCAG GGATTACTTCTGAAGAACAATATATATCAGACGGGAGCCTGTGTCAAATA ACTTATTTCTATCACATAGAACACAGCGGATGTTCTCTAGATGAGATTTC AAAAGTTATTATCACGGTCCTCTGATCCCTGCTTTGATTGCCGTAGAAGT TATTCCAAGCAAAATGATTAAGCAAGCTTCGAGAGTTAATATTATTCGTG AAGAGAAATACCCTCATCTATCGCAAGGCGAAGGTTTAATTCACCGATAG ACGTCAAAAATGGTTGAGGTATCGATTGTGGGAACGTCTTGTATTTTTAC AAACTAGTCTAAAGAGAGAAATCACTATTTTTGCCATAAGGATTTGGAGA CCTCGCTCCATATATTTTTACAAATGTGAAATTTTTTACGAATGCTTAAG ATGATAAACAAATAGATCTAGGTGACCTTTTAGGCGAGACTGATTGCCTC AGACTGGTTCAATGTTACGTCCCCACGATATAATGAGTGGTGGAAGATTG 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