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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s741 | supercontig | LSalAtl2s741:194615..214058 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011018 >EMLSAP00000011018 ID=EMLSAP00000011018|Name=EMLSAP00000011018|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1620bp
MKIASCFLLLSLGLLANSKPQGYGGGSYPGPVVEADPNLIDDVVGGSGGK GITDGGFIENNDPVEPEPSYGDGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXTCEDGEIVTDGGGLIDIRSSFAAVLDPASSKCPGYLEVC CRHPDFSTNSPQTTTPEPVTQPPKPRSYVPECGRRNVGGVGVRIQNDKYK GSTQFGEWPHMCALLEIQGVAYGENINKYVCGASLIAPGVVLTGAHCVDK IPKENIKIRCGEWDTQKEIEPSEHQDRFVEDLRIHPQFNPKNLKNDFALL FTEDDFKLAPHVDTICLPDNLAGIDSYDQNDCFATGWGKDKFGKLGEYQV IMKQVQMDIVNTTECERKLRRTRLGEDFELDKSFVCAGGEKDRDTCKGDG GGPLVCPLHREGNNDGYGVIHETKYVQAGIIAWGIDCGVEGNPGVYANVA DGLCFIHWATQCQTGIPKYFNITGCENWAPQQIESLKYDIHEHQKKLDYI SKDGSGTPSNLRNLNRRIKQAESILKSFEEKHSICIAASGYGDISQVTVE EVGRNEGNVVVDGFGXSNGIHSXQDGSFQDSQILDQDHFVGGYESIYLKM YLNMRNFFFLLTIAPLTYAKPQGYGVVNAEINVAKEDPNLINDIFRGSGG KGFRDSGLNENNSSIEPEPHYGDGGSHVNEVVDTSSEECAYYADQDYKCV PYYTCEDGEIVTXGGGLIDIRSSFAAVLDPASSKCPGYLEVCCRHPNFNT NAPVVTQTTTPEPVTQPPKPRTYKPECGRRNIGGVGVRIQNDKFKGSTQF GEWPHMCAVLKVQAVAYGEDINKYVCGASLIAPGVVLTGAHCVFNTLKES IKIRCGEWDSQNEVEPMIHQDREIKDIRIHPQFDSKNIKNDIALLFMEED FELAPHVDTICLPDNLAGINSYDQIDCFATGWGKDKFGKLGEYQVIMKQV NMDMVNSSECERRLRRTRLGEDFKLDNSFVCAGGEKDRDTCEGDGGGPLV CPLHREGNKNGYGVVQEPIYVQAGIIAWGIDCGLEAKPQGYSTENIEGSS YADLNLIDDIFGGIKPINDVYGGIEEPQPSYGDGGSHIKTTNVFPTTXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCEDGEIVTDGGGLIDIRSSFAAVLDP ASSKCPGYLEVCCRHPDFSTNSPQTTTPEPVTQPPKPRSYVPECGRRNVG GVGVRIQNDKYKGSTQFGEWPHMCAVLEVQAVAYGDDINKYVCGASLIAP GVVLTGAHCVDEHQDRFVEYVKIHPQFDHKNLMNDFALLFTEEDFKLAPH VDTICLPDNLAGIYSYDQNDCFATGWGKDKYGKHGEYQVIMKQVKMDMVN ATECERRLRRTRLGVDFELDKSFVCAGGEKDRDTCEGDGGGPLVCPLNRG RSNNDFGVVQEPKYVQAGIIAWGIDCGVEGNPGVYANVADGLCFIDWATQ CQTGIPQYYKIKGCENWALQQIQSLKYNIYDYQKRIDYITRNGSGTSFNL RNLHRRIKKSERVLKNFEDEHSICIAVSGYGEINQENIIDISGLGRTDGE GENFLDLTSINNKFIEVSYQ back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s741:194615..214058+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011018-706865 ID=EMLSAT00000011018-706865|Name=EMLSAT00000011018|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19444bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s741:194615..214058+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGAAAATAGCTTCATGTTTTCTATTATTGTCACTTGGTTTATTAGCTAA
TAGCAAACCACAAGGATACGGGGGAGGAAGTTACCCTGGACCTGTAGTGG
AAGCAGATCCAAATCTCATTGATGATGTTGTTGGAGGAAGTGGCGGAAAA
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TGATGGTTTTGGCTTMTCAAACGGMATCCACTCAAAWCAAGATGGMTCAT
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TGTATAATTATGAATATTCATATAACTGACTATAATTAAACGAGACCAAT
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ATATAAGAAAAGGATGTTAAAACATTGCTTGAATTGTTATGTAAACTTCA
TTTTTAAATTAATACTGTTGGTTTTTTGTTCTTCTATAATACATTTGTTT
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ACACAGGTTTTTATATCAAAAATATTTTATAAAAAATTTTATATAATAAT
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ATTTTATAGTAACAATTAAATCTCAAAGTGGTCAACCTGGGCCTCCGCCA
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TCCACACCATTCCCACGACTATCTTTAGGGGATATCCATCCATCTGGGAG
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GAGCAGGAAATGATGCCAAAGATCTCGTCATCTAAAAGGAAGGACACACG
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CCTGGATACCTTGAAGTTTGTTGTCGTCACCCCAACTTTAATACAAATGC
TCCAGTCGTTACTCAAACCACAACTCCAGAACCAGTGACTCAACCTCCAA
AGCCAAGAACCTATAAACCAGAATGTGGACGAAGAAACATTGGAGGAGTC
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GACTTTGAATTAGCCCCTCATGTCGACACGATTTGCCTACCAGACAACCT
TGCTGGAATCAACAGCTACGATCAAATTGATTGTTTTGCTACGGGTTGGG
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GTTTGGAAGGTAATCCTGGAGTATATGCCAATGTTGCGGYTGGMCTCTGT
TTCATTGACTGGGCTACTCAATGCCAAAATGGAATTCCTCAATACTTCAA
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TTACTCTACAAAATTACAACAAAAAGTTGAATACAATAGCCCTGGATGGT
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AGAGAAGAGCTTAAAAATGTTTGAAGATCAAGACTCTATTTGTATTGCTT
CTACAGGTTATTTAGAAAACAATATTAATTCTAACTTTTTAAAAAAAGAA
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TTATTCATAATATATTTATTTGTTGTTATAAACAGCTATAGGTGTGTAAT
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AGATATTTTGATATGTATAATATCAAATATGAAGACTGAACAACGTAAAT
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CAAAATTAAAAAAATCATAATAATAATAAAAAAACGGATAAAGACGTTGG
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TGCTGATATATTATAATATTGATATATCGGTTGGCTCTTGCCATATTTTT
TTTTCTAACCTTTTCGGCATGAAACGAGTGTCAGGGAAGTTTGTTCCGAA
ACTGCTTAATTTTGACCAAAAAAATAGTTGCATGTTTTGGCCAAATCCTA
CATCTCAGCCACCATATTCAACGGATTAGCCCCATGCGACTTTTTCTTGT
TTCCAAAACTGAAGAGACCTACAAAAGAAAAGAGTCTTGCAGCGTTTGAA
GGGATATAGACAGCATCGCTGGAATAGCACAAGGTTATATCAAAAAGTTC
TTATAAGAAGTGCTTCGAAGATTTGAAAAATGTTGGCACAAGTGTATTGT
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TATATATATTTTCCTAAATAAAAAAGTATTCTTACTTTTTGAACACGTCT
TGTATACGATGATGGTTTGGTTAATTCAATAAATGGTTTATGAAATGCTT
AATTGGAAAGTATTATGGTTAATCGTGGGGTTTTAAATGGTTGATCTTAC
TGAAAGTAATACTCCAATAAATATAATCAAATTAATTTAGTATTTCTCAG
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AACGCCAATTTTATGAGGCAACCCTTGGTTTTTAATATGTAAATACATTG
TACATATTAAATCCACGAACCCCCATAGACATTAGACAGGTTTAATGCAC
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CATTTCTATGGAATAATAGCACCACTGAAAATTAAAGTTCCAATAACACT
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GATAACTGGGAATCAGGCCATCCAAATCTCTTGTACTAGAATATCATAAG
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AAGTAGACAAGATACCATTTTTTTTTGACTGGTTCCAGTACCAACATAAG
TATTAGTGTTTTCATACTTTTTCTAATAAAATTATAAAATAATAATTTCA
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