EMLSAT00000011238, EMLSAT00000011238-707085 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011238
Unique NameEMLSAT00000011238-707085
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s76supercontigLSalAtl2s76:295282..309906 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011238 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011238EMLSAG00000011238-694004Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000050167EMLSAE00000050167-759095Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050168EMLSAE00000050168-759096Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050169EMLSAE00000050169-759097Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050170EMLSAE00000050170-759098Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050171EMLSAE00000050171-759099Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775994auto775994Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011238EMLSAP00000011238Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011238

>EMLSAP00000011238 ID=EMLSAP00000011238|Name=EMLSAP00000011238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=204bp
MPCLISNNILIKTFLGERFIRDLNDPDIILIYDVNGFISGLQNVVPSKLS
RNEFINMELNPYYQMDNAINGHVTTAYFIDPDRICTDGRSQIEFDSQGTG
YTLIFQKGLDLRQKKSFVEIPLIENEIQNSSNEWFEHGCWFNMGKHYAEF
NHKRDQSCDIYEHPHKFMLSHIVKKGPRCLYKGEKTLGISAMHIYFKSHK
LMCQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s76:295282..309906-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011238-707085 ID=EMLSAT00000011238-707085|Name=EMLSAT00000011238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14625bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s76:295282..309906- (Lepeophtheirus salmonis)
TAATGCCTTGTCTTATTTCAAACAACATTTTAATCAAAACGTATGTTAGT TACAAGAATGAGAACTAAGAGGCAATCATGATCAAGGGCACAATTTTCTT CGTCTGTTTCATTGCGGTAAAGATCCCTATTTCTTTTCTTTTTCAAAAAT GCAATTTTTTATTTATTTAATTCATTTTTTTATATTAAAATTAAATAGTT GATTCGTTTATTTTAAATTAATGATGATTACTGTATCATTTATCGTTACA AGTTGAATATCATAAATTGTGTTGTAAAAAAGGCATGGATTGTGTCTACT TCTGTTGTGTTTAGTGTTAAGGCCGGMATCCTGGGATTGAGTGACAATCA TCTTATAGAGACCTCCCCATTTAAATTAGTATACGTTTAAAAAAAATCCT TACAAAAATTATTATGTTTTGAAGTCGTGTCAAAAGTAAGGAATATTTTT AACCTATAGAATTCTGAAGTTCTAGAAATGCTTAAATAACAAATGAGGAT GTATACTTTATATACAGGAAAATGTCCAGTGAGATCCGTCGTCCTTCCGG GCCACTAGCTAGAACACTTTACATGAGCTAACCTAATTTATAATAGGATT ATTGAATCACAGTTAGGCTGCGTATTTGGGAGACCATTTTGTCGGAATCT TCCGGATAATGCACCCCAAGACTTTCATTAGAGAGTACCCTGGGGGTAAA CTTAGCAGTAATTTTATTTTATAAAACTGTTATCATTTTTTTTTATTCTT GTGGTGAGAATGGCTGAGCACAAAGTGTAATCACAAATGTTTGAGTTCAT GAACGACGTAGAGTAATACTGAGATTTGTTTGGGAGGGATAAGTAGAAAT GTTGAAAATATGAACTACCTATATGCTAAAAAAATGAGCTGAAAAATGAC ATGGTAGCTCTGACAATTTTGAAAATGTTTGGGGGAAGAACAGCTAAGCT GTCATGACAATTTATTAGTTTAGCTGTCTTCACATTTTATTAAATTATCT GTCAGCAGCTATAGGAGGGCTCGGAAGGAAATACACCCCAATTATAATCC GTAATTGGTAAATGTATCTACCAGAATTTCTTCGGCATCAATATTTCATT CTACTCCGAGCCCAAGAAGGACTTACTCTTAAAAAAATTCCAAACAAATT CTTCTTCTTTTATGGGCAAGTCACTTGATACTAATACGTTCCCTTCTCTC TCAAGAAGTAAAAAGATAATGTTAACAGCTTAGGAAAATAAACAACAATA TTCAAGCTGCGACAAAAAAATGATCGGCCTTATTAAATGTCAAACTTATT ATGAGTCTAGTAATAAGTTTTAGCTCCCATTGGACTCCTAAGTAGAATTG AGGATCGACATCGTTGTAATTATTGCCTTGTTAAATACGGAGGGGAATTT ATCTTTATGTCCTTGCTCTCATAGTACATACAAGTAATCTATTAAAACGT CATGACAGCTAGGCTGCACTCCTACCAAATGTTCTACAAATTCTCAGGGT TACAATGTTCATTTTCAATATCTTTTATTTTTACAAAGCTAAAATGTTTA CGATTTACAACTTTACTCAGGGACATGTGCAGGGGGTGGGATGGAGTGGT CAAATATCCAAATTTCCCAAAAATTTAATTCTTAAAAAAACATCCAAAAA ATTTATTAATGGAAATTTTCTTCTAAAAAAATCATTTTTGAAACTATTCA ACAAATTCAAAAAATTTATAGTTTTTGGTGTAAGATTTAAATTTTTCGGA AATTTAAAAAAAAAGTATAATTACTTTTTAAATCTAATTTTTTTTTTTTA AATTTTTTCTGAACACCATTGTAATTTTGAGAATTCTATACAACTACAGA TTTTTGAGAATAATTTTTTTTTAAATTCGTTTTTTTGTGAATAGCTGTAG 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TATCGACATTTTTGAAGTCCTTATTACTAGAGTAGAATCGTTGGAACCAC CGCTTTGCCGTTGCATTTGATACTATATTGTGTCCATAAACAACATTCTT TTTTGCCTTTTTGAAACAAATTTTCTCTTAAAACACTTTCATTTTGGAAT CCTGTAACACACAACTGGCTTTACCAAACACAAAACTGAACTTTTTTTGA AGTATACGCTTAACCTTTAAGTATACTGGATGCTCTTTTTGATGTAGTGT ATTGATCTTGAGATTTACCTCACTTAAGACATCCAGCAAAAACGCTCAGA CCTTTTTACTTAAACTGATACTAGCTTTAATGAAGGGCTGAAAGAAATCC AAATCCCATGTTATTTAAACGAGATCGGGGTAGGTTTGGACCTTTACATC TAAATATTTGAGTAAATTTGGGTGCCTCAACATTCGGGTCTAGATCTGAA TCCAAAATTAGACGGATCCTTGTATCGAATTTTAGTAGAATTTTACCAAA TTTTGAACTTAAAAAAAATGATCTGGATTAAAGTTACATTTTTACTGATT ACTGATGCCGTAACAATGTCAATGTTGCTTTCAGATTACAATTATAAAAA GAGCGAGAAATCCAATGTCATTAATTATCAGTTATTATTTGAATTATTGT TATAATAGCATAAGAATAACCAACTGCAATGAAATTGTTAATGTAGATTG TGCTCCAAGTAGTAATCTAGATAGACATAGTACTTTGCATCTATAAATAA TCATTTTTTTTCCTTGGTTTAGATATAAAGAAATATTATAAGCTTTTTAA GGGACAAAAAATCCCTTGGATTTTTTAAAAGATCCGTACAAGTTCGAGTA CCCGAAGCCTATTCAGATCTTGGGTATCGTATAATGCAAATTTACCCAAG AACTTTGGATTTGGATCAAAGACCTATCTTATCTTTATTTATCATAACCA 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TCGTTTGAAATATCTGATTATCTACAAAATATTGGTCTTAAGCGGTACAT TAACCTTTAACTTAAATTTGAGGTTTTATGTTTGATAAATGATATCAGTT TGTCTAAATGTGTATTTGTACGTCTTTTTGGGCAAGGGTTCACGCCAAAA TATATAAAGATAGACAGATCCATCATAAAATAAAATATATTGTAATACAC AACAAAAATACTGATTTTATTTCGTCTCAAGTTGCAAAGTGTCATAAGAC AATTATTTTTAAATGATTTTGGATAAATAAAAAAAAATTTTTTATTCATT TTATTGCCTGTAAACTTTAACTACTTGAAAAAGGTTTTTTGACGACCTAA TTATACATCAAATGGCATAAAGTTTTGTTTTCTTTTCCAAAAAATATGTA TAATGGAATATTTTTAACAAATTCATTGGTAATATAAGGACATCAAAATA TTTACTACAAAAAGATGTTTCCTGTTCTTTGCTACAAGTTCTTGTTGGTC CCTTTTATTGCCTCTTATAAACACACCTCTTAATATAAATTATGATCATA ATCCTTTTGATAGTTATGAACCAAAAATCTTGAGGCTATTGCAATTATAT ATTGATCAGAATCATTCAATTAAATAATAGTTGAGGTATTAATATTAATA ACAGTTCATTTGTAAATAAATTTATACGGTTAACAAATTACCCTTTAGTC AATTATATTTTGTATCTAAACTCAACGGTATTTTTCTTTAAAAAAAGAAA AAAAAAGATAATATTACTGTAAACACACATACCGAATTGTTTACAATGTC AAGTAATTATGTATGTCTTCACATAAAGTAACTACATATGTTATTATTTT TCATCACAAACAGTTCAAAATAGTTTTAACCCTATTCGTGGTGATGAAAA TCCGAGCTATTTTTTATCTCCCCCGGCTTATCGCAATTGATAATATGAAG AATGTTTTTTTCAGTTATTATCATTATTTTTTAACTCCTGAGTAGCGAAC TTCCTTGCCCAAAACATTCAGTTACATTCAAAACTTGATTAACAAATGTG TGTGTGCTCATAAAAGACAGAGAGTGAGTAGTGACCTTGAGGAATTTTTG GAGAGTTATAATTGTAAGGACTTTTTGGACTACGATTAGAATTGAGGCAA TACATTTGTAACTTTGAAGTTTATAATGAAGACATTCGCTTATTTTATTT TTCAATGAACCATTGATAATATACTTAGAAAATGCATGTATCCAGTTTTT AAGCCAAAAATTATCAAACTACTCAAATCAAATATTGCAAATCTAATTTA TCAAATAAATAACCAGGAGAGCCGAAATTAAATTTAAATAACTTGGATGC TAAATTGTGACATCTAGTAATTCTTTTTTTTCAGTTTGTCTAAAGTAAAT AAAATAGAGAACTCTTTTTTTTTTTTTATTCACCTCAAGTTTCGTTCAAA TATCTTGAAAATTGATTCAKAAGAATAAAATCCTAAAATTKCTGCCACTC TCCAACAAAARCCAAATTGTCTACAACAAAAATKCCTTCACAGTCGACAA GCCTCACAACAGTAGGAAGGACTGCTATAATGTCAAGAGTCGAGAAGAGT TCAGAGTCTTTGGGATCGTCTACAGTGACGGAAAGAGGATGCCCGCCCAT TGTTTGAAATAAGGACATCCTGTCCACGTGGAGGCCTACTATAAGATGCT GAATGCCAATTACCCCAAGGATGATTATTTCAGGCAGTAGGATGGAGCTT CTTTACCACTCAGCGAAGAAGAAACATGTCTTTCTCAAGTCCAAATTTGC CAATATCTGGGCCTCGGACATCTGGCCCTACCATCACATGACCTCAACCC TCTGGACGTCTTTTGTTGGTGCACCGTGGAGAACAAGTCCAACAGCTCCT 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