EMLSAT00000011338, EMLSAT00000011338-707185 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011338
Unique NameEMLSAT00000011338-707185
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s781supercontigLSalAtl2s781:8981..32530 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011338 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011338EMLSAG00000011338-694104Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000050669EMLSAE00000050669-759597Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050670EMLSAE00000050670-759598Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050671EMLSAE00000050671-759599Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050672EMLSAE00000050672-759600Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000050673EMLSAE00000050673-759601Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768857auto768857Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011338EMLSAP00000011338Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011338

>EMLSAP00000011338 ID=EMLSAP00000011338|Name=EMLSAP00000011338|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=481bp
MLYHRSSFVYLLLSLSFTAFNFSFVHSDIYHSPFPTPYGPRGGIHRLTQL
VPNEGQRRLEDDESNAIYVDNLTPEFHRYRGRRRRVFYRNPLSRLFPLFR
RQRKRRRNFRSNFRYRRHKGAIKARGRAYESDEMTAGGMLNSIGGSSSSC
NIAGDSREHRCTFTPACWIAGGSSFSGCSSVFYSCCILPEDPFRKDQFNN
RKMRQLRLETSRKIRLQNDPQCGLTKHNSFSKRIIGGKKAKFAELPWQVH
IRISGYQCGGVLLNHLHVATAAHCVHRNKLDQITVRLGEFDTKNTDKIDE
PLDSESFKVTKIRLHPEFRYMLTQPDRYDIAILELDRPVVYKDNILPICL
PTSDFSLTGKTGVVAGWGKTDNSFGKTGTHLLHKVLVPIIENEQCKHWHR
EKSIAVQLHDEMFCAGHEEGQMDACLGDSGGPLVINFDGRWTLIGITSAG
FGCAVEKQPGIYHKVSKTAEWLADHIHEVRK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s781:8981..32530-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011338-707185 ID=EMLSAT00000011338-707185|Name=EMLSAT00000011338|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23550bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s781:8981..32530- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTGTATCACAGATCCTCTTTTGTCTATCTTTTACTGTCCCTTTCATT CACTGCCTTCAACTTCTCATTTGTTCATTCAGACATCTACCATTCTCCTT TTCCTACTCCCTATGGACCACGAGGAGGAATACATCGACTCACACAATTG GTTCCCAATGAGGGACAACGTCGCCTAGAGGACGACGAGAGTAATGCCAT TTATGTAGACAATTTAACACCCGAGTTTCATCGCTATAGAGGACGTCGAA GAAGGGTCTTCTATCGAAATCCTTTGAGTCGACTCTTTCCGCTTTTTCGA CGACAAAGGAAGCGTCGACGTAACTTTAGATCTAATTTCCGATATCGGAG ACACAAAGGCGCAATTAAAGGTTATTTGAGGATGCTCTTCTTAAATTGAA TGGGATTTTAATGGCGAACATAATTGGGGTGTATTTTTTTCCTTTAATTT TCTTCATTTTGCAATAGTACAGACTCAACTGACCTTTATAAAAATGTGTA CTTTAGCTCGAGGACGTGCCTATGAGTCAGATGAGATGACTGCTGGAGGG ATGTTGAACTCTATCGGAGGATCTTCCTCAAGCTGTAATATAGCTGGAGA TTCCAGGGAACATCGTTGTACGTTTACTCCTGCATGTTGGATTGCAGGAG GATCCAGTTTTTCGGGGTGTAGCTCCGTATTTTACTCCTGTTGCATCTTA CCTGAGGATCCTTTTCGGAAGGTAAGTTCTTCCACATTCCTTCTACATCT ATGTGTTTGACCTTTAATTGACCGTGATAACAAAAACTCTGCGTGCTATT TCCTTCAATGATAGTGATAGTTTCCTTTTCTCTTTAGTCATTTCAAGTTC ATGACCTTGAAGCAAATATCATGTAAAATACATAGTTATGTATGTACCTA CATACAAAAAGAAATGCATACCCAGGTACTGACCAGTCCTTTACCCCCGA CATTCATAGGCTCATTTTGTAATCTATATTTCAATGTGTTATGTTCAGTG AATTCAATGACCCCGAATTAAAAAAGAGTTCATAATGTGTAATCATCCTT GCTGCTACTATGTACTCATTGCTTCATCGCCCAACTGCCACCAAAAAATA TAATAATTTGCATATTATATCTGCCTTTAAAAATATATTAACAATCCCTT TGGTTTAAGTCATTATGAAAAAAAATACGAAAATATTTTATATATATAGT GGATTGAAATCATTCTAATCACTTTAACCAAAGGCAAAAGAACGGACTAA TACATCCTACTCATCTAATAGTAATAATCAGTCATAATATATTTCATAAA AATATCTATGGTATTTAGATCCATATTTACTCCAACTCCATAATCAAATA ATAAAATTTTTCACTATTCTTGGCGTAAATCTAAGAATGAAAGACAAAAG TCATTTTTATTTTGACCTTAATTAAATAATCAACTTCTTTACATATATGT AGATCAAGGGTACCGACTTTCAGACATACAACGTTAAATGTATAAAGAAA TAGTATCAACATTTCTAGTCACTAGATAATTATAAATCTTTATGAACTCT CTCAACCTTCTCTTCAATATGTAAGAAGGGGAAAAAAATCTGGAATAAGT AAGTAGTTCAAATGCAGTTTATGCTTATTTGCCCCTCTAGAAAACCTATA ATTTTTAGGCCTCAGTCCACATTTATATTAGTTATATAAATACGATGTCT GGACTATTTGTATGATTTTGCACAGAACTACCAACTGCTCTTGATGGCAT CACAACTGTTGGATTATTCTCTATATATTCCTGATAGAAGGGATATTCAT AGAGAGAAAGATTTAATTCTAGTTCAACGGGTCAATATTTTAGTACACTA ATTCGAGTAAACATACCCGATTAAAATGGATGATGTAGGCATACAATCAG TTTATTTTCAATCTAAAAAGAGATTCAATAGGTATTTATCTGTTTTGGGA TTAAAATCACCTATAATTATTAAAATTGATCTATATGTATAATATCTACT AAACTTACCCACTTATTAGAGATGGTTTTTGGTCTGGCAATCCTAGACCG GCTTGATTCTTTCATAATTTTTGTTGGGCTAAAATAATTCAGCCCTTTAA AAAAGTAGTTTGGTTTGATTCGATTCCAAATTAAAAATCACTATAAGTTA GTCCAACAAAAAAAGTATCCGTCTTAATTTGTCTCATTTAAAATTTGCTC TAGACCAATTTATAGATGAATTGGTGATGATGTCATGTGTGACTTATACG AATAAACTATGGTGTATTACTCGATTATGTAGTTTTTTTGTTTTTTTTTA GTTTTTCGGGGTGTTCAAGAGGCTTATAGACAATTTGTGCAAAAAAAACA ATAAAAACATCAACGACAGTTGATCTATGTAATATAAAGTTATGTCCCTC ATATGAAACCGAAAAAATTGGTCCACAGAGAGAAACCATAAAAACAGTAT TCTACAGTTTGAAAACAAATAAATTTCAGTCAAATAATGATCCAAATCGG TCTAGAAAATAAACCTATCCCTAACAAAATAGGTCTGAGATTGTGTAATA ACACAGTTTGGTGTTATTACTTTTTTCTAAGGTCTGAAATTATAGATTTA AATTGATTTCGTGAATCTTTATGCTAAAAAAGTGAAGCAAACCCATTTGT AAGAATGATCAAGACCTCGTTTTACAACGAGACCGATCCCGACGGAACTT GGATCGAATTAGTTGGTACTACAAAAATGAGAACACAAATAAATACATTT GTAAAATTTTATAAAAGTGTTACGTTAGAAAATATTTGAAGCTGTGTTTT GAATATAGTTTTTTTATTTTGTGCACAACTATTTACTTCACATACGTAAA 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CTTGGACCGGTGAGTGTTTGTCCTGACAAACAAAACAAGCCCTCAGTGTA CACAAAACCATATGGAACAACGTCATTTAATCAGAAYCCCGATCGMCCTT GTKGGSCCMCTGCCTCTATCAAAGGGATATCGAGTCCTACTANNNNGTTG TTTTGGATAGGGCTACGAGATGGACAGAAGCACTTCCTTTACAAGACACT AATACAGAAAATAAAGCTTGTGCCTTTTTCGTGGCATGGATATCTAGATT CGTAGTCCCTCAGACCGTACACTGAGATTGGGGAGCTCAATTTACTGGTT CTCTATGGAAACACTTGGGACAACTCATCGGTTCGAGTAGCCTATTCCCC ACCTCGTATCCCACGGGGTCCAACGGCATTATTGAGAGGTTTCAAAGGAC TTTGAAGACTTCTGTCGGTTCACGAATGAGCCAGGAAGGTAAATCTTGGG TAGACACTCTTCCAACTGTAATGATAGGGCTTCGTTCTGCCATCCCAGCT ATTCCGGGATCAACATTTTCTCCAATGCACTACGTCTTAGGTKCAGCACC GAGGCTACCGTTAGCGTTCACGGAACGTACTGGTGCGCCCAATGATAAGA GCTTGGGCGCACCAATACGTTCAATGAGCTTCAATGAGATGAAGCATGCT CCACTAAGAGTTATCCCCCAGCCTCCACGAGAGTGAGGGCCGCGTTGGAA GCTCTTAAGAAGTCGGATCATGTTTTTGTCAGAAATAAGCCGATTAAACT ATCCCTGGCTCCTACATATTTGGCCCCTTTTAAAGTCCTGTCTATGTCCG ACAGAATCTTTACTCTGGGCATGGGTAATCTAACCGACTTTGTGTCAATC GACAGCTTGAAACCGGCTTTCGGAGTGTGGGATATTCTTCCTACATACAA GGGCAACTCTCAGTGATTAGAATCTGCATCTAAAATTATATACTTTTATT 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TTGAAAAGCATGTGTTCATTTAATTTAACACCGTGCATCAATTCATTTTA TGGGTACACATTTCATATAAGTATATAATTATAATTATTGATTTTGAAGA TTACATTTCTTGAAGTAATCTATTTTATTTTTAAAAATATATTATAATGG AGCTCAATTCATCAGTTCTAACGGAAATTAAATATTTATTCAAGATTTAT TTTGCATATTTCCTAGTTTAACTTTGACTTCACTCATTATATTAAAAAAA ATGTAAAATAAAACCTCATTTAAGGATTGAATTGAAATGTCATCTGGTTC TACTTTACAACAATGCTACTCAAACTTTTTTAGTCCAACTTGCAATAATG ATATTACCAAAATCCACGTGCGCTGAATTGAGTACCGCTGTTGGTCTTGC ATTATCCATAAATAACAATTAGACAGCACATTTTGAATTCTCTTGAGCGT ACTATTTGAGAAACATGGCTTTAAAGTCTTGTCTGCAAATTCTGAATTAT AAATTGACACATTATCATTTAATGTCCATTAATTATCATGTGATCAATAC TATTAATAATAAGTTTACAAATGTAGATATGATACAAATATGTATAACAG GATTTCAACTTTTATATATAAATTAGAGTTTCACCTGTCTTCAGCATTGT TGTTATAGACCATTGTGGAGGCATAACCAACCAAGTTTTATAACAATAAA ACACTTTTTTCATTCATATTAAGCACATAAAGGATTAATTGAGGATAGTT AAATATTGTATGTCAAAATGGACCAACAAATAAAACAACATAAACCTAAA AATCGATAAAAAAATCCCTTTATTGCTTAGTTTTAGTATACATTTGACCC TAAAATGTATTAAAAATATGTTATTACATCGTTATACAATTGCATTGAAA ATTAACTATTATAATCAAAATATTCAAATATTTTTCATTAATTGATTCTT TTCCCGATTCAATAAAAAAAAATTAATTAATACAAATATAATCATTTTAA GGATTTTAATACATATTATTTTTTATCAAAGGCATCGAGGTGTATTTAAT AAAAGTGTTATGTCTTTTTTTAAAATTCATAAAGTCATTTGATAAATTTT ATCAGGATTTATTTTAAATTTATTCATATTGTGTACAAAAAAATATCAAC TTTGAGCCCTTTAGTCTCTTTCAATGATGATTCAATTTATGACGTTAGTG AAAATATTCAATGCATAATTTCAAAATATATAAGAGAATAAAGATTTACT TTTAAAGTTAAATGTATATTTTACAGAATGTCTACAAAAATATATAGGGA TTTAAAAAATGAAAATATGTATGCATAATCTTTGTACAATATAGATAGAA GAATGTTGAGTATTAGTTTCTGATTTGGTTTTTCTCTTTTCCAACATTAA TGGTATTATTGTGTATACAATTATTGTGGATGACAAATACTTGTGGTTTT TTTGAATGAATTCAATTGCTAAACTAAGATGTGTAATTTAACATAATATT TGTTATTTTGATGCTATGTAGCGTTTTAAGATTTTGGACACTTACCAATC AGTTTTTAGTGGGCCAAATAAGTCAATCATGCCAAGGGCTATTTATTTCT TAAGTATTCCTAGACTATCGTTTACATATTATTTCTCCAGAAATTTTAAA ATAAACTATTTTGATACATTTCATAATATTACAATTATATAATGGATTCC ATAAAATACATTATTAGGTATGATGTTGCTTATAAATATTTTATTAAATG CGTAGCCATACATTTGTTTATGGATTTTTTTTTCATAGAACTAATAAGAT AACTAATATATTTATAAATAAATGAGGTCGGATCAACAAAAAATTCTATT TCTGTCATTTTGGAAATGGATTAAAGGAATAGTAGTATGTAATAAATCAT GCAATAGCCTTGACGTATCAATTGAGACGAGGGAATCCACAGCTTACAAA GGTAGCACTTTGGGGATCGATTTGATGTCCGATATAAAGGACCGATAWTC TTAMCCTGCCGTGACGAGATGACATTTTGTGTGAATAAATATATACTCGA ACACTTGAAGTATTTGGATACCTATTCATTAATACTGAGTGTTATTTCTG TAGTACAGAAAGATATGAAAACTTTACACCTACACCTCAGTTTTATATCT TGTGTTCCCCACTCTTGGCATGCTATTAAAGGAACACTTCGGATACTATT TTACAATAACTTCTTTTAGAAATCTCCATCAAGAAGTATAAAATAGTAAA TATATATAAACCTATATTAACATTTTAATAGAATTAGTCTTAGGTAAATT TGTCTTTAAAACTACTCATTGTTTGTGTTTTTTGTTTTAGTTATTATTTT AGCCAAACATGTTTTTAAAGTGTTGATGCTTCGATTTATTTTAACATATA AATATGGCTTATGGGTCTTTTATTTAACAAATATTAAATGTAATTACTTT AGTGCAAAATATTTACAGCTATATATATTATTCGTTTTGATTATTTTAAT TGTCTCTGTATATATTCATTTGTTTTGCGAAGGGTATAATTGNNNNNNNT TCAGTATTTCAAAATGTTTGAAATAAAATTTGTCTATGAATAAAAATATA TTTTATGCTACAAATCCTAAAATCCTTAGTATAAATATTTCAAATAACAA GAATTTATAATAATTATGATAAAGGTAATGATGATCTTAGTATAGTTTTG ATCTCATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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