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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s781 | supercontig | LSalAtl2s781:8981..32530 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011338 >EMLSAP00000011338 ID=EMLSAP00000011338|Name=EMLSAP00000011338|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=481bp
MLYHRSSFVYLLLSLSFTAFNFSFVHSDIYHSPFPTPYGPRGGIHRLTQL VPNEGQRRLEDDESNAIYVDNLTPEFHRYRGRRRRVFYRNPLSRLFPLFR RQRKRRRNFRSNFRYRRHKGAIKARGRAYESDEMTAGGMLNSIGGSSSSC NIAGDSREHRCTFTPACWIAGGSSFSGCSSVFYSCCILPEDPFRKDQFNN RKMRQLRLETSRKIRLQNDPQCGLTKHNSFSKRIIGGKKAKFAELPWQVH IRISGYQCGGVLLNHLHVATAAHCVHRNKLDQITVRLGEFDTKNTDKIDE PLDSESFKVTKIRLHPEFRYMLTQPDRYDIAILELDRPVVYKDNILPICL PTSDFSLTGKTGVVAGWGKTDNSFGKTGTHLLHKVLVPIIENEQCKHWHR EKSIAVQLHDEMFCAGHEEGQMDACLGDSGGPLVINFDGRWTLIGITSAG FGCAVEKQPGIYHKVSKTAEWLADHIHEVRK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s781:8981..32530- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011338-707185 ID=EMLSAT00000011338-707185|Name=EMLSAT00000011338|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23550bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s781:8981..32530- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTTGTATCACAGATCCTCTTTTGTCTATCTTTTACTGTCCCTTTCATT
CACTGCCTTCAACTTCTCATTTGTTCATTCAGACATCTACCATTCTCCTT
TTCCTACTCCCTATGGACCACGAGGAGGAATACATCGACTCACACAATTG
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CGTAGTCCCTCAGACCGTACACTGAGATTGGGGAGCTCAATTTACTGGTT
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TAGACACTCTTCCAACTGTAATGATAGGGCTTCGTTCTGCCATCCCAGCT
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ACAGAATCTTTACTCTGGGCATGGGTAATCTAACCGACTTTGTGTCAATC
GACAGCTTGAAACCGGCTTTCGGAGTGTGGGATATTCTTCCTACATACAA
GGGCAACTCTCAGTGATTAGAATCTGCATCTAAAATTATATACTTTTATT
AAATTCATATTTTGTATGGGGAAATATTATAGGACTTTTACGAAAAGACA
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CCCCCTCCCTCCTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATATAAATTAATGATTTGTTCATAAAATCAAATGATTTAATTGATAATGA
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TTGAAAAGCATGTGTTCATTTAATTTAACACCGTGCATCAATTCATTTTA
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TTACATTTCTTGAAGTAATCTATTTTATTTTTAAAAATATATTATAATGG
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ATTATCCATAAATAACAATTAGACAGCACATTTTGAATTCTCTTGAGCGT
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AAAATATTCAATGCATAATTTCAAAATATATAAGAGAATAAAGATTTACT
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TTTGAATGAATTCAATTGCTAAACTAAGATGTGTAATTTAACATAATATT
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AATGGGTATATTTAAAATTATATATTATATCTATACTTATTATATGTGAA
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AAGAACGATGGTTTCGTTGCTTGTGGAGCACGTAGCACCATCTCATTGAA
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AAGCTATTGAGAGAATACCACATATACTTTGCGATTCGGTGATGGAAAAT
ATCATAAAAAGAATACGATCCTGTAGAGTAGATGTGGCAGSCATTTGCCT
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TTTTTCTTTGAATATCAAAATAATACCTCCTATTGCAAAACCCTTCTTTA
ATTATAATTTGACTTTAATTGAACTATTTTGTAGTCGAAATGAGATCACA
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AATGAACATTTTATTAAAAAAATTGAGTAAACTTAAAAAAACATTGATTT
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AATTTACTCTTTTTGTATTTTTCCCATTATTTTATTTTTTTGAGAGCTTA
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TTTACTGATATTGATGTTTACAATATTACGAATTTATATGTATAAGGCAT
GTACATACTAGTGTTGAGACTCGGTCCAAGACTGTAGACCGAAATTGAAT
CGTTTTTAAATCGTAGATGAATTTATGAGTTGCCCAAATATGACTTATGT
TACAGATTTAACTTTATTTGATATTACTTTAGATCGATATTCACCATTAT
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GATAATTTCAGTGAACTTATGCTGGAATAAAAGGACTCCGAAAGATAACC
TGTTGAATTTAAAATAATGCCGTTAATATGTAGAATTAATAAATTAGATT
AGGCCGGTACTACGAAGCAGAATGGAGCTCATATACTTCAGAGAAACTTT
GATCGATATGAATTCATGATAATGATGACTTCAACCGGGATGAACGAAAG
AGAGTCATTAAATCAGGACTCCCATATTTTTTTAAATTATACCAGGTGTG
GTTGGTTTTTTAGAATTTGTTTCTCCAAGCTATTTACATGGATTTGAAAA
ATAAACCAACCCGTTCAGGGGTTAAATGATCGAATGAATTCGGTCCATTA
AAAATCAGAGCGTCTCAAACCGGTCTAGGATTTTCAGACCGAAAACCAAT
AATATTATGTAGATCGTACGTATTTTTATATGTAATATGTGTGTTAAATA
TTGAAAAATGTATTATTAAATTAAAAATAAATGAACATTCATTTAATGTT
AAAATAAAGGGGAAAATTAAAAGTTGTATACAGAACCTTCAATAGTTAAT
AATGTCAAATTTATGAATGGAAAGTTAAAAAAAAATGCCATTATTTTTTA
AGCAAGTTAAAATACAAATTTATTCAAAATAATTCTTAGTGGACTACATC
TTATGAAAATGAAATTTATATATTTATCACTTTGATAAAAAGATAATTCT
GTAAGTACCTAATTAATAGAAAATTAACGTCATTTTGATTGAACCAAATA
AATAAGGTTATATATATTTATATATTTTTTTGCAATACTGACTTTTAAAA
AAGTCCAAGGACAGCCCTGCTGCTTAGAAAGCCCTTTTCAGATCAAATAC
TTTTATACTTAAATCTAAGACACTCTATAGGTTCTCAATGTATCCTTATC
TTTTTAATGATGCCTTAATGCTTAAGTCTGAAATCACTGGAGGGGTAATT
CCTGTATCTCTTTGTTTCTTTCAAATTACTATAAAGATAATTTATTATAT
AGGTATATATTGATATTGGTGATATAGCCTCTTCATCCTAATATGACCAT
ATAATGGAACATTCTTAGAAGAGATGGAACAACAAAAATGTACAAATAGA
TTAGTCGTTATGAGAAACATATCTATATATGATCCCTCTTTTCTGTAACA
AAATTTCTTGTGAATACAAGACACATTTTCCTGATGATGAGCCTGACTAT
ACTACATAACTTTTTACCAAATTTATATTCTTCTTGGACAAGTATATATG
AAGCTTTACACATCAATTTTTTTAGTAGTGTCAGCAGCAAATAAAGATTG
ATCCTTTTCCGAATTTAAACATGAATTATTAATTTTCTGAGGATATCGTT
ATTTCAAATTCTTCATAGAATGTACTTACTAATTAAACTAATTTATATAA
CGTTTGTGATGGTGCAAAAGGGGCACTCAAGTCTATTACATGTATTAAGG
AATCCATCATTTGAGTTGTCTTGATATTTAAAGTGTAAGTAAAATAAGGC
CTACAAATTTTTTAATAGCCTTTAACCATTTATCTCTCGATCACTCCTAG
AGAATAAAAAATACACATTATGGTATATGCAGGCTTATGAACGGAATACA
AAATTGAACAGCATTACATGAAATGCATGATTCAATGAACGGATCTGATT
TTTTTTTAAGCGATGAACCCTAAAAATAAGATTTTAGCCTTCCGTTACAA
TAGGTGATAGTAATTTTGGAAGGGATGTAGTTGTCCACGGGATAAGTACC
CTAGAAATACTACTATACAAATTCAGGGGCAATTTTTGGAAATTGGGAAG
GGACCTAAAGCTTCACTCCTGTAGATTTCCCTGATATTAATATTCATGTA
AATGTGAATTAACCACTCCTAAAACTATTATTTATATCCCTTTTAACAAG
TAATAATTTAATTTATCTTGTAATTAATGAAACACATTTCAAACTCTTTG
TTTTTTTATTTTTCGCTGTAATTTTTCGTATGGACTTCATATTGAGTGAA
TATTTCAGTTAGATAATATGTTGAACGTTAGTGTTTGTAATCAAGGTTAA
TTTTATTTCTATTAATCTTGGCTACAATTATTTTTTTCAATGCCCTCTAC
ACGTTGGGGTTTAGTTTTAAAAAAAAACCATTTCTTTTCATGAAAAATAC
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