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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s800 | supercontig | LSalAtl2s800:399883..413388 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011600 >EMLSAP00000011600 ID=EMLSAP00000011600|Name=EMLSAP00000011600|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=954bp
MWAATRKGLIPLNTKLLKRLYSIPPHRLDVLFPPTADFPARHIGPRKSEA KEMLEFIGLKSLNELTDKVIPDNIKLRSEXLLEEPYSEEGLIKRIKEIVS KNKIWRTYIGMGYYNTSIPHTIQRNIFENPGWTTQYTPYQPEIAQGRLES LLNYQTMISDLTGLEVANASLLDEGTSAAEALGVCFRQNKRLKFFLSDKL HPQTISCVTTRAEPFGIELVVGNVSEADFSNKDYSGVLFQYPDTEGNIFD FDGVIQRAKDNGTMTVCATDLMALAILKPPGDFGIDVAXGTSQRFGVPLF YGGPHAGFFATRTKFVRLMPGRMXGVTKDVDDKHCYRLALQTREQHIRRD KATSNICTSQALLANISAMYAVYHGPDGIREISRRIHSAARLLARGLRES GNELENALYYDTLKVLPRLDPLEIKHRAAEKKINLRYYNDGCVGVSLDET XRRKDLKDLLWVFASPKTLLQVAEGCEELEDDIESTPFCRKSAYLTHPVF NTYHSETEIVRYMKKLENKDVSLVHSMIPLGSCTMKLNSTTEMMACSMEG ITNMHPFAPSEQAFGYRQLFEELERDLCEITAXGXXAGLXAIKSYLEHNG QPQRDACLIPLSAHGTNPASAHMAGMRVVPVGIDKDGSIDMEDLKKKIIE NKDTLACIMVTYPSTNGVFDATISEICQLVHDNGGQVYLDGANMNAQVGL CRPGDYGSDVSHLNLHKTFCVGPTCVKSHLAPFLPSHPVILTTTASYLGK KSKPFGVVSAAPYGSAAILPISWAYIKMMGARGLVRATQIAILNANYMSK RLENHYTTLHTGYDGLNAHEFIIDARPYKKTAGILAVXIAKRLXXFGXLK IIXVFCDALICIRNEIRDIEEGRIDWTNNPVKRSPHTLAQIFDSHWDRPY SREIAAFPAPFVQSDNKLWPSVGRIDDVHGDKNLICSCPPIESYVSPHIV HKQS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s800:399883..413388- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011600-707447 ID=EMLSAT00000011600-707447|Name=EMLSAT00000011600|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13506bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s800:399883..413388- (Lepeophtheirus salmonis) CCTCCACTCTTGGTAGAAATCAATATCCAAGTTCGTAGTATGGGACCCAT
TTCTGAGGTAGACATGGTAAGAAATATTCACTTTTTTATATATTAAGTCT
AATACACAATTACATAATTAAAACATAACTTTAGAGTTACTCCATGGACT
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TCGATGTTGGGGCGTCCGTAGCGGAAGCACTGGAGGGGCTGTAGCCTTCC
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GAACTTCATTTCCCTATTTAAATTATGCACTCCACTTCCTGACATCCTAG
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CCAACGCTTCACTTTTGGATGAAGGTACCTCAGCTGCTGAGGCACTTGGT
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GACCATGACCGTCTGTGCTACAGACTTGATGGCCCTTGCAATTCTTAAAC
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TTTTGCTTCACCCAAAACTTTACTTCAAGTAAGCTCTAAACTTAATGTTG
AGCTAACTCTGAATTGAAATTAGATATATTGTTAATAGGTTGCTGAGGGT
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TGCATACTTAACTCATCCTGTTTTCAATACTTATCATTCTGAAACCGAAA
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TTCTTATAATTTTAGATTATAGAAAATAAGGATACTCTAGCATGTATTAT
GGTCACTTATCCGTCCACCAACGGAGTTTTTGATGCTACAATATCTGAGA
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AATATGAACGCCCAGGTTGGTCTTTGTCGTCCGGGAGATTACGGCTCTGA
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GCGGKCCTGGKAATCCATCAATCCTAATATGGGTTTCTTAATATATAAAT
TCGATATAATTATATAATAGGTGTTGGACCAACCTGTGTTAAATCACACT
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TATCTAGGAAAGAAATCAAAACCCTTTGGTGTTGTTTCTGCAGCTCCATA
TGGATCTGCTGCAATTTTACCCATATCATGGGCTTATATTAAGGTAAATT
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TTGCGATGCACTCATATGTATACGAAATGAAATCAGAGATATAGAAGAAG
GACGTATCGATTGGACCAATAATCCTGTTAAAAGATCTCCTCACACGCTA
GCGCAAATATTTGACTCTCACTGGGATAGACCTTATTCTAGAGAGATTGC
TGCTTTTCCCGCCGTAAGTCAACTGTTCATAATTTTTTTACAAACCATTT
ATTTTTTGTTTTTTTCAGCCATTTGTTCAATCTGACAATAAGCTTTGGCC
AAGTGTTGGAAGAATTGATGATGTACATGGGGATAAAAATCTTATTTGCT
CCTGTCCACCTATTGAATCTTATGTATCGCCACACATTGTTCACAAACAA
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