EMLSAT00000012220, EMLSAT00000012220-708067 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview


Name	EMLSAT00000012220
Unique Name	EMLSAT00000012220-708067
Type	mRNA
Organism	Lepeophtheirus salmonis (salmon louse)

Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
LSalAtl2s888	supercontig	LSalAtl2s888:275577..293332 -

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
ensembl	2013-09-26 .965016

Properties


Property Name	Value
Logic name	ensemblgenomes
Biotype	protein_coding
Evidence	IEA

Cross References

External references for this mRNA


Database	Accession
Ensembl Metazoa (transcript)	EMLSAT00000012220 (primary cross-reference)

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
EMLSAG00000012220	EMLSAG00000012220-694986	Lepeophtheirus salmonis	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
EMLSAE00000054798	EMLSAE00000054798-763726	Lepeophtheirus salmonis	exon
EMLSAE00000054799	EMLSAE00000054799-763727	Lepeophtheirus salmonis	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
polypeptide-auto775960	auto775960	Lepeophtheirus salmonis	polypeptide
EMLSAP00000012220	EMLSAP00000012220	Lepeophtheirus salmonis	polypeptide

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at LSalAtl2s888:275577..293332-

protein sequence of EMLSAP00000012220

>EMLSAP00000012220 ID=EMLSAP00000012220|Name=EMLSAP00000012220|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=133bp
VDDCQNYQDQVCETVQKRECNNKQERQCEDSFRTVSESYTEDECRDESVR
ECEKAWQVNGAGEKIWADDPSTCIQVKKTKCSPVSKQRSRQVPDQKCQTV
NVPVCRNVPKQECRSVTKQRCEKKPVEECNNVX

mRNA from alignment at LSalAtl2s888:275577..293332-

Legend: polypeptideexon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>EMLSAT00000012220-708067 ID=EMLSAT00000012220-708067|Name=EMLSAT00000012220|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17756bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s888:275577..293332- (Lepeophtheirus salmonis)
GTCGATGACTGTCAAAACTATCAGGATCAAGTCTGTGAGACTGTTCAAAA
GAGAGAGTGCAACAACAAGCAAGAAAGGCAATGTGAGGACTCCTTCAGAA
CTGTAAGTGAGTCCTACACTGAGGATGAATGTAGAGATGAATCCGTGAGG
GAATGTGAAAAGGCTTGGCAAGTGAATGGAGCTGGRGAAAAGATTTGGGC
TGATGATCCTTCTACATGTATTCAAGTAAAGAAAACCAAATGCTCTCCTG
TTTCCAAACAAAGATCACGTCAAGTCCCGGATCAAAAATGTCAGACTGTG
AACGTTCCTGTTTGTCGAAATGTTCCTAAGCAAGAGTGCAGATCTGTGAC
AAAGCAAAGATGTGAGAAAAAGCCTGTAGAAGAGTGCAATAACGTGNCCT
AGGCAAAATTGTCAAAACATTCACAAACAAGTTCCCATGCAGGTGACACG
CCAGGTCCAAGTAAGAGAATGCAGTGGAGGATCAGGTCAAGTAGGAAATG
GACGTAACATCATTGACCGCAACAATGATCGTAATACTCTTGGAGGAAGC
GGCATCACTGGAAGCTCAAGAAACTCTTGATCTCGAAGAAAYAGCAATAA
TAACTCTGGAAGCAATTTCCAAAAGGCAACTGGATATTGAAAAATCTCTT
TTCTGTGATAGAAATTAACTTGTTATTTACAAACATATTATCTATGTTAT
TACGCTTACTTATTCTCATAGAATACCAAAATATATTTATAGTTTTCCAC
TTAATTTCAATATATACGTGATTAGTTATTAGTCTATGAAAACTGGGGCT
TATTAAAAAACAAAAAATTATGTAATGGTGAAGTTCATAAGTAGGTACTT
ATCCTCCTAAATTGTCTATACACTTTTTGGACGTAATAACGTGAAACTTT
TAAATTAACACATTACAGGGGCTAATTATTTAGGAAAAGTTATAGATCAT
CCAGGAATATAATTTATCNAATTATTTCTCAAATAAGAGAATCATATTTA
TAAAATAATCTTAACAGATCCATGAGMCCCCGAAAGGAGCCGGTAAATTG
ATTAACCTAAGGCATTCAGATGTAATAAGTTATAAATGACTTAGAGACAT
ACTTGTTACTAAATTCTTGTATTCAATCTTGAAAAATTATATAAATATAT
TCAGATAGGTTAATTATCTTTTTATACGAACATAAATTGATGGAAATACA
TCATAATTACTAGTATAATACTATTATTTGCGATAAATATAAAAGCAATG
TGGACTTTGCCTAATATTACATTAGTAATATCCAAATTTCGCCTTTCCCT
AACGCTTTAAACAAGAAAACATGAAAATTGTTAGGACGGGTGAGTTGATA
CACTGGGAGATTTGAAACMCTCCCTTTTTTTTTTTACAGACATACCCTCT
TTGCTCATCAATATTTGTCAAGAATATTTGTGTTAGAATCAATCAATGTT
CCTCTCTGAAATACGATTTCTTATGTTTTTATTAAATAAATTGACATAGT
ATCTCCAAGTATCACTCGAGTACAAAATTTGAGAGCCCACTATCATAATC
TGAATATATCTTATTTAACCAACAACCAATAATGAAATACTCTAGGACAG
GAGCTCCGGTCATATCCATACGGATTTAAAATTATTCTATTCATAATTAA
GATTGATATATTTATGTTTTTTTCCAAGGGCTAATCAATAAAAAGTAAAA
CGCTTATAAAAGTAAAAGTTTATATAATTTCTCGGAACGACCACAGACTG
AAACCCACATTTATTAATGTTATTTAAGCCGTAGAAAAAGAATATGAACA
TTAAAAGTTTCAATCTATGAAGGTTTGGCCTTTAAAGCCTATTTTTAAAA
CTAAGATTCAGTGCCATATTTCGACATAAAAAAACGATATAATGGAATCG
CCATAGCTCATGAACAGCACACTCGGGAGTTATTTTCTTCAGCATGATGT
GTGTATGCTTCACGCCCCGGTAACTCTTAGTGAAAGAAATATCCTATAAA
TATACGGATTTCACCAAAAGATTCCTATGTGAAGTGGAGTAATTGTAAAA
CTATAATGTTCACTTATACTTAATCGGTGCAATTCCATCTAACCAACTAA
AGGAACATTAAAAAAAATTATATGTAAAAGAATTAAAACAAGTTAATAAA
TGCTTCATATTCAAATTAATTGATTTTTATTTACTTACTGTGAATTGTTA
TACATTAGTGAAGCATGACATCTAAAATGTGTAAAAGTAAAGCCGATATA
TAAAACCATATGTAATTTATTTTTTCTTCGGAATATTATTGTAGTTTATA
TTTATGCAAACTAACCAGCTTATTATATTTAATTTTTTTAATAAATATTA
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ATACATTTTCGGGAGGTCAAGGTTGCACCAAAAAATTACCATAAGTGGAG
GTTTTGTGCTCTACCAAATGCCCATTCTTGTTTTAATCATAAAACAACTC
TCAAAATTCATTTTTATATTATTTTAGACATTCTGTTTAAATCTTTGAAG
ACGGAAATTCTTACAAAACTTTGAAGAGCAGTAGAACCCTCCATACGATG
CACATTTCTCTTTTTTTACTATTTTCGTAATTTATGAAAAATTACAGAAA
TTTTGATGCCCCTCGTGTTTGTATAGCACAAAAAAATACATTAACGGGAC
ATCCTACTGGGTATCCCCTTGCTAGTACTTCTATGTTTATAGAGTTCATA
GAAATAACTTATCTATTGGTTCTTTCCACAATTATTATTGTCCTAAAGTG
TACAAGTCTGATAGATGTGGAAAAACATTTACTATCTTCATTGTATGAAA
CAAGAAAGAAAAAGGCCCATAGTTAGAAAGTAAGACGTTGCTTTAATTAT
TTATCGTAACAGTGGGCCTTTTCCCCATTATATTTATATTAGGAATATTC
ACAGATTTTCGATACATCATTTGAATTCAGAAAATTAAACTTTCTAACAC
TAATAGTGGTTATTTGTCGAAAAATCCATTAATNAAAAAAACCTAATAAT
TCTTGCTGATGTGGGGATACCACTGCGACAAAAATTAAAAAAGAAACATT
ATCTAGATGTTAATCATTAAGGATTATTGCGCAAGGGTATTTAATTTGAT
CTGTTGTATTATATTTAGTGTTGGATCGGTCTAAAATTTGAAAAGAATTA
AGTTTTATAAGTGCGGTCCTAATAAAATTTGTCAGTCCTAGGACAGTTCC
TTATCGGTCTCTTACTGTAACTACAACGACGGAAATTAGAGAGATACTAG
CTATGTCCTTTCATCTATTCAATATTATCACTTTCAAGAGACAAGATAGC
TGAAGTGTGAGGGAGGGGTGTGGCTARAAMTTGTTATTTTATGTTYCAGC
TAAAATGTATTATTTTCTTCTTTTTATATTATTTAATCCTAACTTTGAAT
GAAGAATAGTTATATAAATAACTGTTACCGTAGAACTGAAGGACCAGGTA
TCGGTGCTTAGGACCATTGAATGGTAAAAAAGATCGTACCGATAAAGAAA
AAAAAAAGGAGKGGAAAAAAAAGAATTCCTAGGACTTATCCAGTACTAAT
TAGTTAATATCGTTTTTATCTTGTGCACTTTTTTATTTTTCAATCTTGCA
TAAATAACTTATTTATCCATAACTCTACAAAAATGATATAAAGTGTACTT
ATAATGGATAAATCTGTGATTAAAACTTCCACTAGTTACTCTATTGTTAG
GTTCAAATTGTAACTTCTATACAATTGCGAGTTGCACACAGCAATATGAC
TCGTAGATCAAGGGCAAAAGTGTAGAAAACTTTACTTGTTGTCAAAAATT
GGATTTTTGGTTCATGTTATTGTCTGTTTTTTGTACAAATTCTCTATATT
TGACAAAAACTGTTCGGAAATATTCAAAAAATATAGTAAAATCTCTTTTG
CAAATGGGTGTAGCTTAGTTATAAATATTTTGACTTTGAAGGCAGTGTGA
TATCACAAACAATATTTAAGAAGATTATTTTTAGTCGACAGAATTTATCC
TATTTGTCTCACTGTTAGATGTCAATTTTTCCCCTTAACAATTTTTGAAG
TCTGAATGTTGATTGAATGAATTTGATGTGCCCATTGCTAAGCTGTGAAC
AATTCCAAACAATTTTTCGAAGGGGAAGTGATTGCGTCCAGACGCCGGAA
TTTGTGACCAGAATCCATCAAATCGTCAATGAGGGCCAAGGGAAGTCCAT
CAGGGCAATTACTCGAGAAGTTGGTTGGTCAGAGTAACTGATCCTGCTCT
GAATTAACAAAAACCTTCGTTACCACTGATATAGATGAGAAAGGGGCAGA
TTTTGACAAAAAAAAAAGCCAAGGAGAAGTGCTTAAAGCCCTCTCAAAAA
CTCCTTAACCGCCTCAAGCATCCACTTCATCGAAACAGGCTCTTGTTTTT
CTCGGATTGCAATTTTTTTTACAAAGACCAGAAATTCAACAACCAGAACA
ACAAGTGGTTGGCCTTCTGACCTAAGTATGTAGCTGTCGTCGTCGTCATG
CAAACGAAGTTGCCAGCCCACGTCATGGTGTTCGGACTGGTTAACTCAGA
AGGTCACATCCTCATTTGTGCCTCCCAGGTCTCAAAGTCAATAATGATGC
CTACCTTGAAGTGCTAGAGACCAATGTGAATGCCTGGATTAACATGGTTG
CCAATAAGAGGCCTCACATGTGGCAGSAAGMCNCGSCYCCCTGCCACAAC
TCGAAAAAAGTTTCAAATGGCTCCAAGATCAATTTGACGACTTCATCAAG
TTACAGGGGGACAGAAAAGATTATTTACTTACAATGATGGATACTTAGCA
ACATCACAAAATGAAGATATAATGAAAAAAAGTCATTATATTATTTAGTC
AGAAACAAATATAATGTCGATGAAACATAAGTATTAATATTGTACATTAT
ATGTATATTCTACATGAATATTAAGAGCAATAAATCAGTTAATAACAGCA
CATTTCTTTATTTCATATACATATATATGCACTTCTATAGTATCAAAAAG
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TGGAATACATACTCGTACCCTTATAACCAAACATTGAGCAATATAATAAT
ACAGAAAAGCAAATAAATGTTAATTTAATATTGATGCACTTATATACAGT
TACTTGCACACAAATATTTTCAATGTATGTACAAGTACCCTTTCTAATTA
TATTGATGGAGATAATTTATTCATAATTAATTGTTTATTTTAATAATAAA
AAAATTAAACATTGAGATAGAGTCCTATATAAATTATCATGTATCGGTCC
TGCCTGGGAACTGTCCTAATTCATAGGAACGTGTCCGAATCGGATATAAA
AACCGTCCAATATAAGATGACAAAAGACAAGGTATCAGGTGCGTCTGCAG
GGCAGAACTCCAGCTCAAATAAGGATTTTTTTTTATTCGATAATTGTGGA
TTTTTTTTTTGAAGAATTATTTTCTTAAAAAAAATTTATTTAGGCAAATT
ATGAAAAGGGAAAAAAAAATTAATATTTTAAATTTAATTTTTTGGAAAAA
AAATATCAAATGTAAAATTGTTTAACTATTTCTCCTATAATTTTTTTTTT
CAGAATAAATATTTTTATTTTTTTTCCATAAGTTTTTTTCAGCCTTATTT
TTCATTTCTTTCTTATAATTGGTAAACCMCCKAACGYCCGCCACAATATC
AGCGAACATGGTTCGCACTTGGGGGCATTTAAAGTGTCCTCCTATTGACA
GTCCCTAACCGAGGGACAATTCAAACTTCATAGTACCATCTATGCACCCT
TTACATAGATACTGCTTTCGTTTAGAGTATAATGCAAGTTTAGGGTATAG
TGGTTACCCATAAGAAAGACTTGTTTCTCTTTCAAGAAGTCATTGAGAAT
AAAATACCAGGATTCCTCACTATTCCACATTTTTCTAACCCAATAAAAGT
TCAGAACCTTCAATATTTCTGAGACGCTTATCACAGACAATCTTCAACTA
TTCAGTGGACTGTGAAGCCTATCATAGTTGATGTTCCTTCTCCTTTTTGC
GTAGAGAAATTAGATCGCTATAGTGGATATATTTTTAAGAGTGCCCTCAT
TGTATGGCGTGACTATTAGAAAATGAAGCAATTTTGGGACAACGTAAAAG
TTCCACACAGATATTTTGTCCTTGATATTCAGGTTGAAAATCTTGAAGAA
AGAGGTAGCTAGATTAAATCTCCTGACGATTACCTCATTATTCTTTTGAC
AACCCTCGTTCCCTACCCAGACTCCTAGGAGTTTGTTGTTAGGCCATCAT
TTTATATCAGTCCACCATAAGCACTCAATATCTCTGTTTTTCATGGATTA
ATATTTAATCCGGAAGTTACAGAGAACTTTTGAGAAAAGTAATAATCCTT
CTGATTGACTTCATTGATTCAAAAGGGATCCCACCCAAGACCAATGTTAA
GTCTTCGGCATAGAGGCATTTAGGATGTGCTAGGATCTTCGAAAATCGGT
AGTTCTTCAGGYATCCACGAATTTTTGTTAGCTTTTGGTATCAAGACGAT
CCGGATGCAAATTCAGGAAGAAGTACTCGAGATGTTACTCTTTTGTAAAA
AGAGAGCAGAACAGGGATCAAAAGGTCAACGTATTCTTTATAAAACTCGA
ACGTAAAAACATGATGTCACCATGTTATTTTTAATCTCAAAGTGTTACGA
ATGTTTTTCTGCTAAATCTTTACCTTCTTCTTATATCTCAGTATCATTGC
TCGTTTCACACCTCAAGTCTTCACAAAAGGAAGCTGCATTCGTCTGGCAT
CTCCCGCATCAATTATTGTTCTGACAATCATAACATGAGTACAGTTTCGA
GTAGAATTTATTAATCACACTGCAGATGAATTTCGGATCATCTGATTTCA
CGCTATTATTATCAGATAGCTTAATAGCTTTTTTTCTATATCTATTATTA
TCTTGCCGCTTACGCTGCAGTCTGGAATGTGACAGGTCATCAATACTGTT
CATTTTCATTCGGACTCTATACTTCAGATCGTTTTACCACTGCATCTGGT
GTAACTTAGCTTTTTTTTCTCCGTCAATATGAATGCTCTTGGAAGTAGAT
TCGATTTTGTTAAGATATTCCCTCTCTCTTTTCCCAAGAACAGATACTTT
TCTTCTGCACAAAACTCTTATCCTATGTAACATTAATTGCACAAGCAGAA
ACAAAKCCCTCTCATACTGCAGCTTTTGGGATACGTCCAGAATTATGCTT
ACAATTCCATCATTAACTTTGGGATTGTCTATGACGCTCGAGTTAAGTGT
CCACTACTTTTTGTTTCTAAGTTACTTAAACTTAGGTTTTAATACTAAAT
GAGTTACCTTGTGATCCCAAATTTTAGCATTTATTATGTCATAAGAATCA
ATTCCATCTCCTACAAATCCCTTCATCAGGAATAGATTGATTCTTGCTAA
CCCTGGCTTAGAGTTCTTGTCAATGGAAAATGATGTGTTATTTAAATTGT
TCATTTTGCATCATTCATCATTAAAACCGAAGGACGTAATAATTGACGAC
AGTACTTTTGTGAATTGAGAGTTTACTGCCTTGCTTGTTGTGTCTCTGTT
CCTTTTTAGTTTCACTTTAAAATCTCCTCCTATAATTGTTGGCTTATGTG
AGACAAAGTGGATAACTATACCCTGGTAGAAATCTGGGTCGTTAGTGTTT
GGCCCATATAGACCATTCATTTCAAAGTTGATGACTATGTAATAATACTG
TGCTTTAATGTGATTTCCATCTGTGCAACTATTGCCTCCTAGACATGATG
TTTGTTGGGTTCCCATTATCCTTGTTATATCTTTGATCAGGAGCTATGCT
AGATTTCATCATTTAAGGCTTATACCCAAAAATTATGAAACAGAAATATA
ATCATATTTATAAAAAAGTTTATTTTGAGGGGCGGAGAGGGTTTTAGAGA
CACTTGAGGGGATTTACACCACTAAAAAGGTAATAACGACGCATATAAAC
GATGATATATTTGAAACAGAAAAATATCCTAAATCATAGTATATATATAA
CTACATGACAGCAAAAAAAATTATTACATAAATTCACTCTACATTAATAA
TTTATTCCCCAACTTGACGACCAAAATACATATCTAACAAATAACAATTA
AATTAAAATAGCTGGTTCTAAATACCAAAAACCAAATTAAAAAGTTACGA
TATGTTATACATAAAAATTATAAAAAAAAACAATAAAATTAGAAATTGAG
ATATATTAAAAAAAAAAAAAAATAGTAGAAGATTAAAAATATATGTCAAG
GAATTTTAAACTTAAGAAAAGAAATGGGAATTTTCTATTTGTAAAGAATC
TCTCAGCGCACGCTCAAAAATTTTAAGTTAATACAGGTATTAATGCTAAA
AAAAACCCAAAACAATATATATTGCATATATAAGAAAATGGTTTGAATAT
TAAAAATCATTCGATTCAACAAATTTACAAAAGAAAAATCAAATTGAGTA
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CTTGGAGTATCTATAGCTCAATGCTCTCCAACTGGCTATGGAAGTAACAA
CTCCAATAGAAATARCAATGGAAGAAATGCTGAAGCGAGTAGAAGACAAA
ATGGAATAGGTGGAGGTCGCGTTGTCTTKGGTGGAGGACAAGACTCTTCC
TCATCCTTTGGCTCTTCATCTACCTCCTCCTCTTCATCTCTTGGAAGAGC
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AATATCTTATTTTATATTTCACATCCAGAGCCTTATATCTAAATCTGATA
GTAAATGGATCCCGTCATAGTTTCAACTCTTGAATATATTCATTTTTATA
TATAGGTGGATAACTTCCTACCCAAGGAAGGAATCCACTCTACTCTTGTA
TGAAGCTTAAGTTGGTTTTGGTTCTATTTTTAGAATAAATTTTCATCAAA
GATCGAGCATCTCTTGTTGAAGATAAAGCATTTCGAATTTATTCTTTTGA
AATATTTCTTAATGAACAAAGAAGTTTTTCCGTCAGTAATTAATGTAAAT
CGATGTAAAATAAACAAAGGCATAAAAAAAATTTAATTTAATTTCTCCAT
TTCATCAAATATTTTTTTTTGTGTTATTTTTAATATGTGAAAATTATGAA
TATTGATAATGTATAATATTCATGTTGAGATAATAATTAATATTTTATAT
TATTATTTTTATATATAACACATCCAGTCTCTTATTTAATTTAATTGATA
TATTAGTGTCTGAAAGGAGGTTGATTTAACATTAATTAAATTGATATTTA
GTTACTTATTATGTATAATTTTTTTTTTCTTTTGAAAAAATGTATTGTNN
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TCAAAACATTCACAAACAAGTTCCAAAGCAGGTGACACGCCAGGTCCAAG
TAAGGGAATGCAACGGAGGATCTGGTCAAATTGGAAATGGACGTAACCCC
ATTGGTGGCAACAATAGTCGTAATACTCTTGGAGGAAGCGGCAGCAGTGG
CAGCTTTGTTCAAGGAGGCCGAGGAGGTAACCTTAAAGGAAATAGCTCTG
GAGGCT

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