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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000003371 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000003371 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s184:394694:407110:1 gene:EMLSAG00000003371 transcript:EMLSAT00000003371 description:"maker-LSalAtl2s184-snap-gene-4.13") HSP 1 Score: 563.918 bits (1452), Expect = 0.000e+0 Identity = 281/281 (100.00%), Postives = 281/281 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MGIRVFVFPPVVNNNNNNCETKFKAEPDSNRIYYWRSLSSANTTTAATXETLGRPIYDDTTPANLPPPPNFRLNFVKKMEDSLILRLPQGSCDTXPDTPDSLDDDSVDQSSLPPTPLPIPVSDLPLPNPPSQHQQHLMHSRHRFQSTNSPDPWFMQENLIEEISAPPNAVCSSASSPATPIGSPLAQQRTMLRSISQVRLNNSNNNNHHHPNSSIIHFNNPHSTAPPLSNGKPPRTYSSLYPQMIHQTSSNIKTGARHDANNNNEFEDPNETQPFNYIMEL 281
MGIRVFVFPPVVNNNNNNCETKFKAEPDSNRIYYWRSLSSANTTTAATXETLGRPIYDDTTPANLPPPPNFRLNFVKKMEDSLILRLPQGSCDTXPDTPDSLDDDSVDQSSLPPTPLPIPVSDLPLPNPPSQHQQHLMHSRHRFQSTNSPDPWFMQENLIEEISAPPNAVCSSASSPATPIGSPLAQQRTMLRSISQVRLNNSNNNNHHHPNSSIIHFNNPHSTAPPLSNGKPPRTYSSLYPQMIHQTSSNIKTGARHDANNNNEFEDPNETQPFNYIMEL
Sbjct: 1 MGIRVFVFPPVVNNNNNNCETKFKAEPDSNRIYYWRSLSSANTTTAATXETLGRPIYDDTTPANLPPPPNFRLNFVKKMEDSLILRLPQGSCDTXPDTPDSLDDDSVDQSSLPPTPLPIPVSDLPLPNPPSQHQQHLMHSRHRFQSTNSPDPWFMQENLIEEISAPPNAVCSSASSPATPIGSPLAQQRTMLRSISQVRLNNSNNNNHHHPNSSIIHFNNPHSTAPPLSNGKPPRTYSSLYPQMIHQTSSNIKTGARHDANNNNEFEDPNETQPFNYIMEL 281
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000003371 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000003371 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000003371 | 0.000e+0 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s184:39469... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s184 | supercontig | LSalAtl2s184:394694..407110 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | maker-LSalAtl2s184-snap-gene-4.13 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s184:394694..407110+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000003371-686137 ID=EMLSAG00000003371-686137|Name=EMLSAG00000003371|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=12417bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s184:394694..407110+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGGTATACGAGTATTTGTATTGTATATGCCTAAGAAAGAAACAAAGGT
GTGTCTGTATAATGTATGGTAAATTTCCCCTGTACATTTCTTGAATTTAC
TTACAAACCTAATATGGGTAAAATTAGACCTTGACAAATTAGGCGAAAAA
AATTGAATATCTACAAAAAAAAAAAAAATGTTATAGCATAAACTTCTGTA
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CTACARCAGAGACTTTGGGCCGGCCAATCTATGATGACACCACGCCTGCA
AATCTTCCTCCACCACCCAATTTCCGCTTGAACTTTGTGAAAAAAATGGA
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GAGTCATTATAACACTATAATGTTTTTTTTTACTTTATTGCATACATAGT
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TTCAAATGCGCGGCTTTTAAAATGAATAAGAACTAATTTGTAAAATGAAC
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TTAGCTTCTTTTTTTAGTATATATATGMTTATGTACATATKCCTATCTAG
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AATGTTGAACCAGCAAATTATAACATCTTTATCTTCCTTGCAAAAAGAAT
AAAAAAATAAAGTATAAATCATATCTATTATATATGTTCTTTTCCTTTAC
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AACTTCTTATATTTTTAATTCGGAGTATCTACTATGGAATATTAGATATA
TGCAAGCTTATGAATGTAATTTTTCCCTCTCTTTCCCACTTGAGTAATAT
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ACAGTTTGATAAATGTTTGGGAGAAAAGATGCTTATATGTCCTTAATTTT
GATTATATCAGCTGCAAGCAGCTGTGAAAGGAAGGACACACAAATAAATC
CCATGCCATTCAGATTGAGGATCCTAAACTTGCAATAGCATTTAATTAAC
AAATTGTCGAAAAAGTCCGGGCCTTAACACAAAGAGGGCTTTTTTTTTAT
TCACCTCGTTGTCAGTGTTTACCAATCTTCAAAAGACAGCTCTAAAAATA
TTCTACTAACCTACTCTTTACTTTGTGAGTTGTTTTCCTATGTGTGACTC
TACTTGCATTATTTCCAGAATATTGGATCAAAAACAATTTCGCGTAATAA
AATTTTACAGAGCGTTTTCATGGGGAAAAATACAATTCAATATAATCAAT
CGGAATAATGTTAGGGTCATAGACTGGCCAGCCCAAAATCCTGACCTTAA
CCCTATTGAGAACATATACACTACATTGAAAAAGGAGTGTTGAAAAAACA
TCCAACAAATCTTGGTGAACTTTAGAAATTTTATTAAGAAGAGTGGGCCA
AAATTGATTCAAGAGTTTACTTCAATTTACAGGATTCGGAAGCAAAGCGT
GGACTGTCAATAAATGCTAATTATGTACTTACAATAAAGAGGTTTTGTGA
TTTTTTCCTGCATATTCCAAATTTCCTGTTCTTTCTGCATAAGTACATAA
TTACAATAAACATTTCTCAAATCTTTCATCATGAGTGAGCAAGAAGCAAA
AAGGCAGAGGATATCAGACCGTCTGGATGCCAAATTTGAGGTTCAGAGAT
AATGGACATTGTGAAGTGGTCCAGGAGCCTCATTTTCAAGGTGGCCAAGA
TGAAAAAGAATGGGAAAGACCTCTCAGGGAAAGAAGGAAGTTGGGGATAC
AACATGAAAAGGGATTCTGAGCTTCTGGGGCACCTGCAGAASAATATCAA
AGAGGACCCCACAGAATCCATGAATCACCTCTAGCAAGCTTTGCGTGGAC
GAGGGGCAATCAGGAGGGCTGTGAAGGAGGACTTGGGGCTGTCCTCTTAC
ACAAGGACCCACACCACCTATCATATATTATTAAGTTCATGCGTGGATCA
AGGCAAATGGATCCACAGTAAAAAATTTCTCTGACAACAAGATTTTCACC
GTTGACCAGGTCTACAACCGTCAAAACGACCGTTGGCTTGGGGATCGAAT
TTGTGTCGTGCCACACTTCAGACCGGACCAGGTCTCAACACTAACAACTA
CCTACAGAGAGCTTCTGCAGATATCCTTCCTTAATGATGTTTTATATTGA
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TTTGTCTAATAATTAGTTTAATTTACTTTTGTTGAATAACTATTTATTTC
TCTTCATTTCATGGTTGAATGCATTTTTCAGAAAATGTGTACTTATACTG
TATTTGTAGGGCGGTCCCAGAAATAACCGCCCTGACTAAAAAAATATCTT
AGTTGATAAAAAAAAAGTATATTGGAGAGTACAAAATATGCTTCAAGTTC
TAAGACGCCACGGCATTTAGTATTTGTTTGGCAGCTATTACTATTGAGTG
TATGAAAATTGAGAAAATTTGTCAACGTTAAACGATACAATACTTTGATT
TAAAATACCTAAGTCAAATAATTATTACTAAGGGTTAGAAAAGTGTTGAA
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TTACCCACAAGTATATGTGTTTCTTTTGTTGAGTCTGGTGCTTCTGGATC
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TATATAGAATGTCATCCCAAAGTCGTCCACCCCCTAATATAAATATATAA
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GGATTAAGGAAATCAACATAAATTCTTTCCATACTTAGCAAGTACATGGG
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GCTTAATCATCAGGGTTACTCTCTGTCCATCATGAGGAGACACTTCAGTG
ATAACGGTTTATGGTTTAAACGTATATGCTGTCTCCTAGTCATTCATAAT
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TACTACCGTCTTTCATGAGCACACGTACTGGTTATTYATTTATAAATAGC
TGTTCTGCTCTCAAGAATTAATTAATAATGAAAATACTTAGAAAAATGGT
AATTGATGTTCAGATTGTCAACTAAAAAAACACACTCTAGCTTTCTAAGA
CAAGCTTAGCACGCCACTATTCCCTCTTGAAGAAGTTACAATTTTCATAT
GAAAATACTATAATTTCATTAGTAATTGCAAAAAGCTCTTCTTCCATTAT
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GCACAAAGGGACAGTGCCCTTTACAAACTCATCCCTCTCCTCTCCAAATA
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TTTAAATACGCCTTATCCCTTTGACCTCTGAGGGATGATACTATAAATTT
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ATATTGCAATATTTTGTAGGCATATTTGAGTTTTTAAAAGGCTTATTATT
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AACCTTTATTTGATTTAAAAGGCTCACGATATAGCCCCTTTCAAATAATA
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TGAAATGTATTTATTTTGTTTGTTCTAGGTTGTGTGATTTAATGTATTTT
GAAAAAGTTGCGTTTTTTAAATCATATAATCTTCATCGCTTTCAATACCC
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ATGCTTCACCATTGATAGTGCCATGAACTCCATCAATAATACAAACAACA
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TTGTCCACATTGAATGAGGTCAACTCCTCAAAAATCGCCAATCTATCATC
TGCTTCGTCCTCCATGATTGACAAACTCAGAACTGATACAAATCGAGATC
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GGGCAAATAAAACCTGGGAGGAATCGTGTAGACTCCATTGTAGATAGAGA
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ATTAAGAACATTTTTATTTTTTGTTTTACTTCATAAACAAAYGGTCATTA
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AGTGCCAACAATTGTTAGTTGTAATGTAGAGKTAAGTAGTTGCAGTGTAT
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GTACATAAACAAACTAAATAAATTTTTCGTCATCATAAGTGAGCAGCGTA
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GTAAAGTATTCCAGGAGCCTGGTTTTCCAAGGTAGCCAAGATAAAAAATG
ATGGAAAATATCCCTTAGGGAAAAGTAGGAAGTGGAGGTGGCAATTTAAA
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CCACACAACCCATGAATCCCATTTCTTGTCAAGTTTGGAGAACATGATCA
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GGATCCCACAAAACTTKTCGATAGAAGTAATGAAGGCAAGGAACCTCTGG
AATCCACATTTTGCTGCCCAATCCTGTATAATTATAGAAAATAATTTAAA
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TTTGCCTTAAAACTTTTTTAGAGCCTACTTTTGTTTTAATAGCAATAGAG
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GAAAAAAAAAAAAGATTTTTTTTTTTTGTAATTTTAATATAAGCCATAAT
TTGTAAATACTACTAAAAATACTTGCTAATAAAATAAAGTATAGATATGT
GAGTCATACACACATTTATCTCCATACATAGTTCCAGTTTCGACCCACAC
GTTATATTTTTGACAGGACTGTTTTAAAAGTATTTATTTGTCACCGATGG
CACTTATCAATGGAAACTCTATATATTTTTGAACCTCACTTGGTATTTTT
ATAACTTTAATAAAAACAATTTTTTAGGATTTTAATCTTGAGCTCCTACC
GAAAGTATTACAACTCCTTGTAATAATCAATAAATGATAATGCTATTTAA
GAGGAGCAGAAGGTGCAGTATTATTTTTGATACGAAATTCCTGTTGGTAA
ACTCATATGATGTTTGTACACTTATATCACTATAAAATTTGTTGTAGCTG
TAGGTTTTAAAATCCAGAAAATTTGTATTTAGGTAAAAGTGCAGATTTAC
AAAATACGCTGTATACTTTTGTGTTAGTGAGGTAATAATCCATTGATCTA
TAAAATTAATCTAATGGAGATTCAACAGTAAAGTTCAAACCGATAACAAA
AAGGAAGATGACATGTGGCAAAATCTCCTCGAGCCAAAATTACAAGGGCA
AAAATTTAGATAGCAAAATTACCAGTAAACAAATGAAATGATTATATAGT
AATATTCTTGAAACCCTAACTAATACTGCTAAAATTAATTTTTTCAACAA
AAATATGAGTGATTTAGCAATATCTTGAACTAAAATAAGTATTTTCATAT
TTTTTAAGAAATATAAACAAAANAKTATACACCTAAATATTGTAATTTCA
GTGTATACTGACTGTGTTTTTGTGAAATAAAATCTGTCTTATTTTTGGGA
TAATATTTTTACTCCAGTTGACTAACGGAATGTGAKCATACAATCTGTAA
TTGCAACTTGAATTGCTTTCAAACGGTTACTTATAATAGTTGATTAATAG
AAATTTAATTTAATTCTTTGTTCATAGAATATAAGTATAATCACTAAGCA
TTTAGATTTATAAAAACTTTCCTAGCTTGTTTTTTTGTTGACATACCTCC
TTCTATATTCATTTGAATCTATGTAATGTATATTATCTATTTAGTTACAT
AATGGAACTCTGAAATCCAAAGACCCAGACAGCAGTCAAATATCCACAAC
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CGACTTTAATGGTGAAACAGAGAGTCCGGAAATGGAAATTTGTGATCCAT
GTCAGTGCTATGGAAAATGTTGTCTGGACATGGTCGCCTCTTTCTTTTGT
GTATCACTTTTATAAGGATTTTTGTAAACAAAATATACTAAATAGGCATT
AAAAGTTGAAATATATATATATCTCTGTTTGGAAATAAACAAAATTAAGA
TTGCACAAAGCATTCAGAATATAGATTTAGATCATTCAAATTGAAGGAAT
ATATTTCTTACCCAGAG back to top
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