EMLSAG00000009008, EMLSAG00000009008-691774 (gene) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAG00000009008
Unique NameEMLSAG00000009008-691774
Typegene
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Homology
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592757356|gb|GAXK01197057.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1122821_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 137.502 bits (345), Expect = 9.353e-34
Identity = 90/358 (25.14%), Postives = 169/358 (47.21%), Query Frame = 0
Query:  242 VPENAIREISNMLTAEFD-RSGLGFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGVRLSLIT--GGVVDL--------NLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLLLVD-ENTKIVQSLLVKAITIASLKAELGRDI 587
            V +  + E  NML +  D    +  P++  F+ +     L       +++  +S KLS F+      I V  GE +F    P  EL   C+  +++G +   +++ RN++F     LSL +     +DL        ++++  ++ A VG+ +FGKC  K   + PL+   +G   +  +     VR+E R  Q  P+   +                        +  I A  ++   PHLVFK NI++   + ++ ++S+ ++ C   F G+K+FS C  ++   +  I+ F RRTF +N+  ++R+IE+    R+G EI+IPL L + +N   V +++ K  ++  L  +L + +
Sbjct:  429 VSDQQLMETVNMLISGIDPMVPIIGPVKPIFVNQKVLGMLAGPSKERVVNLYLSRKLSQFLDQGRYHIRVSQGEALFKTWLPPVELGTKCDTEVSIGRSYASIVVNRNSRFTATKGLSLHSHRSPTIDLFGQARAYVDINIQGKLKASVGREMFGKCLPKFSVDSPLKMRGKGVGDVFAKVSVHSVRLETRATQNYPIIGRF------------------------LPNITAGIQK---PHLVFKFNIKVDGTVAKFDISSLKLSGCRFSFLGIKMFSHCDLVENLVRKQIQDFTRRTFPLNNSDLIRQIEQAIRMRVGEEISIPLSLGETDNLAPVNTVISKTRSLIMLSTKLAKRV 1421          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592841970|gb|GAXK01115574.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1060653_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 117.472 bits (293), Expect = 1.571e-26
Identity = 88/346 (25.43%), Postives = 163/346 (47.11%), Query Frame = 0
Query:  263 LGFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQF---KGGV-------RLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLLLVDENTKIVQSLLVKAITIASLKAELGRDIGELAGQLTTPE 598
            L  P++   + KD  R +K    +  I + +S +LS  I  S     VK+G++     +P   L  +C     LG++   + +RR +Q    KG          L LI    +D +L+L  R    + K    KC+ K+++   +  V+R K  I ++   + V I     Q +P+  E D F+      KY   +T                   +PH+V +  + L +++    ++ + +++C+V  FGVKV S+C+ ++R   S  +   +++  ++S + +R+IE+    R GNEI IPL + D+  + V+S L+ A  + ++  +L  DI +L  Q++  E
Sbjct: 1265 LDSPVKEILVDKDEIRIVKGPMGQTRIDDWLSKRLSDIIVDSYYKFSVKNGDMYLSTTSPPLHLGTSCGLNFVLGSSTMSLRLRRTSQIAITKGLTYGTGRTPSLDLIASAWLDSDLNLAGRGIINLSKNFIAKCYNKVKQKANVHIVARAKTFISMKVSVTDVTI-----QSRPV--ESDIFVP-----KYIVGKT-------------------LPHIVLRFVLSLNSELSFLSLDHLKLSDCDVNVFGVKVSSYCNILERMILSQSKEALKQSLPLSSYRAMRQIERAIFRRFGNEINIPLYIDDQ--RPVESFLLTADNVINVGKKLSDDITKLVNQMSAVE 2203          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592780846|gb|GAXK01173722.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp648311_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 113.235 bits (282), Expect = 4.388e-25
Identity = 77/329 (23.40%), Postives = 144/329 (43.77%), Query Frame = 0
Query:  266 PIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGV----------RLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLLLVD-ENTKIVQSLLVKAITIASLKAEL 583
            P++   +       L  +   ++++  ++ KLS F+  S   + ++ GE V  +  P  +L + C   + +G +  ++I+ RN++F               L L     + +N+D++ ++ A++G  +FGKC  K   + PLR           +    +VR+E R+    P+                          +V   I+   +    PHL+FK  I+L   I  + ++ + +  C     G+K+FS C  ++   +  I    + TF +N   +LR IE +   RIG+EIAIPL+L D +N   V  ++ K   +  L  +L
Sbjct:  443 PVKPLLVNHKVLGMLAGRSRDKVVNRYLARKLSTFLDHSTTKLTIRQGETVLKSWLPPLQLGSACTNEIYIGKSFAKVIVNRNSRFSATTGPSIHSHAPPTLDLFGFARLYVNIDISGQLSAKIGHEVFGKCLPKFSGDSPLRIKGNAMGNAFAKVIVKNVRLETRKTVYNPI------------------------LGNVFRDIQLGVQR---PHLIFKFRIKLDGTIANFDISELELTGCEFSVLGLKMFSHCDVVESIIKKQIRRATQNTFPLNDAMMLREIEYMLKMRIGDEIAIPLVLNDLDNLDSVNRVIAKTGKLIDLNIKL 1348          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592947194|gb|GAXK01011359.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp23839_c2_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 87.4261 bits (215), Expect = 5.778e-18
Identity = 67/304 (22.04%), Postives = 129/304 (42.43%), Query Frame = 0
Query:  264 GFPIRAFFLGKDAFRTLKS--KHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGV--------RLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFG-VKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPL 556
            G P+ +F L     + L+S    S  +  +II+  L  ++K  +  I +++ +I+ DA      L + C   L   + R R  I+R++Q    +          S      +D+ +DL+    A++G ++FGKC    R  L +   + GKA + V   A+ + I+                                                N  ++  KLN+ +  ++  W+V+++ V+ C VK F  V++ S+CS  +   +  ++ +  +     +PK++ ++E+    RIG+EI IPL
Sbjct:  104 GLPLSSFNLTLGQSQQLRSGNDESVALAQDIINDALKKYVKEGNLNIVIENNDIIIDAAFDDRVLKDRCSLKLFALHPRARGTIKRSSQLMADIYDGDFSAGEFSAAAKADLDVQIDLDFDFRAQIGAKIFGKCRKIGRDTLGIDLKTSGKAILAVALEATDIAID-----------------------------------------------PNFENIKGKLNLNILGRLENWNVDNLDVSKCQVKLFNRVEIGSYCSAARSLIREALQNYINKWTEFEAPKLIEKLERKMQSRIGDEIVIPL 874          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592947195|gb|GAXK01011358.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp23839_c1_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 87.4261 bits (215), Expect = 5.778e-18
Identity = 67/304 (22.04%), Postives = 129/304 (42.43%), Query Frame = 0
Query:  264 GFPIRAFFLGKDAFRTLKS--KHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGV--------RLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFG-VKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPL 556
            G P+ +F L     + L+S    S  +  +II+  L  ++K  +  I +++ +I+ DA      L + C   L   + R R  I+R++Q    +          S      +D+ +DL+    A++G ++FGKC    R  L +   + GKA + V   A+ + I+                                                N  ++  KLN+ +  ++  W+V+++ V+ C VK F  V++ S+CS  +   +  ++ +  +     +PK++ ++E+    RIG+EI IPL
Sbjct:   94 GLPLSSFNLTLGQSQQLRSGNDESVALAQDIINDALKKYVKEGNLNIVIENNDIIIDAAFDDRVLKDRCSLKLFALHPRARGTIKRSSQLMADIYDGDFSAGEFSAAAKADLDVQIDLDFDFRAQIGAKIFGKCRKIGRDTLGIDLKTSGKAILAVALEATDIAID-----------------------------------------------PNFENIKGKLNLNILGRLENWNVDNLDVSKCQVKLFNRVEIGSYCSAARSLIREALQNYINKWTEFEAPKLIEKLERKMQSRIGDEIVIPL 864          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592932836|gb|GAXK01025717.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1928818_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 69.3218 bits (168), Expect = 8.832e-12
Identity = 55/267 (20.60%), Postives = 113/267 (42.32%), Query Frame = 0
Query:  299 HFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGVRLSLITGGV-------VDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFG-VKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLL 557
             F    DA + +  G+I  +A  P  E +++C+  L+  + +    + +++    G  LS    GV       +D  ++++    A +G ++  KC   +R+ L +   + GK  I V+    +VRIE                                              EEN   L F L+  L+ +   W+V+++ V+ C+VK    VK+ S+C+F     +   + +  +     +PK+++++E    ++IG+E++ P++
Sbjct:  341 QFKDDDDATVLIDQGDIQMEAEYPDKEFSSSCDLKLSALHPKISGSLLKSSNISTG--LSFDEAGVQAFMEATLDAIVNVDFDFRAEIGIKILKKCKRVLRETLGIDLTTTGKVLIAVKISGENVRIET---------------------------------------------EENKLLLKFDLDFDLEGKPFDWNVDNVDVSKCDVKLGNKVKIGSYCNFATGLIKEGAQKYLDKWTVFQAPKLVKKLEDKLQKKIGDEMSFPIV 1000          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592863081|gb|GAXK01094481.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp49368_c1_seq4 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 45.8246 bits (107), Expect = 6.421e-5
Identity = 16/73 (21.92%), Postives = 43/73 (58.90%), Query Frame = 0
Query:  482 AQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAI 554
             Q++ W+++ +  + C  +  G+K+FS+C ++++K +  IE   ++  N+  P ++ ++E+    +IG  + +
Sbjct:  200 GQVVSWNLDQLEASKCVERIAGLKLFSYCGYLEKKARKKIEENMKKIQNVKLPAVIAKLEEKLKMKIGKTVRV 418          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592863082|gb|GAXK01094480.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp49368_c1_seq3 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 47.7506 bits (112), Expect = 8.735e-5
Identity = 16/73 (21.92%), Postives = 44/73 (60.27%), Query Frame = 0
Query:  482 AQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAI 554
             Q++ W+++ +  + C  +  G+K+FS+C ++++K +  IE   ++  N+  P ++ ++E+    +IG  +++
Sbjct:  228 GQVVSWNLDQLEASKCVERIAGLKLFSYCGYLEKKARKKIEENMKKIQNVKLPAVIAKLEEKLKMKIGKTVSV 446          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592863083|gb|GAXK01094479.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp49368_c1_seq2 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 45.8246 bits (107), Expect = 2.864e-4
Identity = 16/73 (21.92%), Postives = 42/73 (57.53%), Query Frame = 0
Query:  482 AQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAI 554
             Q++ W+++ +  + C  +  G+K+FS+C ++++K +  IE   ++  N+  P ++ ++E      IG  +++
Sbjct:  254 GQVVSWNLDQLEASKCVERIAGLKLFSYCGYLEKKARKKIEENMKKIQNVKLPAVIAKLEDKLKMNIGKTVSV 472          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592863084|gb|GAXK01094478.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp49368_c1_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 45.8246 bits (107), Expect = 3.121e-4
Identity = 16/73 (21.92%), Postives = 42/73 (57.53%), Query Frame = 0
Query:  482 AQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAI 554
             Q++ W+++ +  + C  +  G+K+FS+C ++++K +  IE   ++  N+  P ++ ++E      IG  +++
Sbjct:  461 GQVVSWNLDQLEASKCVERIAGLKLFSYCGYLEKKARKKIEENMKKIQNVKLPAVIAKLEDKLKMNIGKTVSV 679          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000009008 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s565:344055:376006:1 gene:EMLSAG00000009008 transcript:EMLSAT00000009008 description:"maker-LSalAtl2s565-augustus-gene-3.6")

HSP 1 Score: 1233.39 bits (3190), Expect = 0.000e+0
Identity = 604/604 (100.00%), Postives = 604/604 (100.00%), Query Frame = 0
Query:    1 MLIHFLQSSIFLIGIKGVFGQGTHEGIPSIPSSSDETRSVFIVNASQIRHTPVMSEGALKTAALKYTSNSPQYYPPGSSIPSSSNMECCKCYQQEVSSSFIQDKREITNIPSPNTISYSTTTKISTNPEPVLANDRVXSGAINLLLLQALAQAQQTQEKPKVNPLEEKIQGYYNKIISIFNLDLEILRETIDLIRKANTTVLPLIQNVFLPLVNQAQSTSSSLNLENVIRPLSFRDSTNFTVPENAIREISNMLTAEFDRSGLGFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGVRLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLLLVDENTKIVQSLLVKAITIASLKAELGRDIGELAGQLTTPEVPTYGG 604
            MLIHFLQSSIFLIGIKGVFGQGTHEGIPSIPSSSDETRSVFIVNASQIRHTPVMSEGALKTAALKYTSNSPQYYPPGSSIPSSSNMECCKCYQQEVSSSFIQDKREITNIPSPNTISYSTTTKISTNPEPVLANDRVXSGAINLLLLQALAQAQQTQEKPKVNPLEEKIQGYYNKIISIFNLDLEILRETIDLIRKANTTVLPLIQNVFLPLVNQAQSTSSSLNLENVIRPLSFRDSTNFTVPENAIREISNMLTAEFDRSGLGFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGVRLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLLLVDENTKIVQSLLVKAITIASLKAELGRDIGELAGQLTTPEVPTYGG
Sbjct:    1 MLIHFLQSSIFLIGIKGVFGQGTHEGIPSIPSSSDETRSVFIVNASQIRHTPVMSEGALKTAALKYTSNSPQYYPPGSSIPSSSNMECCKCYQQEVSSSFIQDKREITNIPSPNTISYSTTTKISTNPEPVLANDRVXSGAINLLLLQALAQAQQTQEKPKVNPLEEKIQGYYNKIISIFNLDLEILRETIDLIRKANTTVLPLIQNVFLPLVNQAQSTSSSLNLENVIRPLSFRDSTNFTVPENAIREISNMLTAEFDRSGLGFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGVRLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLLLVDENTKIVQSLLVKAITIASLKAELGRDIGELAGQLTTPEVPTYGG 604          
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. nr
Match: gi|1129200341|gb|OLQ03602.1| (hypothetical protein AK812_SmicGene13435 [Symbiodinium microadriaticum])

HSP 1 Score: 110.923 bits (276), Expect = 7.529e-22
Identity = 75/313 (23.96%), Postives = 142/313 (45.37%), Query Frame = 0
Query:  264 GFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSRE-IISNIISHKLSHFIKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQFKGGVRLSLITGGV-----VDLNLDLNARVHARVGKRLFG-KCFGKMRKNLPLRSVSRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTHQTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVKFFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGNEIAIPLLLVDENTKIVQSL 569
            GFPI +  L KD F  L S   R+ + ++++   LS F K +++ I+++ G+I+ +   P T + ++C   +   N   +  I+ ++   GG+++S  +  V     +D  LD+   V  RVGK +FG  C    RK + L   S G+  IG+   AS+  +E        LN  +                                      +L F  +  +   +L+W+V+ I  + C +K  G+++ S C +++R  +  ++        I++PKIL++++      IG+ + IPL L  +   +V++L
Sbjct:  432 GFPITSLELTKDQFSKLNSTGPRDGLATSLLLPHLSAFFKQAESAIKIESGDIIIEEHFPDTTIDDDCNHKVEALNGHAKGDIKNSSFLTGGLKVSWKSVSVFIDAELDAILDIGGDVRVRVGKHIFGHHCTQLARKTMGLSVDSDGQNGIGINMTASNAHLEY-------LNSTW--------------------------------------YLSFNFHADVVGTVLKWNVDKITADGCKIKILGIEIASVCGYVERHVKDKLQSLLNTVERIDAPKILKKLQDKINTAIGSTVRIPLKLAGQTNTLVRTL 699          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000009008 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 (Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000009008 vs. C. finmarchicus
Analysis Date: 2014-05-09 (TblastN vs C. finmarchicus TSA)
Total hits: 13
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|592757356|gb|GAXK01197057.1|9.353e-3425.14TSA: Calanus finmarchicus comp1122821_c0_seq1 tran... [more]
gi|592841970|gb|GAXK01115574.1|1.571e-2625.43TSA: Calanus finmarchicus comp1060653_c0_seq1 tran... [more]
gi|592780846|gb|GAXK01173722.1|4.388e-2523.40TSA: Calanus finmarchicus comp648311_c0_seq1 trans... [more]
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gi|592947195|gb|GAXK01011358.1|5.778e-1822.04TSA: Calanus finmarchicus comp23839_c1_seq1 transc... [more]
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Pages

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BLAST of EMLSAG00000009008 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 (Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000009008 vs. SwissProt
Analysis Date: 2017-02-10 (Blastp vs. SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000009008 vs. Select Arthropod Genomes
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. Selected Arthropods)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000009008 vs. nr
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. NR (2/2017))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|1129200341|gb|OLQ03602.1|7.529e-2223.96hypothetical protein AK812_SmicGene13435 [Symbiodi... [more]
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BLAST of EMLSAG00000009008 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Analysis Date: 2018-04-18 (Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s565supercontigLSalAtl2s565:344055..376006 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Blast vs. GO2014-04-02
TblastN vs C. finmarchicus TSA2014-05-09
Blastp vs. self2014-05-10
Blastp vs. SwissProt2017-02-10
Blastp vs. Selected Arthropods2017-02-20
Blastp vs. NR (2/2017)2017-02-20
Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins2018-04-18
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Descriptionmaker-LSalAtl2s565-augustus-gene-3.6
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Notehypothetical protein AK812_SmicGene13435 [Symbiodinium microadriaticum]
Cross References
External references for this gene
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (gene)EMLSAG00000009008 (primary cross-reference)
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAT00000009008EMLSAT00000009008-704855Lepeophtheirus salmonismRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at LSalAtl2s565:344055..376006+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAG00000009008-691774 ID=EMLSAG00000009008-691774|Name=EMLSAG00000009008|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=31952bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s565:344055..376006+ (Lepeophtheirus salmonis)
CCATTCATGTAGAAACCACCTTTGAATATACACTCATACCAATGTCGTGA ACTTCTCCTCTTTTAATAATCTTTATACCCTATCCATATACAAGAATGTG CCTTAGTTATTAAATCCTTTTCACAATACGTCATTATACATGAAAATTCC ATGTATACTACTTGAATAAGGACAGGTAAGACATGACTTATTTTTCTTGA TTATAAATTCAACTCCTCTAAAAAATTTACGTATAAATACATGCAATTAG GCAAAATATCACGCGGAACCATGTGGCTCTTATTCTTAGTAAGTAAGAAA ATACAATCCCCTTTTCCTTAAATTATGTTTACTCTCTTTTTTGCTCTATA GTCAATGAATAGATCAATCCTTTTTGGGGATACAATTATTCTTTCGCATA ATTCCAATCCGTTTTCTTACCTACATATTATTATACTGATGTGATACATT TTCTTAAGAGCTGCTATAGAGTCATTTTGCATGAATTCGAATCCGATCAT CATATTTGAGTCACTATTATTTCTATTAGGGCTGTATCAGTCCTTAATAT GTGACTTAAAATCAATGCCGCTCCTGTTATTGGTCCTTTAAGAGTGTCCC ATATTTCAAAATGGCTTTTATATCATTGTCAAATACATACATAATTTTAC TAATTGAATGTGTGAAATAAAACATCATGTATCAATTCATACATGAAAAT GGTTGCCAGTATTTTTATATAATTAGGGCTTAAATTTATAGGTTTTGTTA TTCTTGTTTATTCCAAGGCAAATCAATCACTCAAAAACAGCATCCTCTTT GGCTCTTTTCAAATTTGGCACATATTACATATAATATTAGTTAAAAACTG AAAAATCCAAAATTTCAGCCTTTTTGTCCTCCGGTTCAGGAGTTAGAGGC TTCTAAAGTTTTGGCCTCGACGACACCRACCCRATTTTTAAATTGCTGTA 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