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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000012460 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000012460 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s917:202865:224550:1 gene:EMLSAG00000012460 transcript:EMLSAT00000012460 description:"maker-LSalAtl2s917-augustus-gene-1.20") HSP 1 Score: 849.736 bits (2194), Expect = 0.000e+0 Identity = 434/434 (100.00%), Postives = 434/434 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MYVKVLINLYFILFISGNTNGKQSDILNFENHWKKENNMLRNKKILISIEDKLNNIEEIVNERSDSKKNVDEAIKPDLKGSKYSKPEVLHGKMARIKVNMAIKSSGINNLPMQRNNKKSVNYTYNSRNMDKKVKNMDQFFPEVGKIKLSRKKRNSESVDFSSNPNRYERTSKIKNEENVIFNNELQFKNLIDRVEKTMNKIKSFNKNNRTNNGSFDIPHNKLEKSHQNIVPSIKIRNKRSLNKSKDKKSSKLVNHKKKKHNFKNHSSENDEKLDSKTEEKISEKEKNRVTTSSTISLDNITITTNKVNGEIDDIFDNEIDLEKSPNGLILIVYNPGSSKLKFGQMVDGNLDPVMNDTFILESMGKSKMKDTKLNTTINNVLKNIYTKHLSTIANSSLKKNQTHIRVDNSTTTSIATPDISTISLNKATKKKKLE 434
MYVKVLINLYFILFISGNTNGKQSDILNFENHWKKENNMLRNKKILISIEDKLNNIEEIVNERSDSKKNVDEAIKPDLKGSKYSKPEVLHGKMARIKVNMAIKSSGINNLPMQRNNKKSVNYTYNSRNMDKKVKNMDQFFPEVGKIKLSRKKRNSESVDFSSNPNRYERTSKIKNEENVIFNNELQFKNLIDRVEKTMNKIKSFNKNNRTNNGSFDIPHNKLEKSHQNIVPSIKIRNKRSLNKSKDKKSSKLVNHKKKKHNFKNHSSENDEKLDSKTEEKISEKEKNRVTTSSTISLDNITITTNKVNGEIDDIFDNEIDLEKSPNGLILIVYNPGSSKLKFGQMVDGNLDPVMNDTFILESMGKSKMKDTKLNTTINNVLKNIYTKHLSTIANSSLKKNQTHIRVDNSTTTSIATPDISTISLNKATKKKKLE
Sbjct: 1 MYVKVLINLYFILFISGNTNGKQSDILNFENHWKKENNMLRNKKILISIEDKLNNIEEIVNERSDSKKNVDEAIKPDLKGSKYSKPEVLHGKMARIKVNMAIKSSGINNLPMQRNNKKSVNYTYNSRNMDKKVKNMDQFFPEVGKIKLSRKKRNSESVDFSSNPNRYERTSKIKNEENVIFNNELQFKNLIDRVEKTMNKIKSFNKNNRTNNGSFDIPHNKLEKSHQNIVPSIKIRNKRSLNKSKDKKSSKLVNHKKKKHNFKNHSSENDEKLDSKTEEKISEKEKNRVTTSSTISLDNITITTNKVNGEIDDIFDNEIDLEKSPNGLILIVYNPGSSKLKFGQMVDGNLDPVMNDTFILESMGKSKMKDTKLNTTINNVLKNIYTKHLSTIANSSLKKNQTHIRVDNSTTTSIATPDISTISLNKATKKKKLE 434
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000012460 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000012460 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000012460 | 0.000e+0 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s917:20286... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s917 | supercontig | LSalAtl2s917:202865..224550 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | maker-LSalAtl2s917-augustus-gene-1.20 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s917:202865..224550+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000012460-695226 ID=EMLSAG00000012460-695226|Name=EMLSAG00000012460|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=21686bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s917:202865..224550+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTTGATGAGGAAAATTTTAAAAAGAATACAAATTCAATTCAATTTCATT
TGACAGTTTGAACAAGAAAAAGTGAAACTTTAATAGTTTTGTGAATTTAA
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TGTATACTCTCACTTGCTTGTTCTGAATATGGACCAAGTCCACAACCTTC
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TTTGCTCTTTTTCTTTTCATTTTGTAACAAATTTGCACAAGTAAATTCAA
TTTTTTCTGTGCCTATGAGTTCCAGCATTTTTTGATGGTCTTATAGGTTT
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GCTTGAAATTCTTTGGCAACTCCAAATTTCTTTGAAAATGATCAACAAGT
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TCGCAGATGCTGGTCTATCATATTTTCTAACACATGCCAAGCAGAGCTTA
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CTCTCTTTTCTCTCGGTACGCCAAACACGTACCCCACGACCTGCATAATA
TTGTTTTTGCGGCTATTTCTTAAAAGACTTAGAGCTCTTATTCCCTGAAT
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TTAAATTAAGGTGAGTACACTTAGTTATTATATATCTTCCTTTATTAACT
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TTTTTCTAATTAATTTCTTTAGTTTTCTATACCTTCTCTCTAGTAATCCA
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TTTGATGACATTGGACCATATCGCATCTACGAATTATCCACCTCTATCCG
AATGAATAGTGTCAGGMACACCAAGATTTTAAGGCCAACACTTCATCAAA
GCTTTAAACACTTTTTGTGAAGTTTGGTTCAACACATACTAATTTGCTTT
AATAGTCAATGCAACTGAGCTTGTATTTGTTTGATTTTTTTACTAGATCC
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GAGTAACTAGAAGGCTAAAGGGAACATATTGATTTTGCTCTTTTGACATT
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GTGGCTTTATGTATTGATTTGGTTTTTTCTTTATCCATTACCAATAAAAT
TGGATTATTAACTTCAATAGACGTAATTGGACGTGATAAAAGGTAGGCTA
TAAAAATGTTATACCTTTTTTGTAACCCAAGTTGTAGCTGTATTCTGAAA
TTAGAGAGAAATATCAGTTTGCAATTTGGATTTTTTTCTCTATATGCATC
GATTATCGGCTTMTWATATATTAGTAKGTCAAGCTTACTACCTTTAATTA
TCAATTTCTTGTTTCATAACCACTCCTATGCCTCCTATTTTCCAATGTCA
CGCTTGTTCACGTAAAGTATTGGATTGTTTTGTTTTAGGCGCATGCATAC
ATGTCGAAGGAACTGTTGATGATTCACTGCTTTACCAGATGTTAATAAAT
CGTCCATATTTACATAAACTCCGTCTAACCCTTGCATTATTGAATAAATA
TATCTTTAAAACGATACTCCTGAATTTTTTAGTCCAAATGACATTATAAT
GTATAAAAATGAACCGAAAGGGGTCTAAACTGAAGTTTGTGTCTATCCTT
ACGAAGCATGGGAATTTGGTGGTATGCTTTTGTGAGGTCCAGGTTAGAAA
AAAGTTCACACTCAGCAGAAAGTTTGCGAAATCATGAATTTGGGGGGCGT
ATAGTTGTTGTGGATTTTTTGATTATTTAAAAGTATATAATCCCCGAATA
TTTTCGATGATCCGTCACCCTTTTTTACCATGTGGATAGGGGCTTTCTGA
TCTTTTAATTATTTTCGCCTTGAATTTCTAATTGAACTCTGCATTGGCAG
CTTCTATTTATTTATTTACTTATTTTTTTTTAATGTTCCTTTAATTGCCA
ATGTTGATAATCCTGTAGAGAAAAACTCGTGTAAGGAGAAGGAAGAGAAA
GATTTATGGTATCATTGTTTATAATACTGATGTGATTATCAGCTGCCTCC
ATTATTATGATTTTTGAGGGTATAACGAAAGTATATATTAGTAAAATGTT
TAATGGAAATATACTTCGTATAATTGGTATATTACGTTTTTTATCCGTTA
CAGTAGCTTTGAAAACGTCCATAGCTAATCCTTATGTGACAAAAAAAATT
ATTTATTGACTATGTAATATTGGAAAACCTAACGATCATACCCAAGTCTT
TAAGTGAAGAAACTAGTGTTAGACAAACTAGTTGCGAACCCCCGTTGTTG
TTACCAATTAAGGAGTTGTTTTTGCCATTGAATGNNNNNNNNNNNNATTG
GAAAACCTAACGATCATACCCAAGTCTTTAAGTGAAGAAACTAGTGTTAG
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AATAGTACAAAATTCAGAGTTCCATTTCGTCATTTTGTGTGGATGACTCT
AAACATGCTGAAAATTATCTTAACTTCACAATTTACAATGGGGGTATTTC
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GGGAAGGGAAGAATTTACCCATGTATTTCTCCATAAATTTTTTAAACGTA
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TAGATGAATATACATGCTCTTGATATGAGATGAGGATGATGAGTGGCGTT
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ACCATCTGTTTTTCTTCCAGTAAGTATTACCAAATTCCTGGTTCTCAATT
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CTCTTTCGACTATCAGTATCTAATATTATATTAATATTGAATAATAAAGG
CGGGAATTGATAACGTTCTTGATAAAGGAAGATGTGTATTATTTTAGTCA
ATAGTCAATGATAGAATAAGTATTTCTTTACTTATATTTACTATAACAAA
ATTATTAACTTTATTAAATGGGTTGATGGAGTTGCACTGATTAAGTATAT
GTAAACATTGTGGTATTACAATTACTACATCTAACCTAGGAACCTTTTAG
TGAAATCCACATAAATATAGTATATTTCTTTTTCTAAGAATCTTTTTATT
TAAAAATTAATTATCTTACGTTTTGAATATTTTGATCAAGAAATGTTTTT
TCCAAGAACATGATCAAAGCCCAAAAAGTATCTAAAGCCCGATCCAATTC
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AGATTCTTTGGATACAAGTGGGAAGTTACTTGATGCCCTATAAACATCTA
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CAAAAATTGAAGCCGAACCCTCCAAGCGGTGGAGGCTACTTTCATGTCAA
TCTTATTGATATCTAACAGTCTGAGTGATTTAAAATGATGGTGAAATTTA
ATAGACCGGACCCTCATATTCTACGGAAATTTGATCCATATTTAGAAATT
CATACTGATGCAGTCAACGTTTAGGCTTAGCATCTTTTTTTCGGAGGGGA
GGTAGGAGCATGGAGATAGGATTACATATCCATATTCCTAAACGCATAAG
TTTTTCTCAAATTATTCGCATTTGCCTCTACCATCTTTGAAGATTAGAAT
TTTATACCTACAGAGAAAAATGAAAAGAGCTGAAGGCACCGCTTCAGCAT
CGCTCTTGTGAGGGGGAAGTAGTTTTATTGCAGATCATTTATGTTATTAA
GTCTCCAATTCCTTCGTAACTCCTTAGATAAGTGTGATCACTTGATCCCA
TTGTCTTCCAATGTATCTCCTGGATCTTTGTTTTTGGTAAAAAAAAATAT
CCTGGAATTTCAATGGTGGTTTGCATGAAGTTTCCTTTTTAAGGCACATA
TAAAGAATTTCTCCTCGAAAAAGCGACCTTTAATTGGCTATTATACCAAG
AGCTCGAAATGCATAATGTGACCGCATAACATTTTAAAATAAATTCTAAA
TAAATACAGTTAATATTGATGATTGAAATATCTAAAAACTTTAGAAATAT
GGTATTAATAGCAAACGACATTAGAAAAAAAATTTAAATAGACAACTGTC
ATTATATTGTTTCCCTTATTTTTTTAAAATCATTGGAGACTGATAAGTTT
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AATACATGTATGAAGTCTGTATTTTCCCATAAATGAATCTAAACATAAAG
AGAAAATAAGGTATTTTCTTCAAACAAGTTTGAAACAAGGAACACAAGCT
CAAGCATAATTTATAAACATTATTTCTTTTAATTTATAAAAGAATATATA
CAAAAACCTTCGTCTGCGATAAACTCTATTACTTATATAAAGATGGTTTG
CGACTGTGTGTACTTCTAGTTAGGTTGAACATATAGTTAGGGAAATAATT
TATCACTAAACGACTAGGTTGATTTTTTTACTTTTATCACTAAAATAATT
AAACTCGAGCTTTATATTTAACAATACATGAATAGATTCTAGTTTCTAGC
TAGTAGTTACACTTGTTATTCTATTGTAGGTAAAAGTAATATCAAAATGC
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TATCGATAACGTTGGATCTCCATGCGCTACTTGGTTTAATGCTTTNTCAT
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GAATAATACTGATGATGTTTCATTGGATCAGCTATAATCATGTTACAAGA
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AATTCCACTCGGAGTCCGACAAGTACTGACAATTATAACTCCGCAACAAA
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TATAAGGAAATCTTTGCATATCCAACTCAATTTCTACTGGTATTGATAGA
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CGAATTGTAACTTCAGAGAAGCAATACGTTAACTTCTGTAACATCTACAT
TGTATTCCCAACCTATGTCCCAGATAACCTTATAATTTATGGGTTGCCTA
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AATAATAAAAAAAAAAAAAAATTATCCTATGTTTCTCCTGTATTCGTAAC
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TGCTATTAATAAGGTCTTTATAAGTATCATCCACGTATGATAGATGCTCT
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ATCATTACTCATTTGGGGAACTTTAGCATTAAGATATTTCTGTGGTATTT
CAACAAACCAGCGTTTTTGTGTGAAATCATAGACTGATGAATCTTTCATA
TGTTGTTTTCCTTAGAAGTCCATATCTGTCAGTAATTTATCTTTAAGTTT
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TTTTTCAAATATAACATTATAGATGGATGTTATTTCATAATTTATATGAT
CAACATCTTCAAGAATTATATTCTTGCTTTTGTTACACTGTCAAATATAT
TGATATTTCTGGTGAGATTCTTTGCTCTTCTTTCATGAGTTGAGAATAAT
AAGACACAGTAATCAGGATTTGAAACGGTCTTTTGAATATAATCAGGTAA
CTTTCTCTAAAAGTAGCATCTTTTAAATAATTCGGATAATTATAAGTATT
GGTTGAAGTGGCTCTCTGATTTAATTAATTGTTTAACCTTCATAAGTTTA
GTGCCATATTTGTTGTCTTAACTCAATAAACGAAAAATAACATACATTTC
TCTTGTAAAAGTGAGATCATCAGCAACGTTTATTCTCAGAACGTTAAGAT
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AGTAGTGCTCCTATCTTGATAACTTTCTACTCAAATGGGCTCACTAAATA
ATACATAAGAGTCCCTCAAATACCTATGTATTTAATAACATTGAAGTGAT
TTGTAGGAAAATAATTGTTTTTAACATTAATTAAAGAATTAAATTGTGAA
TTAGAATGAGCTGTTTTTACATTCTTTGTGGAATTATTTTATACATTAAA
TATTCTTTTCTATATGTTGATCATTATACATCGAATTATTTTTATCTAAA
ATCTAAATCATAGTAATTTTTAATATTTTTGTAGTATGATTTTTTAGAAC
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GCAGTTTCTAATACTGTAATGACCTATTTCATGTGTCTTGAGATATTTAA
AATATATCCCTTTTCTTCAACAAACAAACTTAAATTATTTTGCAGTCATT
TTGGGAGCTCTGGGATATTTATTAGTTCTGTGGAGATAATGCAATCTGCA
AATCAAACAACTTATTATATAATTATCTATGTTTAAGTTAAATTTTGAGT
TCTTTATTGATAGCAGCTTCTTCCTCCATAGTTGAAGTAATGAGAGTAGA
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AATGTTTATCTTAATTCATTTTTTGGAGATTTGATGGTATTTTGTTTATA
TCATTAGCTTTATTAAATTATTAGGGTTTCCAATAGGTGATTGTATGGCC
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ATATAAGTATGACTTATAAAATCTATTATACTTCCATATGTTATTAATGG
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GGATTACTTGCATTAGGAAAATTTGTATAGGATAAAGCTTGTCCGTCTGA
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AAGCCAAGTTATGGACCTTAACAATTGACTTATTCACTCATTGAACGAAT
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TCATTTGTAACATAAAACTTCAGTGATATTTATCAAAAAATATGTATAAT
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TTTCATTAATATTTATAACTAATATTAATATCCATTCCTTTGTCAATGTT
TAATTCCATTAATTAATTTATTTGTTTTTTATTAAATGTAAATATATATT
TGAACACTAATGAAACGGCTATAATTTATTTTTATTCAACACTTCATGTA
ATGATCTAATATGGTTAATTATGGTACAAATGGTTGGCGAATGTTCCAAC
CCCTTCAACATATTAGGCGCCTTATATTTATCTTAATGCCATTGGATTTT
TAATTGTCCTAATTCTATCCCTACAACTTTTAAGAAATAATTCCCATAAA
TCTTGATAATTTTGAAAAAAAACTATTTTATAAATATTTGTGTATAATAT
CACATGATATTATAACATGCATCCATTAATAATTAAGACATGTAATTGAA
GACACATTTAAATTAGATTTGATCGAAATTATTTGTACTAGCATTTTGTT
TTATTTAATATTTAATTATTTACATACATATATCTATAAGATAATATTAT
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TATATTGTGCTATTACTTCTTGCAATCTTAGATTACAAGTTTTGTTAATA
CGTTTTATGGGTACAATATTGCCACGTTCAATATCACTTTTTTTTTATGC
CAAACTTACTTCTATTTTTAAATAATCTATCAATTTCCAAAGATTTGGAT
GTTCATTAGTAATAGAGCGTTGAAGGCTATTTTGGAATCCTTCTACACTG
TTATGAGTTCTTCTTTTGTTATTAATTGTTCTCGAGCAAACATTCCACAG
TTCAAGAAGGAATGTTGGTGCCACTTTACTTCTCCATTCTCCATGGCCTC
GCATGTAATGTGTCTCAAAATAAGAAACCATCTCTTGGTCTAAATCACGG
TCATCGACAATCCCAACAAATCCATGAATAATATCTGCAATTGCAAAAAT
GCTAACGCGGAGAAACATTTCATTTTTAAATTAAAATCGGCTTCATTGGA
ATATCTCAATTTTAAACCTATGTTTTCATTGTCTCTGTAGATATTTTTTA
GGTATATGGAATAAAAATCCCGTAATGTTTGTTACAGGAAACACATTTCC
AAAGGTATTCAAAATTGCCTTTTCAAAATTCATAATTAATGTTTGAGGAC
ATAATTATGTTTTTAGTTGCTTCAAAGTAGCAAATAGTCAACTTTATGTA
GCTTTGTACTTATTTGGGAGTAAGATAAATCATCTTGCCATCTATACATA
TCCAAGAATTATGTGCAATGTAAAAAGTTAGTAATAATTTTCTGGGCAGC
ATTTTAATGTTCCGTCAGAGACCCAATCTTTACATGAAGCAAAATTCTCT
AATGCACCCTTAAATCCAAAAAACAATATTCTTTTAGGATCGCTTTCACC
ACTATCTTATTATCAAAATTGTTCACCGTTTCTCAAGAATCTGTAGTCAA
TATCCACATCTTCCAATAGGGATTGGAGGAGCTTGATTTACTTGCTGTCT
CCAGTCTCGAATGCTACGAGCCAAATTCAATTAATTGGACTAAAATGATA
CAGTGTTTTCGTCTAACTTGAATGACATTGGTCCAATTAACAATGCGCAA
GGATAATTGTGAAGTCAGGGCTTGGGATTTAATATTTGCTTTTTTTGCGT
ACATTTAGGGTTTGGATCGACTGCTCCGATGGTCGTGTTCTCCTATTATT
TTGGAAACACAAGTATGTTATTTGGTCGTATTTTCGGTTAACTCTGTTGA
TATAATTATAATAATCCACTAATTCCTTTCCGTTTCTTTAACTTTTTATT
AAATAAACCATTTTTACAGTTTATATATAGATTGTAAGTACTAAATGGTA
AAGAAATATCGAGAGTTTCAAAAGTGTTTAAATATATATTAACATTTATT
AAAACAAATAAATTAATTAATGGAATTAAACATTGACAAAGGAATGGAGT
CAATATTATTTATACACATTAATAAAGTGGGAGCGGATTCTCATTCAGAA
TTTGAATGAATGAATATATAAAGTTGTATTATACGTATTGTTTGATAAAT
GTCACTGAAGTCCATTATTACAAATGAAGTTGCATATTCAAATGTCATTG
TATCATATTATAGAATGCACTCAAAAATTCGTTGAAAAAGTCTATAAGGC
ACTTGTTAAGGTTCTCATAACTTGGCTTGAGATCGATTGGAGGTATGAAT
TTCTACTTCTAAAAATATAACTCTGGTAATTCAAGTCCCTTGAGTGACAA
CGGTAGCTTTCGGTAAATAAGAAAGAAGATTAATGAAGAGACGAAGAACA
TCGTTTTCATCTCTCTATTTCAGTCGAGGTTGCTCCAAATATACTGATCT
GTACATTTTTCTTCCCTTATATCTCTCATTTCCTTGTGCTTTCTTACGAT
CCCACACTGTGGGATCGTAAGTGCACCCTTGAGTGCCTCCTCGAATCCTT
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AGTTCATATCGAAGAGTAAACCATGGCTCTTGCCTAATCTGATCTTACGC
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AAAGTCTAATGATAATTGATAATTAAGCGAATAGCAATTCCTCCATCCGA
ATTGCTGTCCTGTTTGTTTACTTTTCTTTAATCATATATTTATTCATTAT
GAATATTACTTATTTTGTCTCTGGTTCGAACACATTAGTCATTACGTAAG
AGTGATTATTATTTACATTAAATAAAAGAAGGCAAGTCTTCCGCCGGGCG
AGCTCTATCCTATAACAAGGTTAATAAAAATACAAGGTTATACCATAATG
CATGTACGACTGATGTTTGACTTCCACCACGGTTTTAATATTGACGCCAT
KGTAAATGAGTAGTTGCATGTTTTGTCAAAATCTGTTTTTCTTTCCCAGC
AGTCGGTACGATATATTAAATTGAAAATTCTAGCAATAGCAACATCATAG
ACTATGAGGGGTTCCATGTTTTATCCGCCTGGCATGCCCAGAAGTAAATA
CTATACATCAAATTGAATATTCTATTAAGGCCGATTACATGATAGTCTAA
CCTTGTATTTCTATTATCCTTGTCCTATACGAATTTTCCCAGTGGGAGTA
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ACTTATCAATGTTATATATGAAGGAAGTGACTACCTTTAGTATTTACACT
AGAATAATGTATATATTATAAAGTTCTGACACTAGATAAAACATGTAAAT
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