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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000012460 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000012460 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s917:202865:224550:1 gene:EMLSAG00000012460 transcript:EMLSAT00000012460 description:"maker-LSalAtl2s917-augustus-gene-1.20") HSP 1 Score: 849.736 bits (2194), Expect = 0.000e+0 Identity = 434/434 (100.00%), Postives = 434/434 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MYVKVLINLYFILFISGNTNGKQSDILNFENHWKKENNMLRNKKILISIEDKLNNIEEIVNERSDSKKNVDEAIKPDLKGSKYSKPEVLHGKMARIKVNMAIKSSGINNLPMQRNNKKSVNYTYNSRNMDKKVKNMDQFFPEVGKIKLSRKKRNSESVDFSSNPNRYERTSKIKNEENVIFNNELQFKNLIDRVEKTMNKIKSFNKNNRTNNGSFDIPHNKLEKSHQNIVPSIKIRNKRSLNKSKDKKSSKLVNHKKKKHNFKNHSSENDEKLDSKTEEKISEKEKNRVTTSSTISLDNITITTNKVNGEIDDIFDNEIDLEKSPNGLILIVYNPGSSKLKFGQMVDGNLDPVMNDTFILESMGKSKMKDTKLNTTINNVLKNIYTKHLSTIANSSLKKNQTHIRVDNSTTTSIATPDISTISLNKATKKKKLE 434
MYVKVLINLYFILFISGNTNGKQSDILNFENHWKKENNMLRNKKILISIEDKLNNIEEIVNERSDSKKNVDEAIKPDLKGSKYSKPEVLHGKMARIKVNMAIKSSGINNLPMQRNNKKSVNYTYNSRNMDKKVKNMDQFFPEVGKIKLSRKKRNSESVDFSSNPNRYERTSKIKNEENVIFNNELQFKNLIDRVEKTMNKIKSFNKNNRTNNGSFDIPHNKLEKSHQNIVPSIKIRNKRSLNKSKDKKSSKLVNHKKKKHNFKNHSSENDEKLDSKTEEKISEKEKNRVTTSSTISLDNITITTNKVNGEIDDIFDNEIDLEKSPNGLILIVYNPGSSKLKFGQMVDGNLDPVMNDTFILESMGKSKMKDTKLNTTINNVLKNIYTKHLSTIANSSLKKNQTHIRVDNSTTTSIATPDISTISLNKATKKKKLE
Sbjct: 1 MYVKVLINLYFILFISGNTNGKQSDILNFENHWKKENNMLRNKKILISIEDKLNNIEEIVNERSDSKKNVDEAIKPDLKGSKYSKPEVLHGKMARIKVNMAIKSSGINNLPMQRNNKKSVNYTYNSRNMDKKVKNMDQFFPEVGKIKLSRKKRNSESVDFSSNPNRYERTSKIKNEENVIFNNELQFKNLIDRVEKTMNKIKSFNKNNRTNNGSFDIPHNKLEKSHQNIVPSIKIRNKRSLNKSKDKKSSKLVNHKKKKHNFKNHSSENDEKLDSKTEEKISEKEKNRVTTSSTISLDNITITTNKVNGEIDDIFDNEIDLEKSPNGLILIVYNPGSSKLKFGQMVDGNLDPVMNDTFILESMGKSKMKDTKLNTTINNVLKNIYTKHLSTIANSSLKKNQTHIRVDNSTTTSIATPDISTISLNKATKKKKLE 434
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000012460 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000012460 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000012460 | 0.000e+0 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s917:20286... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s917 | supercontig | LSalAtl2s917:202865..224550 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | maker-LSalAtl2s917-augustus-gene-1.20 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s917:202865..224550+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000012460-695226 ID=EMLSAG00000012460-695226|Name=EMLSAG00000012460|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=21686bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s917:202865..224550+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTTGATGAGGAAAATTTTAAAAAGAATACAAATTCAATTCAATTTCATT
TGACAGTTTGAACAAGAAAAAGTGAAACTTTAATAGTTTTGTGAATTTAA
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TGTATACTCTCACTTGCTTGTTCTGAATATGGACCAAGTCCACAACCTTC
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GACTCAGTACTAGACGAGAAATCTTAACTAAAACAACCTTATCTTATTTT
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CTCCCAACAAGAAATGCAGCTCTGGAGGAGGAATGAGTTTCAGAAGCTGT
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TTTGCTCTTTTTCTTTTCATTTTGTAACAAATTTGCACAAGTAAATTCAA
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GCTTGAAATTCTTTGGCAACTCCAAATTTCTTTGAAAATGATCAACAAGT
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TCGCAGATGCTGGTCTATCATATTTTCTAACACATGCCAAGCAGAGCTTA
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TTGTTTTTGCGGCTATTTCTTAAAAGACTTAGAGCTCTTATTCCCTGAAT
CCTGAGGCTCACCACATTTATGTGCTCGGGCCTTTACGAGACTTGGTATA
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AATGAATAGTGTCAGGMACACCAAGATTTTAAGGCCAACACTTCATCAAA
GCTTTAAACACTTTTTGTGAAGTTTGGTTCAACACATACTAATTTGCTTT
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GTGGCTTTATGTATTGATTTGGTTTTTTCTTTATCCATTACCAATAAAAT
TGGATTATTAACTTCAATAGACGTAATTGGACGTGATAAAAGGTAGGCTA
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TTAGAGAGAAATATCAGTTTGCAATTTGGATTTTTTTCTCTATATGCATC
GATTATCGGCTTMTWATATATTAGTAKGTCAAGCTTACTACCTTTAATTA
TCAATTTCTTGTTTCATAACCACTCCTATGCCTCCTATTTTCCAATGTCA
CGCTTGTTCACGTAAAGTATTGGATTGTTTTGTTTTAGGCGCATGCATAC
ATGTCGAAGGAACTGTTGATGATTCACTGCTTTACCAGATGTTAATAAAT
CGTCCATATTTACATAAACTCCGTCTAACCCTTGCATTATTGAATAAATA
TATCTTTAAAACGATACTCCTGAATTTTTTAGTCCAAATGACATTATAAT
GTATAAAAATGAACCGAAAGGGGTCTAAACTGAAGTTTGTGTCTATCCTT
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AAAGTTCACACTCAGCAGAAAGTTTGCGAAATCATGAATTTGGGGGGCGT
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TTTTCGATGATCCGTCACCCTTTTTTACCATGTGGATAGGGGCTTTCTGA
TCTTTTAATTATTTTCGCCTTGAATTTCTAATTGAACTCTGCATTGGCAG
CTTCTATTTATTTATTTACTTATTTTTTTTTAATGTTCCTTTAATTGCCA
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ATTTATTGACTATGTAATATTGGAAAACCTAACGATCATACCCAAGTCTT
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TTACCAATTAAGGAGTTGTTTTTGCCATTGAATGNNNNNNNNNNNNATTG
GAAAACCTAACGATCATACCCAAGTCTTTAAGTGAAGAAACTAGTGTTAG
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ACCATCTGTTTTTCTTCCAGTAAGTATTACCAAATTCCTGGTTCTCAATT
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CGGGAATTGATAACGTTCTTGATAAAGGAAGATGTGTATTATTTTAGTCA
ATAGTCAATGATAGAATAAGTATTTCTTTACTTATATTTACTATAACAAA
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TGAAATCCACATAAATATAGTATATTTCTTTTTCTAAGAATCTTTTTATT
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TCCAAGAACATGATCAAAGCCCAAAAAGTATCTAAAGCCCGATCCAATTC
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TCTTATTGATATCTAACAGTCTGAGTGATTTAAAATGATGGTGAAATTTA
ATAGACCGGACCCTCATATTCTACGGAAATTTGATCCATATTTAGAAATT
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GGTAGGAGCATGGAGATAGGATTACATATCCATATTCCTAAACGCATAAG
TTTTTCTCAAATTATTCGCATTTGCCTCTACCATCTTTGAAGATTAGAAT
TTTATACCTACAGAGAAAAATGAAAAGAGCTGAAGGCACCGCTTCAGCAT
CGCTCTTGTGAGGGGGAAGTAGTTTTATTGCAGATCATTTATGTTATTAA
GTCTCCAATTCCTTCGTAACTCCTTAGATAAGTGTGATCACTTGATCCCA
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CCTGGAATTTCAATGGTGGTTTGCATGAAGTTTCCTTTTTAAGGCACATA
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AGCTCGAAATGCATAATGTGACCGCATAACATTTTAAAATAAATTCTAAA
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GGTATTAATAGCAAACGACATTAGAAAAAAAATTTAAATAGACAACTGTC
ATTATATTGTTTCCCTTATTTTTTTAAAATCATTGGAGACTGATAAGTTT
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CAAAAACCTTCGTCTGCGATAAACTCTATTACTTATATAAAGATGGTTTG
CGACTGTGTGTACTTCTAGTTAGGTTGAACATATAGTTAGGGAAATAATT
TATCACTAAACGACTAGGTTGATTTTTTTACTTTTATCACTAAAATAATT
AAACTCGAGCTTTATATTTAACAATACATGAATAGATTCTAGTTTCTAGC
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TATCGATAACGTTGGATCTCCATGCGCTACTTGGTTTAATGCTTTNTCAT
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TGCTATTAATAAGGTCTTTATAAGTATCATCCACGTATGATAGATGCTCT
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ATCATTACTCATTTGGGGAACTTTAGCATTAAGATATTTCTGTGGTATTT
CAACAAACCAGCGTTTTTGTGTGAAATCATAGACTGATGAATCTTTCATA
TGTTGTTTTCCTTAGAAGTCCATATCTGTCAGTAATTTATCTTTAAGTTT
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TGATATTTCTGGTGAGATTCTTTGCTCTTCTTTCATGAGTTGAGAATAAT
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CTTTCTCTAAAAGTAGCATCTTTTAAATAATTCGGATAATTATAAGTATT
GGTTGAAGTGGCTCTCTGATTTAATTAATTGTTTAACCTTCATAAGTTTA
GTGCCATATTTGTTGTCTTAACTCAATAAACGAAAAATAACATACATTTC
TCTTGTAAAAGTGAGATCATCAGCAACGTTTATTCTCAGAACGTTAAGAT
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AGTAGTGCTCCTATCTTGATAACTTTCTACTCAAATGGGCTCACTAAATA
ATACATAAGAGTCCCTCAAATACCTATGTATTTAATAACATTGAAGTGAT
TTGTAGGAAAATAATTGTTTTTAACATTAATTAAAGAATTAAATTGTGAA
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TATTCTTTTCTATATGTTGATCATTATACATCGAATTATTTTTATCTAAA
ATCTAAATCATAGTAATTTTTAATATTTTTGTAGTATGATTTTTTAGAAC
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GCAGTTTCTAATACTGTAATGACCTATTTCATGTGTCTTGAGATATTTAA
AATATATCCCTTTTCTTCAACAAACAAACTTAAATTATTTTGCAGTCATT
TTGGGAGCTCTGGGATATTTATTAGTTCTGTGGAGATAATGCAATCTGCA
AATCAAACAACTTATTATATAATTATCTATGTTTAAGTTAAATTTTGAGT
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AATGTTTATCTTAATTCATTTTTTGGAGATTTGATGGTATTTTGTTTATA
TCATTAGCTTTATTAAATTATTAGGGTTTCCAATAGGTGATTGTATGGCC
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ATATAAGTATGACTTATAAAATCTATTATACTTCCATATGTTATTAATGG
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GGATTACTTGCATTAGGAAAATTTGTATAGGATAAAGCTTGTCCGTCTGA
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TAATTCCATTAATTAATTTATTTGTTTTTTATTAAATGTAAATATATATT
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ATGATCTAATATGGTTAATTATGGTACAAATGGTTGGCGAATGTTCCAAC
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TAATTGTCCTAATTCTATCCCTACAACTTTTAAGAAATAATTCCCATAAA
TCTTGATAATTTTGAAAAAAAACTATTTTATAAATATTTGTGTATAATAT
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CAAACTTACTTCTATTTTTAAATAATCTATCAATTTCCAAAGATTTGGAT
GTTCATTAGTAATAGAGCGTTGAAGGCTATTTTGGAATCCTTCTACACTG
TTATGAGTTCTTCTTTTGTTATTAATTGTTCTCGAGCAAACATTCCACAG
TTCAAGAAGGAATGTTGGTGCCACTTTACTTCTCCATTCTCCATGGCCTC
GCATGTAATGTGTCTCAAAATAAGAAACCATCTCTTGGTCTAAATCACGG
TCATCGACAATCCCAACAAATCCATGAATAATATCTGCAATTGCAAAAAT
GCTAACGCGGAGAAACATTTCATTTTTAAATTAAAATCGGCTTCATTGGA
ATATCTCAATTTTAAACCTATGTTTTCATTGTCTCTGTAGATATTTTTTA
GGTATATGGAATAAAAATCCCGTAATGTTTGTTACAGGAAACACATTTCC
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GCTTTGTACTTATTTGGGAGTAAGATAAATCATCTTGCCATCTATACATA
TCCAAGAATTATGTGCAATGTAAAAAGTTAGTAATAATTTTCTGGGCAGC
ATTTTAATGTTCCGTCAGAGACCCAATCTTTACATGAAGCAAAATTCTCT
AATGCACCCTTAAATCCAAAAAACAATATTCTTTTAGGATCGCTTTCACC
ACTATCTTATTATCAAAATTGTTCACCGTTTCTCAAGAATCTGTAGTCAA
TATCCACATCTTCCAATAGGGATTGGAGGAGCTTGATTTACTTGCTGTCT
CCAGTCTCGAATGCTACGAGCCAAATTCAATTAATTGGACTAAAATGATA
CAGTGTTTTCGTCTAACTTGAATGACATTGGTCCAATTAACAATGCGCAA
GGATAATTGTGAAGTCAGGGCTTGGGATTTAATATTTGCTTTTTTTGCGT
ACATTTAGGGTTTGGATCGACTGCTCCGATGGTCGTGTTCTCCTATTATT
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TATAATTATAATAATCCACTAATTCCTTTCCGTTTCTTTAACTTTTTATT
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AAGAAATATCGAGAGTTTCAAAAGTGTTTAAATATATATTAACATTTATT
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CAATATTATTTATACACATTAATAAAGTGGGAGCGGATTCTCATTCAGAA
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GTCACTGAAGTCCATTATTACAAATGAAGTTGCATATTCAAATGTCATTG
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ACTTGTTAAGGTTCTCATAACTTGGCTTGAGATCGATTGGAGGTATGAAT
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TCGTTTTCATCTCTCTATTTCAGTCGAGGTTGCTCCAAATATACTGATCT
GTACATTTTTCTTCCCTTATATCTCTCATTTCCTTGTGCTTTCTTACGAT
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AAAGTCTAATGATAATTGATAATTAAGCGAATAGCAATTCCTCCATCCGA
ATTGCTGTCCTGTTTGTTTACTTTTCTTTAATCATATATTTATTCATTAT
GAATATTACTTATTTTGTCTCTGGTTCGAACACATTAGTCATTACGTAAG
AGTGATTATTATTTACATTAAATAAAAGAAGGCAAGTCTTCCGCCGGGCG
AGCTCTATCCTATAACAAGGTTAATAAAAATACAAGGTTATACCATAATG
CATGTACGACTGATGTTTGACTTCCACCACGGTTTTAATATTGACGCCAT
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AGTCGGTACGATATATTAAATTGAAAATTCTAGCAATAGCAACATCATAG
ACTATGAGGGGTTCCATGTTTTATCCGCCTGGCATGCCCAGAAGTAAATA
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CCTTGTATTTCTATTATCCTTGTCCTATACGAATTTTCCCAGTGGGAGTA
ATCCCAGTACATTGTTTCCCTGTACAAATTTTCCGTATGCAAACTTTCCT
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ACTTATCAATGTTATATATGAAGGAAGTGACTACCTTTAGTATTTACACT
AGAATAATGTATATATTATAAAGTTCTGACACTAGATAAAACATGTAAAT
ATAAATGGCTTCTKCAYARCCCKCKARACCCCCCCCCCCCCCTAGAATAT
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