EMLSAT00000000015, EMLSAT00000000015-695862 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000015
Unique NameEMLSAT00000000015-695862
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1004supercontigLSalAtl2s1004:5890..19048 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000015 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000015EMLSAG00000000015-682781Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000000060EMLSAE00000000060-708988Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000061EMLSAE00000000061-708989Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000062EMLSAE00000000062-708990Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000063EMLSAE00000000063-708991Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769191auto769191Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000015EMLSAP00000000015Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000015

>EMLSAP00000000015 ID=EMLSAP00000000015|Name=EMLSAP00000000015|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=361bp
MGRKKIQITRISDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEISVIIFNS
HNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYDQPHESQTNKDILESINRKGIGGPDSPE
GDMDYPLNDSPPPNEMMQDNTPENDFQNMLQQNNARNNQLNHSSTGLQNQ
NYVTGNHSATTYDNGSSLVHHMHQPQTTTALMTQQQQSQQQQQQQSNNSL
IRMLEMGNGNFINQQPSPIPIHQPNGNNKATNNEQQPSSSSPDSLNSSSS
PPNDKDILNLHHXRPIHNIQSGLFGSMNTPSSAPPPQMFNPFQQTTNTTD
FTNLTDLRIAHPAISQWLQQAGSVHPPGPNPPGSRSPIKEEPMSPNRGSP
NSGGSSDYAPL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1004:5890..19048+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000015-695862 ID=EMLSAT00000000015-695862|Name=EMLSAT00000000015|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13159bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1004:5890..19048+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATTTGTATATGTTGTTAAGAGTGTGTTGACCTTCCTGATATCTGCTTCTC CTGCTCTCTCTCTCTCCTTTTCTTTTATTTCTTGCTCCTTCTTTTGCTGT TGCTGCTGCTAATTTCTTTCTTTCTCTTTTTCCTTTAATAACAAAAATAC AAAATTACACATTTTAGTATTTATTTCGTCTCGAAGGAAGGGGTCCTTTG CCGAATTATTCCAATTTTAAACAAGTGCTTAAAATAAAACAACTGGAAAA AACAAGTGACATTAAGTTCGTCGTTTTTTTCTCTTCATCCTCTCTACTAG GTAAGCATGGTCTTTCATTTTGCTGTTGTTTGTGACGCCATCATTATTAT TTTTATTATTCTACTGACTGAATATTATGTGGAATTTATTATAATTACAT ACAACATAGGCCACGTTTCTGGCTAAGTAGGAGTTGAGGAGACAATTTTA ATTTAAGCATGAATTTTATTGTATATTATACTCTCCTCCGAATGAGCCTT TTTGAAAAACCGGAAATTGAACTGTCGTAGTTAAAATTTAATATATTTTT TTATTTATTATTTATTTGATAAACATGAGAGAAAAGCTAATTTAAATAAT GATCTTCATATATGTATCACATATTTTGTAGTAATAATATATGTGCCTAC ACATATGTAGCGTTTCACCTTTTTATAGCCTCAAGGTAATGAAAGACATC TAAACAACTCTTTCTCCATGTGATCAAAACTAAATTGTTTATTACTAACA TCTATGTTAGTAGATCAAAATCCCTTCTTTGAAATTCTTCTCCTTCTCTT ATTTCGTTGAATCATAATACCATTCAAAATATTTGACCTGAGCGTTATGA CCTTTCTTCTTGTAATTAATTCCCTTCCCTTAGAAATGTGCGTTTGAGTA TTATTTTTTTTTTACTCAGTCTAAAAGAATGACTATCATAATTTTGTTTT AACTTTCTTTCTTTATCTTTTTTTACACGTCTTCATTTATAGCCTCTTAA AGCAGCTCCCTGTATTTCTCACAGTGTCGTTGTTTTAACCCTTATAAAAA TCATCAGCATTTATTTAGTAACAAAAAAGAATGAATTTACGATTCTTTGT ACATATATGATATTTTTTAAATAGTCTAGACATGTACATATGTGCTATAA AAATATAATCTCAGGAACTTATTACTACAGCCAACAATTCCANNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTAAAAAACAAATAAG TAATCCATAGAAACGCTCATAACTAACTGTCATTTATTGATGTTGATTCA TATCCTTGCGGATTGCAAAGGGAGTCCTTGATTGTGAGTTTGACTTATAA GCAAACTCCTTTAATTCAAATCCTTTATATGTAGTATATTCAAAATTCCC GCCTCTTTTTTAATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTTTATATA AATTGACAGCAAAAAGTTGGTACTGAACTTTTCCCACAAAAAAATAAAAC AAAATGCGCCATTCAAATCCTTTTCGCCTCCATATTAGGTCATCATTTGC AGCTGTCATTGATGAATTTTTATTTATTTAACTGTATGTAAATGATGCCA ACAACGACTACAAAANTTCGTTTTTTTTTTGTTGAGTTTAGAAATAATCC GAAAAAGAGTAGTAGTTTGTTCTGTGGTAGAGCTCTTTTATTCGCTCTAA CACAGGTAAAAAAAAATCCTGTAGATTGCTAGCATTTTCGTTTTACAATC CTTTCTTTTGTGGGTTCCTCAATAGATCATGATGGGTTATAAGATTTTTA ATCCTTCAAAATCGGTACATCTGTAATAAACCTCTCTCTCTCTCTTATTT AAGGAAGCGAGCAAAATGTCCACGATTAGAGAGATTGTAATTTAATATGG AAGATTTTTTTATTTTTAAGGAACTCTTGATTGTTTTTTCATAAATTATA ATGAGAGTGGATAATGAATATATGAATGATAAGATAATATCTCTAAATTT CCCATCGTCCTTTTCGAGTCAAGGACCTGGAGGGTCTAACAGATATATCC GTACAAAGTTTGACTTCATCAAGATGTATAATGATGGCGTTACTGGTAAT GCAGATCGTGTGTATTTGTTAGCTGTACCCGTTTTTTTTTTTTTAAATTG GTTATCTGAATAAGGTATTTTCTTTTCTTTAGCTATTAGACTCAATTATA TTCAAAACCTGATTAAACATTTGTGTGTGCTCATAAAAGACTGAGAGTAA CCTTGAGATTTGTAGCTGAGTTACAACTGTAAGTCCTTGTTGGACTCCCG AGTAGAATTGAGGATCACCATCAGAGTAATTCTTGCAAATACCTTGTTTA TTTCCTTCTCATCCTCCTCCTCCCTTGTCAGAGGTAATTGATGCTGATAT CCTCCAAAACATTCTTCAAATTGTCAAGGTTACAAGATCGACGTCGGAGT AACTCCACCCATTATCATTGCTCATGCTAACTCAAACTATATATTTTAAA GCAACCCACCTATTTCTACTATTAAATAGAACAGCGACTCCCAACTGGGG CTACGCGAAGACTTAATGCACTGCGGTGTACCATAAAGGGCTCCGTGAGA TTATCTAGGTCATCAAATAATGTATTTTTTTAAAAGTCTTAAAAAAAATC CTGAATCCAAATATTCAAGTAATATAAGTTTTTTCATCCCAATATACGTA TAGGGTCGCTGTAGTGTTGTTAAGATTGGGAATCACTGAATGTCATAATG ATGTAATTGGCTGACTATGAGTTTCTCCCACCCCTTTTTGGTCAAAATAT TAAGAGCATTGCTAGATTAAAGAGCGGTACGGCGGACAACTTCTCGAGTC CCTTGCTTTATGTACTTATAACAAATGATCCTTAAGAATATATTTTTAAA TTAGCGAATAAGAAATCCGTGAATTCTTAAATTGACTGCGCCCCGCATAT TCTGAAACCAGGAGTACTTGAGAAATGATGTAATTATGAGGGCTACGTAA TAAGTGGAATGATTATAAATCCGGGTTCCAAGGGAGTAGTGTCGTAATAA TTAGGGGCCATTCTGCGGCCACTTTTGCTTAATATTTATAGTTATCACAA TAGAATAATCCTCTTGGCTTAAAAAAATTAATGTAATAATTATTTGTTAA AATTTTATACCAACCCAAAAAATGTAACTTTAAAATTAATTTTTGTTTGC CTTTGTTATTTATAAAAATGACAAAAACATTCTGTCAAAAATTCAGCCCC TCTCATAATACTTACACTCCCTTCCCTCCAGGGACGCTCCTAATGACGTC ACCGTATATAAAATGGGCCCCATTTGAAAAATACATTATAACAACGGTGG TTTCAAGATTTCATTAGGGGTGTTATTGTTATCAAAGAGTCCCTCCAGGT CAAATTAATTTATGTAGGTATATCATATTAAAACATCATTTGTGAGAGCA TTTTCACTGACGTCATAAATTGCATCGTAATTGCAGGAGACGCCATCTTA AAATTGATATTTTTACTACCTAAATGGACACATTTCCTAAGAAACTTGAT AGTACTTCATCAAATGATTTTAAAAATATAAAAAAAATTAACACCTGCAC TAAATACTACTTGATGACAATGATATAATCAGTGATATTTGAATTAAATC AAAGTCATATGTACTGAAATCCATATGCAGTGTCTAAATTTCTACAATTA TTAATATTTTTTGATCGATTAGGTCGAGAAAAGTTGGGTAATTAGAGAAA AATATTTTATTATTTCAATCACTTGAAATTGTTAACGTCGTCAAAACATT 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CCATTTTTTTCTGAAATTTTTTTTTTTGGTTAGGAGAATTTTTTTTTTCA TTATGGCAAATTGTGGAGGAGATTAAAAAACTTAATATTTCTAAAAAATT TAATTTTCTGTGAATAGCTAAGGATTTTTTCCAAAAAATTGAATATTTTG AATTTTTTTCCAAAAAATTTAATTTTTTCTGAATAGCTGTGGATTTTTGC CTTTTTTCAAAAAATTTTATAAATGAAATTTCCATCTTGAATTTTTTTTT TCTAAAAAATTTAATTTTCTCTGAAGCGATTTTTTGAAATTTTTTTTACA CAAAATTTAATTTTTTTTTGATTAGCTATGGATTTTTTTTAATTTTATGT GAACAGCTGTGGACTTTTTTTATTATTTGTGAATGGCTGTAGATTTTTAA ATTTAAATAAAAGAAAAAAAAAACCCTCTTCAAATTGCTTCCGCTTTTTT TATGGTATATTTTATACACCTATGGAAATAATAGTATCTAAGGTGTTCAA ATAAGATTTGACATTATTTGTGACACATCCAATCATGATCTTTAATTCTT CCCACTCTTCCTCATTAGAAGATGAAATAAATGAAATAAATGACTTTGGG TCTTCAAACGTGTACCCTTTTCCAATATTTTTTAGCAAGAACAGTTTCCC TTTCTAAATTCAAATAATAACGATATATTACTATTGACTTGGGTCCTTTA AGCTCTGAAGTAAGCCTAAGTGAGTACTATATACTTAAATGGCCTCTATT CGAGAATTAAATAATATAAATAACATCGTTGTAACATGAAAAGACTTCTA AATAGAAAAAATATTGCACGTGTTTAGCTCATATTTTATATAACTTTGTC TATGTTGATGTGAGACGGCAACTGAGTCATTGTTAAATGATCACAGTTCC CCAAATAAACAACAATGATATCTAAAAGTGTTGCCTACGCACTAATATTG 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GTATTTTTAGGGTGGTTTGTTACCCAACTATACATTTATTATGTATTTTT GACGTGTCAACACGAAAGCAAGTTAGAATGATTTTTCTCAAAATGGAGTG TGGTTTACTTTTTTATTTCTACCTACAAATTATTGGTATTAACCCCTTGG AGATGCCGCAAATTGAATTTAAAGTAGCCAAAATTGATCGTCACTATAGA GGAATGATAAATTAATGCATTTCATTTGAAACTGGGGTAATATCGGAGCC TAAATAAGTCCCCATGTACCATGATGTTTATTTTCTTTAACACTAGGAAG TAAAAATCCTTCTTTATGACAATGAAATGACATCCACTTCCATTACCCCC CATTTTTCTATTTCAATTTACCCCTGTTCCCCGACCACTGCACTACATTG TCAGTTTTTTAATCTGTTTATGAATAACGAATTAATAAAATCTATTTAAC AGATAATAGTACATTTTTGCAAGCACAATATCTGATATTCAGCGCTAAAC TCTGCTGTCTGGTTTAAAATTATAATAAAGTCTAATTTTTCATAGATATA TAGCTATTTTATTGTGCTAAGATATGATATAGTTGACTAAAAATGTTGTA CTACTTATAACCATTGTTGTAATTTTATCAGTTAAAAGCTAATATGCTGG ATTGCACACCATTACAGCTAATAGTCACAATGTATCTCACTTTATAGACT TACACATTAGAGCTTCCATGTTGTGTCCGACAACTCCACTTATGTAACAC AGCTGACGATTTAAGATTTTAACTTTTGGGATTTGACAGATTTTKCCTTG CTGTATTTTKAAGCCACATTGCATGGTTTTGCACTGAATAAAGTCAGAGC ACATTGGAGTTAGCATATTTTCGCTACTGAAATATTAAAAAAATGTTGAC TTTTGGCAAAAAAATAAAAATAAATAATAATTGTAGAATCAGAATTTCCA 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ATTACATCCTCACACAAGAGTGAACTGACTCTTATCCCTTTTTATCCACG TCTATTACCTAAACAATATCAATTCAATACATTCTATCTGTAATTAATAA ACATGGGACGGAAAAAGATACAAATCACTCGTATATCTGACGAACGGAAT CGACAAGTCACTTTTACAAAGCGTAAATTCGGTCTCATGAAAAAGGCCTA TGAACTATCAGTTCTCTGTGATTGCGAGATTTCTGTCATCATTTTCAATT CTCATAATAAGCTGTTTCAATATGCTTCCACGGATATGGATAAAGTGCTT CTCAAGTATACAGGTAYGGCGTAGGACCTTTTATTTATTGGTATGTCATT TTTTTATATGTATATATTTTGTTCCAGAGTATGATCAGCCTCACGAGTCG CAAACGAATAAAGACATACTTGAATCTATTAATCGGAAGGGAATCGGTGG MCCCGATTCTCCAGAAGGGGACATGGACTATCCTCTGAATGATTCGCCTC CTCCCAATGAAATGATGCAGGATAATACTCCAGAGAACGACTTTCAAAAC ATGCTTCAACAAAACAATGCCAGGAATAATCAGCTTAATCATTCCTCCAC CGGTAATGACTTTTTTGCAGTGTTGGATTTGAGTTATTTATAACTATATA GCATGGCCGTCTTCAGGATTATATTTTTTTGGGGAGTTGGGTAGGAAGGT TGGCTTTAGGAATTTTTTTGAAAAAAATCCAAAAACTAGAATTTGGTCAA AAAACTAGAATTTGGTCAAAAAACTTTCAAAAATCCATAGCTATTNNNNN NNNNTTTCAAAAATTAATTTTTTTTGAATTTTTTTAATCTAAGCGTTGAA AAAATTTAAATTTTTTGGAGAAAAAAAATTATAGTGAAAAGCAAAAATTC CTTTTTTTTTTTTTTGTGGGGAGTGAGGAGGCTACATCCCCTCCMGCAAA CCCCCTGTGGACGCCCCTGTAGAGTCATAGAGTTGTATTCTTGAGCATTC AGTTATATCTAGTGTTATGTCCGTCCCTATTGGGGACTGAAGACTGCAGT CCCTTTCAGTTCAGTCCCGCATATCAATCCTAAAAACAAATAAAGTTCAT TCCTTAATGACATCACTCAACTTTATTTACACTTTGGTTGTACGAGTACT CAAACTTTCGGCTCCAGATCCGAAACCAAAATTAGACCTATACTTGTTTC CAATTTTATAAACATTTTACCCGATTTCGGGACCTAAATTAAATAGGATT AAGATTACATTTTTACTAAATACTGATCCCGAAAGAATCAATAACCTAAT GTTATTTAGTATTAGAACATAACTATTAGTTATTATAATTATTGTTATGA TAACATGACGTTTATTTAATCTCCCAACTTCTCATTCAAAAAGGAACACA GAGAGGGCCAAAATCAATAAATGGCAGGCCAATTCTTCCAACTGGAATTA TTGTTCAATAATAGGGTATGACTGTTCACAGCTTATTAAGGACTAATGCG TAAGAACACTAATTAGAGGGAAAAAAAGAAGAACATTGACTGCTGAAAAT TAAATGCTGTTTATATTATTGTATGTGTGAGCACGTTGTTACCTTGCTAA TACGAAAATTACAGTTTATTTTGTTGTTTACTGTCGATGTTTTTTCTTCT TTTCTCCTAATCCGGGTTCTGAATGTTGATTGGTTGATTAATAATTCGCT ACTTTTAAACTGTGAACAATTATCAACAATAATTGAACAAAAGTTCCATA CCTGGGAAGAATTGTCTAACTGCCGACTTATTTTGGGCCTTTTTAATTGT TTATTTTCGCAACAAAAAGGTTGCATTATACAATAAAGATAACGCCGTGT GGAGTAACGACGTTATGCAACTGTTTTTGTAGATATTACGAATTTTAATA ACTAATCAAGATAAATAGAGTTTACGTTCGATATGGGCAATATCTTTTTT ATAACTAGAATTATGTATTAAGCAATGTTTAAAGAACTTTAAGATCTTCA ATATCCCTCATATCTTTTTTATGATCTGTAAAAGTTCGCATACTCGAAGC TGGTTCGTGTCTCGGATCTTTTCAGATTTTATAAGTTTACTTATATCGTA CATGGTTACTTTGGATCCGGATCCAAGACCCCTCCTAACTTTAAATCTAT TTTCTTTTTTTCGATTAATTTCGACTATTTGATTAAATTAACCCATACCT TAATATTTCTTATTTTGATCATCCGACTTGGAATTGAGTCGAGTTTTTCA AATAATATTTCAGACGAGTTAAATGAATTTCAGAAAATGGTTTACTTAAA TAAAGTTGAGTTTTTTTCAAGTTCGAAAATACTCAAATCCAATCAAATTA TATCTTATGTCTTTCTGTCTGTAATTTCCATCTAATATATCCTCTGATCA TCCCTTTAGGCCTTCAGAATCAAAACTACGTGACAGGGAATCACAGTGCT ACTACATATGACAACGGCTCCTCTCTCGTTCATCACATGCACCAGCCTCA AACAACAACAGCACTCATGACACAACAGCAACAGTCTCAACAACAGCAAC AACAGCAATCGAACAACTCTCTAATTAGGATGTTAGAAATGGGAAACGGC AACTTTATTAATCAACAACCATCCCCCATCCCAATTCACCAGCCCAACGG AAATAATAAAGCGACAAATAATGAACAACAGCCCAGCAGCTCAAGCCCTG ACTCCCTCAATAGCTCATCCTCTCCGCCAAACGACAAAGATATCCTGAAT CTTCATCATCMCCGGCCCATCCATAACATTCAGTCCGGCCTCTTTGGAAG CATGAATACGCCGTCCTCTGCTCCTCCTCCGCAAATGTTTAATCCCTTTC AACAAACAACCAACACCACAGATTTCACTAATTTGACAGATTTACGAATT GCTCATCCAGCTATATCACAATGGCTTCAGCAGGCAGGCTCTGTACATCC TCCTGGGCCGAATCCACCAGGTAGTCGTTCTCCTATCAAAGAAGAACCAA TGTCACCGAATCGTGGGAGTCCTAACTCGGGAGGGAGTTCGGATTATGCA CCTCTGTAGATGGGGGTCATGATGAATAAAGGTCTTGGCAGGAAATGAGA CAAAYCAGCCGATTAGACAAAAAACATACATTCCTGTACTTAGTTTTTTT TGTTTTAGAAAAAAATATGTATAATGAGAATTTTCTCTTTCTTTTACATA GTGACTTTGTTTCTCTAGAATCTTAGACTCAATTATTGCATCAATCCATT AGACATACAACTTTTTTTTTCTTTTTTGGGGGTTAGTCGATTATTTTTTA TTTTGTGTCGTCTAATGTGTAGTTTTAAATTATTCATTAAAGTAATAGAA TAGCAAATTATGGAATAAAAATTTCTGAATTGTTAATGCCAAATAGATGG CGCTCTGCGGATTACCATTTATATACAATAATAGATATTTTTTAATACCT TTTTTTGCTTTGCTTTACACCTAATCACCTACCTCATGCCATCATCATTC TTTCATTTCTAAGATGATATTTGTTTCAACGTTATTTCATATTTACCATA ATTATTCTATATTTTTATTTATTTTTCCCAATTTTTTAAATTTACATATG ACAGCTCATATTTACTTTTATACAATTTGTAAATACATACATTCATATAC ACATTAGAA
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