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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1004 | supercontig | LSalAtl2s1004:5890..19048 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000015 >EMLSAP00000000015 ID=EMLSAP00000000015|Name=EMLSAP00000000015|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=361bp
MGRKKIQITRISDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEISVIIFNS HNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYDQPHESQTNKDILESINRKGIGGPDSPE GDMDYPLNDSPPPNEMMQDNTPENDFQNMLQQNNARNNQLNHSSTGLQNQ NYVTGNHSATTYDNGSSLVHHMHQPQTTTALMTQQQQSQQQQQQQSNNSL IRMLEMGNGNFINQQPSPIPIHQPNGNNKATNNEQQPSSSSPDSLNSSSS PPNDKDILNLHHXRPIHNIQSGLFGSMNTPSSAPPPQMFNPFQQTTNTTD FTNLTDLRIAHPAISQWLQQAGSVHPPGPNPPGSRSPIKEEPMSPNRGSP NSGGSSDYAPL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1004:5890..19048+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000015-695862 ID=EMLSAT00000000015-695862|Name=EMLSAT00000000015|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13159bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1004:5890..19048+ (Lepeophtheirus salmonis) ATTTGTATATGTTGTTAAGAGTGTGTTGACCTTCCTGATATCTGCTTCTC
CTGCTCTCTCTCTCTCCTTTTCTTTTATTTCTTGCTCCTTCTTTTGCTGT
TGCTGCTGCTAATTTCTTTCTTTCTCTTTTTCCTTTAATAACAAAAATAC
AAAATTACACATTTTAGTATTTATTTCGTCTCGAAGGAAGGGGTCCTTTG
CCGAATTATTCCAATTTTAAACAAGTGCTTAAAATAAAACAACTGGAAAA
AACAAGTGACATTAAGTTCGTCGTTTTTTTCTCTTCATCCTCTCTACTAG
GTAAGCATGGTCTTTCATTTTGCTGTTGTTTGTGACGCCATCATTATTAT
TTTTATTATTCTACTGACTGAATATTATGTGGAATTTATTATAATTACAT
ACAACATAGGCCACGTTTCTGGCTAAGTAGGAGTTGAGGAGACAATTTTA
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TTTGAAAAACCGGAAATTGAACTGTCGTAGTTAAAATTTAATATATTTTT
TTATTTATTATTTATTTGATAAACATGAGAGAAAAGCTAATTTAAATAAT
GATCTTCATATATGTATCACATATTTTGTAGTAATAATATATGTGCCTAC
ACATATGTAGCGTTTCACCTTTTTATAGCCTCAAGGTAATGAAAGACATC
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TCTATGTTAGTAGATCAAAATCCCTTCTTTGAAATTCTTCTCCTTCTCTT
ATTTCGTTGAATCATAATACCATTCAAAATATTTGACCTGAGCGTTATGA
CCTTTCTTCTTGTAATTAATTCCCTTCCCTTAGAAATGTGCGTTTGAGTA
TTATTTTTTTTTTACTCAGTCTAAAAGAATGACTATCATAATTTTGTTTT
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ACAACGACTACAAAANTTCGTTTTTTTTTTGTTGAGTTTAGAAATAATCC
GAAAAAGAGTAGTAGTTTGTTCTGTGGTAGAGCTCTTTTATTCGCTCTAA
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CTTTCTTTTGTGGGTTCCTCAATAGATCATGATGGGTTATAAGATTTTTA
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AAGGAAGCGAGCAAAATGTCCACGATTAGAGAGATTGTAATTTAATATGG
AAGATTTTTTTATTTTTAAGGAACTCTTGATTGTTTTTTCATAAATTATA
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TAAGAGCATTGCTAGATTAAAGAGCGGTACGGCGGACAACTTCTCGAGTC
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TCTGAAACCAGGAGTACTTGAGAAATGATGTAATTATGAGGGCTACGTAA
TAAGTGGAATGATTATAAATCCGGGTTCCAAGGGAGTAGTGTCGTAATAA
TTAGGGGCCATTCTGCGGCCACTTTTGCTTAATATTTATAGTTATCACAA
TAGAATAATCCTCTTGGCTTAAAAAAATTAATGTAATAATTATTTGTTAA
AATTTTATACCAACCCAAAAAATGTAACTTTAAAATTAATTTTTGTTTGC
CTTTGTTATTTATAAAAATGACAAAAACATTCTGTCAAAAATTCAGCCCC
TCTCATAATACTTACACTCCCTTCCCTCCAGGGACGCTCCTAATGACGTC
ACCGTATATAAAATGGGCCCCATTTGAAAAATACATTATAACAACGGTGG
TTTCAAGATTTCATTAGGGGTGTTATTGTTATCAAAGAGTCCCTCCAGGT
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TTTTCACTGACGTCATAAATTGCATCGTAATTGCAGGAGACGCCATCTTA
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AGTACTTCATCAAATGATTTTAAAAATATAAAAAAAATTAACACCTGCAC
TAAATACTACTTGATGACAATGATATAATCAGTGATATTTGAATTAAATC
AAAGTCATATGTACTGAAATCCATATGCAGTGTCTAAATTTCTACAATTA
TTAATATTTTTTGATCGATTAGGTCGAGAAAAGTTGGGTAATTAGAGAAA
AATATTTTATTATTTCAATCACTTGAAATTGTTAACGTCGTCAAAACATT
TAGAATCTCAGATTCATCTGGAGTTTACTTAGGAAAGGGGTCCATATCAG
ATTCTCAAAGGGGTTCGTGGCTCACTAAAAGGTTGAGAATCCCTGTTATC
AAGAATAAATGTAAATGTATATCCCTTTGATGAGATGGTTTTCCCTTACA
TACCAAAGTCATTTACACCCAGTTGCTAAAAGTTAACCGGAAGTTATCTA
CCGCACTTCATTCTCTGGGAGGGTTTATCTTAGAGAAAATATAGAGCGAT
AGAGTATTTTTGGAGGAGGTTTGTAGGGATTAAAGTTAAAGTCAGCTGTT
TTTGGGATATTTATATTCATATATTTTTTCTCATTTGTTATTTTCTTGAT
TTCCAAAAAATATATAATATGTATGTGGTAAGTATATAAATAACGTGGGC
ATACAACAGTTGACGTGAACTTACGCGACATTAACACCCTCGAGCAATCT
ATACCAATTTATGCGGTTTATTTTTAAGAAATATGTAGTGTGTCTACATA
AATAGATATTGTCCCTTGTAAGTACTAAACTATCAAATGGTCATTTTATA
TTGTGACGATTAATTGTGGCTGMTTTAAGCACAATTAGCGGCACATCCAT
AGGCTGAATAAGGATAATTTGGTAATAGAAATCGACGATTATTTATAAAA
GAATACAAATTTATCATATACATAAGACACTTTACATATGTGGTGCGTCA
ACATAAAAGCAATCTTAACAAAAATCAAAAATAAGAGAAAATCTTCATTT
TTTCTCTTCGTATTATAATATTTCATATACATATTTGACTTTGTAATCAA
ATTTCTGGGATAAGTGCAGATAACCAAGACTTTAATCTATATCTTAGGAT
CTTTATTTGATTTAAGTGACTTGTATTGTCCCCGATATGGTCCTTTTTAA
ATAAAATCTATTAATTTGTTATTATTTTATTGTGACGATCAATTTTGGGC
TAGAAAAGTTATTCTATATTGTTTTTGTGTTGATAGGCTACATATTATGA
ATAGCAGAAAAGTATCTTTGCAGAATCAATCTCCTACCTAACTATGGGTT
ACATAGATGGATAGTTACTTTGCATTCATGCAAGAAGTATAATAGACTTA
TATGTATATTATACACTAGCTATGTTGCTTCTCTTGATTAAAATGTATAC
CTACTTTAAGAAAATGAACCTTTTCCGGGAAATTACAATAATTATGACAG
GAAAATAATACGTATATATAAAATCATAAAAGTACTTTTTTTTTAATACT
TATATTTTATTTAGAAAGAGTTGTTAATTTCTAAATAAAAAAACCTAACT
AAAAAAATAATAACGATCATTATTTCACTACGTGTATATTTGTAATTAAA
TGGATATTTATGCCCTATGAGGTTGAGTGACTTGTTAATTTATATTATAC
CTCGGCAGATCATTAAGAGGAAGAAGAAGACAATATTTCTTTATTTTATT
ATATTGCACTGTCGTAAATATGTTATTTGACGGATAATTATATGTGTGTA
TCTGTGTGTTATTGCTGCTGCTTAAATACACATATTAGAGTGGTCACTAA
TTTTAGAATAAAATAGTATGAACGGAACCCATTTACAGTATGAATAGGGC
ATCACTCAAAACAGTTTTAACTTCAATCTAAGTCTATTTTACTTAATTTT
AGTATGAGGTTGCGAGAATACACATATTTATTTCAGATATCCTCCGAGCA
ATATTTCACTAAATTTAGAATTCTATAAAATATGAGCTGGCTCTATTTTT
GTAAAAATAAAATAACTTAAAAATCATGTTGTAATCCTGTCAATTTGAGA
AATGTTTGCGTGGAGAGCAGCTTAGCTTTCATCACGTTTTATTAGATCAT
CTGCAAGCAGCTGTGAGAAGAAAGGAATAATCATGAATCCTTCACCGTAT
CCATTTTTTTCTGAAATTTTTTTTTTTGGTTAGGAGAATTTTTTTTTTCA
TTATGGCAAATTGTGGAGGAGATTAAAAAACTTAATATTTCTAAAAAATT
TAATTTTCTGTGAATAGCTAAGGATTTTTTCCAAAAAATTGAATATTTTG
AATTTTTTTCCAAAAAATTTAATTTTTTCTGAATAGCTGTGGATTTTTGC
CTTTTTTCAAAAAATTTTATAAATGAAATTTCCATCTTGAATTTTTTTTT
TCTAAAAAATTTAATTTTCTCTGAAGCGATTTTTTGAAATTTTTTTTACA
CAAAATTTAATTTTTTTTTGATTAGCTATGGATTTTTTTTAATTTTATGT
GAACAGCTGTGGACTTTTTTTATTATTTGTGAATGGCTGTAGATTTTTAA
ATTTAAATAAAAGAAAAAAAAAACCCTCTTCAAATTGCTTCCGCTTTTTT
TATGGTATATTTTATACACCTATGGAAATAATAGTATCTAAGGTGTTCAA
ATAAGATTTGACATTATTTGTGACACATCCAATCATGATCTTTAATTCTT
CCCACTCTTCCTCATTAGAAGATGAAATAAATGAAATAAATGACTTTGGG
TCTTCAAACGTGTACCCTTTTCCAATATTTTTTAGCAAGAACAGTTTCCC
TTTCTAAATTCAAATAATAACGATATATTACTATTGACTTGGGTCCTTTA
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CGAGAATTAAATAATATAAATAACATCGTTGTAACATGAAAAGACTTCTA
AATAGAAAAAATATTGCACGTGTTTAGCTCATATTTTATATAACTTTGTC
TATGTTGATGTGAGACGGCAACTGAGTCATTGTTAAATGATCACAGTTCC
CCAAATAAACAACAATGATATCTAAAAGTGTTGCCTACGCACTAATATTG
TATCAATTTGATTGTAACCATGACTCAAAATCCTTCATTCTTGATGCATT
TTAAAAGTTGTTGATGTTTTTTTAGATACTGTATCAGTTTTCGATTTGCT
TTGTTGACTGTTTGTTCGGAGCATATCTAAAATCAATAAATTATCCCAAC
CTCATAGTATAATTACTCAAAGTTTTTAAAATGGCTTTAGCGAATTTTGG
AAAGACTTGTGGTGAAGACAACATTATTATTGTGTCCTGGGACATGACAC
ATTCATAATTTATTTCAAAACTAGTGATCACTCTAATATACACATATGTG
TCTTATATTATTTTAATATAACGAATTATATTTTTGGTTAATTAACGTTA
AAATAATATGTTTATTGTAATCAATTTATTTAAATTTTTTATATCGAAGT
AGGAAATAAAAAGTTAAAACCTAGGGACATACATTGAATTGTGTTGTTCA
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AGCTTGACTACCATTAATATATGTGGGAATCAACATAAAAGTAATCTTGG
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GTCCAACATTTCATAGACATATTTGGGTCAATGATAGGCTTTATATACAA
ATTTAGTATATCCAAGAGTTTAGGCTATAGTTTAAAACCTTTATTTGATT
TAAGAGACCCTTATTGGCTCCATATGGCCTTTTTAACAATAAAATATATC
AATTTGTAATTTTTGTATTGTGAAAATTAATTTTGGCTAATTAAATTGGA
ATTTGCGACACACCCAAGGGAATAATATGTTGATGGAAATTTACGATAGT
TTGTATAGGAATACAAATGTAATTCGCACTTAATTTTGAGAAATTTTATT
CCAGCTTGCTTTTGTGTTGACGGGCCACATGTATGTATTGTTCATTGTGT
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GACGTGTCAACACGAAAGCAAGTTAGAATGATTTTTCTCAAAATGGAGTG
TGGTTTACTTTTTTATTTCTACCTACAAATTATTGGTATTAACCCCTTGG
AGATGCCGCAAATTGAATTTAAAGTAGCCAAAATTGATCGTCACTATAGA
GGAATGATAAATTAATGCATTTCATTTGAAACTGGGGTAATATCGGAGCC
TAAATAAGTCCCCATGTACCATGATGTTTATTTTCTTTAACACTAGGAAG
TAAAAATCCTTCTTTATGACAATGAAATGACATCCACTTCCATTACCCCC
CATTTTTCTATTTCAATTTACCCCTGTTCCCCGACCACTGCACTACATTG
TCAGTTTTTTAATCTGTTTATGAATAACGAATTAATAAAATCTATTTAAC
AGATAATAGTACATTTTTGCAAGCACAATATCTGATATTCAGCGCTAAAC
TCTGCTGTCTGGTTTAAAATTATAATAAAGTCTAATTTTTCATAGATATA
TAGCTATTTTATTGTGCTAAGATATGATATAGTTGACTAAAAATGTTGTA
CTACTTATAACCATTGTTGTAATTTTATCAGTTAAAAGCTAATATGCTGG
ATTGCACACCATTACAGCTAATAGTCACAATGTATCTCACTTTATAGACT
TACACATTAGAGCTTCCATGTTGTGTCCGACAACTCCACTTATGTAACAC
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ACATTGGAGTTAGCATATTTTCGCTACTGAAATATTAAAAAAATGTTGAC
TTTTGGCAAAAAAATAAAAATAAATAATAATTGTAGAATCAGAATTTCCA
TCATGAAAAATCATCATTAGCCAGTTAGGATATTTTTGCGTTGGGTCAAT
AATATTTTTATGAAATATTAGGTTGTATTCAGTGGCGTTGCTAGCCCCTT
TTTAAGGGGACAGGAAGCAGAGGTAGAGAAAAAGTTTCTAAAGCCTCCCA
ATTTTTCTTAAAAAACCTTATATATATCTTAATATTTATTTATAAATATG
TTATTGGCGTTACCACATATGGAATCCAAAATGGTTGAACGGATCAGTCG
GAAATTTAGCAAGTAGACGTATAAAATAACCAAGCATGTCCTTATGATAT
TGTTTTGGGCCTTTGAGGTCATTAAGAGTCTGTTTTTGAATGGAATAAAA
CCTCATTTTCCGTCTCTCTTTCTATAACTCTCATTCTCTCTGTATCTTTC
TGCGTCCCTCTCTGTCTTATTTCTTCTACTTTCATTCTTTGTATTCTCTT
ACATTCAGCCCTCCAACACGGCCACCCTCTGCTATTACATATATATATAT
ATATGTAATAAACCTATTTATATGAGTATGGTAATAATTTTGGGGACTAT
GCCCCTGGCTGTATGTATTACATAAGATATATGAAGTAAAATAATGAATT
TGTATTTTTTCCTTTTCTTGATTTATGTTCAAGATTGTTTTTATGTTGAC
GCACCCTGTAGATGGTATTAAATTAAACACTCATTCCTTGAGAATTTATG
AGCTCTTCTCATAAAGTCTAATAATAATAATATTAAAATACCTATATATT
TTATATACTACTGCCTCTGACGAATAAGGTCAAAGTGCAAAGAAAAGGGG
AAGAAGATATATATCTCTCTCTACCTTTAATGACAATAATATGTGTGTGC
CATATTTTCTAATTTGTATTTCCATACTATTTTCCTGTACAAAGAGTTAT
TTACTAACCTTTACCTACTCATTTCAGGATCTCTCATTTTAAGCCACCGG
ATTACATCCTCACACAAGAGTGAACTGACTCTTATCCCTTTTTATCCACG
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CGACAAGTCACTTTTACAAAGCGTAAATTCGGTCTCATGAAAAAGGCCTA
TGAACTATCAGTTCTCTGTGATTGCGAGATTTCTGTCATCATTTTCAATT
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MCCCGATTCTCCAGAAGGGGACATGGACTATCCTCTGAATGATTCGCCTC
CTCCCAATGAAATGATGCAGGATAATACTCCAGAGAACGACTTTCAAAAC
ATGCTTCAACAAAACAATGCCAGGAATAATCAGCTTAATCATTCCTCCAC
CGGTAATGACTTTTTTGCAGTGTTGGATTTGAGTTATTTATAACTATATA
GCATGGCCGTCTTCAGGATTATATTTTTTTGGGGAGTTGGGTAGGAAGGT
TGGCTTTAGGAATTTTTTTGAAAAAAATCCAAAAACTAGAATTTGGTCAA
AAAACTAGAATTTGGTCAAAAAACTTTCAAAAATCCATAGCTATTNNNNN
NNNNTTTCAAAAATTAATTTTTTTTGAATTTTTTTAATCTAAGCGTTGAA
AAAATTTAAATTTTTTGGAGAAAAAAAATTATAGTGAAAAGCAAAAATTC
CTTTTTTTTTTTTTTGTGGGGAGTGAGGAGGCTACATCCCCTCCMGCAAA
CCCCCTGTGGACGCCCCTGTAGAGTCATAGAGTTGTATTCTTGAGCATTC
AGTTATATCTAGTGTTATGTCCGTCCCTATTGGGGACTGAAGACTGCAGT
CCCTTTCAGTTCAGTCCCGCATATCAATCCTAAAAACAAATAAAGTTCAT
TCCTTAATGACATCACTCAACTTTATTTACACTTTGGTTGTACGAGTACT
CAAACTTTCGGCTCCAGATCCGAAACCAAAATTAGACCTATACTTGTTTC
CAATTTTATAAACATTTTACCCGATTTCGGGACCTAAATTAAATAGGATT
AAGATTACATTTTTACTAAATACTGATCCCGAAAGAATCAATAACCTAAT
GTTATTTAGTATTAGAACATAACTATTAGTTATTATAATTATTGTTATGA
TAACATGACGTTTATTTAATCTCCCAACTTCTCATTCAAAAAGGAACACA
GAGAGGGCCAAAATCAATAAATGGCAGGCCAATTCTTCCAACTGGAATTA
TTGTTCAATAATAGGGTATGACTGTTCACAGCTTATTAAGGACTAATGCG
TAAGAACACTAATTAGAGGGAAAAAAAGAAGAACATTGACTGCTGAAAAT
TAAATGCTGTTTATATTATTGTATGTGTGAGCACGTTGTTACCTTGCTAA
TACGAAAATTACAGTTTATTTTGTTGTTTACTGTCGATGTTTTTTCTTCT
TTTCTCCTAATCCGGGTTCTGAATGTTGATTGGTTGATTAATAATTCGCT
ACTTTTAAACTGTGAACAATTATCAACAATAATTGAACAAAAGTTCCATA
CCTGGGAAGAATTGTCTAACTGCCGACTTATTTTGGGCCTTTTTAATTGT
TTATTTTCGCAACAAAAAGGTTGCATTATACAATAAAGATAACGCCGTGT
GGAGTAACGACGTTATGCAACTGTTTTTGTAGATATTACGAATTTTAATA
ACTAATCAAGATAAATAGAGTTTACGTTCGATATGGGCAATATCTTTTTT
ATAACTAGAATTATGTATTAAGCAATGTTTAAAGAACTTTAAGATCTTCA
ATATCCCTCATATCTTTTTTATGATCTGTAAAAGTTCGCATACTCGAAGC
TGGTTCGTGTCTCGGATCTTTTCAGATTTTATAAGTTTACTTATATCGTA
CATGGTTACTTTGGATCCGGATCCAAGACCCCTCCTAACTTTAAATCTAT
TTTCTTTTTTTCGATTAATTTCGACTATTTGATTAAATTAACCCATACCT
TAATATTTCTTATTTTGATCATCCGACTTGGAATTGAGTCGAGTTTTTCA
AATAATATTTCAGACGAGTTAAATGAATTTCAGAAAATGGTTTACTTAAA
TAAAGTTGAGTTTTTTTCAAGTTCGAAAATACTCAAATCCAATCAAATTA
TATCTTATGTCTTTCTGTCTGTAATTTCCATCTAATATATCCTCTGATCA
TCCCTTTAGGCCTTCAGAATCAAAACTACGTGACAGGGAATCACAGTGCT
ACTACATATGACAACGGCTCCTCTCTCGTTCATCACATGCACCAGCCTCA
AACAACAACAGCACTCATGACACAACAGCAACAGTCTCAACAACAGCAAC
AACAGCAATCGAACAACTCTCTAATTAGGATGTTAGAAATGGGAAACGGC
AACTTTATTAATCAACAACCATCCCCCATCCCAATTCACCAGCCCAACGG
AAATAATAAAGCGACAAATAATGAACAACAGCCCAGCAGCTCAAGCCCTG
ACTCCCTCAATAGCTCATCCTCTCCGCCAAACGACAAAGATATCCTGAAT
CTTCATCATCMCCGGCCCATCCATAACATTCAGTCCGGCCTCTTTGGAAG
CATGAATACGCCGTCCTCTGCTCCTCCTCCGCAAATGTTTAATCCCTTTC
AACAAACAACCAACACCACAGATTTCACTAATTTGACAGATTTACGAATT
GCTCATCCAGCTATATCACAATGGCTTCAGCAGGCAGGCTCTGTACATCC
TCCTGGGCCGAATCCACCAGGTAGTCGTTCTCCTATCAAAGAAGAACCAA
TGTCACCGAATCGTGGGAGTCCTAACTCGGGAGGGAGTTCGGATTATGCA
CCTCTGTAGATGGGGGTCATGATGAATAAAGGTCTTGGCAGGAAATGAGA
CAAAYCAGCCGATTAGACAAAAAACATACATTCCTGTACTTAGTTTTTTT
TGTTTTAGAAAAAAATATGTATAATGAGAATTTTCTCTTTCTTTTACATA
GTGACTTTGTTTCTCTAGAATCTTAGACTCAATTATTGCATCAATCCATT
AGACATACAACTTTTTTTTTCTTTTTTGGGGGTTAGTCGATTATTTTTTA
TTTTGTGTCGTCTAATGTGTAGTTTTAAATTATTCATTAAAGTAATAGAA
TAGCAAATTATGGAATAAAAATTTCTGAATTGTTAATGCCAAATAGATGG
CGCTCTGCGGATTACCATTTATATACAATAATAGATATTTTTTAATACCT
TTTTTTGCTTTGCTTTACACCTAATCACCTACCTCATGCCATCATCATTC
TTTCATTTCTAAGATGATATTTGTTTCAACGTTATTTCATATTTACCATA
ATTATTCTATATTTTTATTTATTTTTCCCAATTTTTTAAATTTACATATG
ACAGCTCATATTTACTTTTATACAATTTGTAAATACATACATTCATATAC
ACATTAGAA back to top
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