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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1027 | supercontig | LSalAtl2s1027:154134..181607 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000179 >EMLSAP00000000179 ID=EMLSAP00000000179|Name=EMLSAP00000000179|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=229bp
MNLSSTQNHLGASKLSLSSAKFSKSSNSINSSKPHKGSSECVNEPKQACK NNSISNSSQNIELSNEEINNKSSQNSFSDEKKGKSKKFLNQWKQAASMSK IGNRTKNLLEKWKYSYSVDLNETNLNSTDSLLVSKSPLGSTAWVHPGFSN EQTDVEAIQPGGNLLSDFQKDKFIYFFFHVLDLNADNRIRHYMDWSINTV QYLVLKEVHETFLENFLNIASNFSSKSND back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1027:154134..181607+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000179-696026 ID=EMLSAT00000000179-696026|Name=EMLSAT00000000179|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27474bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1027:154134..181607+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGAACCTTTCATCAACCCAAAATCATTTAGGAGCATCCAAACTTTCCCT
TTCCTCTGCCAAATTTTCCAAATCAAGTAACAGTATCAACAGTAGTAAAC
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ACGGAGCATATATGGTGTAAGCTAAATATATTATAAATAGAATATAGTTA
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CGAAAAAAAAAAAACATACCTTCGATAAATCCCCAGGAATAATTTCCATT
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GAGGATTCAAAGCATATACATGAGTAGCGTTCATTAATTTTTTGTAAGTA
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TGGTTCTTAAATCCAACAATATATTTGGCAGAACATCAACCCCACCCCTA
CCTGTTTCCAATATATTGCAACGCATAGCCTCCTTCAGGGTTCGATGCTT
ACGTTCTATTAGAAGATTGGCTTGGGGATAATATGGGGNTGTCTGTACAT
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ATTGTTTGTCCTCTGCTTTTTTGAAATGGCCCAATTAAATCATGGTGAAT
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TCCCTTATGACAGAAGTCCAAAAATMCTCCCCTTCAATTTTTCATTATGA
GTCAATATGTTTCACAAGGGTATCCGTAAAGTCCGTCCCATCCTTGGAGA
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TTGTCCCTGTTTGAAATGAGGTTTACAAACTCTCTGGTAAACGTTTGCTT
TTAACCTAAAAAAAGATGGAAGTTTCACTGACACGTGACTAATTTCACTC
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GTCACAGTTATGGTGTCCTTAGACACCTAAAAGAAAAATTCACTTGTGTA
CATTCTGAGTGCTAATTTATTACTCTCTCAAATGACAATAACAAGAGATA
TACAAAAAAGAAAAGAAAAACAGATTATAAACACCAGAAAATCCCTTTAT
TGATGGTGCTGAATTTACCTGTTCCAATATCAATTTAAATGACCGTTTTA
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TTATTTTTTATTTGCAAAAGGTTGGAATACACTTAATTATACGTAGTGAT
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AAGCTTCTTATTCTGACAAAAATATTTTTGTACAAGTGCAATAATATTTT
TCGGTTATTTTTTTAATTATCTTTTGAAACCTCAATGACTGGTAAAACAG
TTAATCTAAATCTGTTTTTATTGCTAAATGGTAAATAGTTTTGTACAATT
TAATTACTTCTATAAAGTGTACTAAAGATACTTAAGCTGGAATAAGAAAA
TGATTATTTACCTAGCTACACTTAATCATTAGAACATGTATTTGTTGTTA
ATGAAATAGTGTCTGTTTTATTTTGTAAATGTTTTGAGTTCAAAGCCATT
TAGATTCAGAATTGCATTGTTATTGGTGCATCTAAAATTGAACGTCACAA
ATTTTTTGTTTTACATAGCTTAAATTATAAGAAATCAGAATAGTTTTTCA
AAGAAAAACATATCCTTAAACCTCTTTTTAATATTTTCAAATATATACTG
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GTCAAAAAAGTATAGCAAATTAATACTTTTTTGTTCAGAGTCAAATCTCA
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TGATAGTCCATAAAATTCTTGGAGCTAGTTTCAGTCATGCAACTAGCCAA
TATTTAAACATTAACGTCAAGATCTCTCTCCAACATTTGAATACGTTGAG
AGTCGTTGTTCCACAATACTGTCTTTTAACGCAACTTCCCATTTTTTTCC
AACATTCTTTATTTGATGTATATATTATATAGAATATACATATATAAATA
AACCGCAGCAAATTTCGTAAAAAGTATATAAATAAACATTATAGTTTATA
TTTAATGCTCCTAGATAGAATTTCAACTGATATTCAAAAATTAATCTTAA
AAAAACAACAGTAAACATGCAAATTAAAATTATGAAAAATATTTGTTAAA
ATTTCTTAACATCCTTTTTAAAATACTTCGGCGATTCTGTTAAGTTGATG
GAAGGCACCAGATTTTTTCCCCTGCAAAATTCCAAGACTCACATCCTGCT
TTAAGAACTTTCATTGTGAGAGAAACATAGCGTTCTGAAGCTGCCAAGAT
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TGGTGATAAGGGCTTTACAATTAAGAATTGCAAAGTCCAGACCCCTTGAT
ACCTCAGAAGTTTCACTTTTCTTCTTTGAAATTTCAAAAAGAACAAGACC
TTTGAAATATTTTCATCCCCATTCGTCAGTCCTTTTAGATTTATGGATAC
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TGTTATTATATATTTTTCCACAGTCCTTGCAGGGCCTAGTATTTCTAATA
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TCCCCTCAGAATATGTACTATTTTTTTTCAACTCATAGGGAGGCCTAAAC
GCTAACTATACAGCTCCCAGAGTAATTTTTAAGGCATCTTTGTAGCCAAA
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ACTCAATATTTTTTTGAAAAGTTATGGCTGGRTCCTTCTAAGTATTATAT
TACAGCATATTAATATAAAATATAATTTTTATAATAAATCACTAATCAGT
GTTTGTATAACGGATAATTTAATTATTACAAATATTTTCGGGGCACTGCA
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AAAATTACTTATACCAAGTGATGGTAAAGAGCCAACAATTATAACACATC
AATTAAATAATACAAAAAACAGACAAACTTGTTATAACAATACTGCTCCT
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GACAGTTTTTATAATGTTTTATTTCCACTTGATATTAATTTGATAAAAAA
AAAATCATATCAACCATTGATCAATACGAAGAACTCTCATGAATACAGAT
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TCTTAAAACTTTTATTAAATCGGTGCAAGTATTACAAATTTAAGAAAATA
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GTATTTCTAAATTTTTTTTATTCGTTTAAAGAACCTTGATAAATAGTAAC
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TGAATTTATTATATTTATTGATATATTTATATCAATCAGCTGAAAAATAA
AGTCTCAGCTTTAATTTTTCATCATATTTTATCCCTAATTGACCCTTATT
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TCCCCATAGCTGCATGGGTTCATCCTGGTTTTAGTAATGAGCAAACAGAC
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TTTTCTCTATCGAACTGTTGAGTTGAAACATCAAAAAATGAAAAATATAA
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AAAATAGTGTGCACTACACCACTGTATACTCTATAAAAACTATAGCAATA
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TCAAATATTTGAAAGTTTGTTTATTTTACTGAAGTATTTATTCATTGTGA
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TTATAAAAGTTACTTAAACGAATAGAACATGCGTTATAATATCCTTCTGA
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AAAACAAAAAATTAAGACTGTGAAATTTTAATAATCATTCAAATTTTGTT
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GGAAGCGTTTACGAGMCTTCCAGTTCGCCGCCTGACACAAAATAAAGCAA
ATATTCTATAATACACCCCAACCCTCGGGTTATGCAGACGAACTGCTGTG
CCCGAGTCAAGTTAAATTTATATACCACTACTTCCTCAGAGTAAAGAAAC
CCTCCTAATATCAAAAATACGCCCCAGCCCTCAGGTTGTACAGATTAAGT
GCTGGACCCAAATACAGTTTAAACTCTGCCACTATTGTGTTTCTAAGCAC
CAAGAACCTCTTTAAGCATCCCAGAGTACATCTCCGCCTACGGGTTCTTA
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AATTTTTTTACCAGAACCAATTTTGGAGCCAAAAGACCCTACATCACAAA
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AATAAAATAAACTAAACTCAATATCCTACTTTATGATAGTGTAGGAAAGT
CATAAACAGTTGAAACTCATTAAATATTGTTAAATCACTTAAAAATTAAT
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TGTAGAAGATTGTCTTTAAAAAAATTATATTTCCTTTAATTGATATGTCT
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AATCCACGTCTGCCACCCTTGTTCTGGAGATTTAAAATTACCTTTGTGTA
GCTGGGATCAAATACATAGAAAAAGGAGAGACTAAACAATTTTATTAGAA
TTTATTTTTATTTTGGAAAGACTCCTTACTACAAGTTGTGTCACAAAGTG
TAAAAATATAAATTTCTATTAATATTTTATAATATAACTTGAAGAGGAAG
TCTTTAAATTTATGGATGAGACAATCAGATTTTATAATTTTTTTGGGCAA
CTCTGTAGCATAAGTAGAAATTATGTTATTTTATATTAACAACAAAAATA
AAGATGTAATCTTCTTGGCTCATAGTAGTTGTAAATATTTCCGAAAAATA
AAATAAAATTCTAATTTTAAAAATAATCAAGGAAGTTTAATAAATATGTC
ATCTTTTTTTTTTTTTGWTCAAAGATAAATATTAAAAAACAGTAAATCTC
TTAATAGAGGCATTTTTAACCGTTACATATTAAATTTATAAACAATAATG
TCTGTATGTGTTGGGTGAAAAAGTTTACATATAAGTTTTAAAGAATTTAG
TATGTACAACAAAATATACAACCCTCATATAAAATAAATATTTTTCTCCT
CGAGGATATTCGCCGAACGCTTTGTTACTGCTTTGCAACTGGTCTACAGA
ATTTTTGTATTTTGTTTTGTCCAAAGATGGCTTCACATAGACAAAAATGT
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TACATAAAAAAGCCAGGAGGTTCATATCTCGTGACCAAGAGGCTGAACTG
TTAATGTTCCATATAAGTTTAATGTTCTTTTTGCAGCAAGATTATACTTT
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TTATGAAGGCTTTATGGACCCATATGATTACATTCGTATTCGTAAAAATT
CAATATATACTGCGGTGTTGATTTTCACAATCCTGAAGTCCGATGTTTGA
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CAACATTTTTTATGATTATAACTGATTATACTAGTAGAAAAATTTGTAAT
TTATATTTATGTAAAGTAGGGGACCATTTAAAAGGCCACATTATGTAGAA
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AATGAATATTAGTTACATGGAAGTTTCTTAGATATGAAAACTTTCTTAAA
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ATTCGAACAATAATTATTTAATTAGCTTGGAGAATATTTAACTTTCTCTT
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TTTTCCACAGTAAACTTTTCTTTGTATTATAGTTTTTTTACCATACGTTG
AATTTACAGTCGATGATAGAGCTCGGTCAAAATTCAGCACACAGTATATC
AGAACTGATACTATAACTATTTTAGTGCTTTTCCAATTCATTATCTGAAA
AAAAATCAAAACTTCCATTCGCCACCATTATTCAAAACTTTTACAATTTT
GACAGCTTGTTATGGTAACCTTTTTTATAATACAAACTGAAGTCTCTGTG
TACCGCATACCAAAATTTATAACAACATCCTTAAGATCTGTTTTTTATAA
ATTAAGTTTATTTAGAGGTTACGTTAACTTTTAGATTTTCACAAATTGCA
ATGAAATGTGACTAGTCAAATGTTGCAAAAGTTTTTGAACTACTCATTTA
TTTAATTTGATAAAAGTTGAACCAATTTAGATAGAATGTATTAATATTTT
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CGGTCGAATAAACATTGGATTATATAAAACACAATCAATTCATTAAGGGA
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AAGTTTCAATAAAAATCCTAGTCCCAAATATTGGAGCAAAATTTGACCTC
CCCCCCCCCCCCCCCAAATTAAACATTCCTACGTCTCTTTTCTTTATGGC
AAATCCATAATAATTTTTGTTTGTGAGAATTATCTTGATTTTGTGCGTTT
GGCCTTGATTTATATTGATTTAATACTTATTACTCAAGATAATTTATGGA
TATTAATCTTCCATCCATGAAATAGTTTTATACAATATCTGTTCATACCT
ATTAAGTTACAAAGTAATAATTGATTTTATTAAAAGTATAGTTAATCAGA
TCAAATAAGTGCTCGTAAGCCAAAATCTATTAATATATACTATTAATATA
CCTACTAAAGAGACTCTTAGGTAAGAAGCAACATACTGATTGGTGTTGGT
TCAGTCCTTATTTAGGAATGAATATAGCTGTCCTGACCAGTTAAGTTTTG
GTCCGTTCAAGTTCAGTCCTACATATCCGTCGTAAAAAGTTTGGTCCTTG
ATGATGTAACTCAACTTTATTTCTTCTTGTTTTAATCAGTTCTTGTACTA
AAAGTCCAAAGGGCCAATAGTCTTAAGTGCCGGTCCAAGGACTGATAGGA
CTGGCCCTAAAACTGGATTGGACCTAATAAATAAGGAAGGACACAAGACA
AATGGAGGTAAAAATAATAATGAATACAGAAACATGCACCTCAAATATGC
TCACTCATTCACACACCCTCTATCAAAAAATGAACAGAGATGATATATCT
TGTAGAATGTTACGAGAATGAAACTGTGTAAATAATTAAATAGTTGGAAA
AAAGAAGTAGTTTAAAGGGTTATACGTGTGACTAAGTGCTCGATGTTTAA
AATTATTTTGAGGGTATATTATAAGATTATTTGAGGCAAAAGCTTCTTTA
GAAACCAAAGAACTATGTTCATAAGGGAATGGAATCCTGAAATTTCCAAG
AAGGGCACTTGGAGTCCATTAATCTCAGAGATTCAAAAGTAAGGAATGAT
AACATGTAAAATGCTATGTCATTGGAAAAGGAAAAAGACAAAAAAAAAAA
TAAAAAAAAACCTGGTGGTTATAATAAGAGAGCGAAAAAAGCGTGCAGTA
TATAAAGTATCGATATGTCATACTCTGACGTGACCAGAAGTAGTGAATAA
CAATTCAAAACAATGAAACAGGGAAGAGAAACCAAAAACAAACAAAAAAC
TCATGACAACCCTTTCTGGAAGTTTTTTTGCTTGGGGTGGAGGGATAGTC
AAGAAAATAAAGTTAAAGGATTTATTACTACAACTTAAGAATACTAATAC
GAAATTAAATGCATGTAAAAGAAGGCCAAAGTGTTTTTTTTATACACTAA
AAAATCCAGTCATCATAATTATTAAATTTACGTATATTTTCGGCTTCAAT
AAAATAATCAAATAATTTGTTTGACAATTAGAGGCTGAAAGGKATTAAGA
GAAATTCAAAGCCTCGTTTAAGTTATTAACATGGAGTATTGTCATGATAT
CGGTCCCAGCGACGGTTGTCATCGTATTTTTTTTGTTGTGGAACAGTACC
ACAGTATCTATGTCACCCATAAAGCTGAACCTAATCTCTGTCATAAAGAT
GTGCAGAGACATGATAGCTTGATAGTGGCTGGAAATTTGGTCTCCATTAC
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GTTCGAATTGAAGATCCCTAGCATGATAAAGGGTGTTTGAGACTGGGCCT
TGGATATCATTTATCAAAAGTATCAATACATTTTTGGACTTTGTAGAAAA
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ATCTTCAACCACAGGATTTTAGATAATTACAATTTTTATCAATTATTGCC
GTCTAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAATGATAGATATAACCTAATGTAAA
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AATTCGACATTACATGGATTGGTCAATAAATACAGTACAATATTTAGTTC
TGAAAGAAGTCCATGAAACCTTCTTGGAAAACTTTTTAAACATTGCATCC
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