EMLSAT00000000179, EMLSAT00000000179-696026 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000179
Unique NameEMLSAT00000000179-696026
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1027supercontigLSalAtl2s1027:154134..181607 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000179 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000179EMLSAG00000000179-682945Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000000844EMLSAE00000000844-709772Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000845EMLSAE00000000845-709773Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000846EMLSAE00000000846-709774Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000847EMLSAE00000000847-709775Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773412auto773412Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000179EMLSAP00000000179Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000179

>EMLSAP00000000179 ID=EMLSAP00000000179|Name=EMLSAP00000000179|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=229bp
MNLSSTQNHLGASKLSLSSAKFSKSSNSINSSKPHKGSSECVNEPKQACK
NNSISNSSQNIELSNEEINNKSSQNSFSDEKKGKSKKFLNQWKQAASMSK
IGNRTKNLLEKWKYSYSVDLNETNLNSTDSLLVSKSPLGSTAWVHPGFSN
EQTDVEAIQPGGNLLSDFQKDKFIYFFFHVLDLNADNRIRHYMDWSINTV
QYLVLKEVHETFLENFLNIASNFSSKSND
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1027:154134..181607+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000179-696026 ID=EMLSAT00000000179-696026|Name=EMLSAT00000000179|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27474bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1027:154134..181607+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAACCTTTCATCAACCCAAAATCATTTAGGAGCATCCAAACTTTCCCT TTCCTCTGCCAAATTTTCCAAATCAAGTAACAGTATCAACAGTAGTAAAC CACACAAAGGAAGCTCTGAATGTGTAAATGAACCAAAACAAGCGTGTAAA AATAATAGTATATCTAATAGCAGTCAAAACATTGAGCTATCTAATGAGGA AATCAACAATAAAAGCAGTCAAAAGTGAGTTTTTTCTCTCTCCTTGATAA AAAAAAATCATTACTGAATGAGTTTTTTTCTTTCTGTATACACACAGTTC GTTCTCAGACGAGAAAAAGGGAAAATCTAAAAAGTTTTTAAATCAATGGA AACAGGCAGCCTCCATGTCGAAAATAGGGAATCGTACCAAAAATTTACTT GAAAAATGGAAATATAGCTACTCTGTCGATTTAAATGAAACTAATTTGAA CTCTACGGACTCATTATTGGTTTCAAAGTCTCCTTTAGGATCTAGTATAA AAGAAATTGAGAAAACTGAAGAAAGCAATCTATCATCGAAGGGGAAATGG ACGGAGCATATATGGTGTAAGCTAAATATATTATAAATAGAATATAGTTA TATTATTTTTTCTTTTCATAACCATAATTTATTTAAAAGACTTTGAAATA CTGGAAACATATTACATAATACTACAATGGAGTAATAAAAAACATTTAAA ACACAAACAAACCATCAAAACCCAAACTTAATTGTTTTTAAAATGTGCAT ATATACTTTCTTAAACTATTTATCACCCAACCATCCAGCTTGGAGCTGGA TGCTTTCATGAAGTAGACGCAGAATTGAATTTTCACGAACGCTGCGTGAT TAAATTTTTTAGTTTATTAAATATTTAATGTAATGATTTTTCTACAGCTT CCCCTCTCCCAAATATAATCAAATCAATATACAACCCTCATTTTCGGAAA TAAACATTCAACTGTGATCAAAATTCACCTTATGAAGACCATAAAAAGCC TGAATAAGTTGGACGATATACGATCCCAATACCATTAGTTTTGGTCAAAA TTTTGATATTGAGTTTACGTTTCTTTGAAATGATCTGTTTTTACATTGAA TGAAACTTAGTATTAAATGTTGTAAGGATATTGTTCATGTGTATTTTTGA ACATTATCCGTTCCAACAATTATCTCAAGCTTATTACAAAATTTTTTTAA ATGTTTAAAAAAATAAATATTTGTTTTAAATGTAAAACTTGTAGAATAAT TTAAACAAGTTTCAAGATACTGCATCTGTTGTTCTTCCAATACCATAAAA TTTTTTTTTTTTTGGAAAGATTAGGTTGGAAGAAATAATTTAAAACTTAC TATATTAAATAGTGTTAAACTAACTTCTTATCAAACTATTTAAATTAGGC TCTTCAAATTCATTGTAAGCTTTTAATCCATGAAAACAGAGTAGTTGGCC ATCATTTTTTAGTTTTTAGGGCTCTAACAAGATTGGGATATCAAAATAAT ATTTTATAGCATAAACGTTTAAAGTTAATAGACTTTTTTTATTGCTGTCC CACAATAAGATGGATTGCAAGCTGTTTAAAAAAGGGGTCAAATTTTGACT TGTTAAAATATTATTATCATGATAATAGTNAGAGGTTGTTGGAGCAGTTG ATCGATATTATAACATAATTTTTGAAAAAAAATACTGACTTGCTTAAACA TAACCAAAAAATAGTCGACATATATAAGTGACCCTCTCACAATAATTGAG GCAAAAAAAAAAAATAATAAGAAAAAGTCTTCTACCCTACGAGCTATTAT TTCCCATAGTTAATGGCTCAAATTTGGAAGATCAATTTGATTTTTGAAAT AAAATAAGTATACTTTTTTGACTCTGTGATAAAATTTATGCGGTGTTTCG TTTTGAGATGTGTGAGTCAACCCATCTCCAAGTAATTCATATCTAAAAAC AAAAAAATATTACCACTACCTCAATTCTTCTCTATGCTTGCATTAAAAGT CACCAAAGGTTAAGTATACGTCCTAATAATTAATCATCAAGGGCTATTTT GATAGTTGAAGAATATTTGATGCGACAAAATAATAAACTAACTTCTTACA AAATTTAAAATTTATCATCAAAGGAACTTATATATGTAAATTTAATTTCG TTATATCTTGTGTCATTTATATTGAATATATTTGAACATCAACGTGGAAG TTTTATGTATGTATTTTAAGTATGAGTGATTTTTTAAATATATGACACTT ATCTTCAATCTACTTTCTTGGTGTATCTATATTACCAATTTCGTTAACTA AAAATGAATAGGAAATTTGATCTTGAATTACATACTTTCAATAAATAATT TTATTCTTGTATTAAACATTATCTATAAGTACCAACTTAACAAAGAAATA TAAGAATGATTTCTAAAGATTATACATACTTAACGCTTTCAAAAAATATA TTAACATTACTTTTTATTATGTTGACATAACAAATTGGTTGTTTTAATGA CAAATAATTTTGTAAAACCACTTGAATCAATGATTTTTCTTTTTTGTATT TGTAGTAACTATGTTTTTTTTGTAACCATTAAGCAAAAGTATATTATTAT ATAATAAATAATTTTTGACACAACACAAAAATACACTAATTTATGGAACA TAAATGTTGAATTTAATAATATTTTACAATAAAAGYAGTCAAAAGTCAAT ATTTTTCAATAAGCCAGGATTGAAATGTACTATAAATATGTTCATATATG TACAGATAGATTTAAAACAATATAAAATGTTAGGAAAAATTGCATTACCA AAAACATAAATACATAATGTAGTTTAAAATTAGACTACATGAACAATACC AAAAAACAATAAATGTATCCAATATAAGAATAAAATTATGTTTCCTTAGT GTAAACGTTTTCAATTTAGTAAGTTAATCTCTTAAAAAGAAGTTGATATA GAGTAGAATAGTATGAAAATACTTAATCTCATCAAGGACAAAAATTATTT ACCAAGTTTGGGATTTTTAGAGAAAAAACGGCCAATATAGTAATTATTGC CCTCAGATCTTGCATGCAAATTGTTTCACTATTAGGTAGCTTTGAAGCAA TAGGAGTTTTGGCTCCAAACAAAGCAAAATGAATTGCTCGACTCTGTAGG GGTAATAGTTTGGATGAACATCAAATATAATTCTGGTTTTTATTTCCCTA ATATTGCTCTCTGTTACACCCATGCTCAATAACAAGAACTCTTTCAGTAT TGCCACAACATAGGAATGCTTTGAACTATTATACAATGAATCTATTTTGT GCAAAACCAAGCTTTCACAGTCCTATTTGCAATGCAGTGTTGCATTTCAC AATATAAATTATGACTATTTTACACGGACTATGCTGCAGTGGTCTACGAT CATCATTTTGAGCAAATTTCATAGTTTAATATACTAGTTCCTTGAATTGT AATAGAAGGATCCCAGGAATCATCACTTATCCTTGGTATTTTTAAAGGAA AAACAATATACCTAGCTGCAGAGGACAAAACTATAAATTCTCAAGTTTCC CTTATGAATTGGCTATCTACATTTAACAAATTAGAGCATTGGCGCTCAAA AGAGCGAAATGCATTTCCTGATTTTCAGAGAATTTTGCCTTTGCTTTTTG GACAAGCCGAACAAATTGGGTTCCTTTAAGGTATTAACATCTCCTCCCTC CACATTAAGAGAAATAATTTCAATTATAACGGAAAGCGAAGGACACTCGA CGAAAGAATAATAATTATAGTTTAAAAAAGTTCAAAATCCTTTCAGGGAT CGAAAAAAAAAAAACATACCTTCGATAAATCCCCAGGAATAATTTCCATT GTATTATCCAATGACTAAGGCAATTTCGATTTTCTTACGAACTTTTGACA TATCTTGTATAGACAAAATCATTATATTTAAGTACCAAGATGTAAATGAT ATTTTCCAGATTTTGTAAGAAGAAACCAATATTTTCCACTATTTAAAAGG CAGTTTATGGTAGGATTAGGACCATAAAGAATAATCATATTACTAATTAC TGCTTCAATTTTTAAATCCTTTGGATTTTGTATACTCTTGAAAAAATTTC TTTTCGATAATTTCAGTTTTCTATATATTTTAAAATTCAATAAGATATCT GTTAAAATTAATAAAAATAGCTAAAATTCAATTTTCAGAGATCAAAGGTA TTGGGTCCAYGAGACGGTAAAATCGCATAATTTTCCAAAACTTTTGAACA AATTGATAACCATTACTCCAATGAATGTTTATTTTTAGGTAGATATATTT TTGACAAAGGTTTACGCTCTACTGAGTACCCATTCTAGTTGTCCATATTA TTAATTACTAATTCAACAATAAATTTTCTTCAAAGTTTTCCGAGTAAAAA AACTCACTTGTCTACATGTTGATTGCTAATTTATTGCTCTCTCAAAATAA AATAACAAGAGATACACAAGAAGGAAAAGAAAAACAGATTATAAACACCA GAAAATCCCCTGATTGATATTAATATAAAATACATATATTGCATTCACTA TACACTTCCACCTTCAACCAGTGTTTGGCTTAAGGTTACATATTGAAATA GATTTGATTTTACCATTCCATTCAATAATAAAACTTAATCTAAACCTCTG AATGACTTTATAAGGTCCACTAAAGAAAGGTTCAAAGGAAGACTTAATCG GAGGATTCAAAGCATATACATGAGTAGCGTTCATTAATTTTTTGTAAGTA 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TGATAGTCCATAAAATTCTTGGAGCTAGTTTCAGTCATGCAACTAGCCAA TATTTAAACATTAACGTCAAGATCTCTCTCCAACATTTGAATACGTTGAG AGTCGTTGTTCCACAATACTGTCTTTTAACGCAACTTCCCATTTTTTTCC AACATTCTTTATTTGATGTATATATTATATAGAATATACATATATAAATA AACCGCAGCAAATTTCGTAAAAAGTATATAAATAAACATTATAGTTTATA TTTAATGCTCCTAGATAGAATTTCAACTGATATTCAAAAATTAATCTTAA AAAAACAACAGTAAACATGCAAATTAAAATTATGAAAAATATTTGTTAAA ATTTCTTAACATCCTTTTTAAAATACTTCGGCGATTCTGTTAAGTTGATG GAAGGCACCAGATTTTTTCCCCTGCAAAATTCCAAGACTCACATCCTGCT TTAAGAACTTTCATTGTGAGAGAAACATAGCGTTCTGAAGCTGCCAAGAT TATACCTCTCAACTCATCCACCCGAGTAGGCTTATAGTTAGTTAGTTGGC TGGTGATAAGGGCTTTACAATTAAGAATTGCAAAGTCCAGACCCCTTGAT ACCTCAGAAGTTTCACTTTTCTTCTTTGAAATTTCAAAAAGAACAAGACC TTTGAAATATTTTCATCCCCATTCGTCAGTCCTTTTAGATTTATGGATAC AGAATATTTCAGGGTATAGATGGCAGGGGAGTCCACAAATGCATGAAGTG TGTTATTATATATTTTTCCACAGTCCTTGCAGGGCCTAGTATTTCTAATA CAATCTCTGGAGATTTGTAATTTAACGTTAAACTTTTTATCATCATTTAT TCCCCTCAGAATATGTACTATTTTTTTTCAACTCATAGGGAGGCCTAAAC GCTAACTATACAGCTCCCAGAGTAATTTTTAAGGCATCTTTGTAGCCAAA 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