|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s10 | supercontig | LSalAtl2s10:863142..870599 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000645 >EMLSAP00000000645 ID=EMLSAP00000000645|Name=EMLSAP00000000645|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=217bp
MQLNYKLEVSVYLVLCTLIGATKGEEVVKEASLDDGLHRRVHRDINGEIE
GLCEKLLDISAKNNLQTIFKHPNFIGILQECKSYYQNWMFKRGSLLKAKG
FGLRTKFLPSRRGGSGLRTARRLNLSHKDEENHCEILLYPKTNFQGTPKR
FFASKRFINPREKSLRTFGNCCWKLFASSKRSNRNHKIVAGNAEXKNPSE
WKGIPSSTKRITRVDNC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s10:863142..870599+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000645-696492 ID=EMLSAT00000000645-696492|Name=EMLSAT00000000645|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7458bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s10:863142..870599+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAGAAATGTGTTTTACTATCTAAGTACTTTGACAATATGTAGAGAATTGA
TAAATATTTCCGGATTCCCTTGTTAGAGCAATGTAGTAAGTCTTGTTAGT
TTTCAAAATGCAACTGAACTATAAGTTAGAAGTATCAGTGTACCTCGTTC
TCTGTACCCTTATAGGTAAATTATACCATAATGCTTATTTTATCCAGCTG
CAAAATTAGAACTATAAATTTGATAAAGTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAT
TTATATTGTTTATGCAGCTTTTTAATAACTTTAGAAGTATTTTAAACATT
CTAGGGGGGGGGGGGAGCCCAAGYCCAGTCTGTTGTTCTAGATCACTTTA
CMCAAAATCAAGAAATAAATTAAACTTTTCAGAGCGAAAATCAAAACTTT
GAAAGATCGAGAACAAGAAAGAAAAGTTGATCTTACAATATTTTAGAAAA
TAATTTATTTGATTTCGTCTTGTTCATGGCAATGAGACCAAGGTTTTGAG
GGTGGCTAGGCAATTACCGTGACATAATTTTCTTATGCCCCGGCGTTTAA
TATTTGTTTAAATCTTCCATTGATACCCACCCATCAAACATTTCCTTGGC
ATATAGGCTATATACAAGTAGATAGACTTAAATGTTAGCTATTTGCTAGA
ATGTATATAAAGCATTTTTACTGTTAGCATAATTATCTATTAGGTGTACA
AGTATTTTGATTACGCTTCACATTCAATTCTCAGCAAAATGCGTGCGTAA
AATATTTTTATTTTTTTGAATGACAATCACCAAACAAAAAAGTCTGACCT
AAACAAATCTTTTCTTTTCTCGACGACGAAATAAAGACTAGATCAAATAT
GAAGAAAACAGGACAAAATGTATAAAAATGAAAAGTAACGAAGCAAGATT
AATTTAAATATGACGTTTGAACACTAGCATTTAGGTTGTAGATCTTTGCT
CAAATTTAAACATTAAGGCAAGACAAAAACAAAAAAATCTAAAACTTCTA
ATGACATTGATTAAATTTAAGTTTAATATGTGAACCAAAAATAATAACAA
AAAGACTCTTTTCTTAAGTGCATATTGTATGTTCTATGTATGTATTAGTT
TTAAACAATTTTCTTGAGGCGAAGTAAACAGTTGTTGTTTTTTTTATGTT
ATTATTAATATTTCATTTTTGCATATACAAAAGTTAATGTAATAAGTAAA
AAAAAAATGAAATCTCATCAAAATGTAATATGATTTCCCCCCCCCCTCTA
CCCTAACAAGAGAGAGAATAAAATAGATTAAATTATTTTTCATTTTTGCA
AGTACGCCATTTTATTCTTATTATCACTAATAACAATTATGATAAAGTTT
CAGGTGCAACAAAAGGAGAAGAGGTTGTGAAGGAGGCCTCTTTGGATGAT
GGTCTGCATAGACGAGTACATCGAGATATCAATGGTGAAATAGAGGGTCT
TTGCGAAAAACTGCTCGATATCTCAGCCAAAAATAACCTTCAAACTATTT
TCAAACATCGTGAGTGTGCCTTTGTTTATAATGTTTTGTCCTTCTTATTC
ATAATTCTTGAGATTAAGCACTTCCTGTTCCTTTATTAAGACTTTTAAAA
CATTCATCCTATGTGCTATGGCTTATAAATTATACGTACAGGGTGCAGCA
ACATAACTTCCTTTTTTTATAATGAGTGACAACCGGAATGTGGAAGTAGT
CTAAGAGTTTCATTCTAGAAGCAAGGTTCTAAAATTGTCTTGAAAATACA
ATCAGTTGCTATCATGTGTTAGAGTAGTGAAGAACGCGGGTTTTCCCTCA
AAAAATAAATATTACTAAATAACAATTCGACAGATTATTTTATCAATTAA
TCAAACTTCAATTTCACTCCAGAGTTTTTATTGGTAGAATTTATGAAAAT
CTGTTAATTACTTCCATTTCTAATATACAAAAAAACATTTTTTTCAATTC
ATTGTCATAATTGGAAAGTTACCACATTCTTGTAGCGCAAATAACTCTGC
GGGATATGATGTTAGAGAAATTAAATTTTTTCTATCAGATCTGGTATCAT
TCAAGAATGCTAAAATGGTGTAGTTTTTTTTAAATCAATTAATTAGAACT
GATTAAATTCTGGAAAACCCAACATCTTTAAGACCCTTGTGGAATCGCCA
TTTACTAATTATCTAATCAACTAGTTATACAAGATATGTTACCAATTAAG
TTTTATATATATGTTAAAAAGCAATCATTTTAAAAATTATCAATGAAAAG
TATTCCAAAAGGAATTTAAAAAAATGCAAAAGCCACCCACCCGGTATTAA
AATACAAAAGTTCGGTGTGTAGGCAATGAGGGACGTCAAATATCTGATAT
GATTTTTAAAACTGTGTAGAACAAAAGTTTAAATGTTTACCCTCCTTATG
AATCAAAAATCAAACTTTTTGATTTTTTAAAACTTGTTTTATTGCCTTTT
GGAAAAAGGAAGTATTTGCCGCACCCTGTAAAAGTGAGTTTCCACATACA
ACATACTTGACCAGTAATATAATTTTTTACCTATGACAAGACGAAACGTA
TCTGTCAGCAATTTTTTTGTTAAAACGACTACAAGACAATGACGTAACAA
AAACAAATTAGAAAGTATTTCATCGTTTAAATGTCACAAAACAAGACAAA
ATTAAGACTGTATGTGACTTTCATGTGTCCGGGTTAATAATTTATTCATC
CAAAGACAAAGAATGTTTCTATTAAAAACAATCACAAAATTGACTCCAGA
AAAGTTTGAGGTCTCTTAGATCATTTTTGACATGGTACATACCATTTTTA
TCTTGACTCTTGTGTCAAAGTTTGCCATTTTAAAACTTTTAGTACCGCGT
CAAATACGATACCAAAAGTTAGAATTTGTACATTGTAGTATATATTTTAT
CAGTAAAAATACTTTTTACTAAACCTTTAATAATTTAAGAGTAATTAAAT
GGCTAAATGATGTGCCCTTAATTCATTTTTTGAACCTTTAATGGTCGAAT
TCGAACGCGAATTAGTTGTAAAGATGTGATCAATTCCTGACTATTAGACA
AAGACATTTGAGAAGATGTGATTGGCTAGCTAAAAACTGATTTTAGGTGA
GTTCTCCTTTCTTTTTACGAAGGATAGTTTGTGAAATAAAATAAGCATAT
AATTTTAGTAAAATAAAAGAAAAATCGAGAGCTAATAAAAGAATAAATGG
TGTACATTTTCCAAAATCATTCCAAAACATCACTCAAGTAATGTTTTTCT
GATAGCTATCAATTTCTATTTCTTTTATCAGGGTTCCAAATAGAACAAGC
TCTAGAGAGAGTGCTTCCTTCTCGTCCTCTAAACTAAAATCCAACTTTAT
ATAGAAAAGATGTTCAATTATCACCTCTCACTTCTTCTCGATACTTCTTC
ACACCCTTTGCCATAGACTGTTGATATCACCTCTGGTTTTAAACTTTGAT
TTTTTAACTCGAGTTATATCTCATTAAAATGTAAATATCCCAACTATTAG
ATTTAGAATAGTTTAATAGTTGAAAGGTAAAGGAGTCTATAAGGATAGAG
GTGACCAACATATCAATTGTAAAAATAAATGTATCACCTTGAATTCTGAT
AGGTTTAAAATTTTGTATTGTACAATGTTAATCTTTTGTCTCGCGTCATT
ATTAGGGATGCCATTTTTGCCAAGAAACATTACAGTTATATTTTTTTTTC
ACTTCACGACAATCCCATCCTTAGTCCTTTTTCGATTGAAGGGGTGTAAA
TGCATGAACATAATTTAAATGCATTTTTTTTTTTGTTTCATTATTATTTT
AACTGGCTCGCCACCACTTTTTGTTTAGTATTTTTGTTGAAGGAGTGATG
AGATTGGCTCATTATCAGTTTATTTAGTTTAAATCAACTTAACAAACATA
TTTTTTGATATATATATTTTTTTTTTTGTTGCACATATGTACACTTTTGG
TGTTTGAAATAGCATGGTTAAATGATATTTTTATTTAAAAAAAAGTGCCT
ATATAAAATGAAAGAGCTCAATGTAAATACACATAATTAAAATGGAAACG
AAAAAGTAAACTCAGGGAGATTTTAATCATCTCTTAAACTTGAAGCTTAA
ATTAACTGTAGAGCCCACTAACAAAGGAAAAATAATTGCAGAGAGATTCC
ATGATACCATAACACCATTGTGTTATTTTATGAAGATTATAAAACCACAC
GAACAAAGTTACAACAAGTCAAAGGCACATAAAAAAACCTATAGCATAAA
TTATAATCTTTTTGCATTTTGACCATAGTTTGGTTGGTTATGTATGTGTG
TGTGTTAGTGCGTATACAATACATAGATAAACCATCGTGCCTATTAAGAG
TTTAAATGTTTTGTACAATTAACTTTTGCTCCATGATTCACTTTCCTTCG
ATAATATAATACAAACATAATGCTGATTTATCTATACAACATAATTATTG
CGAAGATCGGAATGCAAAAATATATATATTATGAATATGTAATTTAGAAC
AGATAAAAAACTTATTTATATTACATAAAGATGTCGGACTTGTGTCATTT
TTCATGGACTTGGAACCAGAAGGGCTTAGACTTGACTTGGACTAGAAAAA
GTTAGATTTAAACGCAGGTTCAACTCTTTCCTTTATTCATCACCAAATCC
CCATTAAGAAATCTTGCCTATGACGATACAATCAAGAGGGTCCTTGAACA
AGCAAATTCACGGTGATTTTAAATGGCTTGAAAAGTAGAAAAGGATCCTT
TTGCCAAGAGATCTGTATAAATGTATAAGTAAATATCAGGTCGTTTGTTT
TAAAAGCCCACGACGTCACAAAAGTATCCAAATATAATTTAAGAAGGCCT
CATTTTCCGAGTAATGGCTTAGTTTTATCAACTTATATACATACGTTCAC
AATCAGGAGAGCAATATCTATAGATGAAGACTTAACTTGTATGAAGAAGC
ACGGATTCCTATAAAAAATATTACTTACATTAAAACGGCCTAGGTGTTGT
TTTTGATACTTTGCCATTTTCAATGTCATTGTTTAACCTTAACTAGTGTA
GATTTCAAATAGAGCTTCCATGGACAATTTTTCTCTTATCATTAATTAAT
TAAAGTATTCAAATGGCTGTTGACAAGAAATCTTGTAACTGCATGTTCGT
CAAAGTAAATCAAATTGTTTGAGTCACGGAATCTATTTAGGACCACAATC
TTCCCAAAAACAACAGCTGGGGTAACATGGTATCTCATAGATACGGTAAA
ATAGAGGATTGTTTCATCGCTGATATCATTGGTGGTCTCAGCACTGCTCA
AATCAAGACTGAAGTACCTTGTAGATCTGAACGTTTATCTAACTACAATC
AATTGTTTTGCATCGAAGAGGAGTTTGAATCCAACCCTAAGTTAGTCGGT
GACAAGTTCAAAAAGCCCTTTTAATTATCTAAAAAAATAGATATTGTTAT
TTAGTGAATAAAGTTCCTTTCCATAGTCACTATAAATTATTATTATTATT
TTTTTAAATTTCACATGAGGAAATAAAATATATTTCAATTTATTAAATTA
TTTTAATGTATTACACGTTTAAAACCTTTTAAAGATATACAATTGTAATA
TAATTTATTTAGTTGCCATTTAGATATATAATTTCTCCGATGGATAAAAA
AAATGTACGGCTGKTCTWGTGTTWTAGATTGAAATTTTTTGGGAGTGGCG
CCTTACAATTCCTACAGCTCTGCACTATTTATATGCTAGTTTCAAACAAA
ACAAAATAATATTTATTTTTCATATTTTCTAAAAAAAAAAGTACCCATCA
GTTTATAAAAAATGATGAGGGTGACATGAACAAAAATGAAAAAATTAAGA
CATTTCAATTCCAAATTTTGTACTACTAAAAAATTGACTGGACTCAAAGT
TAGTTATATTTATTGCAAATTACTTTGCATGTTTTAACAGAAACTTGTTT
ACCTTTTTGAAAATAAATAAGTTATTTCAAATCATTCAATGAAATATCAT
AAATACACAATTGTTTTGAGTACGCCAATTCACTTTTTGGCAAAAAAAAA
ACCAAAAAAACATGACGTAACTTTGTAGCTTTGTGTGGATGGAAATGAAG
ATATAAAATAATATCCAAGTTGTATAATACTATGAAATCTTCTATTTTAC
AGCAAATTTCATTGGAATACTACAAGAATGTAAGAGTTACTATCAGAATT
GGATGTTTAAAAGGGGATCCCTTCTCAAAGCTAAGGGCTTTGGTCTAAGA
ACAAAGTTTCTGCCATCACGCAGAGGAGGAAGTGGACTGAGAACTGCAAG
ACGACTCAATCTATCCCACAAAGATGAGGAAAATCATTGTGAGATCTTAT
TGTACCCCAAAACTAATTTTCAAGGAACACCCAAACGATTCTTTGCAAGT
AAACGGTTTATTAATCCCAGAGAAAAAAGTCTTCGAACGTTTGGGAACTG
CTGTTGGAAATTGTTTGCTAGGTACTGATTATGATTATTTGTACAATAGA
CATTAGGAATATATCAGTCCCAAAATTTTGATGTCTCCTATGGCCTCATT
CTAAATCCTAAGCGCAGCTCCCAATTGGACATAAAAGCCGTCCATAAAAC
AAACTTTTCTCAAAACATCATTATCATACATATATCAGACCACTACCATT
TTAACGTGAGCGTGGCCTGGGCCACTTTCTTTAAGGCTTTTTTTTAAATT
TGATTTTATTCAAACTTCACTTTTTAGATAATAAATTTTTTGGGGAAAAA
AAATTAATTGTTGTTGTTAATTCAACTAAAAGAGTGAAATAATGCAGCTT
GCCTAGTTTGTTATAAAGTAATATTCAAGTATACTCCACGACCATAGTTG
ATAAAAATTGGGCAAATGATGCGGTCTTTGTAAGCCACTTGGCTAAAAGA
TTTGCTGCAATCAAAGTGTAAATTATACCTTGCAAAGGGTGCATAAAGGC
TTGGGATATTTTTTAGTTGCCAATAACATTCTCGGGACAGTACGAGACGA
GACCAAATTAAAACCCCTATTGGAGACTGATACAATGTTAATAGACAGAC
ATGAATATTTAATTATATGTGATTAACACTTTTCATCTTTCTTTGTTTTA
AAGTTCAAAACGAAGCAACAGAAATCATAAGATAGTGGCGGGGAATGCAG
AGKATAAGAACCCATCCGAGTGGAAAGGGATTCCGTCGAGTACAAAGCGC
ATAACAAGAGTGGACAACTGTTAACTGAACAATTATTTGTATCTCTWCTC
ATTATCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTCATTTATGGCTGTTTGTACG
TTCGTTWGAGGACATTAAACTCGGATTAATTAAGTGTCTAACAAAAGTCT
TTAAAGACGTTTTTTATTTTGAGTATATATGTATATAAAGAAAAAAAATC
ACGTTATGAAAGTTGTGATATTTGATAATGAAAATAATAATAAAAAGACA
TATTTTTC back to top
|
