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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1201 | supercontig | LSalAtl2s1201:8544..22787 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001238 >EMLSAP00000001238 ID=EMLSAP00000001238|Name=EMLSAP00000001238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=740bp
MEPAFSSILLSNPNADTFEIWRIRKLKLITLPEASYGKFYDGDSYIIFSR KNREAHIHFWLGTYTSQDEATVAAYKTVELDNYLDGYPVQHRESQGCESK RFLSYFKNYRGIMYLNGGFDTGLSHFERSLVPKLFLVKGKRDPIIIKQIV PHCWSEMNSGDVYVLKVCSETESDCIFVWRGRTSNFYEKLNGIKLGSYLK EETPSAKVVVLDDQTEAEHLSHEELKMFESVLPLDEKAQKLKDSKITVSD DDIQYVRRKEVAIYDLEKGINDEVVMTRVDVHQLNQKLLQSKKAYIIDDH LLSGIWVWVGKESPFMYRNEGLKAGQGYIKEKNYLANISITKIVQNTEPV EFRIFFKNWKIQDVTQSQNDKRQNDFKKLPPKFDTKAHHNNKPSMASYFR MVDDASGEKEXFRIEKGDLVPVSQENYGLFYSGDCYVILYSYYEFNRLCY IIYYWLGIHSSQDERGIAAWRTVELDDKYGGKPVQVRVIQEKEPPHFLAM FQGRFKILMGGISSKFNKGEEGVQNENENQHRLLHVRGTNKLLVRAVEVE CSALSLNTNDCFILETNESKNFIWYGKCSIGDEREISKSYLFGKDYENIY EGLENKEFWNFLGGEQSYENVNDLKVNYRSNNSEPRLFQGSNASGQFIME EIFDFNQRDLIPDDVMLLDVEDCLYIWIGSQSNELESKNILSMTEEYLIS DPTGRDLEIPIAIVKQGEEPLHFRGFFGNWDFNWFENTFY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1201:8544..22787+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001238-697085 ID=EMLSAT00000001238-697085|Name=EMLSAT00000001238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14244bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1201:8544..22787+ (Lepeophtheirus salmonis) AAATTATTAATTATACCTGCCTTACTCCTAACGATAAAAGATACTAGAGT
TTACATACATTGATTTAATATAGGACATTTGCCTTTAAAGTCATAGTTAT
ATTCTGGATCTACTACTTAAGATATAGTTGAATAATATACTTTGACCTTA
AATGTAATAAAGATGGAACCTGCCTTCTCGTCCATTCTGTTATCAAATCC
CAACGCTGACACGTTTGAGATATGGAGGATACGGAAACTTAAATTAATAA
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ATTTTTAGCAGAAAAAATCGTGAAGCTCACATTCATTTTTGGTTGGGAAC
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TAAGCGCAAACCTTCACATATAGTTCTGACTCCTAAATGAATTCATTATC
CTTTCTTCAGTATGTTAAAGTCAAAAATGTGTGATGTTGAACATGGTGAA
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GTAGGGTAAGCATAGTTATTTATAAGAAGATAGATAGGTTTTCATAGGAA
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ACATATTAGTACACGTCATGCCTATGTTTTGCATTTGAAAAATAGAATAT
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TTCCGTGGCCTCGAGAGAAAAAAAATACAAATAACCAAATATTCAATTGG
ATATAATTGTTTTTCCCCCTTGATTCCTTTCAACGATGATTTGATCCTGC
TCTTCCAGTTTTTTAAACAAAACGACGACCACTGTATAATTTAAAAAAAA
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TTTCTTACCTTAAGATAATTAATATTATTAATTCATCGATGTTATTTATT
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TCATGATAATATATGACTCTGTAATCAACTCATAATCCTTTATTGCATTC
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TTTATCTGTTTACGCCAGATATGTAGCCTTATCGTTAATAAAAAAAAGGA
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ATCTCTTTCTCAATACTTTTAATTTTTATTCTTGTTTTTCATTTAGAACT
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GCCTGGGACTTTATAAAAATAAACAATTTACTTCTTTCAAAAGGTTAGAA
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TGTTTAAATAATCATAATTTTTTATCTAAGTGTATGAATTCAGTTGGAAC
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CTCTTCCCACCACCCAAACAAGACTTATATTAAATTCAAGTACTGAGCTT
GTGACGAGTATATAAGATTAACCATGATAAAAATGATAAGGAAATTAAAC
GACTTGTACCGTTTAAAACAAAGATTTTGGGATCATTTACGACATTTTCC
ATGTTGAAATAATCCCTTAGCTACAAAAAAAAAAAAAATACAAAAGAGCA
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TTTCTCACTCTAATATGAAACCTCTGTACAAATAGATCAGGAAGAAGATA
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TGTCCCTCTTTGAGTGTTTATTTTCAACAGGGCAAGTTTTTAGTGTGATT
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TTTCTTAAAAATAGTTAGTAAATGAATTGTTTTCTCTCTATCTACCCATG
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TGCCCAGCACAGTTCCATAGTTACGAAAGGATAACCTCTTGACCTTTCTA
ATTACATAACTATATCCCTCACTAGCCACGTCAGAAAAATAATAGAGCAG
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GGAGTTTATCGTGAGTTGTAGTAACTGTAATCTTGACTGTATTGTTTTAT
ATTTCAATTTCAGCAAAGCCTTCAATGAATCCCTTCATAGGGAAATTCTC
TTTAAATTGTCCAGCATCGGTATTAAAGATCAATTTTTACAGTGGCTTAG
TTCCTGTTTGACGAATATTATACAGAATGTAGTGATCAATTCCACAGTCT
CTAAACCTTGTGACGTTACATCATCTAATCTGCAAGGTAATGTACTTGGA
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TGTTTTAAAATTGGACATTATTCAGGTATACACATAATAAATCAATTTTT
CGTATTTAAGACGTATTTGTTTGCCCTTTAATATTTTAATTATTCATTGA
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CTCTTTCAAGCTCTCCTTATGTTAATAATCCGTCACAACTTGTGAATGAG
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GAAATATTTTCCAATGATTGAATTTCTTTTACATTGCAATCTAAAAGCTA
AATGAGTGCGTAAGCACTTCAGTTAACTATCCTTTAGACTTAAGAATTTA
CATGGTTTGTGATCTGAGACTAAAGACTCATAAAGATTAGGCTAGGCTGA
AAGCAAAAGCTTAGAAAATTGAATATGAAATATTCACTTCAAATTATGTT
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CGTAACTCCATTTGAGAATCACTAGTACAAACAACTAAACTTGGTTTTAC
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AAAATATTGACTGGACATTGTAGAGGTGATTGACCTAAATACTTTTTTTT
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GGCACTGCTGAACTATTGATATTCTTCATATTGGAAAATAGGTACGTATA
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ATCCCTTAACTTTAAAAAGTTATATCTTATTATCTTTTTTGTCTAATTTC
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TAGCAATACAACAAAATCTTTTTCAAAATAAGCTTCCTTTTTTGTGTTTA
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GAACAAAATAATATTAAAAAATGGCAACAATAATACAACTCAACAAAATT
CCCTATTAGCTTATTAGCCTTGTATACAAATCTAATATCATTTTGTATTT
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ATGAATTTCAAATACGTGTATTATATATATATATTTATGGAATAATCCAA
TTTTGAGTAGAATAACAGCAATAATGTTAGGCTTTCATATTTCAGAATTG
TATTGACATAAATTTAATACTTTTGTTTTTAATATTATCAAAGGGAATTG
AACTTTTTGAATGCATGAATAACTATTAATCTTATATGATATTTTCAAGA
ATGTATATCTTTAAAATAATTTTTGTATAGTAGCAAAGTTAATTAGATTG
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CTAACCTGGAATGTGTTTGCTCTTGGAAACCCAATTACCAGAAATTGAGA
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CGTCGCTGCATATAAAACTGTAGAGTTAGATAACTATTTGGATGGGTATC
CGGTTCAACATCGTGAAAGTCAAGGATGTGAATCCAAAAGGTTTTTATCC
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TGGATTAAGTCACTTTGAGAGATCTTTGGTTCCAAAGTTATTTTTAGTGA
AAGGGAAACGTGATCCAATTATTATCAAACAAATTGTTCCTCATTGTTGG
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AAAAGTTGAATGGGATAAAGCTAGGAAGTTATTTAAAGGAAGAGACCCCA
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GCATGAAGAATTAAAAATGTTTGAGTCAGTACTTCCATTAGATGAAAAAG
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TGATGAAGTGGTAATGACTCGAGTTGATGTTCATCAGCTTAATCAAAAAT
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GGGGGTTCAAAATGAAAATGAAAATCAACACAGACTTCTACATGTGCGTG
GAACAAATAAATTATTGGTTAGAGCAGTAGAAGTAGAATGCTCTGCTTTG
TCCCTCAACACTAATGACTGCTTTATTCTTGAAACAAATGAATCCAAAAA
TTTTATATGGTATGGGAAGTGTTCAATTGGAGACGAAAGAGAAATATCAA
AGAGCTATCTCTTTGGAAAAGACTATGAAAATATTTACGAGGGACTTGAA
AATAAAGAGTTTTGGAATTTTCTTGGAGGTGAACAGTCTTATGAGAACGT
AAATGACTTAAAAGTAAATTATAGAAGCAACAACTCAGAGCCAAGATTAT
TTCAGGGCTCTAATGCAAGTGGTCAATTTATAATGGAGGAAATATTCGAC
TTCAATCAAAGGGATTTGATACCCGATGATGTCATGCTTTTAGATGTTGA
AGACTGCCTTTATATATGGATTGGGTCTCAATCAAATGAATTAGAAAGTA
AAAATATTTTATCAATGACTGAAGAATATCTTATTTCTGATCCGACAGGA
AGAGATTTGGAAATACCGATCGCTATAGTCAAACAAGGAGAAGAACCTCT
TCATTTCAGGGGGTTCTTTGGTAATTGGGACTTTAATTGGTTTGAAAATA
CATTTTATTAAGATAATTAGTCATCAATTAAGCCTCAAATAGCATTTTTT
ATACCTCTAATATTTTAAAACATATAATTGTCAATTTATTCAGAAATTTT
AATGTTGCTGTTTCAAATTATTAGAAGATAAAAATAACTTTAGGAAGGTA
CATTAATTAATTATATTTTTGTTAATTAAATAAACTAATTTTCC back to top
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