EMLSAT00000001238, EMLSAT00000001238-697085 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001238
Unique NameEMLSAT00000001238-697085
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1201supercontigLSalAtl2s1201:8544..22787 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001238 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001238EMLSAG00000001238-684004Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005406EMLSAE00000005406-714334Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005407EMLSAE00000005407-714335Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768806auto768806Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001238EMLSAP00000001238Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001238

>EMLSAP00000001238 ID=EMLSAP00000001238|Name=EMLSAP00000001238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=740bp
MEPAFSSILLSNPNADTFEIWRIRKLKLITLPEASYGKFYDGDSYIIFSR
KNREAHIHFWLGTYTSQDEATVAAYKTVELDNYLDGYPVQHRESQGCESK
RFLSYFKNYRGIMYLNGGFDTGLSHFERSLVPKLFLVKGKRDPIIIKQIV
PHCWSEMNSGDVYVLKVCSETESDCIFVWRGRTSNFYEKLNGIKLGSYLK
EETPSAKVVVLDDQTEAEHLSHEELKMFESVLPLDEKAQKLKDSKITVSD
DDIQYVRRKEVAIYDLEKGINDEVVMTRVDVHQLNQKLLQSKKAYIIDDH
LLSGIWVWVGKESPFMYRNEGLKAGQGYIKEKNYLANISITKIVQNTEPV
EFRIFFKNWKIQDVTQSQNDKRQNDFKKLPPKFDTKAHHNNKPSMASYFR
MVDDASGEKEXFRIEKGDLVPVSQENYGLFYSGDCYVILYSYYEFNRLCY
IIYYWLGIHSSQDERGIAAWRTVELDDKYGGKPVQVRVIQEKEPPHFLAM
FQGRFKILMGGISSKFNKGEEGVQNENENQHRLLHVRGTNKLLVRAVEVE
CSALSLNTNDCFILETNESKNFIWYGKCSIGDEREISKSYLFGKDYENIY
EGLENKEFWNFLGGEQSYENVNDLKVNYRSNNSEPRLFQGSNASGQFIME
EIFDFNQRDLIPDDVMLLDVEDCLYIWIGSQSNELESKNILSMTEEYLIS
DPTGRDLEIPIAIVKQGEEPLHFRGFFGNWDFNWFENTFY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1201:8544..22787+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001238-697085 ID=EMLSAT00000001238-697085|Name=EMLSAT00000001238|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14244bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1201:8544..22787+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAATTATTAATTATACCTGCCTTACTCCTAACGATAAAAGATACTAGAGT TTACATACATTGATTTAATATAGGACATTTGCCTTTAAAGTCATAGTTAT ATTCTGGATCTACTACTTAAGATATAGTTGAATAATATACTTTGACCTTA AATGTAATAAAGATGGAACCTGCCTTCTCGTCCATTCTGTTATCAAATCC CAACGCTGACACGTTTGAGATATGGAGGATACGGAAACTTAAATTAATAA CTTTACCAGAGGCATCCTATGGAAAGTTTTACGATGGTGACTCATACATT ATTTTTAGCAGAAAAAATCGTGAAGCTCACATTCATTTTTGGTTGGGAAC CTATACGTCACAGGTAGGCAAGGTCGTTCATTACTGAAATCTGATGAATG CTTTAAAGTAAAAAGACCATACATTTATATTTTGACATAAGGACACGTGG TTCGATCAGTGTTCATTTAATGAGAGAGGGGGGGGGGGGGTATTGTATAT ATATATATATATACAATGATGAAAATCCAATGAAGAATTTGTATGTTAAA AAAAAATTCGAAAATCAACATTGTAACCCTGACAATTTGAAGAATGTTTT AGATGAGATAAATTAGATCAGCTACAATCAGCTGTGACAAGAGAGGAAGG AGAAAATGATACAAACAAGGACATTTGCTAGAATTCCTCAGATATCACTC ACAAAATCGCCTCTGAGTCCTTTATTGTCAGGGTTACCATGTTGATTTTT CAGTTTCTCTTTTTTAATATGCCCATTCTAAACTAGATTTTCATCATTGC ACAATGTATATATATATATACCTAATTTGAAAGGGGGGGGGGGAATCACC GATATGCTTAAATATTACACTTTAACCGAACATCTTCCCACTTTGTGTTC TTCTCATTATCTTGAAATAGTCGTTCTAAATTTTCCCAAAATTTTGTATA AAATAAAGTATAATAATAATCTCAAAAAAAAAGAAAATGAAAAGATTGCA GAATAAATCTAGGGAACCCAGCTTTTGATATTAAGTACACATTCAAAAAT ACTTTACGACCGAGAGACAGACAAACTTGACTGATGAATTAAAATATATA TTGGATTTGTGTCAAAAAAATTGCATAGATTCTTACTTTATCTACTGGTC TTTGTCCCATAAAACACAGAACATTTGATGAATTTATAAAAAGTCAACCC GTAGGATGTAAAAAGAGGACGGTCACGTGATCCTTACTATTTTTAAAATT TTAAATAGAAGATAACTAAAATCAGTAAATGTTTCTTAAGAGTAATCATA CCAGGTATAGTAAGTCTAACCCTGTGAGCCGCAAAAATAAATTTGCGACT TAGCTGCGTTTCATTTCTGAAAATTGTGCAAACTAGAATGGCTAATCGCT TAAGCGCAAACCTTCACATATAGTTCTGACTCCTAAATGAATTCATTATC CTTTCTTCAGTATGTTAAAGTCAAAAATGTGTGATGTTGAACATGGTGAA TTTAATGTCTATCAGATCCTTCTTTCATATATGTATTGTGTGTCACAAGG AATAAATAAATCCATCAATCGTGAGATAACTATCTGAATTTTATTCCAAA TATACCTATTTATAATAACAACAATTTACTCTAGATACTATTTCTTTGCA TAAGAGATGATTTCTACTTTGACTTTGACCTTCAATCCATACCTTTAATT TTTTTCCGATAAAAAACATCTTTACTATATTTACATAATGACACTAATTT CAACTTTATGTCTCAATACAATATTTCACTCTAGAAATTTCCTTTTTCCT AGATAAACAACAGTTATTATAAATTCCTACACCGAAAGTTGGGATGTTTT CATGTATCGCTAGATTCCAAAAGGAGAGGAACCCCACCGCCGTCAGATGA AGTTACCTTCAAAGGCCACTCTCAACTCCTCAATTTATATCTAGGAAATT CAGGGTACTTTTGGGTACCGCCATTTCCCAAAATGAGATAAAATCCGAAA CAGCCTAATAATTTCTGGGGACCCCTCGGGGGGTATATGTAAGTACTGGC GGKGAGKTTCATCCCATTTTGGGGCTAGGGSGKACCAGAAAACAGCTCCA ATATTTGGGGTGTAAATAGGGGTTGTCAGGGGCTCTTAGTGGTTGTTTAA ATAGTGGCAGTGGGTTTGTTCCCATTTTGGACCAAGAAGTAACCGAAAAT AGCCCCTACATTTGGATTTTATAACGGGGTACAGAGGGGCCCTTACTAGT TGTTTATATAGGAGTGGGGGGTTTGTTTCAGGTGGGAAATGTCTGAATGG GGTATATTGCAACACTATTAGAGAAGCCCCTTATTTTATATTCTGCGGTC GACGCTTTGTCTCGTCAACCTTTTGTGTATTCGACGTTTTGTTAGTCGAC GCTCTGTCCACGCACCGTTTTAAAGTTTTAGTTGATTATGTATTTTTACT TTTTTGTGCTACTTTGATGTGTCAAAATTTAATGGCATCTTATAGTGATC ATATGTAATCCTCGTACCGAATGAAAAAAAAACGATCTTCAACTTTGCTA TAATCCTGTTGAACAACAGACAAACAAACAACCAGATGGGAAAATATAAA CTTCATTGCTGTATATAAAAATTGTTACATTAAGGACAACCTTGACAAAA TTATAGCAATAAGTAACAAAAAGTATTGATACTTATGCTTACTTCATAGC CGTAAAACAAACTTGACAAACTGCATGTGTCAGCTTAAAWAGAAAAATCG TCCCCCCCCCCCCCCTTTATTAGTGTTTTGAATATTTATTGGTGGAATTT TACTGAGTAGTGAATAATTCCATAATGATAAATAATTGTCTAACAGCTTC AAACTGAATTGGGGTCTTTATTCTCATTCTTTTGCGAAAGTAAGGTTATG AGGTATATAAAAGGTAACAAATTGATATATAGAGATGTATCATCCTCAAT TTTGAAGTAATAGTGGTATGAAATAATTAATATTTGAATTCAGGCTTATA ATAACTTAAAAGTTCAAATTTTGTTATGGTCGTTTTACATTTTAAGGTCT TTCATATATGTACAGATTGTTCCAAAAAATCGTTGAAAATAGAGTAAAAA CAAAGGCAGAGCTCCTACAAAACAGGAGAAGTTTGAACTGTGCAGCATTA TAAATTGGTGATAGAAGCTTACCTGAATTTATTATGTGGAGGAATGTTAA AGTGAGTGAGAAATCCAGGATGTACAAATTAATTCAACTTATCCTTTCTC AAGAATTGGTTATGCCCTCCACTTCCTTCAATTCTCTCAATTCCCATTCC ATCCTCAACATGTTTCTCTTGCTTGTCGATATCCAATACACTCATATGAG GCTTCCCTTTTACCTTGTATCTTTCAAAATACTGCTCCGATTCTGCACTT CAAAATATAAAAAACATTTTATTTTTGTTCATCTGTCATCTGGAGTACTT TACTTATTATATAAAAAATAAAAGTCCAATTTACGTAGTGGGGTGCCACA ATACTCAAGAGTCTAGCACAAATCGAGAGTCTTGTTCAATTTAAAATTAT GCCTTCCAGGAAAAGAGAATTATCTCTTATAAAGTTTTTGTGTACCTTGA CATTGCTCAAGATCAACCGATAACAATTTCCATTCATTTTTTCTTTTACA TTTTTTTTTTCATTTTGTAAGTAAATGATTAAAAATTTAGCTTCTCTCTC GTAGGGTAAGCATAGTTATTTATAAGAAGATAGATAGGTTTTCATAGGAA ATATCCTACTGATAACGAAATTTCAATGAAGAATCCTATAACTCAATGAG 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TTAAATATGCATTGCTCTTTTTCCAATGGAACAGAAAGAATTAACACATT TTTCTTAAAAATAGTTAGTAAATGAATTGTTTTCTCTCTATCTACCCATG ATTTTCAATCTTTTTTTTTCAAAGTAATTATGTGCAAACTAATTGGAAAA TGCCCAGCACAGTTCCATAGTTACGAAAGGATAACCTCTTGACCTTTCTA ATTACATAACTATATCCCTCACTAGCCACGTCAGAAAAATAATAGAGCAG ATCGTTAACTGGAAGCTTCAACCGTTCCTTGAGAGTATTAAACTTATTCT TAGCAGGGCACATATTCCGTCCTAATACGTCGGTGTTTCTAATTTTTTTA GGAGTTTATCGTGAGTTGTAGTAACTGTAATCTTGACTGTATTGTTTTAT ATTTCAATTTCAGCAAAGCCTTCAATGAATCCCTTCATAGGGAAATTCTC TTTAAATTGTCCAGCATCGGTATTAAAGATCAATTTTTACAGTGGCTTAG TTCCTGTTTGACGAATATTATACAGAATGTAGTGATCAATTCCACAGTCT CTAAACCTTGTGACGTTACATCATCTAATCTGCAAGGTAATGTACTTGGA CCCCCTCTCTTTGCCGTTTACATTAACAGTTTAGTGGATAATTTTTCTGA AAAAACCTCTCCTTTTTCCATAATTTCAATAAATGCAAATTATTTAAGTA TGTTTTAAAATTGGACATTATTCAGGTATACACATAATAAATCAATTTTT CGTATTTAAGACGTATTTGTTTGCCCTTTAATATTTTAATTATTCATTGA ATAATAATAAGCACAACATCCTAAAAAGTATAAATTATTGTTAGTTAATG CTCTTTCAAGCTCTCCTTATGTTAATAATCCGTCACAACTTGTGAATGAG TAATTCATGAATAAACTTTATTCATATTCTCTTGAAAAATCATTATCCAA 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CAAATATTTTTTGATATAATAAAAATCAGTATTTTAGCCAAATTAAAATA TAGAAAAATTAAATTGAGTATCGGGAGTTAAAAGAATTATTTCTCAGAGT AGATTTTGCATACTGATTTTCAATAGTACGTATCAACTTTTAGTCCCTAA CCATTGATCCATTTCCAAAAAGGTTGTTTCACCCCCACAAAACAGTCTGC CATAATATACACCACATTATAAAGAATGTCCATTTTATTGAACTTCGAGC CTTACATCATTTCAACTTTAAATATGGTTAMTCAATTTCACTTGAAGTCT ATCCCTTAACTTTAAAAAGTTATATCTTATTATCTTTTTTGTCTAATTTC TATGAATTTTCCATTAATGTTCTCAAAAAGTATTGAATTATTGTTGTGAT TAGCAATACAACAAAATCTTTTTCAAAATAAGCTTCCTTTTTTGTGTTTA AATTTCAACAACTATTTGCTATTTTTATTTTTTTAAATTGGCTTTCAAAA GAACAAAATAATATTAAAAAATGGCAACAATAATACAACTCAACAAAATT CCCTATTAGCTTATTAGCCTTGTATACAAATCTAATATCATTTTGTATTT CATAAAGATTAAATACCTTTAAAAATCTATTATTATTTTCAAAATTTGAT ATGAATTTCAAATACGTGTATTATATATATATATTTATGGAATAATCCAA TTTTGAGTAGAATAACAGCAATAATGTTAGGCTTTCATATTTCAGAATTG TATTGACATAAATTTAATACTTTTGTTTTTAATATTATCAAAGGGAATTG AACTTTTTGAATGCATGAATAACTATTAATCTTATATGATATTTTCAAGA ATGTATATCTTTAAAATAATTTTTGTATAGTAGCAAAGTTAATTAGATTG CAATGTTTTAGACATAAATTATCTAAAGTTAAGCGATAGACTACTTATAA 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TGAGTCTGATTGTATTTTTGTTTGGAGAGGACGCACTTCCAACTTTTATG AAAAGTTGAATGGGATAAAGCTAGGAAGTTATTTAAAGGAAGAGACCCCA TCAGCTAAAGTAGTTGTGCTTGATGATCAAACTGAAGCTGAACATCTTTC GCATGAAGAATTAAAAATGTTTGAGTCAGTACTTCCATTAGATGAAAAAG CTCAAAAGCTTAAAGATTCAAAGATAACCGTTTCAGATGATGATATTCAA TATGTTCGACGAAAAGAAGTCGCCATCTATGATTTGGAAAAAGGAATAAA TGATGAAGTGGTAATGACTCGAGTTGATGTTCATCAGCTTAATCAAAAAT TGCTTCAATCAAAGAAGGCATATATTATAGACGATCATTTACTTTCCGGA ATATGGGTTTGGGTCGGAAAAGAATCGCCTTTTATGTATCGTAATGAAGG ACTCAAAGCCGGCCAAGGATACATTAAGGAAAAAAATTATTTAGCTAATA TCTCAATTACAAAAATTGTTCAAAATACAGAACCTGTAGAATTTAGAATA TTTTTTAAGAATTGGAAAATTCAAGATGTTACTCAAAGCCAAAATGACAA AAGACAAAACGATTTTAAAAAGTTGCCCCCCAAATTTGATACTAAAGCAC ATCACAATAATAAGCCATCAATGGCTTCTTATTTCCGAATGGTGGATGAT GCTTCTGGAGAAAAGGAAGKGTTTCGAATTGAAAAAGGTGATTTAGTGCC TGTGTCACAGGAAAACTATGGATTGTTTTACTCTGGAGATTGCTATGTTA TTTTATATTCTTACTATGAATTTAATCGTTTATGCTACATCATTTATTAT TGGCTTGGAATACATTCATCTCAGGATGAAAGAGGAATAGCCGCATGGAG AACAGTAGAATTGGATGATAAATATGGTGGTAAACCGGTTCAAGTTAGAG 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