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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s121 | supercontig | LSalAtl2s121:348141..363404 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001312 >EMLSAP00000001312 ID=EMLSAP00000001312|Name=EMLSAP00000001312|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=103bp
MKKLYETDRQIMKNKGNRNVLYIRSLNTNDFGNYSCRAENELGKARTYTS LSGQPRPPRFTSESIGXRSQTXXISWITDSFEPITEYKLLYRKSDNGLKQ QIF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s121:348141..363404+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001312-697159 ID=EMLSAT00000001312-697159|Name=EMLSAT00000001312|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15264bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s121:348141..363404+ (Lepeophtheirus salmonis) CGACGTATGAAAAAACTCTATGAAACTGATCGCCAAATTATGAAAAACAA
GGGAAACCGAAACGTACTATATATACGATCCTTGAACACCAACGATTTTG
GAAACTACTCGTGTCGAGCAGAAAATGAGTTGGGAAAGGCACGAACATAT
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GTTTATATAAGCAAGGCGTTGTTATGCCGTCATCATGAAAATGAAGAAAA
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TGGACAACATTAACGTCTTTTTACCACTAAAGCCATGCTTTGCTAAAGTT
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NNNNNNNAAAAATGAGGACAATCTTAAGTTCCTCTTCACTGAACAGGTGA
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GTATTCTTCATCATTCTCCATCTTGGCCATCCTGAAAACCAGGCTTTTGA
AGCACTTTGCAATGATCATAATACTCTCAACTTCAACGTCAGCATATAGA
AGATATGAGCTGCGTTGATATTTGCCATCTTTCTCACTCATGATGACGAG
ATGATGGAATATGTCTTATTTACGGACAAAAGATGCCTGAAGTACAAACT
ATAATCAATAAATCTTCCTACATTAATTAGAACATTATCGCTAATTAATC
GTCCACTTTTGCAAGTAAACTCTTTACTGAAAGTATTGGCAATAAAATGT
CGATTTAATGGAATAAAAAGCCTTTTTCTAAATATTAGCTTGTAAAGTAT
CCTTGTTCACCATAGGAGAGTTACACTCATTTTTGGACACCGCTGTTGAA
CAGAAATGTTGTTGTTTTCATTTATGATGTACTCAATATTTTCTCATAGT
ATAAAAAAATAAATATATATATTGTTAAATATTGTCAAATATGTCTTTGT
TCTTCTTATCATATTATATTATTATTAATATTATGTCTCTTTTGTATATC
CGCTCAGCTCATATAATTTTTTTTTTCTCATTTTCGTTTTTCGTTGTTTT
TCTTTATTTTTACGTCTCTTTACTTCTTCATCCCCCCCCCCCCCCCTCCC
CTATCCTTTATGTCAAACGAAACTTCATCAAAAGTTTTACTTATGTACAT
ACATAAATATATATGTCTCCTGAACAACAACAGATGCTCTGTTGGTCCAA
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AGAGATGAGAAACAAAGCGAAAAAAAAATCTATAAAGATGTTTAATATTA
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TTATAGTCTTATATCTACTTCATATTTATATATATGTATACTATATACAT
ATAGTTACCCTTATATGAGAAATATTGTAATATATGGATTTGATTTAAGT
GTTTTCATATCATCAACATCACATCAACTCTGGATATATATTTTCGTACA
TATTTATAAAACATATTAGTATAAATGGAAAACAATTATTTATTGTTAAA
TATTGTGAAAAAAAATATGACATTCATATTATGTATAGTAGGAAAAATAG
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GTCTGATAAAATGGTTTTACATTAAAACGATGGAACAATAATTATTTTGA
GCACTCTTGAGAGCTAAATAAACTATCTGTTACTTCTTTTGGGGCGTGTA
TATCGACTCCAATGAGGGAGATATTTTTTCTCTTTCGGCTCCACCTTCAA
TGTATGTAAATTATTAATTATTTATATACTTTATTTATCCGATTTTTATA
AAATGGTACTTCATTAGATCCTAAGTTTTTAACAAATTCTGGAATTATCA
TTTTGTGCCTTTTATTTCCTTATAAATTTATTGTAATAGTTTATTTAAAA
TATTGATAAATGAAGTTACTAATGGAACAATTTAAAAAAATGAAGAAATA
AGTTGCCGATTTTGTTTATTCATCCAATTCCGATAGCGTTTATAAATCTA
TGAATGGTCTATTTTACACTTTTCTTGGACATTAAGATTTTCGAATTTGA
TCAATTCCACAACTGCTGGAACAAGCGCTGGCTTATGAAAGAAGAGGTCC
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GAAAATCGGTTATGAGGCCTACTATAAGATGCTTAGGTACACCATCTTGG
CATAACTGAAGACCATGTACCCAGAGGGTAACTACGTGTGGACTCTGGAC
GAAACCCCCTCTCACACGTCTCCCAATTGCCAAAAGTTATTTCCAGATAA
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AGACCCCACTGAACCAACTCCTGCATTGGCTTCAGGAGACGAGTAAAGGC
TGTGGTTGATGATGAAGGTGGCCAAATTGAGTTAAACAAGCTTTCTAAAA
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TTGATTCATACATTTTTAGAAACTTTTGATACTGTCCTAAATATGAAAAA
ACATTCACTATTTTTACAAAAATTATTGGAATAAAATAACAATTGCTGCA
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GACATCAAGTAATTTCCCTTGCTAGTACTCATTATCATCGCTCTATGTAT
TTTTACTCTATGGCTTAGACACCTTGAGTGCAGGCGAGCATTATAATATC
GCGCCTGTAAAAGATATACATATTTGTATCATTATACATTTAAAAAAAGT
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CATACATGAAAAGTCTTTATTTTATTTTTGACAAAAATTGCCATATTGAA
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TGTTAAATTTAATTTATTCACATTCTAAAGAGAAATACAAACCTATCAAW
ATTTTTTTTGTACTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTAATGTAGAACCAT
GTCGTCAAAAAATAAGCCTCAATAACTGAAGCATTTTGCAAACATTGCAA
AAATTTATGTCATCAAATGTTCTTGAAAATTGAAAATACGATATTGTTGA
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CATTTTAAAAATTGAAAATTGATGTTTGATGGAAAAAGTAAAATAAAATG
AAAAAATTAGAAAAATTATTAAAAAAATGAATTAAACATATATTTTTATT
TGTCAAATTTATATGGTAACGAATTTCCAGACGAATTTCTAGAAATTTTA
TTTTTATGCGCAAATCCAATATTCCATTGAAATTCATTTTTTTGTAGCCG
AAAAAGTGCAATTTTCTTCAATTTATTTATTCCCTTAAACTTCTTCGATG
TTAGATAAATTTATAAAACGTCCTTTTCTTAAAAAGGTTTTTGGAGACGC
CCATCACTTTTTAATTTATAACTTAACCCCCAATTTAGTCTCTTTGAGCT
CCAAAAAAACATGTTTTGTGTTTTGAATATGGAATAAGCCCCTTATGTAC
CCCTCTTCCCGTCAAAAAAACAAAAAACAAAAAAATAGGCACTCCATCTT
GACCTGATCAGTTTAAAAAGATGTACCCTTTCAAAGTTTTAGCGTCCTAT
ATCCAACGGTGTGGGCACCCATAAAGGTTATATACACAAACTCTTTTATT
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TCTCTTGTATCTTGTTCGAAATTTTCAATATTAATTAAATAGTTAAATAC
CATTAATAGATAATACTACATAAGACTCGAAGATTACACTTTATTTTCCG
ATTTCGAGTCCGATTCCATAAAAAACATCCGATTTTCCTATTCCAATATT
AATTAATTGTCCTATTACTCGTTTAAATATTAGGCAACTGAATAAGGCGT
GCATTTCTAACAATCTAAATTGGGGACTGCTTTGATCTTGATAAATATAG
GAAAAATGCTTTTGGGCATTTTATTGTCTCATAAATTGCATGTTGATTTA
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TTGAAATAACGGGACGCAACAATTAGATAGAATTCATTGTCTATCCTGTT
TTTAATATTTTTGATAGACACTAAATGTTTAAGTTATATTATCTATCCGT
TTCATTCTAACATTATAATAAAATGTAATCATAATTCAACTTTTTCCTCA
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CTCTTAATATATCCGACATCAATCATTCTAACGTCACATGAAAAGGCTTT
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TTACCCCAGTTTTTAAAAAATTTATTCTAACATGTGAATAAACTATAAGT
GAATAATTTAATTATGCTATATATATTTGATGCATATAATAACATTGATT
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TCAGATTTAAACCTATACTTACATATTCATAGTAAAGATTTTAAATTATC
TCATAAAATATCTAATGTAAAATGTATATAGTTTAATACTTTTTGTTATA
CCGGCACTGTAATGTTACTGTGGTACTGACACATTTAAACCGATAGAATA
CCAAACTGATATTAGAACCATTTCTTACAGTAATCATTATAACAAGGAAA
AAATGTTTTGCCGATGACATAACCCTTATAAATTTATAAGCTACAAAATT
GTTACAATAAAGCAGGAATAAAAATCTATTTATTTCACAATCAAATATTT
AAACTAGCCCTTTTTAGCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAKTATCTTG
CCCATTTAACAATAAGTCCATTACCGCCCTTAACGACCTTTTTGTCTAAT
AGATATCGAAAAATATCAAAATACAGATACTACTTTTGATACCCGTACTA
AAATATTGGTACCGTGACTAAACTACTAATGAGTATAATCCTTTGAATGA
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TGGTTTGCTAAGACACAATTGAATAATGACATCATAACAACCTGTATAAG
GTAATAAATAAAACAAATCAGGACGTCAAATAATTTTTTTCTCACGCATT
GGTACGAAACCACGAAAGCATAAAAATTGTTATTCAAAAAATTAATTTCA
ATATTCTTGAATAAAATCGAATAAGTTGGGAAATAATAGTATTCGAATAT
TTTTTTATTCGACTAAAATATCTATGTATAATTCATTCTATAAATGAAAA
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TGGACAGCATTATCTTTAATGTAGCTCATACTGTTTTCGCCTAAAAGAAA
CAAAAAAGAGGCCCAAAATCAGTTGGTAGGTAGGCCGTTATAAAAATATC
AATAAGCTATTACGAATATGAAAAATGTATCGTCTTTGAAGTATATCGGA
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GAAAGAGAGCAGCTCAGATGTTGAAAGGTTTCATCAGAATAGCTACTCAC
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CTTTCACGCACTAGTAATTACTTTAAACGTTAATTATATCTCTTCAAGTA
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CTGCCAATGCACAAATGATATCATTAGAATCAAAACAAGTATTGTTAATA
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TCTTTGTTCCTTAGAGATAGACCCTTAACTTCCTCCTATTCATATGCTCC
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TTAGATCAAGATTTTTGCACTTATCTGGTTGTGAATAACTCTCTCAGAGA
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ATGTATGGTTTGTCTAGGATATAGGAATGTTTTGATGTGCTCCCTGATAT
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CCATAGGATCTAGGCAAGATTATAGTATTCAATCAAATTTATTGACTATT
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AAATATATATATATATACATAGAATAGAAACAAGACAATTATCTTACAGT
GATTTTTTCACTGTATATAACTGAGGACTCAAACTGGACTCTACGAAAAA
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TATGGCCCTGTTTAACTTCTGTTAACTATTTATTTCTTTCTTACCCTATA
CTTATCATAAAAAAAAACCTTAAGACACATACGTATATATACATAAATTT
TCTAATGTTCTACACCAATGAAGCTCAACATGAATTTGTTCTTCATCTCT
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TTTCTTCCTTATTTCTTCAGGAGTTCCCCGCAATGAGGGCGAGGGGAATA
CACCCTGTTCCTCCCATAACTTTAAAACATCATAATAATGATGCAAGAGC
CATTTCACTCTTGAATGAACTCATCTTAAAATGGGAGGGTCATTCATTCC
CTTCCACACAATATATATTATGCTGTATACAATTGGTAAGTTGTATAAAC
AAATTGTACAAGTTACAACCTCAAAATGTTATGAATAATTTAGACTACTC
GCAATGAGGATAATGAGAGTTCTAAAAAATATGACCGAAAAATGGTGAGT
TACTTTTTTCTGGTTACCAATCTGAACTATGTTTTTGTTTTTACCAGAGC
TGTTATCATTAATGTTTCATTTTTGAGTAGATAACATTTAAAAAAGATTA
AAGTTTATGTGAGCATGAATAATAAAAAGTATAATAGTTATGATTTTTTT
TGTAGGGCTGTAAGAGTCAGTCCTTTCTGGACTCAATATAGAATGGGGGA
TTGACATTAATTCAGTAATTCCTGGCGATGTATTTACTCGATATGGAGTG
GGATTTTTTATTTATTTCTGTTATCTCATTCATGTTTGTAGCTAATCTGA
TAAAACGTCGTCCTGACAGCTAAGCAGTTTTTCTTTRAAACATTACTCKC
TCAAATTGTGYGGCTCACTCATTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTACAAACNGGCCAGTCTATAATTTTTATAAATTT
AGGGATAATAACAATATTTAACATTTCATGGACGGTTAATATATATATGA
TTTGCTCCTTAAAATGTCTGATTATCTTATTAAACAGTGCAGAGTGAGAC
ATATAATATTTAAGAATCTGTTTATACAAGTTATAACTTGTACACAAGTG
GTCGTTGCCTTAAATTCATTTTTTTTTTCCATCTGATTATTATTCACATA
CTGCTTATAATTGGTCAATGTTGATAATCTGGTTATTATACTAACACCAT
TTGAAAGGATTAAAAAATATAAATATTTTTTTGTACAATTACGTATGTAT
ATTGTAAATATTATATCTTCAAATGTATTATACTTTAAAGTATTACAAGT
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TTTTTTAAAATAATTTATAAGTTGATTTGAAATAAACATTAAGAAGAGTT
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TTTAAGTAGAAAATTATATAAAATAATTAATTAAGTTTCAGGACGTTATT
TTTACGGGACTTTCATAGTTACAGGCCTTATTTGAGAAGTATTTATTCTT
CTTAGGAGTGTTTGATGAACCATTATCCAAGAGTAAAAAGTTTGTTTTAA
TTTTACAACATACATGTAATTAATTACCTCAATTGGACAGTTTATGGCTT
RAGAAATAATTTACTGCAGAACAATATTAAAGTAAAAAGCTGCATGTACC
GAAAGTTCACCACGCACTTTTTACGAAAGAATTTCATCCCTAGACAAGTT
CATCCCGAAGCAAATTTATCGCAAGGAAAGTTATTCTCAAAACAAGTTCA
TCCCGAGGAAAATTCATTCCTAACGATACCAATATTTGGAATATTGCTTA
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TAATTGAAATAAGGACTGAAATTTCTTAGGCTAAACGATCCCCTTTATTC
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GAGCCACCTACACCAGCTTCATGGCCTTCAAAACTATGTTAAATAATGAG
GAGGTATTACTACGTTCTAAGGACATGAACAGTCCTTTATATACAATTTT
TATAAGACTTTAATAGCTTGGCTCCTAAATAAAAATGGACGCTATAGACT
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TCGGGTCAAAATGTTATGTTTGACATAAAAAGCAAATACTACAAAACTTT
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CATTTTTGTTTAAGTTTTCATGTTTCCTTAATAACATCCCAAATTCATTA
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AAAAAAATATATACTTCCAACTATTACCCTGAATCAAAAACTGTCAATCA
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CGCACATTTTTTGACATATATCGTCAATGAAAAGCATTGTTTCTGAATTA
TTTATCAATAATACAACAAATAGTTGTTTATGAAGACGATTAATTAGAGT
ACTTAATTTTGAAGTAACTCATATTTTTAAACGGAATTTGGGAAAAAAGT
TCTTGGTTTTCTCACACAATTGAGAGAATGTTCTTTGTGTTTGGTCAAAC
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GTTACTTCAATATTTTTGACTATGTTTGCTGTTTTTTTAATTTATATTTA
TCCATGTTATTTTGCCAGTCTGGAGATTCACATAGAAACGATATTATATT
TTTTTTGAAAAGAGATAGTTATATTGGTTACAAAAATCATACGCTAATTT
TCCGTATCTTATTTTATTTTATTATGAAGAGGCATTTTCATTCATGGCCT
CAACAGTATTGGTTTTTGTAGTTAAATGTACTTGAGAGTCAAACACACAC
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ATAGTTATTTCTTAGTATTAATAAATGAACGTGTTATAATTCTATGCTTC
CATTACTCATTTAAATTTTTTTTTAAATTTACCAAATTAGAATAAAATAA
AATCTCTGAGTTTTGGATATATACAAATTCAATCATTTAACAATAAAAAA
TATATTATTATATTACSAATCTTMATCAAATATATTAACATCGTTTTTTT
GTTGTTTTTTTTATCAAATTTCATGTCAATTGATTGAAATTTATGTTGTA
TATTATAAATAACCAAAATTATATTTTTTCTTCATCTTGAACATTTAGGT
CAACCCCGACCTCCACGTTTTACATCAGAGTCTATTGGCTAKAGATCACA
AACAWACAAWATATCGTGGATAACAGATAGTTTTGAACCCATTACGGAAT
ATAAGCTTCTGTATCGTAAATCTGACGTAAGTATTTTATTATATTTATCA
AAAATGAACATATTTATAAGTAACTCCTTTTTTAAAGAATGGTCTTAAAC
AACAAATATTTTAA back to top
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