EMLSAT00000001312, EMLSAT00000001312-697159 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001312
Unique NameEMLSAT00000001312-697159
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s121supercontigLSalAtl2s121:348141..363404 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001312 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001312EMLSAG00000001312-684078Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005755EMLSAE00000005755-714683Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005756EMLSAE00000005756-714684Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005757EMLSAE00000005757-714685Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776671auto776671Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001312EMLSAP00000001312Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001312

>EMLSAP00000001312 ID=EMLSAP00000001312|Name=EMLSAP00000001312|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=103bp
MKKLYETDRQIMKNKGNRNVLYIRSLNTNDFGNYSCRAENELGKARTYTS
LSGQPRPPRFTSESIGXRSQTXXISWITDSFEPITEYKLLYRKSDNGLKQ
QIF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s121:348141..363404+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001312-697159 ID=EMLSAT00000001312-697159|Name=EMLSAT00000001312|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15264bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s121:348141..363404+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGACGTATGAAAAAACTCTATGAAACTGATCGCCAAATTATGAAAAACAA GGGAAACCGAAACGTACTATATATACGATCCTTGAACACCAACGATTTTG GAAACTACTCGTGTCGAGCAGAAAATGAGTTGGGAAAGGCACGAACATAT ACTTCACTCTCAGGTTAGTAACCAATCTTTGCAACTTTATGCATTAGAAA CTAATAGTTCTTCACATTCAAAATGCAAATTAAATATCGTCAAATAAGAA AGAAAAATGTCCAAAATATATTTGGTAACTTTTTTTCTCATTACCTTGAG GCAATGTGGAAATAATATATTAATTCTTTTCTTTTTTGTTTCTTGCAAGT ACGTAAATAGATAATTTTCTAGTATACCATATCATATCATGTTTTTTTTT ATATTATTCTTATCTCGTTTACTTTGATGGAAATAAAGTTTAATTAGTTC TAAGATAATAGAAAAGTCAACAATCGAATCCAAACACTTATATGATTACA TTTACTCAGAAAATTGCTTTATGATTAAAGATAATCTTATTGCAATCAAA AATCTCCAAACCAGTAATATAAAAAATATATAACATAATATAAAAGTCTA CATATTTTTGGATTTAATTATAATGGAATTCAGGGATTAGGCATATGGAT CCGATTAAGGGACTAGAGTTAACATAATATATTCATACAATTTGGTCGAG ACTCTTGAAATTTATTAATATAAGTGGTATTAATGCTTATACATATTGGC ATAGGCAGTTGAGGAAATATATATAGGATTTCGACTTATAGTGGTCAGTT TTATTTTTTGTAAGCTGTTTTCTTTAAGACAGATTTATCATTTTTTTTAC CATACAAGCTCTATCTGGACATCTAAATAACTTACTGCGGGTTTGTTTTT TATATTTAATGTAATTAGTCTCGAAGCAGCTCTATATTATGAGAGGAAAT ACATAAGTACATCATGCTTATAACATTTGTCTTCAATCAAAATGAACATT GTTTATATAAGCAAGGCGTTGTTATGCCGTCATCATGAAAATGAAGAAAA CGTCATATGTCCTCCCTATTGTAAAATAGTAAAACAGTTAAATTCTAACA TTATTGGTTAATGGACATAATTTCAAAGTTTTTTACCTTTTGGGGCAGAT GTCTTGACCCCAAGAAATTTTCTAATAAAGCCAATAGATTTACAATTTAT CAAAATATTATTTTAAGGTAGGTTACAGCATTTATTGTGTATAAATACAA AAATATATACATTTAGACGTACACACGCACGATAGATGTGGTAACCCACC CTTACAGAATCAACATTAACTTACCTTTTATTTACAACATTAGACCTCAT TTAATATATCTTTACAACAGGGAAAAATATTTCTGAAGCTCAAATGAAAA AGTTATTATTTTTTTTTAAATTTGGTGCTACATTTATTATTTTTGATTTT ATGTTTTTTATGAAGATAAACGAATAATTTAAAACAATTATGCATTGACA CTTCGCCAGCATTTCTTATAGACATGATAATAGCACACACGTGACTTGGA AATTGTGTACAAATTTATATTTTAACATTTTATCATAAAGAATAAAACTA CAAATTGGTGAAAAAATTATTTAATTTACAGCAAATTTATCTAGGACAAA AAAAAATGCTCAGTTTGACAAAAATGTTAAAGTCTTAACTTAATATATAA AGTATTTTTTAAAATATGGAGTAAAATATTGAGACATAAAATTTAAATAA ATTAAGTAGTAATAAACAAAAGCATGTTGAAGTGGTGGAGTTGTCACCAT TCTTTTCTTAAGCATCATGGATATTATTTGGTTGCAGATTTGGTTTTGGG TCGTGGAAAAAGTAGGAGGTGTAGCTCATGCTCATGTGTCCTCTTGGACT CTTTTGTACACCTATCTAAACTCTTTCATTCTGACATCAAGTGAGTCTGC GATCAAGCTGTGCCAACTTCTTGCGGAGAATCACATGTCGATACTCATAC TTGATGTCGTAGTATTTGTCTAAATAGTAGATATACTTGGAGCCAATGGT TCACTGAAGCTTCTTCTTGATACTCTAGCTACTGAGAAAATAACAATTAA TAAATATATTCATACTTTTGGAATCCAATATAATTAACCTTTAAATTTCT TGGACAACATTAACGTCTTTTTACCACTAAAGCCATGCTTTGCTAAAGTT TAAGAACCCCTGTTCCAGATTATATACGGTTATCCAATTATGTGATATTT CATTTGACATAATATTGACATCAAAATAATGGCCTAATACAATTCTTTTC AAATATAATTTATAAACTTTGGAATTATGTGATTAACTTATTGTTCTTTA TGTCCTGTAAATATTGATTATTTTTATAAAGTGTTATATGAAAATTGATA AAAAGAAAGGCTTTATTAACCAACAAGATACTTAACACGAAAAAACTCCA TAGTTTCCAAATCACTTTTCCACTCATATAAAACAAAAACAACAAAATAA GTAGAACAGCTTTTAAGAAAGGTAGAAAAAAACACTTTATATATTTTTTA GAAAATACAGAGTGGTCCATAATGAGAGTCGTATTCACTTTAACTTGATT AAATTCAGTGTGTAGATATTTTGTTTACCAAATCGAAATATTTTAAAATC AGGATGGGGCCCGACCACAAAGCAAATCAAGAGAAAAATTATAACAAAGA AAATTTAAGGAATGGAATCGTCATAGCTCAGTGACAACGTGCTCAGGAGA TATTATTCTCTTGAACTCAATGTGCGTTCGATCCCAGGTGATTCCTAGAG AATGAAATATATAATACTTTATGTATGTATATGGATTTCACAATAAAATT ACTATGTTAGATTGAGTAATTGTAATTCTATAATGTTTAGTTATACTTAA TCGCTGCAACTCCATCTTATCAATAAAGGAACACAAAAATGAGGACTTGT GACATATAACTTTTTGGCCTCTCTCTACACCGAATTATAACCCCCTTGGC TTAGTAATGTAGGAAATAGTCGAAAAGGAGGCCAATACAGTTTTCAGTCA CATCAAATACTCCCTAATGGTGGGACACAGAGGGAAAATATTATTTAAGA ATATTGAGCATACTAAGTGCAAGTATTGGCTAAGTTATTCATAGCAAGGG AATGCTGCAATGAATGAGAATTTGTTGAATTATAGTAAAACAATGCTANC CCTGAAAAAAAGTAATATCAGATCCTCTATATATMCCCACCATACCCTGG AGAGGTTGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNAAAAATGAGGACAATCTTAAGTTCCTCTTCACTGAACAGGTGA TCCAGACCCCTCTTCAAATTGTGCCCTCTACTTCTTGCTTTCCTGGAGAG GTATTCTTCATCATTCTCCATCTTGGCCATCCTGAAAACCAGGCTTTTGA AGCACTTTGCAATGATCATAATACTCTCAACTTCAACGTCAGCATATAGA AGATATGAGCTGCGTTGATATTTGCCATCTTTCTCACTCATGATGACGAG ATGATGGAATATGTCTTATTTACGGACAAAAGATGCCTGAAGTACAAACT ATAATCAATAAATCTTCCTACATTAATTAGAACATTATCGCTAATTAATC GTCCACTTTTGCAAGTAAACTCTTTACTGAAAGTATTGGCAATAAAATGT CGATTTAATGGAATAAAAAGCCTTTTTCTAAATATTAGCTTGTAAAGTAT CCTTGTTCACCATAGGAGAGTTACACTCATTTTTGGACACCGCTGTTGAA 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CCAAAAAAACATGTTTTGTGTTTTGAATATGGAATAAGCCCCTTATGTAC CCCTCTTCCCGTCAAAAAAACAAAAAACAAAAAAATAGGCACTCCATCTT GACCTGATCAGTTTAAAAAGATGTACCCTTTCAAAGTTTTAGCGTCCTAT ATCCAACGGTGTGGGCACCCATAAAGGTTATATACACAAACTCTTTTATT TATATATATATACAGATAAGACAAAACTAAGTCATAAATTCACATAGTTA TCTCTTGTATCTTGTTCGAAATTTTCAATATTAATTAAATAGTTAAATAC CATTAATAGATAATACTACATAAGACTCGAAGATTACACTTTATTTTCCG ATTTCGAGTCCGATTCCATAAAAAACATCCGATTTTCCTATTCCAATATT AATTAATTGTCCTATTACTCGTTTAAATATTAGGCAACTGAATAAGGCGT GCATTTCTAACAATCTAAATTGGGGACTGCTTTGATCTTGATAAATATAG GAAAAATGCTTTTGGGCATTTTATTGTCTCATAAATTGCATGTTGATTTA TTCTTTATATACTGGACAATCAGTATGGTCTAATACAACATTGATTGCCC TTGAAATAACGGGACGCAACAATTAGATAGAATTCATTGTCTATCCTGTT TTTAATATTTTTGATAGACACTAAATGTTTAAGTTATATTATCTATCCGT TTCATTCTAACATTATAATAAAATGTAATCATAATTCAACTTTTTCCTCA ATATTAATGAAAAAAATAGGTGATATTCTTATATAATTTGATTGTTTATA CTCTTAATATATCCGACATCAATCATTCTAACGTCACATGAAAAGGCTTT ATATAATTTAGGGATCTATTTTGTGTATCTAAATAATAGAATAATTATTA TTACCCCAGTTTTTAAAAAATTTATTCTAACATGTGAATAAACTATAAGT GAATAATTTAATTATGCTATATATATTTGATGCATATAATAACATTGATT GATATAGACTTTGATCGTTGACATAGTTGTTAAATCATGAAAGGAATTGA TCAGATTTAAACCTATACTTACATATTCATAGTAAAGATTTTAAATTATC TCATAAAATATCTAATGTAAAATGTATATAGTTTAATACTTTTTGTTATA CCGGCACTGTAATGTTACTGTGGTACTGACACATTTAAACCGATAGAATA CCAAACTGATATTAGAACCATTTCTTACAGTAATCATTATAACAAGGAAA AAATGTTTTGCCGATGACATAACCCTTATAAATTTATAAGCTACAAAATT GTTACAATAAAGCAGGAATAAAAATCTATTTATTTCACAATCAAATATTT AAACTAGCCCTTTTTAGCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAKTATCTTG CCCATTTAACAATAAGTCCATTACCGCCCTTAACGACCTTTTTGTCTAAT AGATATCGAAAAATATCAAAATACAGATACTACTTTTGATACCCGTACTA AAATATTGGTACCGTGACTAAACTACTAATGAGTATAATCCTTTGAATGA GGAATCGACGTTTGAAGCAGAAGAAAGATAGTTAAAAAGCATCGTAGAGA TGGTTTGCTAAGACACAATTGAATAATGACATCATAACAACCTGTATAAG GTAATAAATAAAACAAATCAGGACGTCAAATAATTTTTTTCTCACGCATT GGTACGAAACCACGAAAGCATAAAAATTGTTATTCAAAAAATTAATTTCA ATATTCTTGAATAAAATCGAATAAGTTGGGAAATAATAGTATTCGAATAT TTTTTTATTCGACTAAAATATCTATGTATAATTCATTCTATAAATGAAAA TAGCTATTTAAATTTAAAAATTGAGAAGAAGAACTTATCTTTCTTCATCT TGGACAGCATTATCTTTAATGTAGCTCATACTGTTTTCGCCTAAAAGAAA CAAAAAAGAGGCCCAAAATCAGTTGGTAGGTAGGCCGTTATAAAAATATC AATAAGCTATTACGAATATGAAAAATGTATCGTCTTTGAAGTATATCGGA AGATAATTAAGATATATGATCATGGTTGAAAATAATATGACTTCCAGTGT ACTAAAAAATTAAATCGAAAATTTTACGTGACAATCGAAAAAAATGTTTG GAAAGAGAGCAGCTCAGATGTTGAAAGGTTTCATCAGAATAGCTACTCAC AGTGGCCATGAGAATTCGGAAATCAAAACAAAAACCACTCCATATCTATC AATGATATAGACAGGAACTATTCTATTGTTGATCCTCAATGCTACTCTGG ATTCAGCAAGGACTTAGACTCTGAAACAAATCATCAGTTTTACTCTTCGT CTTTCACGCACTAGTAATTACTTTAAACGTTAATTATATCTCTTCAAGTA ATGATAACAGCTTGAGAAAATAAAAAAACTTTTAGATTGGAACAACAAAA AGACTTCTCTATTACATTATTTTTTATGTCTTTATTATCAAAGTGATGKC CTGCCAATGCACAAATGATATCATTAGAATCAAAACAAGTATTGTTAATA TAAAAAAAAATAGAAGGAGTCATAATTACAATAGGAACATACTGTCCATT TAAGCAAACTTTTAATCTAAATATATTATTAAATTTCACATCCATGAATC GAAAAGAGTACATTTAGAAAGACGAGTACTACAAAACTATTTGTTCCTTT AACATCTCAAATCAAGAATGTAGGTATTATATATAATATTTTACATACAT AGAGTAGCAGTTCCATTTTTAAAACTTTTTTTATGAAGTGGAAACGTATT TCTTTGTTCCTTAGAGATAGACCCTTAACTTCCTCCTATTCATATGCTCC 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