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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s138 | supercontig | LSalAtl2s138:65965..79353 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002085 >EMLSAP00000002085 ID=EMLSAP00000002085|Name=EMLSAP00000002085|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1385bp
MNKYGLHCHGSSKMIMVSSDEAPDTGEESEEDLITSYLGHESACVLASQQ AHNHNRILEENLLQLSEIHENIQRMRMENAEASGKLLLGPRISSSCPSLN NEEEEEIIPERNETDKRLPSSVTTPPSSSSSASVPPPNHTNNTTNSHSTT IGALTRSRRKGGSSNGVTGGSSGDKRKHRSGRRRSLSVSSGDSEGDTVDG IKGAPRPRSSSSIVFVRSTSGAPDSASPTFVKPESGKGGHGRARKGSHLF SHLPALQKSISTPSIAVDQTRNGKNKRFVASDSESEEDYNLVQHNSSSAK VAGSNHHPHQQHLHRTLPGEGAPPLPPNQNNSSPQLSLTEFLHLPDPILE DNDDQRKRRRKKERSSIFFRKKKDKNSSSSKSFQQPFSKIQSVSAMNSFS KIGNINHHPPHYIQMINNRIPSHSHSMSSLRKSSAGSYTSNFYTGRGDSG KYDDKDETINLDDTTGLLECEFTPNEEIFIEGGPAGIRSLDTDPFLKIEE DEPENWQQTRRPADIQDFRPIDIKRQEHIYEFIITESNHCQVLKVIQKIF VEGMTKYLNLSSDIIDRLFPSLDLLIDIHFKFLEELRVRQNQEPIVDXIX DXLLSQFSGPNAELWRRAYGIFCSHHTDAVSTYKDIMKSDRRFQQFVRQC TANPLLKKKGIPECILFVTTRITKYPLLIEPLIKTAKDRPEEQKKLIRIN DLVRGILNDVNSKVAEKEREQRLIEIYNRIDTKSSLLHQGKKFKKSDMLS SSRRLMFEGIGSLQQSRNRNLQVNIVVLSDILLFFQDNNQKFVFVTPDNK PAIVPVRTLIAREKTGLNTKALYLISTSETEPEMYQIDIQQPPTREEWIR GIREAVDACSPGSDSDSHAGVCDDDLRKYVEAKYLRMRHLMTELRSKDLE VARLLEDKMRVMAXAFRAIGNNNVIDDEKVPDYVSLVQEKDSSSGATKAQ LLEHLQEVHKISNQLYGLSNSSVCLSRSVSSVGEQKSNTYTCPVLPKRAE TFGGFDQQAGSXPTIQEVGNSAETITDGNIPKSNENVLIQLDPEQQKAAV RMNHHLNSLICLISEHFTSLESLKSDLNEARDRVHLSGGRYKHNQQLEEL RNLQEQLTHEKLEWQREVSSKEQDLDDKKDKLNKAQVELEREKKDVAEQR DQLYRKLEALKAQGIDFSSNMTILKSDHSNDNIHSASGYVMNLKVHDANS SPPVISYNSTNSEDSVGVNQSPSDLVAPRLPNSSSSLGSAHSLSNLNLLS TTNESNRALKDNLEIKQQIPVKLSSKLSTSISKEKSKKSSFISSGGKQSG KSGNSLDSSGIHQLLPLKLVESQDKKGSFKCNNSCSSYQKLSDSHLTSAG SGDHEIFHTRSGSSPVSMSQPSSSRKTAEEKVVFL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s138:65965..79353+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002085-697932 ID=EMLSAT00000002085-697932|Name=EMLSAT00000002085|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13389bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s138:65965..79353+ (Lepeophtheirus salmonis) AGAGATAGAAAGAGCGCGTGTGTGCAAACTCCAAAGGTATCTTTAAATGA
GGGAGCTAGAGCAGAGAGGGCTGGAAAGAATTCTGATCATAGAGAAAGAA
AAATATAAATAAAGAGGTGACAAGGTATGCAAAAGACTGTTGTATTCGTT
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GCTCCGTGTTTTTTTTCAATCCATAATTATTAGAAGTAAGTGTCTTATGA
GTCCGTGTTTTTCCCAAGAGTTCCTGAAGCAAGATCCATCAGCATGAATA
AGTACGGTCTTCATTGCCATGGAAGCTCCAAAATGATAATGGTCTCGTCA
GACGAAGCTCCTGATACGGGAGAAGAGAGCGAAGAAGATCTCATCACTAG
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ATCATAATCGCATCCTGGGTAATAATTTGATGGATTTAATTGGCTCGTAG
CCTTAGTTCTCATATATCATAGATTCCATCATTCCCATTCTAACTCCCAT
TTTTCATTTACTGCAAATTAAAAGAATTGAAATGTGAGAAGTGAGAGGAG
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TAAAAGACTCCCCTCCTCGGTAACTACTCCACCCTCCTCTTCTTCCTCAG
CCTCAGTTCCTCCTCCAAATCATACCAACAACACCACTAATTCACATAGT
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GATGGAATAAAGGGAGCTCCCCGGCCACGATCCTCATCCAGTATTGTATT
TGTTCGCTCTACATCCGGTGCTCCAGACTCTGCCTCACCTACATTTGTCA
AACCAGAATCCGGGAAAGGGGGACATGGAAGGTAAATAAAATCATATTTA
TTCTTCAGACATACCGACCTATAGTTACTTTTTGTGCTTTTTGTCCCTTG
GGTTTTGTACGGAAGTTGCTGTCAATAATTTTTGGGAAATATAATCTACT
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GAATGTATATTCCCCTCCTAAACATCAATTATTATTATTGCACTCATAAT
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TGTGTTTTGATTCAGTATTATTTATTAAATGATTAACCCTTGTCATTTTA
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TGTTACTATTGTTAACATCATCTATGTACCTAAATTATTTCAGAGCTAGA
AAGGGGTCTCACCTATTTTCTCATTTACCAGCTCTACAAAAATCCATTTC
CACGCCTTCGATTGCAGTTGATCAGACTCGCAATGGAAAAAATAAGTAAG
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GAGTTAAAAAAAAAAAAATTAGAAATGTGTGCACGTCCCCCTCATTTGTC
TAATAGATGTTTATGTTTTAATCTTTATTATACAGTAGGTTTTTTTGTTA
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CTTTATCTATTTTTTATTTGACACTACTTATAGGAGGTATTTATAGTCTA
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TTGAATTGATGTAGTTGGTCAGAAATATTACTTCTATTCAAAGTCCATTT
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AAGTTTAAAGTAAGATTCTTCTTTTCATCTCACCCCAAGGGCCACGACAG
TCAAATCTCTCAGACCCATGTTTGTATATTTATTACAGACAACACAAGAG
ATACATTTATGGAAGCAATATAATAATAAATAAATTATAATTTTTGAATG
TCTTTGAATTTGATGAATTTGGTTTTGATATTGAATGGTGCCATTCTAAG
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ATTGAGGAATTTCGTTGGCAGAGAGAGATTTAAATACATCAAAGAGATGT
GGTAATCAAAAAGTGATACTCTATTTTTTGTCTCTATTCTATATATTATT
TCTAAAAATTATTTGTTACAATTAAAATTAATTTGAATTACCTAGTCATA
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TGGMCTCCCAGAGTCCCCTTCCAGTCATTCTACTTTGCGTTAATCATGTA
TCTTATAAGTAGTGTTACCTATCTTTTTTTCGTTATCTCATTTTTTATTT
ATTTCCATCATTAACTAATTATATTGGTTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGGCGTCTAGACGCTTTGT
AGCCAGTGACTCTGAGTCTGAAGAAGATTATAATTTGGTTCAACATAATT
CCTCCTCTGCAAAAGTTGCGGGTTCGAATCATCATCCTCATCAACAACAC
CTTCATCGTACACTCCCAGGAGAAGGAGCCCCTCCACTGCCACCTAATCA
GAATAATTCCAGCCCGCAACTATCATTAACTGAGTTTTTGCATTTGCCTG
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AAATGTTGTACTTTTGTTCTTTTTTCCTTTCTATTTACCTAGTTAACTAT
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TCTTCTTCTTCAAAGTCATTTCAGCAACCCTTCTCGAAGATACAGTCAGT
TTCAGCTATGAATTCATTCTCCAAGATTGGAAACATAAACCATCATCCGC
CACATTATATTCAAATGATAAATAATCGCATTCCATCGCATAGTCACAGC
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AAAACTCACGAGCCATAATAATGCTATTTTCCCCTTCTAAACTATTTGTA
TGTTACAATCAGAAAATGATAAACAGAACATATTTTTATCCAATAAATTA
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AATCTTGATGTCATGTATTCATAAAAGTTTTTTTCTTTTTTATTTAAAAA
TCTCTATCATCATAGTTTTATTTTAATTAATATTATGATAATATTGTAAT
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TTTGTTTCGATCCATTTTTGGTGATCCTTTATTTACGAGAAAAAAAGACG
GATTTTAGTTGAAGTCAAATTAAACTTACAAAATGATCGGGTATTGGACA
AAAAATGATTTAGTTTATCCCGTATAATCTATCAGAAGCAAAAATTAGGA
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AGAATATTGGCGATTTTAGGATTTGCTAGCATACTTTTTAGTCAGATTTT
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ATGGCATTGGTTAATAATGGAAGTGAAATCTCCAATTCAACGATTGCTTC
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GCCCGGGATGCTGTGGGGTTTCTCTGATGAAAAGAATTTCTGTCAAGCCA
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GTTATGCCTTCCCACATGTTTGAAARAGACCTAAAGGTCAATACAGAGGT
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TTTTAGACGCCAGTCAGTCACTTTTTGATTTGTAACTAAACCCCCTATCT
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AGTACTAATGTTTCATTCATATTCCAGAAAATACGATGATAAAGACGAAA
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TACACATGCAAATTTCATTCATTAATACTTACATATATTAATTCACAGAT
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TTTTGTTACTACGCGCATCACTAAATATCCCCTACTTATAGAACCTCTCA
TTAAAACTGCCAAGGATAGGCCAGAAGAACAAAAGAAACTGATTCGTATC
AATGATTTAGTGAGGGTAAGATATTCAGCTATTAAACCATTTTTGAGTAA
TTTGGTCAACAAAATACACTTTTATAGGGTATATTGAACGACGTTAACAG
TAAGGTAGCTGAAAAAGAAAGAGAACAACGGTTAATTGAGATATACAATC
GCATTGATACCAAGTCTTCCCTACTCCATCAGGGTAAAAAATTTAAAAAA
TCGGATATGTTGTCCTCTTCTCGTCGATTAATGTTTGAAGGGATTGGTAG
TTTGCAGCAATCTCGGAACCGTAACCTACAAGTGAATATTGTGGTTCTGT
CAGATATATTGCTCTTCTTCCAGGATAACAATCAAAAATTTGTATTTGTG
ACTCCTGATAATAAGCCTGCAATTGTGCCTGTACGTACGCTCATAGCACG
AGAGAAAACAGGCCTGAATACTAAGGCTCTTTATCTCATTTCTACTTCTG
AAACTGAGCCAGAGATGTATCAAATTGATATTCAACAGCCTCCTACTAGA
GAGGAGTGGATACGAGGMATAAGAGAGGCAGTGGATGCTTGTTCTCCTGG
ATCTGATTCAGATAGTCATGCGGGTGTATGTGACGATGATCTTCGAAAAT
ATGTAGAAGCAAAATATTTGAGAATGCGTCATTTAATGACTGAACTTCGA
TCTAAAGATCTTGAAGTTGCTCGACTCTTGGAAGACAAAATGAGAGTCAT
GGCTGYTGCTTTTAGAGCAATAGGCAATAATAATGTTATTGACGACGAAA
AAGTTCCGGATTATGTGTCTCTAGTCCAAGAAAAGGATTCCTCGTCGGGT
GCAACTAAAGCTCAACTTTTAGAGCATTTGCAAGAGGTTCACAAAATTTC
CAATCAATTATACGGTTTGTCCAATTCCTCTGTGTGTCTGAGTCGTAGTG
TTAGCTCTGTGGGTGAACAGAAAAGTAACACCTATACTTGTCCTGTTTTA
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KCCTACCATTCAGGAAGTTGGAAACTCAGCTGAAACTATAACGGATGGAA
ACATCCCTAAATCTAACGAAAACGTTCTTATTCAGTTAGATCCTGAGCAA
CAAAAAGCAGCTGTTAGAATGAATCATCATCTTAACTCACTTATTTGTTT
AATATCTGAGCATTTTACAAGTCTTGAAAGGTAAACGTAATTCATTTCAT
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ATTATTTTTTAGTTTGAAATCAGATTTGAACGAAGCGCGAGATAGAGTAC
ATTTAAGTGGTGGTCGTTATAAACATAATCAGCAATTGGAAGAACTGAGA
AACCTTCAAGAACAGCTAACCCATGAAAAGTTGGAGTGGCAAAGAGAAGT
ATCCTCAAAAGAACAGGATCTTGATGATAAGAAAGACAAACTTAATAAAG
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GATCAATTATATAGGAAATTGGAAGCTCTTAAGGCCCAAGGAATTGATTT
TTCATCTAATATGACTATATTAAAGTCTGATCACTCAAATGATAATATTC
ATTCAGCCTCAGGTTATGTCATGAATCTCAAGGTACATGATGCCAATAGT
TCTCCTCCAGTAATATCCTACAATTCCACAAATTCCGAAGATTCAGTTGG
AGTAAATCGTAAGTTATTGACAACTCATTATCATTCATAATTTCATCGTT
CTGTCTTTTTTTATTCTGCAGAATCCCCGTCAGACCTGGTGGCACCCAGA
CTTCCCAACTCCTCATCAAGTTTGGGCTCCGCACATTCCCTTTCTAATCT
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TGGAAATTAAGCAACAAATACCAGTTAAATTAAGTTCTAAGCTCTCCACG
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GGAACATTCCTTGGTACCTCGACCCTTCCCAGAAATTTTAGTTTAAAGCC
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ATTGCTTTTGTGTTGATGCAGTCATACAGTCTAATTGATATTAATTATTA
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GATTCTTCTGGAATTCATCAGTTGCTACCACTTAAATTAGTTGAAAGTCA
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AATTATCTGATAGCCACCTTACCTCTGCTGGTAGTGGAGATCACGAAATA
TTTCACACACGATCTGGTTCTTCTCCTGTTTCAATGTCTCAGCCATCTTC
GTCAAGAAAAACGGCGGAAGAAAAAGTTGTATTTTTATAAAACATTAGTT
TGAATTTCTGAGCGCCATATAAAAACTATACGTACATATAATTTAAATAA
TGTTCTATTTTATTTTTATATACATACAATCATACAAAAATAACTATTGT
ATTATCGTACTAGTCTTTTAAGTTTAGCAAAGAAGAAGAGAGAAAAAAAA
ATAGATATTTTAAAAACTTGGTCATTTTTAAAAGAAAAATAAACCTACCA
ATTTATTTGTTTTGTTATTTTACAATAAAAATATGTAGAATATACTCCAT
GTTCTGCCATTATTCTTAACTAATATATATTTTTTTTTTGTCAACGGCAG
SACTGTTACTTCATTGTTATTATTATTATTATTATTTTTTTTGTATTTTA
GACAGACTACATGAATTATTAGTTACATATCTATCTAATATTGAGTGTTC
TTGATACGAACCATTTTCTACTACATATACACACATTCCTTACTATTCTT
ATATACACTATTGTTTAGTCTTAGAATAATAATTGTTTTATATCAACCCG
CTCTTATTTCAACCCAACCCATTATTACCCAATGCATTGTTCCCCATATG
CAGCATACAATACAAACCAATAATATCTTGTTACTTTATACATATATTAT
TTTATTTTCTCTCTCCATGTGTGATATTTTGGTAAACTCTCTTAATGAGT
GATGATTGAAGAAACACTTTTTCATTATACATCCATAAT back to top
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