EMLSAT00000002085, EMLSAT00000002085-697932 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002085
Unique NameEMLSAT00000002085-697932
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s138supercontigLSalAtl2s138:65965..79353 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002085 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002085EMLSAG00000002085-684851Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000009239EMLSAE00000009239-718167Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009240EMLSAE00000009240-718168Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009241EMLSAE00000009241-718169Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009242EMLSAE00000009242-718170Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009243EMLSAE00000009243-718171Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009244EMLSAE00000009244-718172Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009245EMLSAE00000009245-718173Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009246EMLSAE00000009246-718174Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009247EMLSAE00000009247-718175Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009248EMLSAE00000009248-718176Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009249EMLSAE00000009249-718177Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009250EMLSAE00000009250-718178Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009251EMLSAE00000009251-718179Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771196auto771196Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002085EMLSAP00000002085Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002085

>EMLSAP00000002085 ID=EMLSAP00000002085|Name=EMLSAP00000002085|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1385bp
MNKYGLHCHGSSKMIMVSSDEAPDTGEESEEDLITSYLGHESACVLASQQ
AHNHNRILEENLLQLSEIHENIQRMRMENAEASGKLLLGPRISSSCPSLN
NEEEEEIIPERNETDKRLPSSVTTPPSSSSSASVPPPNHTNNTTNSHSTT
IGALTRSRRKGGSSNGVTGGSSGDKRKHRSGRRRSLSVSSGDSEGDTVDG
IKGAPRPRSSSSIVFVRSTSGAPDSASPTFVKPESGKGGHGRARKGSHLF
SHLPALQKSISTPSIAVDQTRNGKNKRFVASDSESEEDYNLVQHNSSSAK
VAGSNHHPHQQHLHRTLPGEGAPPLPPNQNNSSPQLSLTEFLHLPDPILE
DNDDQRKRRRKKERSSIFFRKKKDKNSSSSKSFQQPFSKIQSVSAMNSFS
KIGNINHHPPHYIQMINNRIPSHSHSMSSLRKSSAGSYTSNFYTGRGDSG
KYDDKDETINLDDTTGLLECEFTPNEEIFIEGGPAGIRSLDTDPFLKIEE
DEPENWQQTRRPADIQDFRPIDIKRQEHIYEFIITESNHCQVLKVIQKIF
VEGMTKYLNLSSDIIDRLFPSLDLLIDIHFKFLEELRVRQNQEPIVDXIX
DXLLSQFSGPNAELWRRAYGIFCSHHTDAVSTYKDIMKSDRRFQQFVRQC
TANPLLKKKGIPECILFVTTRITKYPLLIEPLIKTAKDRPEEQKKLIRIN
DLVRGILNDVNSKVAEKEREQRLIEIYNRIDTKSSLLHQGKKFKKSDMLS
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PAIVPVRTLIAREKTGLNTKALYLISTSETEPEMYQIDIQQPPTREEWIR
GIREAVDACSPGSDSDSHAGVCDDDLRKYVEAKYLRMRHLMTELRSKDLE
VARLLEDKMRVMAXAFRAIGNNNVIDDEKVPDYVSLVQEKDSSSGATKAQ
LLEHLQEVHKISNQLYGLSNSSVCLSRSVSSVGEQKSNTYTCPVLPKRAE
TFGGFDQQAGSXPTIQEVGNSAETITDGNIPKSNENVLIQLDPEQQKAAV
RMNHHLNSLICLISEHFTSLESLKSDLNEARDRVHLSGGRYKHNQQLEEL
RNLQEQLTHEKLEWQREVSSKEQDLDDKKDKLNKAQVELEREKKDVAEQR
DQLYRKLEALKAQGIDFSSNMTILKSDHSNDNIHSASGYVMNLKVHDANS
SPPVISYNSTNSEDSVGVNQSPSDLVAPRLPNSSSSLGSAHSLSNLNLLS
TTNESNRALKDNLEIKQQIPVKLSSKLSTSISKEKSKKSSFISSGGKQSG
KSGNSLDSSGIHQLLPLKLVESQDKKGSFKCNNSCSSYQKLSDSHLTSAG
SGDHEIFHTRSGSSPVSMSQPSSSRKTAEEKVVFL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s138:65965..79353+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002085-697932 ID=EMLSAT00000002085-697932|Name=EMLSAT00000002085|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13389bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s138:65965..79353+ (Lepeophtheirus salmonis)
AGAGATAGAAAGAGCGCGTGTGTGCAAACTCCAAAGGTATCTTTAAATGA GGGAGCTAGAGCAGAGAGGGCTGGAAAGAATTCTGATCATAGAGAAAGAA AAATATAAATAAAGAGGTGACAAGGTATGCAAAAGACTGTTGTATTCGTT TCAGTTGTTCACTTTGGTATGTTTAATGGGTAATATTCTGCCAAAAAAGC CATTCATTTTTAGGCGGATTATTTTCCTTCCGCGCGGATTTTAAAATATA TAATATCAACTAGCAGACTCAACACAACAGCTGCATTATACCTCTCAAGA TCAGAATATTTATTATGTMCCTGCCTAACTAAGCCAAGTAGCCAAGTGTA AATCCTTGTCACCTCTATTTTTTATTTTTCTTTCCCTATGATTGTGATCC ATCCAGATGGAGTGGATCTAAAATGTATTAATATAGAGCTAGAGAGAGAT CCACACACTCGCAGTTTCCCTTTTTTCATTGGGATTTTTCTTTTATATTC TCTCTTTCTTTCGTATTGACTTCTTTGGCCAGAAACTAAAAAGTGATTTG ATTCAATTTCCATCTGAGCTCAACAGACAACAACCACTACTCTGACTTTG GCTCCGTGTTTTTTTTCAATCCATAATTATTAGAAGTAAGTGTCTTATGA GTCCGTGTTTTTCCCAAGAGTTCCTGAAGCAAGATCCATCAGCATGAATA AGTACGGTCTTCATTGCCATGGAAGCTCCAAAATGATAATGGTCTCGTCA GACGAAGCTCCTGATACGGGAGAAGAGAGCGAAGAAGATCTCATCACTAG TTATTTAGGTCATGAATCCGCTTGTGTCCTCGCTTCACAACAAGCTCATA ATCATAATCGCATCCTGGGTAATAATTTGATGGATTTAATTGGCTCGTAG CCTTAGTTCTCATATATCATAGATTCCATCATTCCCATTCTAACTCCCAT TTTTCATTTACTGCAAATTAAAAGAATTGAAATGTGAGAAGTGAGAGGAG TTCTTTTGGGCAAGGAATGGAATCTCTTTCTCCTCTTCTTTTCTCTCTTC CTAATGAATTAATAGGCCTCTAATATATTGAGGAGGTGTTCCTATTCCAT TTTTTCATACATGCTTATTATGGCTAMTAATAMTTTTWATAMTTTTYATC TTTKAAGAGGGRATATATATCCTTCCTAACTTCATTTAATTAATTAATGA GATACCTTACTTTATATTAAAAAGAGGAAGGCCCATAGCCTTGTTGTTCT GTGCATCTCCCCTAAAATCAAAAGGAATTCAACTTTTGGAGTAGTATTCC AAGTCATGTGGATTATTATATACACGTACTTTTGAATCTTAAAGACGCTC TCTCGAATTAATTTACTTCCTCTCTTATAATTATCTCATCCTTCCTCGTA CATTTCGATTCTATAATAAAAGTAAAATAAATAAAAAATGACACATGGAT ATATTAAGTAGTAATATATCTAGTTACACTCTCTTAGCAGTAGTTGAAGG AGGAATCTATTCTAAGCAAGAGTTCTACTCAATATTTTATTATTTTCATT TCTTATTATAATATATGAATAATTATTCCAGAGGAAAATTTACTTCAATT ATCCGAAATCCATGAAAACATTCAGCGAATGCGCATGGAAAATGCTGAGG CATCAGGGAAATTACTTTTGGGTCCTCGGATATCCTCTTCTTGCCCTTCC TTAAACAATGAAGAAGAAGAAGAAATCATTCCTGAAAGAAACGAAACGGA TAAAAGACTCCCCTCCTCGGTAACTACTCCACCCTCCTCTTCTTCCTCAG CCTCAGTTCCTCCTCCAAATCATACCAACAACACCACTAATTCACATAGT ACAACGATTGGAGCCTTGACGCGATCCAGGAGGAAAGGAGGGTCCAGCAA TGGAGTGACTGGGGGTAGTAGTGGAGATAAGAGGAAACACAGAAGTGGAA GAAGGAGAAGTTTATCTGTTTCGAGTGGTGATTCGGAAGGGGACACAGTT GATGGAATAAAGGGAGCTCCCCGGCCACGATCCTCATCCAGTATTGTATT TGTTCGCTCTACATCCGGTGCTCCAGACTCTGCCTCACCTACATTTGTCA AACCAGAATCCGGGAAAGGGGGACATGGAAGGTAAATAAAATCATATTTA TTCTTCAGACATACCGACCTATAGTTACTTTTTGTGCTTTTTGTCCCTTG GGTTTTGTACGGAAGTTGCTGTCAATAATTTTTGGGAAATATAATCTACT ATCATTTCTGAATCTATGAAAACACTTTTGTATGTACAACATTGTAGAAT GAATGTATATTCCCCTCCTAAACATCAATTATTATTATTGCACTCATAAT TAGTAAATTGTTCTACTAAGGAGAGATAAACATGTTTTTTTTGTTACGTA TGTGTTTTGATTCAGTATTATTTATTAAATGATTAACCCTTGTCATTTTA TGACTTACATGTGACTGTATTTGATTCAACTTGTGCCTTTGTATAAGTAT TGTTACTATTGTTAACATCATCTATGTACCTAAATTATTTCAGAGCTAGA AAGGGGTCTCACCTATTTTCTCATTTACCAGCTCTACAAAAATCCATTTC CACGCCTTCGATTGCAGTTGATCAGACTCGCAATGGAAAAAATAAGTAAG TTATTCTCTTAAAAATAAAAGTATATAGTATCTTGAATTTCTTAAGTAGA GAGTTAAAAAAAAAAAAATTAGAAATGTGTGCACGTCCCCCTCATTTGTC TAATAGATGTTTATGTTTTAATCTTTATTATACAGTAGGTTTTTTTGTTA CAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTAAATCACTTTAATAATAATTATTTAATG TTTTTGAACGCAATTTATTTATTTTATTTGTTATTTTATTTAGTTTACCT GAACCTACTCATCTTTTTATTCAAAAACTTATTGAAGATCACGAGTAAGA CTTTATCTATTTTTTATTTGACACTACTTATAGGAGGTATTTATAGTCTA ATCCGAATAAAAACAGCCCTAATGCCTGGTTGCACCACTCAATTTAAATT CAATTCTGCATAAATGTCATGACCTAATAGTTTAGTAGTTAAAATTCAAG TTGAATTGATGTAGTTGGTCAGAAATATTACTTCTATTCAAAGTCCATTT AAAAAATACTCATAAAAAATGCGAAGATAGATATTTATAATTAAAAACTA AACAAATTTAGTATATAAAATCTGTCATTTTTGTTATGTTTTTGTTAATA AAGTTTAAAGTAAGATTCTTCTTTTCATCTCACCCCAAGGGCCACGACAG TCAAATCTCTCAGACCCATGTTTGTATATTTATTACAGACAACACAAGAG ATACATTTATGGAAGCAATATAATAATAAATAAATTATAATTTTTGAATG TCTTTGAATTTGATGAATTTGGTTTTGATATTGAATGGTGCCATTCTAAG TACCAAAGAATTAGTATAAACGTTGTTCATACGAAAAGTCGTAACTGGGG TAGACAATTTGTTTCTGAGATAAAGAAGTTGATTTTATACGGATTTGATT GTATTTACATTATCAAATGTTGATTACATGATTTAGAAAATTAAATCAAG GTTATTTTATTGTTATACGACTGTCTTATATATTATTAAGTGCCAACTGT ATAATTATATCCAAATTGATTATTGTTTAACACTAGGATGACTGAAATAT CGTTTATTTGACTTTTTATAGTAAATTATTTTCATTAAATCCTCAAAAAA TTGCTTAAATCATTTTGATATTTATAGTCTAATCTTATGTTTAAGCCAAT 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GATTTTAGTTGAAGTCAAATTAAACTTACAAAATGATCGGGTATTGGACA AAAAATGATTTAGTTTATCCCGTATAATCTATCAGAAGCAAAAATTAGGA TGGGATGCCATACGCATTCCCGCTGGATATCTTTGTTCTTGCGGGGAAGT TCAAAATTAATTGCAGGGTCATTTCCTATGATGTTTACACAACAACACCA TATCATGTTTTATGAATTGGTTATTGTTCTTATAAATTCCTATATATAAT CAACATCTGAAAAAAATCAATATCGGCCAATTTATATTTTATAACACTGA GAGTTTCAAACCGTTCGGTATCTCTATGAATCCAATTACTTGAACTGTTG GAGATATTAAATAAATTTACTAACTGGAAATGAGAATTGATTTCAATTCG AGAATATTGGCGATTTTAGGATTTGCTAGCATACTTTTTAGTCAGATTTT CCATTATATATACATACACAAGCAAAATATTAGCCAGTGTTGCTCGGGGG AGAGTTATGGTATTTTTACAGGCAATATATCACCTGTATATAATATTAAA TGTATTATTATGAATTTAAAAAAAAAGTGTTATAAACTTCAAATAACGTA TCAACATTTTTTGGCATTTTTTCTTTAAACGTTTGATGAATAAAATTTAA AAAATATTCAGAAAATGACTGATATTTCAGTTAACATCAAATATTATGTG TCAAATTTATATGCAAACAAATTTCCAGATAAATTTATACAAACTTAATT TTATCTTGGAATCCAATATTCCATTGGAAATCTATTTTTTGTTTTTGCAC ATGAAAAAAAAAATATTGAATAAATTTTGAAAACGTCGTTATCCGTAAAC AGGGAGAGGGGATCAAATTGTTGCCTACTTTAAACCTTGATAACTTGAAG ACGACATTTTCAAATAAAAACACGGTTACCAAATAGGAAAGCTATTGTCG 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TTGTGTATTTTCTTGATTTTTAATCCGGCCATTTCAATACTGTAAAACTT AAAAAATTAATCGGAGCTTAACCAATATTTATTCAGCAACCTCTTTGATT GGAAGTTTGTCTAATAAGTAATAACCAAAAATTTTAAGTATCAAATCAAA TACTTACGGAAATCTTTCCCCTTTCCAAAATAATTATTATACATAGGCAT AGTTGAACCAACGCATCAACAACTACATAAATTCTTGTTTACCTCAATAT ATAGTTTTTTATAATTTATTAACATAATATAAAAAAAACGCGATATGAGA AGAATATACTGCACTATACGGGTAGTCAGAATAATTTCACATACCGCATT ATGCAAAATTCGTGGTGTTTGAAACTGCGTTATGCGGGGGCCGCCTGTAT TTCATTTAGAGATAGACTTATTTACGGTCGGCCGGTAAATCTATAATTTG TACGACTATTGGTATCATCCAACAACATAACTTATTCTTATGGATTTTTT AGTACTAATGTTTCATTCATATTCCAGAAAATACGATGATAAAGACGAAA CAATAAACTTGGATGATACCACAGGGTATGTAGAAACATGAACTTCATTT TACACATGCAAATTTCATTCATTAATACTTACATATATTAATTCACAGAT TATTGGAATGTGAATTTACACCCAATGAGGAAATCTTTATAGAAGGAGGT CCAGCTGGTATACGATCCTTAGATACAGATCCTTTCCTCAAAATAGAAGA AGATGAACCAGAAAATTGGCAACAAACCAGACGRCCTGCCGATATTCAGG ATTTTAGACCAATCGACATCAAGAGACAAGAGCACATATATGAATTCATT ATTACAGAATCCAATCATTGCCAGGTTTTAAAAGTGATTCAAAAAGTACG TTATTTTTTTATTGGGTTATTCTATATTTTAGAGTCTAAATATGTATATA 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ATTGCTTTTGTGTTGATGCAGTCATACAGTCTAATTGATATTAATTATTA TATTTGTTTATCAATTGACACTTTAGTCTGGTAAATCAGGGAACTCTCTT GATTCTTCTGGAATTCATCAGTTGCTACCACTTAAATTAGTTGAAAGTCA GGATAAAAAAGGTTCCTTCAAATGCAATAATAGTTGTTCCAGCTACCAAA AATTATCTGATAGCCACCTTACCTCTGCTGGTAGTGGAGATCACGAAATA TTTCACACACGATCTGGTTCTTCTCCTGTTTCAATGTCTCAGCCATCTTC GTCAAGAAAAACGGCGGAAGAAAAAGTTGTATTTTTATAAAACATTAGTT TGAATTTCTGAGCGCCATATAAAAACTATACGTACATATAATTTAAATAA TGTTCTATTTTATTTTTATATACATACAATCATACAAAAATAACTATTGT ATTATCGTACTAGTCTTTTAAGTTTAGCAAAGAAGAAGAGAGAAAAAAAA ATAGATATTTTAAAAACTTGGTCATTTTTAAAAGAAAAATAAACCTACCA ATTTATTTGTTTTGTTATTTTACAATAAAAATATGTAGAATATACTCCAT GTTCTGCCATTATTCTTAACTAATATATATTTTTTTTTTGTCAACGGCAG SACTGTTACTTCATTGTTATTATTATTATTATTATTTTTTTTGTATTTTA GACAGACTACATGAATTATTAGTTACATATCTATCTAATATTGAGTGTTC TTGATACGAACCATTTTCTACTACATATACACACATTCCTTACTATTCTT ATATACACTATTGTTTAGTCTTAGAATAATAATTGTTTTATATCAACCCG CTCTTATTTCAACCCAACCCATTATTACCCAATGCATTGTTCCCCATATG CAGCATACAATACAAACCAATAATATCTTGTTACTTTATACATATATTAT TTTATTTTCTCTCTCCATGTGTGATATTTTGGTAAACTCTCTTAATGAGT GATGATTGAAGAAACACTTTTTCATTATACATCCATAAT
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