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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s173 | supercontig | LSalAtl2s173:277123..290523 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003088 >EMLSAP00000003088 ID=EMLSAP00000003088|Name=EMLSAP00000003088|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=188bp
MDQNSRSIQLSVLQSRMIKLLLRASLVLLVFHVSFIDSLPQLGSLVRGSS GFLSDIVRSNVDEDSNRGKLAILIAENGGDTDKIKDSLKLRLKSKVPFLL TDEEKAELEKREKEEERQQEDAKNDSSLSSRLFNSAKDRVFGRSMKSEDL SQIMIKTGELLIILGKSSLIKPDNAGDYVEYALSNFNA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s173:277123..290523- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003088-698935 ID=EMLSAT00000003088-698935|Name=EMLSAT00000003088|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13401bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s173:277123..290523- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGACCAAAATAGGTAAGAGGGTGTGTAGTGTTTCTACCTTTTGTGAGT
CATCTCACATTTTCTGTTACTATACGTACTAGTTCTTCTTGTAAAGTAGA
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GTCGGATATTGTGAGGTAAGTTTAATTATCTTATTTGCTCTTAATTGATT
GTTATTCACATCTGTTAATAAATTTATATTTTTTCACAACTATAATTATA
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ATTTTAATGTATTTATGCGTCACAACACCGTGGTAATATAAAGTTGAGAA
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GCTACGTGACAGCTTTATGCCCACTAGGCGTATTGAGCATACTGGAATAT
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AGACTCCTAACAAATTCTTGATTTATGGATTTTACATACTAACACAATAT
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AAGTTCCATTTTTACTCACCGATGAAGAGAAAGCAGAACTAGAGAAGAGA
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TGGCATTATTTCACATCAAAAACCTACAAAGTTTATCAAAATATGTATTC
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GGCATGACTGCTCAATTTGTGGGTAAATATAAATGATTTAACATTATATA
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AAATAAGCTCATACAGAAATCATTATCGTCATATTTATACCGTATTAGTA
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TTTTGATTTTAAACTATAATTTTTCCAAACTAAAATGGCTTKTWCCGAAA
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ACAGTCTAATCTATATACATTAATATATAATTGGGTATTATGTCTATGTG
TAGTCGCTTATTACACAGTATTAGGGATAATCATATATTAATTACTATCG
TGACCAAATGCATATTTTATTTCTTGTTCAAAAAGAAGGAAAAATAAAAG
TTGAGAAATATTTATCCACTTTTGGCAAAAAAATGAGATGCTGCTCACAT
ACGACGAGCTTTTTGAATACTCGCAACTTCAAATTTTAAGAGAAAGTGGG
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AGAAAAATTTGATCTTGTCAGTGTCACTAAAATTGTGATAATTGCCACTA
TGACTTCATATGAATGTTAAAATGTTTCATATATGTTCAATTTATATAAC
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ACCGACATATTGGCCACGAAAAAATCACTTGAGACTGAATAGGAAAAGCT
GCACCTCAAGACTAATATAATGTTACATTTTATGTGTTAATATCCTTCAG
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AAGTTTTTTTTAACGCGATTTGTGACAATGGCACCTTAAAACATTTCCAA
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TATTGTTCTGAACGTTCTATATCGATTTCTTGTTAAACTGTGAACATTTC
TATTTTGGAATAGTCCAACAATTGGAAATTGGCAAGCAACCAGTTAATTT
AGGACATTTTTGTCTTTTTGGGGGGAATACATTAATGATAGTTATGTATA
TATGTCACCAAACTTCTTTTCATCTTATTTTTTACATATTAATTTTCAAA
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TGATGTTATTATTTTTTTTACTAAAAAACAAAGTTTATATATCAAATAAT
TATATCTTTGATAAATGAAGGTATGTGCTAGTCATGTAAATGTGTTATTG
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AATGACGATGCAATTATACTTCCTCCCCCCCTTATGTAATAAATAGCAAA
TTTAACTCTTCTAAAAATTAATTTAATTATATTTAAATATATTTTTTACA
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AGATGCTTTTATGAAATAAAATAGATACATTTCGAAATAATAGTGAAAAA
AAGTCATGAAATTAGTTTAAAATTTTTTAAACACTCAACATCTTTCTTTA
ATGCAGCTTGATACCAAATCAAATCCAATTATATTTGAATTAAACAAATT
AAAAAAGATTGGGGATCCAAAACTTGCAGCAGCATGACTAAATAACGAAA
AACGTATTTTTTATGGAATCAATAAACGAGAACCCAAAACAAATTTGTGA
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AATTATACTACATGAATTGTTATGTTATTAAAATGGTGAATTAGTCTAAT
TATTTATGGCTTTTACTATATCATTAGTGAGCGGCGAAGTGGCGTTCACT
AATGCTAGAGCTTGATCAAGAGCGGAATCCTGCTCATTGCTCAAATTTTT
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TAGACAGTTGAAGTTATGTGACAAAATGAGCTATAATTTTTATTTATATG
GTGCATCTGTGACTCTCTGCTGTTTCGGTTGACAAGTTTGCCTCTCATGT
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AAGATCTCAAAATCCCACGCAAGCATAAGTTCAAAAATTTGTTCAAGCTC
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GTAGTCGATTCTTAAATAAGGAAAATTTGTATAAGCTGTTATTTTATAGC
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GACCGAATCAAGACTAAACTGAACAGAACTGCAGTTATGGGTCCTAAGCA
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AAAACAAAAACAAAATGATGTAAATATGTTAGATGTCTTACAACTTAAGG
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TTTTACGGATCAAATAATAGAACACTGTCATTCTAAGTTTCTACCTATAA
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AGAGCCATACAACCTTTTCATAATATTGTGTGTGTAATACTCAGGTATTT
GGCAGGTTAGTAATAATTTATATGTCTCTTTATTGTTATTGCTATATGTG
TATATATAAAACATATTACCTTGTTACTAACTAATAACAAAGTAAATAAT
GATATATTATATTGTATTTAATACTCTCAAATCCTCAATTTAAAGTTAAT
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AATTAAGTTTACTTTTCAATAACTCGCTTTTAGCTAAACATACATATAAT
ATTTACCTAGGTATGAGTATAATTTCTAATTAATATAAGCTTTTACTTTG
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CCAACGTAATAACTCCATATTTGGTTTTTTTTCTAATACACGGTCCCTGG
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TTTATTTGGGGCTTTTCTTTTCAGTAAGATTAATTTCAGCAACATCCTCT
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CTATGTTTAATTCTGATCAGAACAGATTCCTTGGCTCTGGAGAGAAAGTT
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CACGTCCCAATTTTTTTAAAGGTATGGATTGTCACTTCAAAAATGCTCCA
AAAAAATAAAAAAACAAAAAAAAAACCAATTATGTATTGTACTAATCGAA
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GTCTTAAACTTGGAAAACCAAGTATAAGGTCTCCGCCCGCAGGGCTTAGC
TGCTGGAGCCCGGCTATCAGTGTTGGGTTTCAATCTGAAAAAAACGAGAT
CGGTTTGACACAGTTATTTTTTTGTTGGACCTGACTAATTCGGTGCTTCA
AAAAAGTTTGGTCTAGATTGGTTTCATAGAAAAATTTAGTCTGGATGTCC
CCAAAGGTAAAATTCGGCCGAAGGAAAAAATCGGTCTTATTTAAGTCTCA
AAATAGAGAACATTGTTGCCAAGGTAATGGAGATAAACTGAAGATTAATT
TTAGAGTAAGACAACCAACAATTCAGCTATTCGGACTTAGGAGAAAAAAA
CAGAATTAGATAGTAAACAAAAATATATTTCACTCCTTCATGGGAGCCTT
TTCAATCGTAAATCTTTTAATTTTTTAAACTTTTCAATAGTTTTTTTTGT
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GAACAGAAAGATATGTGTAGACATCGATTAATATCATGTACTCCTTCTTC
AGTAGAGGGACACCACTAGCAACATAGTAATCATTAATCACACTGTTGAT
AAACAACATCCAACCTGGGAGTGTTGTTTGTCAGCTTTGACCCTGCTTCT
TTGAAGGGAAGGGGGGGGGGGCAAGACAAAAGGTGTACCTTTTCTATAAA
ATAAAAAGAAACCTTCTTGGATTTTGTATTCTAAAATGTATTAACCAGTA
AAACTTTATAAAATCTAAATTTAGGACATTCATGTTTTTGTATATTCAGT
AGGAAACATTTAAATTGTTATTATAAATAACTTTAACTCCTAGAAAAATC
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TTCATATATGAAAATGTCGTTGAAAAGAAGCTCACTTAAATAATTTCTCG
CTCAAATGAATGTCGTAAGATGACACTTGATTAAAATAATCTCACTCAAA
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TGAATGAAAAACTAGTTCAATAAAAAATAAATGTTGTTTAGTTGTAAAGG
AAATCCATTATTTTCAATGCCATTTCCAATGTGTAATGCATAATTATACA
TTTTTTTCTTAGGAGTATGAAGTCAGAAGATCTTAGTCAAATCATGATTA
AAACTGGAGAATTACTGATAATTTTAGGTAAATCGAGTCTCATCAAACCA
GATAATGCAGGAGACTATGTGGAGTATGCTTTATCTAATTTCAACGCTTG
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