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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s174 | supercontig | LSalAtl2s174:364234..370462 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003104 >EMLSAP00000003104 ID=EMLSAP00000003104|Name=EMLSAP00000003104|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1006bp
MLFRLCGSSMARMSSRVLLKPKKGPLALWSKNCFTPGVSGLARTGIKVVP KDKVGPKEIFSTMFHHIWPKNEPQVRKRVMFALGLLVTAKLLNVSVPYFF KKAVDVLNSEANDYFSLGTPAETVFAMASAILIGQTGALSKVIDRGSRGI SFALNAMVFNIFPTIFELGLVSGVLGYNFGANYAFTALGAVGMYSVFTLG ITSWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSLINYETVKYFNNEAYECQQYDKSL LKYETASLKTTESLSLLNFGQNAIFSVALSAIMMMAAKDISNGALTVGDL IMVNGLLFQLSLPLNFLGSVYREIRQSLIDMQVMFQLMATPSKITSSKGA TEINFINNMEDASITFDDVKFGYNIDKNIANGLSFSVESGKTIAIVGESG SGKSTLVRLLYRFYEPQLGSIKIGNYNINEVTLDSLRRQISIVPQDCVLF NDTIFHNIKYGNLNCSDEDVYKVAKLAEIDNAIRSWPQGYLTQVGERGLK LSGGEKQRVAIARAALKDSPIIIFDEATSSLDSITETMIMKALKRVTSGK TAIIIAHRLSTVVHADEIFVLSNGKVIERGTHEELLNTLTLPNGRSRRFV DLISHKDNILMDSARKDAFFTYLTIIRNKIGGAMEIKESEVLDIFTKILI NSGFMLNDTLLNIGTSLSLEFSAIDHSCRPNAIYMFTGRQIVVKALCDIA NFDDVRIAYIGNIEPRSIRQKMLSHQYFFDCDCEECTDDPLNLEKIKSHS PCCPQCKNLLDDDKCINCNKEVNLSRYFKIKEILKNEKEMNAKTCLYFVE VLKYFHPFDYVSYKFCDDLIARNDLIDNNKLQILYERNILTMRKYGCIYD IQMSEYLMNLIGILLSKQELKSVPNLLFEAKAIMEGIDESKSSCSKGSLE SRLQSLKEDTSKFHESYWTTHNDAFIKERTQFIARLLTEKYPDQIEDKKT LSSKEMSLFYKSFLDKRKKLHWDYNLDWQKRNARILLLSMGVELKNIFNH FTPKAK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s174:364234..370462- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003104-698951 ID=EMLSAT00000003104-698951|Name=EMLSAT00000003104|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6229bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s174:364234..370462- (Lepeophtheirus salmonis) ATGCTGTTCCGACTCTGTGGATCCTCGATGGCTCGAATGTCATCGAGGGT
CCTTTTGAAACCAAAAAAAGGTCCTTTGGCCCTATGGAGTAAAAATTGTT
TTACTCCTGGTGTTTCGGGATTGGCACGAACTGGAATTAAAGTAGTACCA
AAGGATAAGGTTGGACCAAAAGAAATCTTTTCTACCATGTTTCATCATAT
ATGGCCAAAAAACGAACCTCAAGTCCGTAAAAGAGTCATGTTTGCACTTG
GTATAACTTAAACCTTTGATTGACATTAAATTTTTAGCTTTTCTAAAGTG
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GTCTCAGTTCCTTACTTCTTCAAAAAAGCTGTGGATGTCTTAAATAGCGA
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ATAGAGGTTCAAGAGGGATCAGTTTTGCATTAAATGCTATGGTTTTCAAT
ATATTTCCTACTATTTTTGAACTAGGACTTGTGTCTGGTGTTTTAGGGTA
CAACTTTGGAGCTAATTACGCCTTTACGGCATTGGGGGCAGTTGGAATGT
ATTCTGTTTTTACATTGGGGATTACATCTTGGAGAACTCAATTTCGGGTT
AATATGAATAAGGCTGAAAATGAAGCAGGAAATAAGGCAATCGATTCCTT
GATTAACTATGAAACTGTTAAATACTTTAACAATGAAGCCTACGAGTGCC
AGCAATATGATAAAAGTCTCCTGAAATATGAAACTGCCTCACTTAAAACA
ACTGAAAGTCTGAGTCTACTTAATTTTGGACAGAATGCAATTTTTAGTGT
AGCCTTGTCTGCCATTATGATGATGGCAGCTAAGGACATTTCAAATGGAG
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TCCCTGCCCCTCAATTTTCTGGGATCTGTATATCGGGAAATTCGTCAATC
ATTGATTGATATGCAAGTCATGTTCCAGCTTATGGCGACTCCCTCAAAAA
TAACCTCTTCAAAAGGTGCTACAGAAATTAACTTTATTAATAATATGGAA
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AGTTTTAACTGTTGACGCAATTGATTGTTTAAAGAATATGTATCATGATG
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ATTGGGTTAAATTTAATGTAAATATGACATTCTATGTCATTGAAATGATA
ATTGTTTAATGCTTAACCTTTTTATTAAACAAATGCATTAATTTTTGAAA
TGCGTAAGATATGAGAATGACAGTGCCGTAATCACGGGTTATTTTTTAGG
TGGAGTCATTATGGATGATGAGCGATGAATACAACTACTAACTGTATGAA
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CTTACATTTGGGGGTGGATATTCTGAGGAAGGTAAAGAAACATTAACACA
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ATGGGATGATAATAATGCAATAATTGAATATTTCATGGATAATCAATATA
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AAGTATTCTGTGGAACATTATAAACTTCAAATGCCCACAGTTATGCTACT
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CGTATTTTAAGACCAAGAAAACTTCCACTCACCATATTATATATTATTCA
AATGAAAGAAATATCTTATTTTATTTAATTGCGAAAAATTTAGTTACTTT
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ATATTCTAATGGATTCAGCGCGTAAAGACGCATTTTTTACGTATTTAACA
ATAATTAGAAATAAGATTGGTGGGGCGATGGAAATTAAGGAATCTGAAGT
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ATACGCTTTTGAACATTGGAACATCATTATCATTAGAATTCTCTGCCATA
GATCACTCATGTAGACCAAATGCAATCTATATGTTTACTGGTCGTCAGAT
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CTTATATCGGAAACATTGAGCCACGGAGCATTAGGCAAAAAATGCTATCG
CATCAGTATTTTTTTGATTGTGATTGCGAAGAATGTACTGACGATCCCTT
GAATCTTGAGAAGATTAAATCACATAGTCCATGCTGTCCTCAATGCAAAA
ATTTATTGGATGACGATAAATGCATTAACTGTAATAAGGTAAATAATGAT
ATCATATAATTTAAAATATGTATTTAAAAGTATTTAATTCTTTCATAGGA
AGTAAATTTGTCTCGATATTTTAAAATAAAAGAAATATTGAAAAATGAGA
AAGAGATGAATGCAAAAACTTGCTTGTATTTTGTAGAAGTGTTGAAGTAC
TTCCATCCCTTTGACTATGTATCGTACAAGTTTTGTGATGACCTAATAGC
TCGTAATGACTTGATCGACAACAATAAATTACAAATTTTATATGAAAGGA
ATATTTTGACGATGAGGAAGTACGGCTGTATCTATGATATACAAATGTCT
GAATATTTGATGAATCTTATAGGCATACTTCTATCTAAGCAGGAATTAAA
GTCTGTACCTAATTTACTTTTCGAAGCTAAGGCTATCATGGAGGTTATAT
ACCCACACGGCCACTCTATATTTGAGGAATTTGATCATTTAAATCTTTTC
TACCTACAAATGAAGAATACATAATATAATTATGCAAATGAATTAATAGA
GTTATTATTTTAATATGCATACGCAATGGGATTTCTTATTAAGAATTAAT
GCTTTATTGAGCACATTTTTAAACTTTGAATGATTATATATAGTAATTTT
CGTCTAGTAAGTTAAAGTACAAGCCACGTAATGCTCAGCCTTAAGAATAT
TGCTACTAATTCAATTATTAAAATGAAATAAAATCAAACTTTTATTAATT
ATCCAAGATATGGATGGMCAGGGATGTTGCTAGTTCTCATTATTTNAGGG
GGCATAGCTCCAAAAATTATCGACACCGTAATATAAATGACTTATATAAA
TAGGTTTATTCTTTAAATACTTATATATGATAAATTTTTTGGGACTAGCG
ACGCTACTGTGCATACATACTGACACAATCAAAATCAATGGTTAAATTCG
TTATAAGTTAAGTACCTAATAATTAATAAATATTCATCTAGCTATTATTA
ATAGAAAAGGTTTAGTGAGACATGGGAGGAGATAAATATTTTAATTAATA
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ATGTTATTGACTTACCATGGAAATCTGTTCAATGTTTGTAAATGTAGCCC
ATAGTCCATAATTTGGATATTATTATTAATCCAAAATTTGCAATTTCTAA
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AAAAAGATGTCTTCAGGATATCCTTGAATCGCTCTCTATTGATTATTTAA
TTTATTTTTAATTATTATCTGATAAAATAAAGGGAATTGACGAATCCAAG
TCTTCATGTTCGAAGGGTTCCTTGGAATCGCGACTCCAAAGCCTTAAAGA
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