EMLSAT00000003153, EMLSAT00000003153-699000 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003153
Unique NameEMLSAT00000003153-699000
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s175supercontigLSalAtl2s175:732203..749764 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003153 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003153EMLSAG00000003153-685919Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013828EMLSAE00000013828-722756Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013829EMLSAE00000013829-722757Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013830EMLSAE00000013830-722758Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013831EMLSAE00000013831-722759Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013832EMLSAE00000013832-722760Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779518auto779518Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003153EMLSAP00000003153Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003153

>EMLSAP00000003153 ID=EMLSAP00000003153|Name=EMLSAP00000003153|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=315bp
MIRRFYCCKIRSAVLAIGFTLLLIETASVLVTFWVMSNAESVSDSVVSWL
RVRRNKFELEELEIIHGKMYFVERYLDFLAFPATFHILLMVSNLLLLSGA
VFSNRILLIPWIIMYILKILIITGLLIFFLIKLPSYIFKVIIFLILCPFI
IIFGFIIFVIRSFYILLRDLKLKEAMAKVYKNSEAGSSSFKPPSYVRRPS
WAIRPPPSLWDADYLRQLDPRFNASTRSGRNPPNSRSCTHKKSSIFKESD
MESCSVETSSIATGGKDDLQSVMTLSDKYKLQEEVHVLPPIISTESSFDI
DDKFNGFADRWRNSI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s175:732203..749764-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003153-699000 ID=EMLSAT00000003153-699000|Name=EMLSAT00000003153|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17562bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s175:732203..749764- (Lepeophtheirus salmonis)
TCCATCATGATACGACGATTCTATTGTTGTAAGATTCGAAGTGCCGTTCT TGCAATTGGCTTCACACTTCTACTTATTGAAACTGCCTCAGTTTTAGTAA CATTTTGGGTAATGAGCAACGCAGAAAGTGTCTCTGATTCCGTCGTGAGC TGGCTCCGGGTTCGACGGAATAAGTTTGAATTGGAGGAATTGGAAATTAT TCATGGAAAAATGTACTTTGTTGAGGTAATGTTTCATTTTTAATAATTTG TACATCATTTTTTAGTAAATTTTTCCCTTATTTTTACAGAGATATTTGGA CTTTCTTGCATTTCCAGCAACTTTTCATATCCTTTTAATGGTTTCAAATC TCCTACTACTCTCAGGAGCAGTTTTTTCAAACCGAATCCTATTAATCCCA TGGATCATCATGTATATACTAAAAATTCTCATCATCACTGGGCTTCTCAT ATTCTTCCTTATTAAACTTCCTTCATATATCTTTAAAGTACGTCATTCCA AAATTATAATTAATTCGTAATTGCATTATATATGTATATTATGCATAGTT GACTGTCATTTATAATGATCAAGAGATAATATTTAATCTAGGAAAACGTA ATAATATAAAAAACCTTGGACTGACATAATTATTTATCTATGTGGGCGGA TGTAAATAGACGTTTATTATATTTTTTACTATGTTAAAATGTCTTTTATG TAAAAAAAAATTTACTGAAAGCTATTTTTTGTAGATTTGTGTTATTTATA AGGTTACAAATCTACCTAATTATTTACAAGGCATTGACMAAGATTATTTT TTCTTTTATAACTTATGTTATAGAAAATTTTATAAATTACACTTTTTTTA TAAAAACTTTCTTTTTTACATTTCTGGGAAAAAATTATTTATTATTTTGA CAATTTTTTTTCCCATATTATTAAAGCTTTTGATTATAAACCTGTCTTTT ATACCGAATATTACACATTTGATAACAAATATTTATTCAGAGGGGNAGTA TTCTTCCACACTCCCATTTAATTCTTAAAAATGGCTGAATCCGGCAGCKA AAACCCGGCAATATTATTTGTGTCCTWGAAAGMATATGTTGGTAACCTGC AATATATGAGTGATCTTCTCAATTACTCGTCCAAATTTTGATCATTCAAA TATATAAGTAAGTCATATTATTTAATATATATTATATGGCATTATCTCAG ACGTGATTTCCTTATCTCTAGTAATTCTAATACTAGAATTCATCCCTCAA TAAAAGCCTAAAAACAGGATTGGATGATCCTCATCCCACCTAAATATCCC ATTTTATAGTTGGGGGATACATAATAAAAATTAAAAATACAGTTTGATAT TAATAATAATTTTCAGTCAATACTGTGATAGATATAAGGACAAATTATTT TAATTTTATGTAAGTATAAAATTTAACTTCAGTTATGTATATTTTTTTTT GTATTTTCATAGGTTATAATTTTTCTCATCTTATGTCCATTTATTATTAT TTTTGGATTCATAATATTTGTAATCAGAAGTTTCTATATTTTACTACGAG ACTTAAAGCTCAAAGAAGCTATGGCCAAAGTGTACAAAAATTCGGAGGCT GTAAGACTATTTTAAATGCAATATCTATAACAAAGATAATTACTATTTTT TTACTTTCTAGGGCTCCTCAAGTTTTAAGCCACCAAGCTATGTGAGACGT CCTTCCTGGGCCATTCGCCCTCCACCTTCCCTTTGGGATGCAGACTATCT TCGTCAATTAGATCCACGATTTAATGCAAGCACACGATCTGGACGAAATC CACCTAATTCTAGATCCTGTACGCATAAAAAGTCATCCATCTTTAAAGAA TCGGATATGGAGTCATGCTCAGTTGAAACGTCTTCCATTGCTACTGGAGG 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TGATGATTCCAGAATACTTTTTTTATTTCAATAGGATTAAATAGGAAAAA TCACAAATCCATTCGTGATGAAGGGAATTTATTTCCAGTCCATTTGGTAA AAAATACGCAATTAATATATAACTTACTTTGGTTTCTCCATAGAATCTGT CTTTGCATTTTGATATTTTCAATTTTTCCTTTATGAAAAATATTCGAGTA ATAGTTCTCATTTCTATCTGAATTCAAATTAGCATCTGTGCAAATTAACT TTTTTGAGGAAACTACAAAGTATGGAGTACTATTATTTGTAACTAAATAT TATTCAGCTATGACAATGAATAATTGTAGTAAGAAGATAGTTTTATATCG AATGGATTTAAATTGGGAACAAAATTATTCCAGATATGCATTTGAGCAAT GATACTTCATAGAGAGGGATTTGAAATTTGGGAAACCTATGAAGGACTAA TGAATCAGAATAATTTTATATCTCAAATGAAAGKCCGACACAACCAAAAC GAAGACTCTAATATCTTTTGCAGGAGAAAAATTGGGAAAAAACAATAACA TTTTACGTAACAGAATATATATTCAGTAGTTTTCTTTTCAACTATTTTGC ATTGTAATTCACATAACTAATTTTTTTTTACAAGAACAACATTACTATTT CTTAGAATAAATTAATTCATCTTGGAAAAAATATATAAGTTTGTGTAATT CCAAGTCAAGTACCAGGTCATAGATAAAATGACTCGATTTAGGACTAAAG TATTAAAACTAAGAACTAATATATAGTCATATCTCTGTATATTATTCTTG TTTAATATGATGTATTATTTGTATTGAAGGGATCGTAGAACTCTTTTACT CTTTCAAGTTAAACGAATACTTTAATTTAAATAAAGAGAAATACCTTGTT CAAAGATATTGTGAGTTTATGTTACTACCCTCATAAAATTACTTACTCAT 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