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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s182 | supercontig | LSalAtl2s182:344829..368713 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003323 >EMLSAP00000003323 ID=EMLSAP00000003323|Name=EMLSAP00000003323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=453bp
MRHYFFFITVLVRCCESTISLDKIESALLHDGIDDNHGFSNEWIVQINGY PSDADTLAFNQGYENIGPVTYAAQLFHKKRVKRGFMQSSVKKRGINMDIL RIWDEERRSKLEDLPLQATFIFNDELWDHQWYMQDTRSRSSLPAIHLNVL PVYEMGITGNEVRVVVLDDGLEWRHSDLIDNYDPSISYDFNNGTLGDNDP TPHYPSNSYASPNSHGTRCSGEISMVANNDKCGVGVAYNSKIGGSASQRG NFPWYGEQCSSTLASTFSSGAYTDQKIATTDTNDTCTVSHTGTSAAAPLA AGVIALTLEANPNLTWRDVQHLIVYSSSTNGILKNKGWELNAAGYAFNSR FGFGVMDAATMTKNAMKWKNVSPGLSKTYLGQPGNRDLAPGFPVEILFNI GYERPQRVRSGDDQIKYLEHIQVVTTIKYAVRGSLEIVLRSPQGKDSTLK TFS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s182:344829..368713- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003323-699170 ID=EMLSAT00000003323-699170|Name=EMLSAT00000003323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23885bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s182:344829..368713- (Lepeophtheirus salmonis) TTGAAACTATGAGACATTACTTCTTTTTTATCACAGTTTTGGTTCGTTGC
TGTGAGTCCACTATTTCTTTAGACAAAATAGAAAGTGCATTATTGCATGA
TGGAATAGATGATAACCATGGATTTTCGAACGAATGGATTGTTCAAATTA
ACGGATATCCCTCTGATGCAGATACACTTGCTTTCAACCAGGGCTATGAA
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GCGTAAAACAAATCATCCAATCTTAGTTAGAAATCGAAGCTTGGACCTAT
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GTCAATTCTCAGATCAATCAGTTTAGTAGTTTCATAGATATGTACGCCTA
AAGGTAGGGAAATAAAATATATTTTCCTCACAAAATGGCGCCGAAATTTG
ATTAGACCCTCACTTCAACATAAATAGCTCATTCATTTTATATTCAATTA
TGTTCAAAATTCGTTCATAGATTTAATTAAGCATAATAAATCAAAATATG
TAAATTTTATGTCTATAATATGAATTCATGCAGATATAAACCTTCAAAAA
ATAGCTTGCAATAATTTAAAACACAAGTTTTTAAGGGCAATTTAATACAT
ATAGCAGAATTAGTSAATTCTGWGATATGCGGTTAACTTTTGTGCTCGTT
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TTTATTTCCTTCATCTCATACTCTTATAGCTACACATAGATAATCTAATG
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TTGTCAGGGTGAACATTTTCATTTTCTTTTTTTAACATACATACCTACAG
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TGCCAATGTGTAAAATATAATGAAAGGATGCAAAATAATATAATGAATAC
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TAGCTGGTCTGTTGATTTGTAATTGGTAGTTTATAGAATGAAGTTTCTTT
TCCGTAGGARTTGTCATTATCATTTAATTCCTGAGTAATGAACATCCTTT
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AATTCAAGAGAATAACTTTTTCTTAGCGCCTTGTCCATTGAGCTACGTCG
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TATCTTTTTATATCACTGGACATTGCATTACACCATAAGAAAACAAATTA
CCTTCTTTTTTTATTTTTCATTAAAAAACTTTACACTTCCATCCTTACTA
GTGATGAGTGTAGAGCGTGAGAAGAAGGTGGGAGCGATACTTATGATTAA
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CTATCATGAGGCTCTATTAAATTAATGCCAAGAAGCTATAAAAGATATCA
ATTTGTATRTTTTCCCCCTTTTTCAGTCTTTAATGCTTAAATTCAAATTA
GCTCTTTTAAGTTTCTTGTAAGCTCAACAATTATTTAATAATAGTTCCAC
AGAATTGATTAACTGTTTCTTTTTGAAGAAAAGGTTGCAAAATACAATAT
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TTTGTTTAAACAAATGACGTCATTACGTATATACAAGGATGACTCAATTT
TGCACATACTTATATCTTCATGTTGARTAAGACCTTGCCCCCGAATCAAC
AATATCAATGTTGCTTTTTTTAATGCATTCTAGATCACAAGGACTTTGGA
AAGCAAGCGTTAAAATCAGATTTATATAAAATAAAATTTCAGGGAATATT
TCTAGGGAARCCCAATAGTCTTTGGGATATTTCTAAGCGATTTAACCAAA
CCAGTAAGTTCTTGTTTTGGGAATTATGTTTTTCAATACAATAATTGATA
ATTATGTTTAGATTGAATTATTCGATTWTTATATTTTTTATRTATACAAW
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GCTCSATCACTTGTTTCTAATGTCCTCCCTCCAAGATTTATACATTCGTC
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GATTACATGATCAATTTTTTCTMCAAATTTAGTGGGGGACAATTTATATT
AATCAATGGTACCTTCAGCACTCYGTTGAGAGTGCTAATAATTAATATTT
GACTAACTAACTATCCATGAACTCATCCTTTTNATATTAATCAATGGTAC
CTTCAGCACTCTGTTGAGAGTGCTAATAATTAATATTTGACTAACTAACT
ATCCAACTTCCATGAACTCATCCTTTTGACTATTTTAAAGGTAAATTATA
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CATAGTAGCTAGTCTTCTGTATTATTCTTTTTGYAAACTTTTAATTATTA
TTTAGATAAAGTTATTATCTATTATCTACACTGAATTGATGATCTTATCA
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AAGCATAAATATAAAAATCCAAATTGTATCTGATAACTTTTTTGAGTTCA
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ATGAAAACAGCTGAAGGAATATATATTCCATCATTGTTTATTTAAAAAAG
TGAGCCGTAATACAGACTAAAGTAGCGATTCTCAACAGGCATTCCACAAA
TCATAGGGCTTGCAAATTTTTTTTAAAAACAATAATAAAATAAAAAATAA
GCTTTACTCGCTAACGGTTCTTCTATAATTTCGTTAGATTGTAGAATGAG
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AAAGTATTTGGGATTTGGTGTCTCTTTTTGTGGGACTCCGCATCTAATTT
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CAACTTCGGTATAGGATCAAAGTTCTATTGACTTTTTTTTAACCAATATA
AGGTCAATTCAGGATTAGAAATGAATCTAACAAAAACCGCCATCCTTCCC
CTTGGATCTTGGAAGCCAGATAGTTCTACAATAATCGAAACTAGTAGAGT
TCTACCAAAGGTAAACATCTTAGTCTTAGGCATCGAATGGACAACCAATG
GGCTATCAAGAGGTAATTGGGTACGATGAAATATGATGATCAACAATCAG
ATCCAAAAATGGCGCCATTTATCTCTACAAAAACGAATTGATAGTTCAGA
AAAATAGGACCAAAATGCCTTTTGTTAATAATTTTGGGAATCCATTTTTA
TTAGAGAAGACAGCTATCCATCATAAAATTTTAAGTTATCATGATACGGG
TAACCGGTATCCAACAGGAAACCAAATTGGAGGCATTTTTTCTCTAGCTG
ATGCCACAACCCCAATATCCTCACAGAGTCTGGATCTTTGGTCTTGATGA
CTTTCCTGATGCTGTTGTCAGCCTCACCAAAGCACACCACCAATCATTTT
GCTAGTTGTAGACGGGGTCTACGCTAAAGGTCTTTTCATCAGGGAAAACA
ATTACCCGGTTGCTGTTGCGCTTCAGATAATTCAAGAGTTGTTGACTTTG
GTGAAGAAGGAGTTCTTTTTGACATCGGGCAGGTGTGACCTCTCAATTCT
TCTAAGTGACCTTCCTCCAGCCTTTGGGACCACCTTGTCGACAGTAGATA
GATGCACTTTCTTCTTCTTGGCGTTCTGACATCTCTATCGTTGGGTTGAC
CTTAAAGGCATCAATGATGCCTTCAGGCTTCACTTTGGAGAGTCTTCCAC
TCTTGGGATTGTTCTTAAGGTTGTCCTCATCAGGGAAACGATTTCTGACT
CGATAGACTGTGGCCTTGCTGACGTTTCAGGCCTTTATGATGTCCAAGGA
GGTCCTCCTGGCACGGATTAATTTGCCTCCATCGCAACAAATACAGAATT
TTTGTTTACATCATGTACATCAATCAAAGGCTTAGAATCTAAGCAATGCA
AAAATAATCACAACTTTAAGATTTAATCAACAACACCTACTCAAAACTGT
ATTTTTAGAAGGTCTCATTACTTTTTCTATTGCTGGTGTGTCATATAGGT
AAATAAATGAGTGTTCTTTTGCAGAAAAACATTTCTTTATTTAATATATT
CATTAATGATCATTTTATAAACTCAGCACAAGTAGTATTTGGTTCGAATG
TAGTTTGAATCTTTACCGTTGTATGTACTTTAAATAATAAACAAAAACGA
TGGTAATTCAATTGAAAAAAGTCCCAATGGCTTCTCCGTTATCAATTAAT
TGTTATTCGACATGATGGATGAAAATGTAAATTGGATTAAATGAATATAT
ATAGTTGTAATATTTATATTATTTGATAAATAACACTTAAGCCAATTAAT
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TRCTGATGGAGCTTATAGTCCACTTGTTATGGTTCTCACAAATTAGTTTG
AAATCCATTGGTGGAATTGATTGACAGTCCTAGATATACAGCTCCAAAGA
TTCGAGTCCCTTCAGTGAACTTATTCCATAATAATCGCAATCGCGTTCGT
TTATTATTTAATTTATTTAAAGCACTACAACGGTAAAGATTCGAACCACA
TACTTCGGTGTTGTGCAAATATTCATTACTGAATACTATTTTTTTTTTTT
TGCAAATAGATCATTCATTTAGATCAAATGCCTTGGAGTTCCTATGYATT
TAATCAAGTCCTGATTGACATTTATATATCCCGAGGTCATCACTGACTCT
ATAATTATATGGATATGTTTGTCATTGGAGTAATGTAGTAGATGATTACA
CTGTATTGTAGTATAAAAAAAATCAAATATTCTATAATTAGTTTTGGGAA
TGTGTCTGTTCGGCAAAGTGGTCATTGAGGAAAGTGACTGTTTGAAAAAA
TGGTATTCGGAAAAGTGTTCTAGAACCGTTTGTAAGAGTTAAAATGATAA
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TGGAAGATCACAAGATATTTATAAATGGCGTCCTTTCACTAGCAACTCTA
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TGTTATAATAAATTATATTTTTTGTCATGTTAAATGATTTATGAGTCAAC
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AATAGTTTATTCTTATATTCCTATAATACATAAATAATATTTATTCAAAG
GTATTTAAATACTATGTACAATATACTTGTAAAACAATCAACTTCAATAA
AACAACGCTGATTATAATAAACTGAACCATTATTATCTAACTTTAGGTTA
CCTATGCAGCCCAACTCTTTCACAAAAAAAGAGTCAAACGGGGCTTTATG
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TTATTTTCAATGACGAACTTTGGGATCATCAATGGTATATGGTGAGGAAT
CTTTGAATTTTTTCCAACATTTATATTTATATGTAGGTAGGGAAGAGAGG
TAAGTGTCGGACAGTTTATAATGACTTKCCTACCATTTCCATTGTAGCAT
TATACCTTTGAATACTCCATGTATTCCTTCAATATCTAAGCATCTCTGTA
CTTAATTATGCCATAATATTTTGCTCCCTTTTTCCGGCGCATGGTACTTT
CGCCTTAAACTATTTTGCCTGAAAAACATTTTTTCTTTAGGATATTTCAC
CTTAAAATGATGTTTACACGTCGAGATTGTTTATTTTTGTTTAAAATTGA
TGTTTCCTTTGAACCTTTTTAATCAAAATATGTAATGCTTATTACTATTA
AACTCATAAGATGTTTTTTTTTCGGTTGGAATTATAATGGAGTTATGTCC
CAAAATTTTAATGTATACATACTAGGACTGGGACAATACGAACTGAGGTA
CACCTTTCACGGTACACATTTCAGTACGGTATAATAGTAAGATGTTAAAA
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AAAATTTCTTTTTCTGTAACAATAAATTATTCCTAAATATACTTAACTTC
GCTAAAAAAACAAAGGTTAAATAATAATATAATTCAGGAATTTATATTTT
TTTTGCAAAAAGAAGAGCTTGTCTAAATTCTTCKTAATTATACAAGACAT
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TCATCTATCTACCATACATCTGGCTTATCGTCGAATGGCATATATTTTAA
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CCTATTATAAAAAAAAAAAGCTAAGATTCTATAATATCAAAATATTTAAT
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ATAGAAATCTCACTATGTAATGAGTTCGTAGCAGAGAATAGTAGATAATC
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AGCTGAAGAGATAATCACTTCTCTGTAGTTAATTATCATTAGACATGATG
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ATTTATATTTTGAGCCGAAATATTCTTGAGGTAAAATGGCTTTAATGCAA
AATTTTATAAGGCAAGATAATTTAAGGYGAAAGTACGAGGCACACTTTTC
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TATGAGATTGMTTTTCACAGTGGCCTCTATGTGAGTTACATACCCTTAGA
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TATTAGTACTCTGTTTTAAACCAGATGAGTGGAATCGWCAGTCTATTGAA
TGCAACAAATCCCAAGCTCATCGCCAATGCTAATGTGCTTGGTAGTGATG
TACAGGGATCCTCTTGATGACAATATGCTCATTAATTGCTTTCTTGAAGT
TGTAAATAGTCTGCCTGCTGGTCTTTTTTGATTTTTTGATTGTATTAATT
TTTTTTTGGAGGGGTGTCAATGCACGCAGCTTCTCAGGTGAAAGGAGGAA
TGATCAATTACTCTTAATGATTTTTCTTATTCCTCTCTTGCATAAGTGTG
CAGATTTTAATTACGTAGCCGGTATAGGCCATACCACTGGACTCGAATAA
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CTCAGACTTTTAACTTATTTGTAAAGATGACATAATCAATGGACTAAATT
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GTGCGAGTTGTTGTTCTCGACGATGGTTTGGAATGGCGGCACAGTGATCT
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GGGTGACCAACTTTTCTTTTTATATGGGGCTATTTCATAGAGTTATAAAA
TGTTTCATGTATAACAAGTTGAAAATCGACTTTAATTGAAAGTAAAATTT
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GATAGAACATATATCAATATTTGATTCGTCAATGTTCTGAATTNAAAANA
TTMCCCCCCCCCCCCCTACACACAAAGGTCCAAGTATCCTCTTTTTAGGA
AMACCAAAAGCTGTGATGGGTTTATCTTAATGTATTATGTAAATAAGTTC
TGATTTTGAGCCAGCTGTATACTACAAATACATTGCATTTTTTATAATCT
GCTTCTACAAGTTAGAAAGTGTACAAAATTCACAATAATATCCGGCCAAT
TTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGATAGA
ACATATATCAATATTTGATTCGTCAATGTTCTGAATTCAAAACTATTACC
CCCCCCCCCCTACACACAAAGGYCCAAGWANCCTCTTTTTAGGAACACCA
AAAGCTGTGATGGGTTTATCTTAATGTATTATGTAAATAAGTTCTGATTT
TGAACCAGCTGTAACTTGTACAAGCAGGTTGTTACAAATGGCAACTAAAA
GCATTAGTATTGAGGTTCTGTCTGAAAATCCTTGACCGATCTGAGGCCGT
TATGATTTTTAGTGAATAAACTAATTCAGTCCTTTAAAACAGTGACCCCG
CGACCCCCACTAATTTGGTCCGTTCTCAAAAAATAATTCGGTATACATCG
ATCAAAAAGATAACATTGGTCTTGATCAGTCTCACGAAAAAAACCAAAAA
AAAACAACCCGATCTGAATCGGTCTCATGCAAAATTCAGTTTTAGACCGA
CTCTATAAATTGTTTTTGATGACGTCATTTGTGTTTTAAAATTTATTACA
AAGTTATATGTGTTGAGTACATTCTATATCTAAATCTCATAATTTGAGAC
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AATTAAAATAAGGCAGTATACTACAAATACATTGCATTTTTTATAATCTG
CTTCTACAAGTTAGAAAGTGTACAAAATTCACAATAATATCAGGCCAATT
TTTTTTTTTCTGAGAATATGTTAAAGAGATAAATAACTACTCCTTTTTTG
TGTTGAATTAGAATATAGATATGACGAGGTATCCCTGAGTTGTTTATCTA
TTTAGCACATTGCTATCTTTCTTGTATCTATCCAACTTTTCATCAGAAAG
GAAAAAAGGTCTTAAATCAGATGGTAGTTAGCCAATTCTTCCAAACCCTG
GAATTATTATTCAATAGTTGTTGAGAATTATTAACAACTTAACAAGAGTT
CATTCTAATTCAATTCGTCAATTTCATTTCAGAACACACATAAGGTACAA
GATGCATCAACAAGTCACAAAAATACTCATATATTGTAAATTTATGTATT
AGTGGAGTAAGGCCGTGTCAAATGTTGTAATTCTTGATTGAATATGATAT
TGTAAGCATTTATATCACTATAGGGCTTTAATTTCTAATTTTTCAACTTT
CTGAAGTGTATTGTAAATTATGTGTTTACACGTCAAAGTTTAAGCAAAGT
TTGTTTTTGGTTTAAATAATAAATTCCTATTTTTAGTTTTTTGTTTTGCT
TTTTTTGGGGATTACACTATTTTTTTTTTTTTTGGAAACATATGGTTTCT
TGAACAAAAATCTTTTATGCATATACKAATGTTATAAACATATTTTGTTG
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TATTATTTTATACAACCAATGGTTAGTTGGTAAATTATGGATCAATGTAC
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ATGATCCAACTCCACATTATCCCTCTAACTCATATGCTTCACCAAATTCC
CATGGAACCCGTTGCAGTGGGGAAATATCCATGGTAGCCAACAATGATAA
ATGTGGTGTTGGCGTCGCCTACAATTCAAAGATTGGAGGTATTCGAATGT
TGGATGGCACTGTGAATGATCGAATTGAGGGTCTAGCCTTGAAATATGCT
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CTGTCCACGTCTTATCTCGTCCAGTCCCGTGCCATTCCTGCTTTCTGCCA
TTGAAAAACATTCAAAACTTAAAAGCGCCCTCTACTACTCATCATTTTAA
ATAATATTATTGTAAAGTAGCTTAATTTACTTATTAAATTAGGATGGTAA
AATTTTTGTGTATCTTTCATATAAAAGAATAGCTTGGCATTATTTTTAAT
TTAGTTCAATATAAAAATTGGATGTGATGGTCAAGACTGATTGATGATGA
CGTCCCTGGCCGATTTTTAAGAATATGTCATTTAGCACATTCAATTTCTA
CGGGACGAATTTTGCATTCTATTCGGACAGGTCTTTAAGATTTAGAACAG
GACCAGGCGTCAAAATTTTAGCACTGATATATCCCTACATAGTCATTTTA
GGATTCGGTCGATACCAATTTGTTTCCCGGTTCGATCTTAAGTCATTTTT
ATATTACAATTTGAGACTGCGGTATCAGACCATGATCTCAAACTTAATTT
TTTTCAAATAATAGAACAATTTCTTCGGTCTCAATATATGTCTAGCCTTG
AAATATGCTTATTAAAAGTACATTAAGGCTTTTAGTTAATCATATCGTCA
TACATTTTAAATTAAGATTCGATTACTTCTATTTTTGTCCATTCAGTCTC
AAATTCGAGATTGATTTCTACCAAAATTTAATACTTTTCAAATAGTGGAG
CAATTTTTTCAGTCTCATTCCAGAAACTGATTCCGCCCCATCCCATTTAT
ACGAGTTGTACAGATACAAAACACTTAAAATTTCATATGACATCATTGTA
TTGGTGTTCACAATTTTGAAATAAAGATGGCTTCATAGACAATTTATCTA
AAAAATCAGTCTAAACTTATTTTAAAAAAAGATCATTCAAGACTAAATTT
TTTTGTTGGACAAATTTAGATCAAATTTTGTCAAACAATTGAATAAATTC
GGTCCAAAAAAAAATTATAAAGGTCTCAGATTGGTTTAGGATTTCCTGAT
AAAAATCCATATATGGAACTATAACATAAAACTCATTTTTTGAGCAAATT
GACATATATTTTTACTTTTATATGTAAAATAATTAATTCTCAATATTTAA
GGACTAAAATTTTCAGAACAAGAATCAAAAACTTTATTTAGTAGATATAA
GTTTTTATTAGCCATTTATTTCCTCTTTTATAATTGTTAATTTTAACAAT
GTTGTTTTATTCATTTTTGCAAACTCTTGGTCTAAAGACATAATTCAGTT
GTTTRCATATTTTTGAGTATATTATTTTCTTTAATTTAGGAAATCTAGGA
TGWAATTAACATTTTTGATTTAACTTACCCCCCCCCCCCCCACTATAAAT
TTGTCAAAATAAAMATTTTTTTCATTAATAAAATATATATATTCCTAAAA
ATATCACATATTATGTGATTTATGTGGTGACAATTGTACATTTCAGAGTG
GATATATACACCGCAAGTTGGGGGCCAACAGATGATGGAAAAACTGTTGA
AGGTCCAGGAATTTTGGCTCAAACTGCCTTAAAACAAGGTGTTGAAAAGG
TAAGCAATTAATGTAACCAATGAATACTAATACTCTATACGTAGAACATA
AATTCTTTTTTCACTTCCTTTTTTTTGACCAACTAAGTGCAATTTTTCGA
GAAGAATATTTCTGTAATGAAAGAGAGAATTGAATCKAAACAATTGCGTA
ATTAATGTCTTAGAAAATACAATTTTTTGGTCGGATTTATTTATTTAGTA
TTATCCAAATAGTAATAAATAAATATAGTTCCTTTAATTATTTAAGGCAT
TCGTTATTTACACAATTATTTAAATCCATCTTTCTTTTACAATCAGAAAA
AAAATAAAATACTCTAGTGAAAGGTGGGCGACATGAACAGAAATTCAAAT
AATATTGAATGGCGCTGTATAAAAAAACCCAAATATTAACGCTCACCCTG
ACAAATTGAAGAATGTTTGAGACGAGAGTAGCTCAGCTTTCATGACTTTT
CATAAAATGAGCTCCAAGGAGCTATGTGCTGAACTAAATAAATAATAGAT
AAACTGCGAGGTCAATCCTCAATTCTACTCCAAGTCCCTACAAATAATCT
GTGTTCCTTTTTGTCTTTTATGCACTAGTGATCATTTTATACTTAATTAT
CTCTCTTCAAGAATAAAAAAATAATGATGACAGCTTTGAAAAATAAGGTT
TAGGTAGCAATAACAAAAAGAGGGCAATCTGCAAATTTCTTATTTTTTTA
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TCACTTTACCAAATTGGAAATTTTAACTTTTATTTAAAAAAATAAAGATT
TATCAATCTAATAAAAATAAATTATACATATTATGACTCAACTTGAACGA
GCGCAGTTTTTCATATATTTATTCCACGTGTCCAGTTATACACTCTTCTT
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