EMLSAT00000003323, EMLSAT00000003323-699170 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003323
Unique NameEMLSAT00000003323-699170
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s182supercontigLSalAtl2s182:344829..368713 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003323 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003323EMLSAG00000003323-686089Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000014512EMLSAE00000014512-723440Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014513EMLSAE00000014513-723441Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014514EMLSAE00000014514-723442Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014515EMLSAE00000014515-723443Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014516EMLSAE00000014516-723444Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014517EMLSAE00000014517-723445Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014518EMLSAE00000014518-723446Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014519EMLSAE00000014519-723447Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776627auto776627Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003323EMLSAP00000003323Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003323

>EMLSAP00000003323 ID=EMLSAP00000003323|Name=EMLSAP00000003323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=453bp
MRHYFFFITVLVRCCESTISLDKIESALLHDGIDDNHGFSNEWIVQINGY
PSDADTLAFNQGYENIGPVTYAAQLFHKKRVKRGFMQSSVKKRGINMDIL
RIWDEERRSKLEDLPLQATFIFNDELWDHQWYMQDTRSRSSLPAIHLNVL
PVYEMGITGNEVRVVVLDDGLEWRHSDLIDNYDPSISYDFNNGTLGDNDP
TPHYPSNSYASPNSHGTRCSGEISMVANNDKCGVGVAYNSKIGGSASQRG
NFPWYGEQCSSTLASTFSSGAYTDQKIATTDTNDTCTVSHTGTSAAAPLA
AGVIALTLEANPNLTWRDVQHLIVYSSSTNGILKNKGWELNAAGYAFNSR
FGFGVMDAATMTKNAMKWKNVSPGLSKTYLGQPGNRDLAPGFPVEILFNI
GYERPQRVRSGDDQIKYLEHIQVVTTIKYAVRGSLEIVLRSPQGKDSTLK
TFS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s182:344829..368713-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003323-699170 ID=EMLSAT00000003323-699170|Name=EMLSAT00000003323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23885bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s182:344829..368713- (Lepeophtheirus salmonis)
TTGAAACTATGAGACATTACTTCTTTTTTATCACAGTTTTGGTTCGTTGC TGTGAGTCCACTATTTCTTTAGACAAAATAGAAAGTGCATTATTGCATGA TGGAATAGATGATAACCATGGATTTTCGAACGAATGGATTGTTCAAATTA ACGGATATCCCTCTGATGCAGATACACTTGCTTTCAACCAGGGCTATGAA AACATTGGACCTGTGAGTATTACGAATATAACAYAAAAAAAATCTTATTT ATTSAATTTTTGATGTTTTAGATTGAAGGATTCGATGGTTATTACTTAAT GCGTAAAACAAATCATCCAATCTTAGTTAGAAATCGAAGCTTGGACCTAT CACGCCGATTAGAAGCCCATGTGCAAGTAAGTTGAAAATTCTACATATTA ATATTCATGGGACAAATGAAAGCAAATTTTACCTTATCAAATTAAAATTT GATGAAATTATATAGATTTAGATATTTACCTGCACACTCAAAGTTCCACA TAAATGGATTTATTTATGTTTCTGCAATTTTTTCTGAAACTGTAAAGTAC GTCAATTCTCAGATCAATCAGTTTAGTAGTTTCATAGATATGTACGCCTA AAGGTAGGGAAATAAAATATATTTTCCTCACAAAATGGCGCCGAAATTTG ATTAGACCCTCACTTCAACATAAATAGCTCATTCATTTTATATTCAATTA TGTTCAAAATTCGTTCATAGATTTAATTAAGCATAATAAATCAAAATATG TAAATTTTATGTCTATAATATGAATTCATGCAGATATAAACCTTCAAAAA ATAGCTTGCAATAATTTAAAACACAAGTTTTTAAGGGCAATTTAATACAT ATAGCAGAATTAGTSAATTCTGWGATATGCGGTTAACTTTTGTGCTCGTT GTGGCATGGAATGACTTCGTTATAGYATAATAAAAAAAGTTTTACTTCCT GCAGAAACCTATCATCTAAACACGCAGCTGTAAATCTATAAAAAATCTTA TTATTCCAAAAAGTAAGTTTCGAGATCCCTAGATCCATGATTTCTCAAAA TTTTGTGTTTAGACATAATAATCTTAATGTGAACAAAATATACAATTAAA TTTGTAAATAAAAACTATATCCCGTTGCGTGTAACAAAGTAATTGAAATA TCATTTGGCTTATTCTAGAAGAATGTAATTATTTACTTGTTCTTATTCGC TGTTCCTGAAATAAGAAAACAACAATATCTTTGATAGATATGGTAGGGAA CAATCTAAAGAATCCCAGTCATGTTTATGAGTATAGCTGTAAGAAATATG GGATTGGACGAGTGCTAGACTTTTTGTTGTTGCAACTTCAAGAGTGTTTC ATATTTTCCAAAGGTGTTATCATTTTTATTCTTTAAAAGAGAACAAAAAA GTTATAAAGTAATCGCTAGTGCATAAAAGACGGAGAGTAATCACTTAGGA TTTGTTACCGAGTTACAAATGTAAGTAAGTCCTTGTTGGACTGGGAGAGT AAAAATTGAGGATCCCAATAGGGATAATTCCTGCCTGAGTGGCCTTTATA TTTATTTCCTTCATCTCATACTCTTATAGCTACACATAGATAATCTAATG AAATATTATGACAGCTAAGCTGCTCTTTTACCAATTAAACATTATTCAAA TTGTCAGGGTGAACATTTTCATTTTCTTTTTTTAACATACATACCTACAG ATCATAATTTTCCCAGCTATAGTTATAAGTAGTGTCAGGAAATTATGTGC TGCCAATGTGTAAAATATAATGAAAGGATGCAAAATAATATAATGAATAC AAATTTTATGTTACATAGATATGACTAATGATATAAATCCGGTATGTTTT TAGCTGGTCTGTTGATTTGTAATTGGTAGTTTATAGAATGAAGTTTCTTT TCCGTAGGARTTGTCATTATCATTTAATTCCTGAGTAATGAACATCCTTT TCTAAATAGATTCAATTATATTCAAAACCTATTTGAACGTTCGTGTGTAC TCATAAAAGACGGAGTGTAAGCCTGAGGATTTGTAGCAGAGTTATAATTG TAAGATCTTGTTGGACTCAGAGTATAATTGGGCTTCGACATAGGAGTAAT TATAGCAAATGWTCTATTTTATATCCTTCTCTCCTTCCTCTCTTGTCACA GCTGATTGTAGCTGAACTAATGAAACRTCATGGCCATTATTCTTTCTCTC CTTCAAAAAATTATGCAAATTGTTAGGTTTGCCATGTTGATTTTCGGTAT CTTTTTTATACTGTAATTTCTTCAATGGATATGACGTTCTTTTGCCTCTT TATTTTTATACCTACCGGTAGTGCAAATGATTTAAACCTCTTGAGTGACA GAATAATACAGATTGCCACCTGAGATTTTATTATTACTTACATGCACTGG GAGAATGTTTTTACTTACGTCTCTATATACAATACATTTGTAAAATATTA TAGTGTTCATACATAAATACAATATTTCCTACAATATAATTTACTGTTCA ACAATATATATTATCTTATTGTTAATTAAAAAAGTTTTGACTAATTGAGT ATATTGTATATACAATGGTAGTAGTATGTAGTTGTGGTTGACATCCATTT GGCTTTCTTAAAAAAAAGCAATGAGACGCCATTTTTTTAATGGTCTTTTA ATTGGTCAGATGGACTTAAACTGATTAATTATAAATAAACATTATAGTAT TTCATTTACTCCATCTGACCTAGAATCTTCTTTGAAGTCCATTTACATAA AGTATACTTCCTTCTCTAGAAACAACCTGGGTGCAAACCAACGCAAACTG AATTCAAGAGAATAACTTTTTCTTAGCGCCTTGTCCATTGAGCTACGTCG 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ACGACATAAACCTTTATTTATTGATGGATCTTTTAATTCATAGTTGGAAA ACATGACGCGACAAACACGCTACAAAATGTAGTATGAGTTTTAATTGCCA TTCATTTAAGGTGTACTCTATTTAGTTGTTSTGGAATATTCATGTCCAAA TTTCTCACACCCTTCACCTTCCTCCTCCCTTTCCCCTATGTTACGCAGAA TCAAATATATATTTAATTTGAAGTCTGTAACTTTAGACCTCAATATGAAT TTCCTTCACGGTTTTCAAATGATATCATATTCACGAATAAATCAAATAGC TATATTATTTAATACTTCGCTCATCAATGATAGGTTTCAAGTATATTTTC AGAATCATGCAACTTCGTTTCTATTCGGAGAAAAAAATGTTACTTCAATA TTTGATCAGAATATAACTTTATCAATTGAAAACTAACCTAATTTGTTTGT ATTTAGCCAAAATACACAGTAATAGATGACTGACTAACTAACAACGATAA CTTTCAATAGTGAAGGAAATGGTTTATRTCAACTTAAATTAAAAAAATTA CAAAAATTACAAAATCATCTAAATACAAAGTTTAATATAAACTTTTTTTT ATTTAAAAACCAAATAAATTAATTTAAGTTGAGTAAAAATATTAAGGCTT TATGAGATTGMTTTTCACAGTGGCCTCTATGTGAGTTACATACCCTTAGA TTGTAGATTAAACATTTAAAAAATATATAAAATGTAATTTGGCAATTCAG CTCGTAATGAGTGCGTAAGTGAAAACTATAGACATTTTGAAAATCATTTT TATTAGTACTCTGTTTTAAACCAGATGAGTGGAATCGWCAGTCTATTGAA TGCAACAAATCCCAAGCTCATCGCCAATGCTAATGTGCTTGGTAGTGATG TACAGGGATCCTCTTGATGACAATATGCTCATTAATTGCTTTCTTGAAGT 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