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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s188 | supercontig | LSalAtl2s188:1709..12916 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003422 >EMLSAP00000003422 ID=EMLSAP00000003422|Name=EMLSAP00000003422|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=408bp
MVVPRELNVTTKDLLHLFASSPISPTVGDNISEEEAMCNLTDFYKGYRNV
HGWLSLCVCIFGTIANILNIIVLTRKEMNGSPINLILTGIAVADMLVMIE
YIPFTLHRNLLTGRSKEIEYSWGFSLFVWSHSNFSLVIHAVSIWLTLSLA
VWRFIMIRFHSLSPIYCTLGRCKIMLFLAYVIPVFLCIPNYIATTINKKT
NQGKVIYVLDWSDIATAHNKLLYRINIWLYTFILKLIPCIILTIITGWLI
KALYKVEERSARLRSRHYDSNTKSKLRNGNGQTSVIVNSRKKSADRTTRL
LVVILVLFLLTEFPQGILGMLSAIYGDKFFKDCYLPLGDVMDAMALINSA
INFIFYCFMSKQFRKTFVETFGCRSLNMSSNQVQMKNGQNNGLAARKRRS
SPIPSLSI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s188:1709..12916+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003422-699269 ID=EMLSAT00000003422-699269|Name=EMLSAT00000003422|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11208bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s188:1709..12916+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGTGATGGTTGTTCCACGTGTATGTGAAATTGCTGTAATACTATAATAAA
TCGAAATACTCTTCTTTTCAAGTGCAATTGACATCACTGTGAAACATATA
TTCAATCTATCTATAAAAAATCCCCAATTATGTATATTTTCTTTATAAAT
TGATCTGAAGAAGTAAAAAAGGAACAATAAAAGTTCATTGGTTTATTACA
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ACATCAGAGTAATGATATTTTTCAGATATATATTTTACAACAATATAACG
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TATCAGAGGAGGAAGCAATGTGTAATCTGACAGATTTTTACAAGGGATAT
CGCAATGTTCATGGTTGGCTAAGTCTTTGTGTTTGTATATTTGGTACCAT
TGCAAACATTTTAAATATTATTGTATTGACAAGGAAGGAAATGAACGGAT
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TCTATATTATTTTAAAAAATTTGGCTTATTTTGTCTCTTGCATATGTGTA
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AAGCATTCAAAATGATCTTCACTTATTTAAACAACTATTAAAGGTGTTAA
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GAACACTTTAAACTTCCAAAAGATATAATTTATTAATAAACAAAATAATT
CCAACAAAATTTTTACAATAATTATTTATATGTCTGAGCTCTCCTAATCA
TTAATATAACCACCCATAGCGGCAAAAATGGCTTCCAGGAAGGGCGGAAG
GCATGGAACTCACTGCAGATGTAGTCATCTGTCAATGCGTACCAGTGCCC
GCTGACAATAATTTTGAGGGTCTTGGTGTTTGGATGCAGAAACTGAACTC
AAAGGGTCAAAAAGAGTTCTAAAATTGGCTCTCCATCCTCACAAAGTACT
TTCCACCCACTTTTTTGTTAGCAGTCTGGTGTGAAACACCAAGATATATT
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CGTTGATGACTTTCTGACGGCAATGAAAGGGGCTTAGATGCACCCAGCTA
CTTGGAGTGCACGCTTGGGAATTCGCAATCACCTTCAAGTGTCATGTTCT
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TGCTTTAATATATTAAAATATTAATTGACTGCAAGCGCTCAACTTTCATT
AATTATTTGAATTAGTAAGTGTTCAGATTTCAATGGACCACTCGGTTTAT
ACATTATACAGGTTGTTAAGATCAAATCGGCCACATTTTTCAGTATCTTT
AAACTGTCACTGAGGTGACATTTTTTGGTTGATTGACTTGAAAGTTAGCT
TGAATTGTACATATGAATATTGAAATATTAACTTTTGCCAAGTCATTTCA
TTAATCTTCATTCGTTAATAAAAACAAACAAGTTGCTGAACTAGTTTATT
ACTAACTTAACCTCTTTAGCCTAACAAAATATGTAACATAATATGAAAGG
TATATCATTCTCATTTTCAAATTGGTATTGAAAAAAATATTTACAAATAA
GGAATTGTGGCAATTGGAGAATTTTTCGAAAATATTAATTTGTTTTTCGC
AAAAAATGGCTTTATATATGAAAAAATAACATTGACAGAATGTTTATCTT
ACCTTCATTGTACTGGGCAATCTTGATACTTAGATAATAAAATACAAAAA
AGTGTTATTCCAAAATGATTATATTATAGTTTAATGTATTTTTTTGTCAT
TCAATGGCCTTTTTTATCTATACTTTTGTCCGAAAATCACGCAAAATCAT
ATGAAATCGCCATAGCTCATGGACAGCACGCTCGGGAGTTATTCTCTTGA
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ACCTCATGTATATGGATTTCACCGAAAGATTCCTAGGTTAAATAGAATAC
TTGTAATACTATAATGCTTGTTTGTACTTAATTAGTGCAACTCCATCTAA
CCAATTAAAAAACATTTAAAAAAATCATCAAAAAAGGCATTTTGGAAAAA
CTATAAGGCCGATGAGGCAGGGTATAGGACATACTTAGATCTTTAAAAAA
ATGATGTTTGAGCTTCTCACACTTTAAAGCATGGGAAAAATGCAGGAATA
TATCAAAACTCAAAAAAGTATATTTTTCAATAGGTAACTCTAGATATTAC
CTATGTAAAAAATTAATTGATCGGTTCTCTTAGTTTTAACTTTTGATACA
TATTCTTTAAAGTGTTAGCTCAACCCAACTCTGAGCACTTTTGTTTGCAT
ATAATAAAAAGGGCTGTAATCTTCTCACGTAACTAATCTAAATATTTTGG
AAATTATGTCATTAACAACTTAAGCCTAAACTTTTTTTTTTTTTTGTTTA
TGTATACACACTATATATATAAAATAAACTTTTCTTTCAATACTTTTTAA
AGCTAACTATACCTCTTAACTTATATAAAACACATACATACATTAATACA
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ATTGCAATTAATCACATAAAGTCATTAATCATTATTTATTAACAAATTAA
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ATTGAGTGAACATAAATATGTCTGATAAAGAAAATAAAAAATCAATGGAG
TGGCCTAGCTCAGTGTATTACGTGCTCAGGCGAGATTAACATTAGTAATG
AGAAGATTTCCAACAAATCCCTGTGCCGATTCCAATGCAATTCTAGTAAA
AGTTTCCTGTGCAGATCCTGATTCTTTATTTTTTTAAATAATAGGATTTT
AAAAAATAATCCAAAAACCAAGACCCCTCACAAAATAAAAAAATATATAT
ATTCATATAATCATGCTAACACCCTGTTAATAACTATATGGGGTAAGCCG
GTGCTACATACTCGTTATAACAAATTGGAGTTAATATGTATATTTATTTT
GCTCATGCCTTATTCTTTAATAGTAAATTAGTGAAGTTGCGAGAGTGGAA
AATAAAAAAGCCTGTTCAGATTACCAATTTTAAAAAGTATTTAAAATTCC
AATACGAAGTGGTCCATTAAAATCTGACCACTTTGAGNCTTTAAAACTTC
AATTAGATATAATTTATTAATAAACCATAGAATATCAACAAAAATTAATA
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AGCAACGGCAGAAGACCTGATACCCACTGTGGATGMATTACTCTATCATG
GTGTCACGTTGCTGGCAGACAGTGGCTTTGATAGTCTTGGTGTTTGAATG
GAGTGCTATGCAGGCCTTACCCTCGACACAGACCTAAAAGATGTAGTTAA
GAGGGCTGGCATCATGACTGTAGGTGCCCAAAAGAGTAAAAAAAGAGTTC
AAACGAACTCAAAATACTCATTCAAAAGAGTATTGCAATAAGGAATATAG
TTTTTTATCATTTCTATCATCAAGAGTTGCCTGGTCACTCTCACAAGTAT
CTTTTTACCCACTTTTTGATAGCACTCTGGAGAGTTTGGTTTGAAACCCC
GATATTTCTTGAATGAGCCCTCATGTACTTGACGGAATTGGCCTGGGCAG
TTTTCTTTAATGGCTCAATTTGTCCTATTTGACAGAACATTTCAGACTTG
CTGACGGCGTAGACAGTGGCCCTGAAGACGCCCGCCCAAAGGTTTGGATT
GCGGAAATTTGTCGATCACATTCAAATGTTATTTTCTCGCCTTGTACATA
AGCTAGAGAACTCAGATTTTTTTATTTTTGTTTACTAATTGCCTATACTT
TAAGATATTGAAATATAAATTAATTTCAATCACTCAACCTTCATTAGTTA
TTAAAATTAATAAGTGTTCAGATTTCAATTGACTACCCTATATATTGAAT
ATAATTCTGATATATAGATATCGATGTCCCTGCTAGACACTGAGGGTATT
TGTGTTTATTACCTTTATCTCAGAAATGCATGTAGATAATCTATGAAGAA
AATTTGATATCCTTACGTCATAGTTGACAATCTTTATTGAATTAGCAATT
GTATAAATATATATTTATTTAAACAAAGGATGTTTTTCTTTTTTTTTACA
TTATTTAAACTCCTAAATAACAATAACCAGACATGTATAAAATATGTCCT
AGAAAGTGAGAGCGACTTCTTATAATTGGTAATATGAACAAGTTTTTTAT
TTTAAATATCTGTTTACATTATAATATAATTCTTGTGAAGAGAAGATCTA
AGTATAAATATTAACTAGACCGTGTGTTTATCAAAGATGGAGAGTCACAA
TAAGGGCCTGCTGGTGTATTTTGAGTTTAAGTCCTTCTTACACTCGAGTA
GAACATATAAACTTCCTTCCTCTCACGGCTCCTTGCAGCTAATCTAATTA
AATGTCATGTTGGTCCTTATTTATTCGGTGCAGTCCAGTTCAGTCTTAGA
ACTTGTCGTATAGGTCCTTAGGATTTTCGTTCCTTGGTATCGGTCCTTTG
GACTAGTCCTTATCTGTTGGCCATGGAATTTTCTATTAAAATGTCGATGC
CAAATAAGAAATATCATATACAAGGCGCGGCAAAAAATTATTTACGCTCT
CAATCTAGAACTTTATAAAGCTGTATTTCAGCAACTAGTTCTAATAGGGA
ATATGAATAAAATGAAAATAACTAATATGATGTCTTGGGTACCCTAACGA
TCAATGTAGCCCCCCTTGGTGCAATGATGAGGTGGATGTAGTCCTCAGAC
ATGGCATCCCAGTACTGGTTGACAGTTTCCTTGAGGTTGTTGATATTTGG
ATGACGGACGGTACAGACTTCGTACTCCACATGCACAAAAAAAGTAAGTT
TGCATCTTGTGAGTAAGGGCCCATATTTTCTTTGGCCAGAAAAGCAACTT
GTTCTTCAACTACATGTGGGCCTTTTTGGACGTGTGTGTGCAGGCGCACC
ATCTTGCTGGAACACCAGATTCCTTTCTGAGTAATTGGTCGGTAACAACT
TTTCCTCAGTTGGTTTCTTGCCACCGTACAAAAATGGCCGAAACGAAATT
CATTGGTCACGTTAAGATGGCATTTTCTTGGATTTTAACTCACTTAGGAA
GATCTAGGTTTTTTTCATTTTTTGTTTCTTTTTAGTATTTGACTGCATTC
ACAAAACCTTGATATGTCTAAGAAAACATAGTTTTAAAGATTTTTTGCTA
CACCCGATATGTATTAAAAGCATTGCACATATCCAGCAAAAATTATAAAT
ATTTTCATTATTATTTTCAATAAAATATGAACAGTATAAATTTTTACTTA
GTTAAATAATTTACTCTTTTATATAATTAAATAATTAAAATAAGAAAAAG
TACCCATAATCACGTCATAATGAATCGATTTTACCTTTTTTAAGGACGGA
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TAATGACACCTAATCTGCTCTCCTCCCAAAACAAAAATTTAATCGTCAGG
ATAACATATTTATTTTGATACTTTTTTTATTTTTACATACCGGCCGACTT
GTTTTATGGATCACTGACTAAAATTAATAATTTTAATTGAGAGGAGTTTA
AAAATAAACAATTGAAAAACAAAGCAAGCAATTTTTTTTTTTCATGATTT
CTTTCCTACAAAATAAAATGTATACATATTTAATGATTACTTATTGTAAT
TAACAGGAATAGCTGTTGCGGATATGCTTGTTATGATCGAGTATATTCCT
TTTACTCTTCACCGAAATCTTCTCACTGGTCGATCAAAAGAAATAGAATA
TTCATGGGGATTTAGTCTCTTTGTTTGGTCCCATTCCAACTTTAGTCTCG
TCATACATGCTGTTTCAATCTGGTTAACTCTCTCTCTCGCTGTCTGGAGA
TTCATCATGATTCGATTTCATAGTCTTAGTCCAATTTATTGTACGCTTGG
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TAATGTATTTTACAATATGTATTACATATATCTACATGATATTCTCTATA
AGGAATGAATGAAGGACAAGTCTCTAATACTATGCATGATTTTTTAAGGA
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TAAAGATACTATTTCCCTCAGGAATATTTGATCAAATATCATCAATAATG
ATAGTTTTACATGTGTTTTATCACACACCAGTATTTATATCTACAAGTAG
AGAATCTTTAACAATTTTAAGATTATTGTACCTATAAGCAAAGATGTGGA
AATTTGGAATTCGGCATTATCATCGATGGAAAATATACTGTAGATTTATA
TGCTTTCAATCACGTTGAAATAAGAATGGCTCTTCTGCACTTGGTTGGAA
TAAATTTCAATATATTCATATTAGCAAAGAGCCTTGGTCAGGCAATTATT
ATTATTTTTTTTAATTCAGTGTTAAGTGTTTTTTTCTATACAGATTTTTT
GTGCTTCAAATTATTAAAATATTTTGGTTCCTTCCTTCTTCTTCTGTATA
TTAACTTGTAAGAAGAAGATTAAATTTAAACTTTTTATCACTATTTAAGA
TCATTTTTGTTGGATTTATTCGTAATCTTGACCTTTGAATCACTTACGTT
CCCAATAAGTTCATAAGCTAAAAATTTTAAACATTATGGAATTACAATAT
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TAAACAGACCAAAAACTTTTAATCAATTCAACTTCAGGGGATACAAGTTT
CCCATAAATTCAATATTGCTAGATTTTATACGTAATTAACTTTCCTTTCC
TTTGTTTGATAGCTTTCATAATGATGAATCAAAAAGTTAATTTGGTAAAC
TTCTAAATATCATCATTTTTCAATAGCTGAAATAACCACCTGTATGTTTT
GTATGTATATTGAGGAATCTATACTCAAAATATTATTCAGTTCTTATGTA
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CTAATACAAAGGCGTAGTCATAAACAGTTTTAATGTACTTTTTTTATATT
TAAAGTTATTCCTGTGTTTCTCTGCATTCCAAATTACATTGCAACAACAA
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CTACACATTTATCCTTAAGCTCATTCCTTGTATCATACTAACAATTATTA
CTGGATGGCTTATTAAAGCCTTGTATAAGGTTGAAGAACGCTCAGCCCGA
CTTAGAAGCCGTCACTATGATAGCAATACCAAAAGCAAATTAAGAAATGG
CAATGGACAGACCTCGGTCATAGTTAATTCTAGAAAAAAAAGTGCAGATA
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ATATACCTAATACATATTTAGGGTATACTTGGAATGCTCTCTGCCATTTA
TGGGGATAAATTCTTCAAGGATTGTTACCTTCCTCTTGGAGATGTTATGG
ATGCAATGGCACTCATCAACTCGGCTATTAACTTCATTTTCTATTGTTTC
ATGTCCAAACAATTTAGGAAAACTTTTGTTGAGACTTTTGGATGTAGATC
GTTAAATATGTCTTCAAATCAGGTTCAAATGAAAAACGGTCAAAATAATG
GTTTAGCAGCTCGCAAACGAAGGTCTTCTCCCATTCCATCACGTAGAAGA
TCCGTCCTTCGAATGAGAAAATGCCAGTTACCAGAGGAAATCCCAATRAT
AATAAACAAAAAACTAGACAAACCGATCAAAAACGAGCTACAAGTTGAAG
AATCAAAACCAGAGGGTGGAAATTGATGGTTCCAGTATGTGTTGTATGCT
GTTATTACAAATTATAAAATTTATATTTTAATTTTCTATATATTTTTTAG
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