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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1 | supercontig | LSalAtl2s1:3380543..3389240 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003717 >EMLSAP00000003717 ID=EMLSAP00000003717|Name=EMLSAP00000003717|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=634bp
MRWLPLVLVHWIVGLCFLTRMGXASXDLLAMPIATFPSFPLNFTSPTYFG
SIPENSVGKVLVSPSYVFGKDSARLLWGIPLGGEGKRPFHNWHITYHIVT
AAGEAGEAAEXFKAEXALIGDFLFLNVRLRLGNLRVLNREKRDEYILEIV
ALVKDEKNRSLTPDPNLRTTMFIQVSDTNDLDPIFPSSNYTFRIDKDMPL
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IGNEKKSVYSMAVVXVDRGIKTISKTYASDIANINIIVEDVNYFDPDISV
IFFQNIVQESFSNLFAIVEVDDKDEGRHGEVLSLEILNQNDDSNFPTDNG
IPQRYSYQFLNVKFDGSINDQPLFNRNVFHVYVNESIPINTQLIRLQRNT
VFKDNFLVSYSIVGGNKHKHFKINNRTGVLYSAEKLDSEVRSSYTLAVTA
LYSPITGKRKQTSVKIRIFVIDVNDNDPAFDMNVKEVFFHENQPPGSTVI
KIKAKDKDSGENGYISFTFANLNAIPFEIDHFTGVIRSTKLIDYESDKRI
YKLRIRASDWGYPFSRQEEMELLVRIQDVNDNRPQFDKTKCIGKISRNLP
IGSEIFNMTAIDLDEGNIVSYRXGIFNLTFCSRI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1:3380543..3389240+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003717-699564 ID=EMLSAT00000003717-699564|Name=EMLSAT00000003717|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8698bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1:3380543..3389240+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCGGAAAGAGCTATGATTCATCAATAAATATTCTTTTCTTTCTATCGAT
AGAGCTTCTTTTATTTCTTCAAGCCTCAACTAACTCCACTACTATGATTC
ATTAACGTGTAATTAGGATATACCCTTCCTATCCATCATATGATAAATCA
TTGTTACTCGGTGTGTGAAGTTAAAAATGGTCTACTTGGTAAAAAGTAAA
AGAGGATATAAAATAATATGATAAAATAAAAATATATAATAATAATTTTA
ATTTTTAGTATTCTGAAATACAAATAATAACAACAATTTTTTTTTGTATG
TAACGTGATTATTATTTTCTAATTGAATAGGTCTGTAAAATTATAAAATG
TTATATTTCTTGAATAATAGTAAACGAATAATTTTTACAGAAATCCTTAA
ATGGAGGAAACAATTATTATTTAGTAGAGACTTAATCGAACATACCTTTA
GTTCATCCTCCATCAATATCAATCTAAGGTCAAGAACTAATTCATGAATT
GATATAAGTATATATTATATTTATTCATGTGAGACTTGAAAGATCACGAT
AAAAACAATATGACCTCTTCCATTTCTTCGTGAGTCAGTCCTTGGTCACT
AAAAAGCATCCTCCGAGGGTTGAACTTCTTTCCCACAATGATCTGAAATA
TTAAACAATCATGAAAGCCAGTAGAATCTTGTTTAGGAGTCCTCAACAAA
TAAAGAGGCAAGGAGACAAATGTACGGATTCCTCATGGCAAACGAACGTT
TTTCATGAGTACATGAGATAGATTAACAAATAAAAAGTCGAATAATTAAT
TAGACTATTATTTATAATCTTTTATCAAATCAAGCAGTTTTCTTTGCTAC
GTAGATATACTAAAGATAATTTTTTATGTCAACATATGTATTTTCTGAAA
AGACGTGCACTCTCCATGTATATAGTGCTCCCTGGATCAGACTAAGGCCA
AGTGAGATGAGTCCAAGAAAGAGATGCACCTTCGTGAGCTATTTAATCTC
GTTGATAGTAAAAGTAGATACGGTAGAGAAATAACAGGCGACCCAATATC
TTCGGACAAGAGCTATGAATAATGATTCATCAATAAATATTACTTTCTTT
CTATCGATGGGAGTTTTTTCCATTTCTTCAATCCTCAACTAAGGCCACAA
ATATGATTCATTAACGTGCCAGAGGTCAATGAGTCCTTTCGAAACAGACT
CAGCATCCCAGATCCGTGATTCCTTACTCCTTCTCCTTATAATATAAAGT
TAAACAGTACAAGGTTACAAATTATTATTACTTCTTTATCATTATTCCTT
TTTTCTTCTTCTCTAGCAATATGGTTAAGTTCGAACAGATAATAGAAAAA
CATAAAAAGACGTCCAAGATGTCATGTGACAAAATCTTATCGAGGAAAAA
TTACCAAGAGGGAAACATGTAGGAGGCGAACATGTTAGCGGAAGAAATAC
CGGCCACCACTCATTTCAGKGTTCCATGACATAGTCCTGTTATTTTCTAG
CCCGGTCCACCCTTACTTGGTCTATTATTTGATTCTCTTAACTTCTTTCT
TTTTGCCCTTATAATAGAAATGAGTTCATCTCTCACTTCTTTTTTAACTG
ATTCCAATCTCTGTAATAATATTTATAATTTGAACACTGATGCTTTTGGT
GTTAAGCAAGACATTCTCCTTGAATATTAAATTTTGTTTGTTAACTGTTT
ACTGTTTTCATATTCATGGAATTCAAATAGATGTTGACTCTTAGTCTGTT
TATGTTTTGAGTGTTCTGCTTGTAATAGTTGTGATTCTGTTGGATTCTTG
GGTAGAATGAGATGGTTGCCACTGGTGTTGGTGCATTGGATTGTAGGTTT
GTGTTTTCTGACGAGAATGGGAYCCGCCTCTCMGGACTTGCTGGCCATGC
CCATTGCCACTTTTCCCTCCTTTCCCCTCAACTTCACCTCTCCCACTTAT
TTCGGGTCCATCCCTGAGAATAGCGTGGGCAAAGTGCTGGTGTCCCCGAG
CTATGTCTTTGGGAAGGACTCTGCGAGACTTTTGTGGGGCATTCCATTGG
GAGGTGAGGGGAAGAGGCCTTTCCACAACTGGCACATCACATACCATATT
GTTACTGCCGCAGGGGAGGCGGGAGAGGCGGCAGAGKTCTTCAAAGCAGA
GKCTGCTCTCATTGGGGACTTCCTCTTCCTCAATGTTCGTCTTCGTCTAG
GAAACCTTCGAGTTCTCAACAGGGAAAAGAGAGATGAGTACATTTTGGAG
ATCGTAGCCCTCGTCAAAGATGAGAAGAACAGGAGCCTCACACCGGATCC
CAATCTCAGGACCACTATGTTCATTCAAGTTTCCGATACTAACGACTTGG
ATCCTATCTTTCCCTCCTCCAATTATACTTTCAGGTACGTTTATCATTAC
TCTCCAACTACTCCAATACTTGCCCTTTTTAATTTTTCACTTATCTTTTA
CTTATTATACCTATAAAATCGAAAATAATCCTCCAACTATTTTCCATGTT
TTCCTTGCAATACGCTCAAATCCATGCTCTATGCGTTTCGTTCATTAGAA
ATATTATCTCTCATAAGTGGAGTTATCCATCTGATTCGAGTCCGGATGGG
GGGAGGTCAAGGGAAATTATGTTAGGACATGAGGAAATGCCCATGAACCC
GCTCCTGAGTTCTGTGTTACTTTGTTAAGTAATACTTACTATAATTTTAT
TAGTTTATTACTTTGAATTGGAAACAAAAGTGATCATATTACTTTTCATT
ATGTTATTTCATTTTTATTTTCTTAGATTAGATAAAGGTAATTATTTTAA
ATTGAAAAATTATATGATATTATCTCAAGTTCAAAATAAGATTAAAAAAC
TTTAAAAACATTGTGATGGTCATAGAACGATAAAGATCGTTATTGAATGA
GGTCTTTTTAAAAAAATTATATTTCAGACTTTTAGCTATCAAACAAGATA
TTTTGACACTTTCTGGATGTATTCTTCTTGGCCTCTGAAAAAAAACAAAA
AAACTGTATTCAACTTTGAAAAATACATTTAAAGATCTTTTAAGATTAGG
TTTTGAAATAGATTCATATTGTTTCTCTATATCTTCAACATCTAGCATTT
GAATTTTAAAATAGCCAGAAATTGTGAAAAACTGTATAGCCTTTTTCTGA
AGGCCTTGGGATGTTAGAAAAAAACTACGGCCATACTTGAAATCAAAATA
GGAAAATCATCTATTTCAATTTTGTGACATTTTGGCTATTGAACAGTGTT
AGTAATAACTGCCTGTGAAAATATTTTTCTATATTTCAATTACAGGAACT
GGCATAAATTTTAACTGTATTTTTTTCAAACTGGAAGAATTGACGAATGA
AAACTTAGAATATTTAATCTAGGTAGCTAACATCAAATTTAAATTGACAA
AGGCTAATTAATCATATAATGGTATGAACCAATGCCGTTTCAGTCCACCT
TCCAAGATTTTTATTTTTTCTTATTGATTCCATTCAGTGATCTGAATAAT
AATAATAATAATAATAAAACATTAGTGTATACATACTATGTTTTGACAAT
TAATGATATTACGGAAATGTTTTAATTTCCTATAGAAATTATGTTCTATT
TTATTAGGCTTTTTTAACAAAAAATAAAACTCTATTTTAAAAGGAAGATG
CTTCTTCCAAGACAGACTTAAATTCAAAAAAAGAACTGTGCTAAAAGTTT
TTTATTTTCTAATCATAAAACTTTGTATAATTTATCTTAATTATAGTCCC
ATCCCTAATAATAACTATAATTTACATTTTGTTTAAAATATATTTGATAA
AAATACATTTTTACTCTTTTCTCATTAGAATTGATAAAGATATGCCTCTT
CATCGAACGATTGGTACAATATATGCAGAGGATGCTGATGAAGGTATTAA
TGGTGAAATTTACTACTCTTTTCATCCTTCAACATCTTCGAAGATAATGG
AATTATTTTATTTACATCCTATGAGTGGTTCTATTTCACTTCTCAAAAAT
ATTGGCAATGAAAAAAAGTCGGTTTACTCGATGGCAGTGGTAGSTGTGGA
TAGGGGTATTAAAACTATATCWAAAACATATGCATCCGATATAGCTAATA
TTAACATCATTGTTGAAGATGTAAATTATTTTGACCCGGATATTAGTGTT
ATATTTTTCCAAAATATTGTACAAGAATCCTTCTCCAATTTATTTGCTAT
TGTTGAAGTAGATGATAAAGATGAAGGAAGACACGGTGAAGTGTTATCAT
TGGAGATTCTCAATCAAAATGATGATTCAAATTTTCGTATTATGAGAAAA
TTACCTGATGTTAATTCAACTAAGACCAAAAAACAGTTTTTATATGTAGT
AAAAATAATAATTACAACAATATNATAATTTGAATTTGACACTTAAAGCA
ACTGACAATGGTATACCTCAAAGATATTCTTACCAATTTTTGAATGTGAA
ATTCGATGGCTCTATCAATGATCAACCCTTATTTAATCGCAATGTTTTTC
ATGTATATGTAAATGAAAGTATTCCAATCAATACTCAACTTATTCGTCTT
CAAAGAAATACTGTTTTCAAAGATAATTTCTTAGTATCTTACAGTATTGT
AGGGGGTAATAAACATAAACATTTTAAGATTAATAATCGTACGGGAGTAC
TTTATTCAGCCGAGAAACTGGACTCTGAAGTAAGATCTTCTTACACATTA
GCAGTAACTGCTTTGTATAGTCCAATTACAGGAAAAAGAAAACAAACTTC
TGTTAAAATTAGGATATTTGTAATTGATGTTAACGACAACGATCCTGCGT
TTGACATGAATGTAAAGGAAGTATTCTTTCATGAAAATCAACCCCCTGGA
AGTACTGTCATAAAAATAAAAGCTAAGGTACGTAGAAGTTGAGTATTTTT
TACTTCAGTAATTTATTTTTTGTCAGAATATATTCTTGAGGAATTAATGA
TGGTAAATCGGGGTGGAAAATTCCAGGTTTAATAAAATTATCAGGGCATT
CAATGTCAAGTGTACACACACTTCCGCCATCACCATCACAAATTTACATA
ACACAGAAATAAATATTTTTTTTAAATAAAAAGGGAGAATTTACTATTAT
GGCAATTATGACCTTTTTCTAGTTATAGGCCTAAATGAAGGTGATTCAGT
TGATATCCCACTCTAATTTTTTTAACACATATAGAATATAAGTAGGTTAA
AGGTCTTACAACAAATTGGTAAAATAAATTTTGAAGCTTGGCGGGGGCGC
CATTTTTATATATTTTGTAATTATGTTTTCATAGTATTTTTGAGACATAT
GCCATTTTTTATGAAGTATAAGTTGAACTTTGTACTTTTGAAAGTATTTT
AATTCAGAAAAAAATTAAATCGGTCTAATCTCAATGTAGTTATGGCTTAC
TCGAGCTCGGAGGTCTTTTGAATGTAGCAAACTTTGAGGGACTCCCGAAC
GGGCCCTTGCGCCTTCATAAGCCTTTTTTATATCATTATTGTATAGGCAC
CCTTACTAAAAATTATGAAAACCGGTGATGATCGTGTCTAAAATTTCGAA
AAAGTGTGTACACTTGACATGGAATGCCCCTATAGGAATAGCTTGTTTAC
TATCAGACCATTCTTTATGTTAACATTATACAACTCCAGGAAAAGCTGAT
ATGAAGGTCAGTGTGTTATAATTTCTTATGCCTTTTAGAGAGCAGAAATA
GTAGTCAAAAAAAGTCATTCAGTTATACCGTTGTTTTATTGGGCATCCGC
TTATCTTGGAAGATATAACACTAAATTTAGTTTATACTTTGTCGACAACT
TCTACTAAATATTCTACTCACTCAATTTTTGGGTGATTGTAATACAATTT
TAAAGTGACACCGAAGCCGCGATCTGGTGAAAACATTGAATGATGTGCAG
CAAGTGAATAGAAATTCCATCAAATACACCAAAATAACCATGTATTCTAC
AAACGCCATTATAGTGTAATTTTTAATCTGTCCTGTAAGGGAAAATCAAG
TGTGGAAAGCGATAAAACTTAACGATCTATTATAACTTTCTTCCCCCCCC
CCCAAATTATCTCATTGAATTCGAGACGCAGAAGTGTACTTCTACTCTGT
TGTACATGGTATAAGAGAGATGCTACACAATTTGAGCCTTTCTTATATGT
TTCCTATAAACATTTTAGAATAAGATTACAAAGACTGGGAATGTTTGAAA
TAATAATGTGCTTGTTTTCAGCCTCATCAAATATATATATGCTTTAAGTT
CCTAATCCTTCTTTCTCAATAGCAAAAAGAAAAAGAAAATGTGTATTTTC
CACTTTTATTGGCATGTAAGAAATTGATTTAGGTTCAAAAAAGTCCATCG
TTAATAGCATAACAGATTTTGATGATCTTTGGCGTATTCAACTTTCGTAT
TTTAATACCTGCGTTCAGTGTGGACAAACGGAGATAGTCTTCTTTTTTGC
TTTATAAATGGAACGGTTTCCCAAATCTATCAACCTCTTCAAACGTTTGA
TAAATTAAAACTTACGTTGTGGAATTATGACACAACTATAACCGAAGATA
AATTTGAACAAATATGTCAATCTGAGAATATCTAAACTCTTTGTCATTTA
GGAAATGTACTTGAATCAAAGCTTGAACAGTTTATAACAATTCTAAATAC
CAATGAAAATGAAGATTAAATTTTCATAGAAAAATAAATTTTATTGCTGA
ATAGTTAAGCAATATATCAAAACTAAACGATTTGAGTGAAATCAGATAGT
CTTCTTCGTTCCACACTGCAGTCCACAACGGAAAAGTTATCTTTTAGAGA
AACAGAGAGTTAGCTTCAAATGCTTCACAACGACCTGGAAGATCTTTAAT
GGATTTGAATGTCTTTAATAGAATGAAAATCTTGTCAAATTGTAGAATCA
AGAATATAGATTGTTGAGACAGACCCAGAGGAGAGAGACTCTGGACTCCT
ATTCTATTAAATAAAGGAGCATTGATGGAGTTGTTACATGAGATCCTAAC
CAAGGAGACGAATTTTCTTAAATTTAATAGCGGAAATATGGATTCCTAAT
GTCCCAAAACAGGGAGTAGATGAGGAAGATGGATGAAATTTATGACTGAA
TAGAAGTGGACATCGACAGCTCACACGTACTATCGTAGAGACATTGAGTG
AAGTCCAATTCTGTGGAAATTCCCCCTTTTTATATGGCCCAGATATAGTG
TAATCAAATTCATAGTAACAACAAATTGTTTGTGTATTCTTTTAAAGTCA
TATTCTCAAGATTTAATGCAGCATTGACTTAGTTTGTACTAGCAATAAAT
CTTGCACAGGTTTTTTCCCACAATTTTTGTATCTCATCTCCAATTCTCTT
AGCCTATATTTTTGAATGGTTAAATTTATATTTTGAATTTGACTATTCTC
ATTTTGAGTTTGACTACTCCATTTTGAATTGGAATATTTCCATTTTAACT
GGACCATTCCATTTTGAATATGAAATGGTATAGATATACCAGGGGTCCCC
ACTAAAACTTTTTTGACATATTACTTTTCATTGATTAATATAATTCTTAT
ATTGTTTCAGCTTTTTCACATAGTTATTGAGGAAAATACAAAAGAAAAAA
AAAGGTTTTAATTATCTTTAGCCTGTGATAAATTGGATGAAGGGGGAGTT
TTTTTTTTATCGATTACATCATTGACAATTTATTAACGTTAATAAATCGA
AAAAATGATTTTATTTAAAAAATGTTATTTGGATTGAACAATTTTTGTGA
TTAACTTTAATAGCTAAAAAATGAAATTGTATGTGGGTCACAAAATGAAG
CTTAGTCAAATTGTGAAACAACCTAAGGCTTTTTTATTATCAAAAAGGAA
GAATGCCCCAGTTATTATATAGAAATAAAAAAAAATCTTGAAATTATGCC
TCTCAAATAAGTAAAAAAATATATGAAGCAACGTTAGGGTTGTAAACGTG
TCTTGAGGAAATCAATAGAATAAATTTTTTAAACGTGACCTTCATATATG
TCTCTACTTTTTTACTTTTATTTTTTCTCATAGGATAAAGATTCGGGAGA
AAATGGTTATATATCCTTTACCTTTGCAAACTTGAATGCTATACCGTTTG
AAATCGATCACTTCACTGGGGTAATAAGGTCTACGAAATTAATTGACTAT
GAATCTGATAAGCGAATTTACAAACTTCGAATTAGAGCAAGTGACTGGGG
TTACCCATTTAGTCGTCAAGAGGAGATGGAATTATTAGTTAGAATTCAGG
ATGTAAACGATAATCGCCCACAGTTTGACAAGACTAAATGCATTGGAAAA
ATATCTAGAAACTTACCTATAGGATCAGAAATTTTTAATATGACTGCTAT
AGATCTTGATGAAGGAAATATCGTCTCGTACAGGMATGGAATTTTTAATT
TAACATTTTGTAGTCGTATTTAAACCTTGTATTTACCAAGTTGCACATAT
CCTTGGTTTTTGGAATTAACGAAACTATCTTTAATTAATGTAATAGGTGC
ACTGAATTTCAATTTCCCAAAACATAAAGCTTCTCTGATAACAAATATAG
TTTCATCCAAGGTTAAAAGAAGTACAATGTTAGACCATCATGTAATCGAG
TTTGCTAGAATTTTCACTTTTATGTATCGTATCATATGCAACCAATCATA
TTCTATGACACCACTAATAAAAAACGTGGTGGAAGGCAAACATCAATC back to top
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