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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1 | supercontig | LSalAtl2s1:3380543..3389240 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003717 >EMLSAP00000003717 ID=EMLSAP00000003717|Name=EMLSAP00000003717|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=634bp
MRWLPLVLVHWIVGLCFLTRMGXASXDLLAMPIATFPSFPLNFTSPTYFG SIPENSVGKVLVSPSYVFGKDSARLLWGIPLGGEGKRPFHNWHITYHIVT AAGEAGEAAEXFKAEXALIGDFLFLNVRLRLGNLRVLNREKRDEYILEIV ALVKDEKNRSLTPDPNLRTTMFIQVSDTNDLDPIFPSSNYTFRIDKDMPL HRTIGTIYAEDADEGINGEIYYSFHPSTSSKIMELFYLHPMSGSISLLKN IGNEKKSVYSMAVVXVDRGIKTISKTYASDIANINIIVEDVNYFDPDISV IFFQNIVQESFSNLFAIVEVDDKDEGRHGEVLSLEILNQNDDSNFPTDNG IPQRYSYQFLNVKFDGSINDQPLFNRNVFHVYVNESIPINTQLIRLQRNT VFKDNFLVSYSIVGGNKHKHFKINNRTGVLYSAEKLDSEVRSSYTLAVTA LYSPITGKRKQTSVKIRIFVIDVNDNDPAFDMNVKEVFFHENQPPGSTVI KIKAKDKDSGENGYISFTFANLNAIPFEIDHFTGVIRSTKLIDYESDKRI YKLRIRASDWGYPFSRQEEMELLVRIQDVNDNRPQFDKTKCIGKISRNLP IGSEIFNMTAIDLDEGNIVSYRXGIFNLTFCSRI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1:3380543..3389240+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003717-699564 ID=EMLSAT00000003717-699564|Name=EMLSAT00000003717|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8698bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1:3380543..3389240+ (Lepeophtheirus salmonis) TTCGGAAAGAGCTATGATTCATCAATAAATATTCTTTTCTTTCTATCGAT
AGAGCTTCTTTTATTTCTTCAAGCCTCAACTAACTCCACTACTATGATTC
ATTAACGTGTAATTAGGATATACCCTTCCTATCCATCATATGATAAATCA
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AAAAAGCATCCTCCGAGGGTTGAACTTCTTTCCCACAATGATCTGAAATA
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TTTATTTTCTAATCATAAAACTTTGTATAATTTATCTTAATTATAGTCCC
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AGGTCTTACAACAAATTGGTAAAATAAATTTTGAAGCTTGGCGGGGGCGC
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TCTCTACTTTTTTACTTTTATTTTTTCTCATAGGATAAAGATTCGGGAGA
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TTTCATCCAAGGTTAAAAGAAGTACAATGTTAGACCATCATGTAATCGAG
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TTCTATGACACCACTAATAAAAAACGTGGTGGAAGGCAAACATCAATC back to top
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