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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s219 | supercontig | LSalAtl2s219:245349..254852 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004143 >EMLSAP00000004143 ID=EMLSAP00000004143|Name=EMLSAP00000004143|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=390bp
MNLELLESFGQNYPEENDGTLDCITMAIXCQFNRFGTLLAVGCNDGRLVI
WDFLTRGIAKIIQAHIHPVCSISWSRSGRQLASASTDNNVSIWDLLTGEC
EQRFPAXXVDLEDGSHRLIPLDDENDSQIVAXYDHRGKXIFTGNSKGKVS
IFNSSNLELITSFHPTQKLQDLVNRTMWKKCCFSGDGEYVCAGSARQHAL
YIWEKSVGNLVKILHGTKGEILMDVVWHPVRPIVASISQGVVTVWAQQQV
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PEIEEPEEHWVHGVDGTNEDSSIKRTTSTDSKESSSPKKKKTKVTEVTLQ
NPPKDEVHPLLAKSSGKDKNLSNKRNSGRAKGKDKGKLNK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s219:245349..254852- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004143-699990 ID=EMLSAT00000004143-699990|Name=EMLSAT00000004143|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9504bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s219:245349..254852- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATCTTGAGCTCTTGGAATCATTCGGTCAAAACTATCCTGAGGAAAA
TGACGGTACCCTGGATTGTATCACAATGGCAATCMCCTGCCAATTCAATC
GTTTTGGGACCCTTTTAGCCGTGGGTTGCAATGATGGTCGCTTAGTTATT
TGGGATTTTCTTACTCGAGGCATAGCGAAAATCATCCAGGCTCATATCCA
TCCAGTTTGCTCGATATCCTGGTCTAGGTCGGGCCGACAACTTGCATCGG
CTTCTACGGATAACAATGTCTCAATTTGGGATCTTTTAACGGGAGAATGC
GAACAGAGATTTCGTTTTCCATCTCCTGTGCTCCAAGCGCAATTCCATCC
TAAATTCCATCGGTAGTATTCCATCTTTTAATTAAAAGTACGTTTGGTCC
TTAAAGCCTTTTTCTCAATCGCGTTTCTATTGTATAATTTCGATTCAGAG
CCATATTTCGAAATGAAATAACCCTATATATGAAAATTAAAGGTAATCAC
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TACATTTTTGTGTTACATTGGCTTTCCCCTCTCCAAATTTAATCACTTCT
TACTGTGATCATTTATAATCTTCGTACAAGTGTGATCAAAATCGAATCTT
AACCTTTGCTGTACTCCTGGTGATTAACAAACAGAGCCAAAAAAATTAGC
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CTTACATTTAATCAATAAATACTAATCAAATTCATTGGATGTRAAACATA
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TATTTCCAGATATATTTTAGTATCTCCAATGCGAACAGCGGCGGKAGKTG
TTGATTTAGAAGATGGATCCCATCGACTTATTCCTCTTGATGATGAAAAT
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TGTGATAAGAGTCTACCGTATGGATGAGGTTTTCAACCAGCCAGATGGAA
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AATCAAAAAGAAATGTATATGTAAGCAACTTTGGTTGTCGTCATATCTGC
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CATATTATCAAATGTATTTATATACGTTAGTGTTGTTACGATACCATTAT
TTTTTTACCATTGGCATTTTTGATACTTTTTAGACTAAAAATATGGAGCA
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GTTGTCACAAACTGTATATTAAGGAAATGGACTTATTATAGAACATATTC
TATTAAATACATTTTGTAACTATAAATACCAAGACTTTCATACAAAATTT
GGTGTTTAATTTCCACTTGTGGGATCTCTAATAAAGCAAAAAAATTAAAT
TTTTACTCCTTGAGTAATCTTAAAACTTACAAATTCATAATGAGTATTTA
ATCTATATTTTACTTAGTTACTAATCTTTCATTCTGTTGAATTAGTATTA
CTCAAAACATTCCAAAATTTAGATTATTTGCAAAATATTTGACTATTTGA
AGTCAAAATGAGACTTAGCAATAAAATGACTAAAACCTTACTGTCTATCA
AAAGTATATCCTTCTATTACCTAGTTTTATTATATAGATTAGGCACTAAG
ATGTGTTAAAAATATGTTGTTACATCGTTATACAATCTTATTTTTATATT
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AATTATCCTACTTTTCTCATCCCTACTCGATCAAAAAAAATGTACAAGCT
TATATATTTTATAGGGATTTTCAGTATATTTTAGTTTGATTTAATTCAGA
TATCATTGGCATAAACTAATATTCAATGCAGGTGTTATGTTTTTGACGAA
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GGGGGGTCAAAGTTGATATGTTTACTACATAAAATGTACAAATTTTAAAT
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TTTKTWTATATAAAWTATGGATTTTTTTWGTTAGTTAAAATGTATTGCTA
TTGCTGTTTACCGTTGACATATATGTGTAAATAATATACCAATACAAAAG
TAAAGAACACGACAATTGATTGGGGTATTTGTGCTACCAGATAAACATCA
ATTTCATTCTGTTATATCTTGGCTTATATAGGTCGTATGATAAAAAATCC
TGGAGTTTCGATTAGTCACCTGTTTGTAAACAAAAAAAATAGTTAGAGAT
GGAGCAGACAAGAAGCACTGTAATACGAGAATTGTGTCGAGCGGAATTCA
CTCTCCATGAGTTTATCAATCGTCTCAAGTACTCGAAAAGTACAGTTTAC
TGGATTTGTGATGAATTTGACGCCAAGGGGAACACTATAAGGTGAGAGCT
AACAAAAAACGAYCCCCCCGGTTCGTGGTGGGGCTCAAAAAGTCAATCCA
TGCAAATCCCACCTCCGCCACTGCCAAGCTCGCAAAGACCAGGAACTTGA
GTAAGACAGCCATCTAGAGATCCATCATTGTCGACCTGAGATATCTCTCT
AGGGTAGTTAACCCTTGAAATTGTATTCAACATTTTTTTCATTTTGAATA
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TTATTTCCATTTTAACTGTTAACGTATTGTCTATAATATGGAAATAAGAT
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TATTAGAGGGATATAATTTGATAGACAGTAAGGTTTAATTTCAGTTTTMC
CATCCAGTAGTTGATAAAATATCATAACAAATATTGAAATCATATCATTG
AATTAGGTGGATGTCTCAAATAATGCAGCAATTCCAGCATTTTGTAGTAG
TGATGAAGATGAAGAGGATAAAAATGCTTTACTTTATTTGCCTACAGCTC
CTGAAATTGAGGAACCCGAAGAGCATTGGGTTCACGGCGTTGATGGAACA
AACGAAGATTCTTCTATTAAGAGAACAACGTCCACAGACTCTAAGGAATC
CTCTAGTCCAAAGAAGAAGAAAACTAAAGTAACAGAGGTTACTCTTCAAA
ACCCTCCAAAAGACGGTGAGTACAATCATGTGAATGGAATATCCATGGAG
AGTATTTTCAGGTTCGGCTTTAGGGGGGAGGGGCCCACGCTGAAATTGTT
CTACAAAAAATTAAAGTATATACACAAATAAGAACAAAAAAAACCCCGTC
ATTAAATGAAATATGGAGACTAAAGTGTAACTTAATTCACTTTTTTGTGA
AAAAGTAAAGAAATGGAGGTTTAAAATTGTTCCTTTTTATAAAAATATGA
TTGACAAAGTTTTTGAATCATTTATATAAATATGTAGAGTTAGTAGCTAA
ATAACCCTATAGTTGTGAAATTTTACAACTTTAAAAAAAAAGAAAAAAAC
GTGACTTTGTTTCAATATCATCCGTATACATCACGGCTTKCTTGAGTTGA
CTTTATATGTTTTTAAAGTAGTCGTCTCTACGTTTTATGAACTCAAAAAA
GTTATTACATTAGATTTGGATTTTTATATTAACTTATATCAATTCAGGGG
CTTTGTTGGGATTTCGTGTCATTTCATTTTGAGTTATTATTTAGATTATC
AATTCAATGTATATAATAATTCAAAACTATTATTATAAATAATAATTAAT
AGTTGGCAACAAAAAAAAAAATATAATAATACAAATTTCCTTTTGACAGT
TGAGGTCGAAAAAGAATAAAAAAACTAGTCAAAAGGGAAGGAAAAATTAG
ACCTTAGAGCTTTTTCGTTAAATTAACAAATTTAGATAAATACAATTGCG
TGGGACGTCGTAGCTCAATGGACAACACGCTCGGGATATTTTATTCTATT
GAACTCAATGTGCGTAGGTTCGCCCCGATCATTCATAGAGAAGGAAATAT
ATATAACATAAATGTTTATGGACTTTAAAGAAGATTCCTAGTTCAGACGA
AGTAAATATAAGACTTCATTGTTTACTTATACTTTATCAGTGCAAATCCA
TCTGGTAAAGGAACATTTAAAAAAATTGCTAGAATTTTTTTATATATTTT
TATGAGCACTCAGTATTTACCTGTCTAAAAGAGCTATAATATTATTTAAA
CGAAATTTMCCCTCGATTCAACCTATCTGTCGGTTTGTTAGCGTATCCCA
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GTCCAATATCGTGGGAAAGATAAGAGTTTCTTTGTTGCGATCCGGGCCCG
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TCTGGAGAGTCAGGTAGGAACTGGAAGAGTCTGGAGGGGRTTATGAATCA
ATCGTAAAGKGTCTTTTCCTTCGTGTATCACAGACAATGGTTTAGATTTG
ATATTGTATACCCTAATTTGGAAATACGTTTATTTTTTAATTAGATAAAC
AAAGAACTTGTCATTTTTATGACTTGACCTTGATTAACTTTTTTATGACC
TTTTTGAGAAAGAAAAAACCTATATGGCCAAATTTGATCCAATATCTCTT
AAAAGTTTACGTAATGTAGAAAAAGTTGCAATGAAAATTTAGAAGGAACT
ATTTGATAAAAAATGACATTCGAGTTCATTTGAAGCCAATGGTAACTACG
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AGATTTGTTGATGTAGGCCTTTTTGAGGGCCTAAACAACCTGGTTTTATA
ACAATGAAAATCCTTTTTCATTAATATTTGGGAAATTAGTTAAATGTTAA
TGTTAAAATGTGACTAACAAATAAAATGACTAAAACCTTACTGGCTATCA
CAGATTTATCCCTCTATTGCTTAGTTTTATTATATATCTGACCCTAAAGT
TTATTATAAATATCGTGAGCAGACTTTTATCCCAAAAACTTTTTTGCCAA
ATGGACATTTCGCCGAAAGACTATTTGGGACATTTGGCCGAAAAGTGATA
TTAAATTTATTGATATATACGATTGCATATTTTAAATTCAATTTAAAATG
ATATTATGATATATATGTAGGTATTGCTCATATGTTATATATGTCATATA
GGTAAATTGGTGAAAAATATTCGATATTCATTAAAGAACATTAAATAAAC
ACAACACAGTAGTGTTTCACTGTTATATGAGTGGTAAAAAGGTTGCAGAC
AAAATCGTTACGTTGTAAAATTTTCTTGTACCCCCCATACCCCCCCCCCC
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ATTGAATGATGAAGATGATTGTCATGAAATATCCCATTTAATATCCCCAG
CCCACAAGTTGGACAGCTGAATCGCTGGGCCCCGAAGCAGTTTAAACTCC
ACGGCTGCCGCGTTTCTAAGTATCTATGACCCTTTTATAATATGTTATAA
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GTCAAATTTCATCGTTGCAGACTCTCTAAGCATCAAACAACCCTTTTAAT
ATCCAAAAATACATATCAGCCCTCACGTTGTACAGATGAATTACTGGACC
TCAAAGCAGTTTAAACTCTACCACCACCGCGTTTCTAAGCATCAAGGATC
CCTTAGAATATACTAGAATACACTCCGGCCCATGGGTTGAGTAATAGATC
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CCAGAAACCCTTATAATATCCAAAATACATATTGTTCCTCAGATTGTACA
GGTGAAGTACTGGACCCCAAAGTAGTTTAAACTCTMCCGCCGTCGTGTTT
CTAAGCCCTAAAGATCCTTTCTAATATGCTATGACACATCCCCGCCCACA
ATTTGTGCACCATCTACTTGTACTTGTTTTTGCAACTTTTACGTGATTTA
TGGCGTTGAATAGAAATACTTAGAAATATAATAGCTATGTATTATATATG
TCTTCGTTATCATTTATCGGACTAATGAAATATAATACATATCCGATTTT
AAGGGATATATCGTGCACAAACTGGGGTGTATCATAGCATATTAGAAGAT
ATCCTTGGTGCTTGGAAGCGTGGCGGTGGTCAAGTTCAGAGTCGGTTAAA
GTACCTTTAGGCCAAGAACATTCCTGTACAACCTGATGGCCGGGGTGTAT
TTTGGATATTAGTAGTGTTTTTTGATCCTCAGGAAAGTAACAGTGGAATA
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ATGAAATATTAAACGGGATATTTCATGCTTAGAACCGTGGCATGGTAGAG
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GATCAGAGAAGCGGCGGTAGAAGAATTTAACCTGCTTCGGGGAACAGCAG
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GTCAGTGAAAAAGCTTTGTTAATAAGTAATATTTCAATATAGCCAATTTC
CTTAGATTCAATGATTTTATATTGAATCAAAAGTATTCATTTTTTTTCAA
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AATTTTTTTAAATGGTGAGAAAGGAATGAGCCCTGGGAATTTTTTATTGG
CTCACGCTAAAATTGTCCATGAGAGTTCTTATCATTACTGAGAAATTAAT
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TGCATCCTTTACTCGCAAAATCAAGTGGAAAAGACAAAAACCTATCGAAC
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