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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s290 | supercontig | LSalAtl2s290:443342..466882 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005405 >EMLSAP00000005405 ID=EMLSAP00000005405|Name=EMLSAP00000005405|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=340bp
MNELDPLRAEAEQLKNAIRDGRKAACDTTLAQAAGTMDPIGRIQMRTRRX LRGHLSKIYAMHWGAESRNLVSASQDGKLIVWDSYSTNKVHAIPLRSSWV MTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYNLKSREGSVRVSRELPGHTGYLSCCR FLDDNLIVTSSGDMTCALWDIETGQQTTTYTGHTGDVMSLSLSPDSRTFV SGACDASAKLWDIRDGMCKQTFPGHESDINAVTFFPQGTAFCTGSDDATV KLYDIXADQELAQYSHDNIICGVTSVAFSKSGRLLMAGYDDFNVNVWDTL RVERAGVLAGHDNRVSCLGVTDXGMAVXTGSWDSFLKIWN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s290:443342..466882+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005405-701252 ID=EMLSAT00000005405-701252|Name=EMLSAT00000005405|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23541bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s290:443342..466882+ (Lepeophtheirus salmonis) AAGGCCTTGAGTTCTCCATCCATATATTTTTCAAATTATGAGGTTTATCA
TGTCATTTTTCGGATGTTTATTTTTTTTACATATCGACTGTGCTTATAAT
TAACAATTTTAGAAATTCTAAAATATGCTAGGGCGTGTAGAAGAAAAGGT
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GGAGGCGGAGCAGCTAAAGAACGCAATTCGGGTAAGTTTGTTGAGTGTGT
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GAAAAGCAGCTTGTGATACGACTCTGGCGCAGGCAGCAGGGACAATGGAT
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TAGCTACAGTACAAATAAAGTGCATGCGATACCTCTGCGATCTTCTTGGG
TCATGACTTGTGCTTATGCTCCATCAGGAAACTTTGTTGCTTGTGGAGGA
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TAATAGAGGATTGGCTTCAAGGGCTCACTCCTACTTTTTTTCCACTAACT
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CATCTTGTCTAGTGCATCTACAGATTCATTGCCCGTATTATTGTTATGAC
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TTTCCATTCCAACAAGAGCTCGCAATGCTTGTAAAATTCCTTCCAAACCC
GTCATAAACTGTTATACCTGTTTAAATTTTCATAGTCGCCGAGAATAGAT
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TGATCCGTCAGTGAACATATTTACACATCGAGGATTTGCAGATGCCCCTT
CCTTCATAGTCTCAAAGGAAGGACAGTTATAAGGTTTATGATTATTTTTT
CCCAAGGGTGCATCAAATTTGTAGAGTATTTAATCTCAATCTTGTTGGAG
AAGGGGCTGTCCTCCTTATGTACTTGACTGTACAATCCATGTGACAGGAA
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AGGTGTGAAGGTTCCACATTAAAATAATCTCCATTACTTTTGTTGGTGTT
GTTCGCATAGCTCTACACATCAAGATCCCTTTGAAACTTAGTGATGTTTC
CCTGTTTTTCTTAGACCCGAGGTGCCCATATTGCTGCCCCATAACATACC
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GGCCCCATTGGTATCTAACTAAGTTTCTTGCAGGAAATAATACCTTTTAG
TTTTTTTGACGCTATGGTCAACCTAAGGACCCCCTCCCATTCGTCGGTGA
ATTATAACACTAAGGTATTTGTATTGATCCCACTCTATCGCTACATCATT
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AACTCACTCACTGTTGAGAACATGTGATTTCTCTGTTTAACTAGTAATGT
TTGAGCCATTTAATTGTTCACGTATCAATACCATTATTTTCCTAAGATTT
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TGTACTTTTAGCTTAAACGATTTGTTATGCCAATACACCACTCCCTCTAG
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GCTCCATAACTTAGGAACAGAGGAAAATTTAAGTTATTACTTAAATATAA
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ACTTCCTCCACAAGTGCATTATTTATATCATTTACCCAAATGGCATGAGT
GTTCCTATTTGTCTCAGTCCCTTCATCCAAATTTTGTTTCTGGCCTTGTT
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AGGATGCCCAATCTAGGTTTAATTTTTTCWTTTTGTCGTTTTATTSCCGC
CATTATATGCTGTCGTGTCTAATTCAGTACATCTCTTTCTCCAGTGATGG
CGCCTCTCCAAGTCTATTACTCTCCTATATTATCGCTTGCTTCCATAATA
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TCTTGAGAGCCATCCCCAAATTGCTTAATTCCCTTGTCCACCACGGAACA
TTCTTGCTCTGGGACTTTATTATCGGAGGTGCCACTGTGTTAACCGTTAT
TTTAATAGATATGATGACTTCAGATGGAAGTTATTCTATATCTTTTGACA
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ACAAGAATTTATTGGGGTTTTTAACATTATACCATCGATTTGTTCCTGGT
ATGACTAAAATACTACGATCTTTTTTTCAACTGATAATAGGAGCTCCCCC
TACCAAAGCATCATAATTAAATATAGGATCGAGCCTATTATGGGKTTAAA
AGAAACATTAATACGTGTGAAGTCAGTATAAGCTAATGCGACCTTAATTA
TACATCCGATTCCCTATGCACCATTAGTTTTCTCTGTTGAGGCTTCTGAC
ACGGCGTTTGGAGGATTTTTGAAACTACTTGTAAACAATACATGATAACC
TTAATCTTTTCTTTTCATGACACACATCCGAACTGAAATATAGTACTTTC
GATCTGGAATTACTATCCATACATTCATCTTTAAGGCATTTCCGTAATAT
TGTTGAGGGTAGACGATTCACAATTTATACGGATCACAAACCTTTAACTT
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ACAGAATTGCTTTCAAATGTTAATCTGTCAATCGAGTTCGATGTGCTGAC
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TCTTTCAAAAAGTCATTTGCTTGGAAATCAATGAGCTCCAACTGTAGTTC
CACTGGCACATCATCCAGTACAACTATAGTACTACTGGCACATCATCCCC
CCATATTTTTTCCTTCATCAACTGTAATACCTCGTACCTGAAGGCTATAG
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TTCATGCATGCTTCAAATAATCCCAAATCTTGCGTTATCTGAACAAGTCA
CAAGTCATTTGCTGCTTCTATCAATCACTGATGAAGTTACCATTAGTAAA
CGGCTTTTCTCGTTCTACCATCTTATATACTATTTTGTAACTTTTACGAG
GGATAAATTCATTTTCAGCTAACTTTCTCGTGAAGAAGTTTCTTTGAGTT
TCTAAACCACAATACAGGTGTGCGCGTCTAAACCTGAACACTCTGAAATT
TTTAAAAATAGTAAAATAATTGTATAATTTTTTACGTGGCCGACGAATTA
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TGCCGCCAATGTTCTCCACTACCAGCTCTAATCTGGACCGGAACTAGCTG
CATGACTTGGTGATGAAGCTGTGGTCGAGGTTGGTTCAGGTATTCTTGAG
GGCAGACTTCAGCTGGCCCTTGGACTTCTATTGTACTCCGGACAGCATCC
CCTTTAAACCCCCAAACACTGCTAAGTCAAGTGGCGAACAATCAGGCGAG
TGAGGCGGCCAAGAATTCCGATCGAAGAAGGCTGGAGTCTCTATCTGAAG
GGAACACTTAAACGATAAACTATTACTTCATAAGACTTTGTTTGTCACTG
TGTTTGTAAATAATTATTAAATTGTTATGTGCTACATATATCGAGCAGCA
CGCTCCTTATTACATATTATGATTCTTCATCTGGTGGGGGTCTTATGTTG
CGACCTATCTAATGTGTATATATAAAATGAACAGGTACTGAACATTAAAG
TATACTTATCTAGCAAAGAAAAAAAAAATCCTTAAAGAATACACCCTTTT
TAGGTTGCTTCTTTTTATTAGGTCATGATATGTAGAATGGTAGGATTTGT
TATCCGATAGGTCGTCTTTTAAGTCCTCATTCAAAAATATAATGAGGCTA
CACTTGAACTATAGTAGGTGTCTAATCCTTTCTACACACTACTTTACTCC
ATATCCTCCCAAAAATTTCGGAGTGTCAGTTCTACTCTTGCAGCTTACGA
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CGAATCTCAAGTCAATGTCCAAGTCTGTGAACATTTTCATAGAGTCGAAT
CTCATTTCAAGTCCATGACCATAATATTAATATAGGGTCTATAGTTTTAA
GCCAAGTGTTGGGTTGGTCCTTATTTATTTGGCCAAGTCTTAGGACAGTA
AGTCTTTCGGATTGGTCCTTAACTGTCGGCCCTTGAAATTTTTCATAAGA
ATATCGATGTTTAATTCAGCCAAATAAGATATATTAAATATGCATTAAGA
TTATTGCACACACTTTGTAAAAAATATTATATTTTTCATTATAATACAAT
ATTATACGAACATTTTATATTATTACTTGGTTATATTATTTATTATTATA
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ATCGATTTTACCTTCTTTAAGGACTGACAAGTGGGACCAGACTGGATTGG
ATTGCGTTCCGCTGTCCTAAATAAGGACCCACACAACACTAGTTCAGGCT
TCTCTTTAGTCCTCAATAAGTCGAGTCGCGAGTCATAACTATGGATTCAT
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ACAAACAAAATTCATTTAAAAATACCAGCGTTTGTATTTTATTTAAGAGA
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CAATATTTCATTAAAACGACTACATTGTTAGAGATGTAAATCCTGGGATT
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TTGTTTAACATGCCTATTTAAAAAAAAAAAATCACTTCTAAACATTGTTA
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AGATATTGTTTTTCAAAATGTGTGTTATTCTAAAACTGTTCCTTTTGATA
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TTTTTCAATAGGTGTTGGATATACTGATTTTGAGAGAAATTTTGACTTAT
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AGGTAATCACCGAAATTAGGACATGAAGATATATTTTTTTTTAATAGAAG
TTTTTGAAGTTGTGGGTACTATCAATGAGAAGAAAGCCTGGAGCAGCTGG
YTTTGGTATATTTGGTTTCCAAGATCTTTAACCAAAAAAAAATCTTAGTA
GCATTTCCGGTTATTGTTGTCCATCGAAATAGGTATAACATAAAATCCGA
TTTTTAAATTTAAAATTTTATTTGTAGCATAAAGTTTCTGAGTTGAGGTT
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AATTTTAATTAAAAAAACTCGACTCTTTGAGCAGTAAATATCATTCAATA
AAAGTACAACTCATTTCTGGACATATAATATTGACTAAAATGTTCGGAGA
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TCAAAGGACATCTGGCGAAATTGTGTAGGACTTTTCTTGTTCCAAATGAG
GGATGATTGGTGAATAACGTTTATGTGCTCCAGAAGAATTTAGGGTAATA
CATTTCGAAGCTTACTGATTGAAATAATCTTCTCTTAAAATGTTATCCAG
TGTGATATTTTTATAGAAGAAAAAGAATATCCGATCCATATGAATACTAA
ATGGGAATACTCAAGGAAACTTAGGTTTCCAATCAATGAAATTGAATATA
TTTTTCTATAATTGATATTTGGTAAAAGTATATCACGCGTATCTTAAGAG
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TTAGATAATAATGAGATATCCAGTAGAACGACTATCTGATGAAATATTTT
TTTTAGTTCCCTCATTTTTGTGATTAGACAAGTGTTAGGAAGATTGGGGA
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TCTGTAACAAAATCCTTGTCTTGAAAATGATGAAAGCGAACTTGTTAATT
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TAGGCACTTATTTAACATTCACAATAAGGGAACGAGTCCAGAGATACAGT
AGGGTACTTCGGAGTATTTTTATATCCACTGCGACAATTTGGTACACAAC
ATAGGTTGGCATTAAGAATGAAGATGTCGAACATGATTTCAAGTTCATTA
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ACCAAACTTTTTAATAGTGACGTCGTAGAATGTGATTGTTTGTGTGTATA
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TATAAATTTTATTATAGTCCTACTCTTATATTTGTATATTTATAATTATG
AGATGCCTTTGTATGAACCTGTATAATAAACTAAGTTGTAAATACTCAGT
CATCTTGAGAACTATACATGCCCAGTAGGCAGTTCGAATTGAATAATACT
TCCATATTTAATATTTTTTCAACTGCAATTCAATTTAATTACATTATATT
CTACAAAATGCCTGGCAACAAAGATTCATATGGTGGTGTCAAGGCTAAGT
TAACGATAAATATAGCCAATTGCCAATACTGGCTCGGAAAACTGGAGAGC
TTTGAACCATCTGCAATATGCACCAANGTTCTAGAACATGTTGATTAATC
AATATTTAAAATGGAAAAATCATAAAATAATCTTTTAAACTCAACTCAGT
TGATGTATGAATATGATTTGTGTACTGGGGAAGAATTTACATAATAGGAG
ATCTAGCTACAAAAGTTCATGAACACTACCAGAAAATTATATTCAAGCTA
TGGTAAATTATGTCAAAACATAATCTTGTAAATGTATCCTCTGTATGGTA
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GATCAGCCATTGAACGAACTCGAGATGTTTTGATAAGATGTACAATTAAT
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AAAAAAAATTATTCAATTCGAAAATCCATTACACCTCAAAATTTTACAGA
TCTGTGTTTATTCAGAGGCCTTTCAAACCAATAAGGTAATTTCATTACAG
ATCTTGCTGACATTGCTGCACCTCTTCGACTGTTACAAAAGAAAATAAAT
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GATAACTCGTCGATTGGTGAACACCGAATAGATACATTTAATCCAGTAAC
TCTTACATATGTTCGTGTCAACAATATGGAGTACGCGAGAACAATTGTCA
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TAATATGTATTACTAAAGGCGAAGAAGTCCTACAAAATCCCTAGACAAAG
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AATTGGGAAATTAAATTTGGTACAAATATAAATAAACCAAAACAGCAAAA
AAGGACACACTTGAAAAGCATGAATAACAGAATAAAAAATCTACTGCCAT
CGGCACTTCTTTTAGTTGAATTCATTACATGGCTTGTCCAATCTTCCTTC
AAACTTATAATACGGAGATATTTTCTACAAAGCTTTGCTTTATACTTTTT
TATATGAGCCCATTTCATAGGGCGAGGAGTCACCATACAGTGTGTTACTG
CTGTCCTTTGCAAAGTAAACTAAAACTTCCCTGTCAAGAAAATATCACAT
TTAACATCATGAATTGAAATAACGATATTATCCAACGCCTAAGTTTCCAT
GCTTATCAGATTTTCATGGTTTTTAAAGAAATACCTCTTTGCCCTGTTCT
AAAGTATTATGTCTATTGTTGAGTTTTGAGTCAAAAACCACATCGTTTAA
TCACAAAATTCTATGAGCTGCCCCAATGAAAGAAGAAAATCAAACGGCCT
CCGAATTTATCATTTTTGTTCAAAACAAAATCCACCTTCAAATCCTACTC
GAGGAAATATAAGACCTCAAACCAACATCCGGGTTGACCATTTAGTTATT
AAAAAAATCTTCTGCTAAATTTTAGGGAAGAAAGTAGAAATCTTGGCAAG
TCCACTTGCTCCTTGCTTCCTCTTAATGCCTGAATATAAGATTTATAGGA
TAAATTTTCAAGCCAACTTTTTTCCTCCTTAATCGAATGCTCTCCGATTA
TCGGAGACGAAGTAGCTTTATACAAAATCTATGGAATTATATATGTGTCA
TATATATGGATCCATTTTTGTAAGTTAAATATCTCCACTCCGCTAATTTT
TTATAGATCAAACTGTTAAAGGAAGTCCAGTTTCCTAACGTTACTCCGTG
TCTGTCCCTCTTAATCCAAAGAACTTCTAAACTTTTTCGTATTATTCAAC
CTCGAATTTTGGTGTAAGATATTGGAGTTCACTTAACAACTGGTAGTATT
GCCGTTTTATACTTGTTAACTGCAAGGCCAGACTTTATCTCAAACTTCTC
TAAGCAACCCAATATAATTTCGKCCCTTCTAATATGTTGCTTCTCCGATT
TAGCCTCTACCATAAGTCATATCATCTGCATGTATATAAATTATTTTCAT
GCTGGATCTTAGTTGTATAAAAAATCTGCCTTATTTCCTTTTGATAATAT
TACTGAGTTCTTCAATTGCTGCAACGAAAAGTAAAGGAGAAACCCAGCAC
CCCTGTCGGCAACTTCTTTTCAATTCAATTGATTTACTCTCTAACCCACA
TATAGACATTGTTGAAGCCCTAATCGGAATATAAAATTTCTTTGGCAATA
ATTTCTTAACAGTCTTCATTATAAAAATGTGCCTGATAGAATCAAAAGCT
TTCGAAAAATCAATAGCTATAATCGCACCGTACATTTGACGTCTATTTAC
CGATTCTAGTGCCGCTTAAATGTTCCAAGAAATATCAGTGATGCTTCTCC
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CTCATTTTGCATGCCTAAAACTCCCAACTACAATTCTATATGCTTCAGTA
AGCACCATTATGGGCCTCCAATGATGGAAGTCTGTTCCTTTACTATTTTT
TGGAATAAGAGCAATTTTTCCCTTAGTCAACACTTTAGGAAGACAGCTGT
GTTTCTACATGGATTTACCAATACACGTTAAATAAGGCACAATTTCCTTT
TTTGCCACGGCATAAACTTTTCCAATTATTCCTTAAGGTCTACAAGCCTT
ATCAGATTTAAATTTCTTATCTATAACATTTTCCAATAGTATTCTAGTGT
TTTCTTCTGAGAAAATTGTTCCCTTGTGTCTCCTTGCACGGGGAAAGTTT
TTCCTATCCCCTCCTAAAATATTTTGAAAGCACTCATGAAAATAGTTCCA
AGATATCCTTTCTTTTTTACCAGTCATTTTCCACACACCATTATTAACTT
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CACTTGAATAGTATTACTAAGTCGCAAAGCTATCGCAGATAATGTGCGAT
CAAAATTTACTGTTAGTTTACGTTTAAGACTTAATTAAAAATCTTCATCT
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