EMLSAT00000005405, EMLSAT00000005405-701252 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005405
Unique NameEMLSAT00000005405-701252
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s290supercontigLSalAtl2s290:443342..466882 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005405 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005405EMLSAG00000005405-688171Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000023576EMLSAE00000023576-732504Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023577EMLSAE00000023577-732505Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023578EMLSAE00000023578-732506Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023579EMLSAE00000023579-732507Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023580EMLSAE00000023580-732508Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023581EMLSAE00000023581-732509Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023582EMLSAE00000023582-732510Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777725auto777725Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005405EMLSAP00000005405Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005405

>EMLSAP00000005405 ID=EMLSAP00000005405|Name=EMLSAP00000005405|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=340bp
MNELDPLRAEAEQLKNAIRDGRKAACDTTLAQAAGTMDPIGRIQMRTRRX
LRGHLSKIYAMHWGAESRNLVSASQDGKLIVWDSYSTNKVHAIPLRSSWV
MTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYNLKSREGSVRVSRELPGHTGYLSCCR
FLDDNLIVTSSGDMTCALWDIETGQQTTTYTGHTGDVMSLSLSPDSRTFV
SGACDASAKLWDIRDGMCKQTFPGHESDINAVTFFPQGTAFCTGSDDATV
KLYDIXADQELAQYSHDNIICGVTSVAFSKSGRLLMAGYDDFNVNVWDTL
RVERAGVLAGHDNRVSCLGVTDXGMAVXTGSWDSFLKIWN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s290:443342..466882+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005405-701252 ID=EMLSAT00000005405-701252|Name=EMLSAT00000005405|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23541bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s290:443342..466882+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAGGCCTTGAGTTCTCCATCCATATATTTTTCAAATTATGAGGTTTATCA TGTCATTTTTCGGATGTTTATTTTTTTTACATATCGACTGTGCTTATAAT TAACAATTTTAGAAATTCTAAAATATGCTAGGGCGTGTAGAAGAAAAGGT TAGGAAAGTAGTGTAGAGGAGATAAGAGGGAGGAGCACCGTAGGTGGGCG GGGTGATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAAGAGGAGAAGGAAGGGGTTTG AGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAGGGAAGGAAGGAAAGAGGGAAGGAAAG AAGACAGAGAAGAGAGTACAGGTTGGACGGAGGGTCGGAGGGTTGGTGGT GCGAACGTTTGTGATGAGGYTGGAGGTTTAGGAATGTGTGTTGACGGGAG AGTGTTGTACTAGATAGAGGCAAGATGAATGAGTTGGACCCTCTGCGTGC GGAGGCGGAGCAGCTAAAGAACGCAATTCGGGTAAGTTTGTTGAGTGTGT GTTGGACGTGACTGGATCCTGAGTCTGTATTTTTTCTCCTCAGGATGGAC GAAAAGCAGCTTGTGATACGACTCTGGCGCAGGCAGCAGGGACAATGGAT CCAATCGGMCGCATTCAAATGCGGACGCGGAGGYCTCTCCGGGGGCATCT CTCCAAGATTTACGCCATGCATTGGGGAGCGGAATCGAGGTGGGTGTGGG GTGTGGAGGGTGGAGGGTTTGCTCTGGGCACTCATGACATGTCTTTCTCT TGCAGGAACTTGGTGTCTGCTTCTCAAGATGGAAAGCTGATCGTGTGGGA TAGCTACAGTACAAATAAAGTGCATGCGATACCTCTGCGATCTTCTTGGG TCATGACTTGTGCTTATGCTCCATCAGGAAACTTTGTTGCTTGTGGAGGA TTGGATAATATTTGTTCCATTTATAAGTAATATAGCATTTTTCTCTCATC TAATAGAGGATTGGCTTCAAGGGCTCACTCCTACTTTTTTTCCACTAACT TTGCAACACACTTTTTAATATTTCATGTACATAACGTACCTTCAATTCAA TTTCAATTATCAGGTTGTGTGCGAGGTGATCCACAATACAGTACATTTCA ATATATTTTACTAACTTCTAAAACCATTGTAGAAACGGTAGAATGTTAAT TTTTTCACTATTATTTTTTAAAACATATTGAGTATATATGTGAATGAAAA TAATCTATATATTTCAAAATTCCATGAAATGGCACTGCGTAATGTTATTT ACGAGTACTGACATTGTGGAACCTATTAACTTTTGCAATGCAGGAGATAC ATGCCTTATGACCCCTGCATGCAACGTATTAACTGATAATATTATCAAAA TCATGTTTCATAATTGTACATATATCATATTAGAATGTTAAGATAAGACA AACTTGAAAGGTAAATAAGCTTAATGTTTACTATTAACTTGTCACATCTG GGTAATTCCATGTCAATTCATACGACTAATGTAATCTTGAATCACATTTT TGATTAATTTTTTTAAGCATTTCTTTTAAACTATTAACACTAGACTCTAT ACAAAATTTCTAGACAATATCTTTATTCATAGGAGATATGAGAGGATTAA GGATTTAAACATTCGAGTCTGAGATCAGAGTTAAAGTCATTTCTTGAAAT GCAGTGCTATAATAACGGTTTTGTTAACGGAGGGCTTAAAAAGCTGCCCC AAATGACTGGATAGAGTAGTAAATCCTTTTTTACATAATTTAGGAAGACA AAAAGTACGGTTGAGGCTGTCAAATATATAAAGTCACGTGTTCGTCTAAA GTCTTCTTACAACTCGAACTATGGTTAACTTGACATTAGGGACAGACAAT TGTCTAAATTGTGGTTGGCGTAAATTTAAACGATATATACATGCTCTTAA GACCGATAAGCTAAATAAAGAAACCTGAAAATAACGTGGTTACCCAGACA ATATTTTGGAGTAGATCAGCTTAGCAGTTATGATTGTTGTATTATGTCAA CTGCAATAGAAGCCGTGAGAGGAAGGCGATAAACTCGCATCCCAATCCAA TTTGAAATAATATCTTGTACGTTCTAGGTTGTATCTTGTACAAGTCTACT ATTAACGTTCTTATTAATTTTTCCTCCCTATTTTGAAAAGTATCAACGAG CGAGGACTGCTATTTGWGCTCTGTATTTTATGATCGGCCGATCTTTTTTC ATCACACCCTCCAATGATAACTAAATCATTGTTTTCGTTTTCCAGAATTA TGATAACAGCTTTGAAAAATAAAAAAAACAGCTCAGACTTGAAACATCTC GCAAGCATTCTAGCTCATATTTTATACAACTCTACTGATAAATACTACTT CTGAAAAAAGATATTGGGGCCAGGACATATTGTGATAATGCAACTGGAAG GGTATAATATCTTTATTCTGATTTAAAATCTTCAAATTTGAAATATAATG CATTTTCACATGAAGTCACAATGACAATAGACTCTGTCGTGTAGTTATAA TTTTTAGGTATTTAATTTAACCCTCTTGTAGTATTTACTTGTTGTGCACA CTTTAGACTTAAAAATCAAATTACCGGCATTCTAAAATATTACATACACA GCCGGCATATTTGAAGTTTGAGATAACTTATATAATCCTTAATTAACTAA CTGTTACCTAATTTTTCATTGAAATATTTATTTATTTTAAACGTAAAATT GTTTTAAAAAAATATCCGATATACATGTCATATAGAAAAATATATTTTCC TATGAGTTTTAATATAGCTTATTCGATGAACTCAGCGTCCCTAATGTTAG ATTTTTTCTCATCACAAGATCCATCGACGGATGACAATATCAAGAGTTTA ACCTTAATATCTCCAAAACGACCAGTGGCAATAAAACATAAAATGTATTT CTTGTTCCATTGCAGATCTCGAATAAAACCCCCATATATTTCTCCTCACG CTTAGGGCATCACATCTCGTTATAAGATGTACAGGAGAATCTGGTTCATT TCCACACAATCTGCGTGAGTCATCCTCCACCAAGCATATCCTCTTTAAAT GTTTCTTCAAAGGAATATGACCAGTCACAAAACTTTTTTCAATTGACAAA CAAAACCCTTTTAATTGATGTTCTTCTCTCTTTATATATTTTCATCTCTC ACAAAGGCGAGGAAAAAAGTACTTTGTTTGCCGATAACTTGGGTCACKAA GCCACTTGTTCAACCAGACATAATTAATTTTTTTCCTTATTTCATTCTTA ACTGTGACCAGTGGGACTTCCAATGTAGAATTTTCCGTCATTTTACATCC CATCTTGTCTAGTGCATCTACAGATTCATTGCCCGTATTATTGTTATGAC CTTTTACCCATGAAATGTTTACATAAACTTTCAATCTGCCTATCTCAGCC AATATCCCTTTTGCTATCTAGTAAAGGTTCCTCTTTTCTTTTGACAGACA ATCTATGGCAGTCATACTATCAGAATGAAAAACCATCGAACATGAATGCT TTTCCATTCCAACAAGAGCTCGCAATGCTTGTAAAATTCCTTCCAAACCC GTCATAAACTGTTATACCTGTTTAAATTTTCATAGTCGCCGAGAATAGAT TCGTCCCCACACGAAATACACCATCAATACCCAACCTTATCTTTAATTTT TGATCCGTCAGTGAACATATTTACACATCGAGGATTTGCAGATGCCCCTT CCTTCATAGTCTCAAAGGAAGGACAGTTATAAGGTTTATGATTATTTTTT CCCAAGGGTGCATCAAATTTGTAGAGTATTTAATCTCAATCTTGTTGGAG AAGGGGCTGTCCTCCTTATGTACTTGACTGTACAATCCATGTGACAGGAA CATCATCCAAAATTCTTAAACTGGTTGTCATCATATGTCTTTTAATGCTA AGGTGTGAAGGTTCCACATTAAAATAATCTCCATTACTTTTGTTGGTGTT GTTCGCATAGCTCTACACATCAAGATCCCTTTGAAACTTAGTGATGTTTC CCTGTTTTTCTTAGACCCGAGGTGCCCATATTGCTGCCCCATAACATACC ACTGATTCCAAGCATGCCTCTCGAATGTATTTGATGTCTACAAGATCGTA GGCCCCATTGGTATCTAACTAAGTTTCTTGCAGGAAATAATACCTTTTAG TTTTTTTGACGCTATGGTCAACCTAAGGACCCCCTCCCATTCGTCGGTGA ATTATAACACTAAGGTATTTGTATTGATCCCACTCTATCGCTACATCATT TATTTTGATCTCAGGAAAACTTGCTCAACGTGCCCAGGTACATAACATCC CCTTAGTCTTTGACTCATTAAACTTGAGATGCATTTGAGATATGCAAAAG TTCATCTCGCTTATTCGCTTATGAATTATATCACCATTGAAGTCAGATCA ATCTCAGTTATCACCAAGGCTATGCCATCTGCATAACTAATAGTAAGTAA TGGGCCCTGCCTAGGTTGAATAATGTGCCGAATGGTGTAGTTCCATACGA ATGGTGATAGAATTTCCTTTCAGGACATCCTTTTGATGGATTGAAGAAGA AACTCACTCACTGTTGAGAACATGTGATTTCTCTGTTTAACTAGTAATGT TTGAGCCATTTAATTGTTCACGTATCAATACCATTATTTTCCTAAGATTT TTCCATGGGACTGTAAGGAAGGTTGACGAATGCTACCTCGATGTCGAAGA AAACGATTATGGCATGCTTTTGATTAAAAATGGCACTTARCAGCCACTTT ACCAATTGCTGAATTTTGACTTTCCCCTTTGGAAACCGNGATTATTTAAT TGTACTTTTAGCTTAAACGATTTGTTATGCCAATACACCACTCCCTCTAG TCCTTTAACTATTGTGTTCTCTAGGGTAATTGGTATGTATGCTTTGGGAT GTGTATAATCATAATTTACTGGGTTTTGGTAAGAAAATGACACTATCTTC GCTCCATAACTTAGGAACAGAGGAAAATTTAAGTTATTACTTAAATATAA AAGCTATCCTGTTAATATATATATATTAATATGTAAAAAAATAATAGGGC TAAGTCATCAGGTCCAAGGTTTAAAAAAAAAAAAATTGAATGAGCTAAAT ACTTCCTCCACAAGTGCATTATTTATATCATTTACCCAAATGGCATGAGT GTTCCTATTTGTCTCAGTCCCTTCATCCAAATTTTGTTTCTGGCCTTGTT TATAAAGAGTAGCATTGCTAAAATGCATTTGAGGAGTTTTCTTTCTTTGT AGGATGCCCAATCTAGGTTTAATTTTTTCWTTTTGTCGTTTTATTSCCGC CATTATATGCTGTCGTGTCTAATTCAGTACATCTCTTTCTCCAGTGATGG CGCCTCTCCAAGTCTATTACTCTCCTATATTATCGCTTGCTTCCATAATA AYCAATTCTATCCTTGGAACTCAGTGTTTTGTGTACTTGTCTTTCAGCCC TCTTGAGAGCCATCCCCAAATTGCTTAATTCCCTTGTCCACCACGGAACA TTCTTGCTCTGGGACTTTATTATCGGAGGTGCCACTGTGTTAACCGTTAT TTTAATAGATATGATGACTTCAGATGGAAGTTATTCTATATCTTTTGACA AGGTCTTAAAAAATTATATCTGTTGAATTTCCGTCCCTTCACACGAAAGT ACAAGAATTTATTGGGGTTTTTAACATTATACCATCGATTTGTTCCTGGT 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CACTGGCACATCATCCAGTACAACTATAGTACTACTGGCACATCATCCCC CCATATTTTTTCCTTCATCAACTGTAATACCTCGTACCTGAAGGCTATAG TCTAYCGAAGTTTTTTGAACCTCCKTGAAAATGTATTTTCCAGTTGTTGT TTCATGCATGCTTCAAATAATCCCAAATCTTGCGTTATCTGAACAAGTCA CAAGTCATTTGCTGCTTCTATCAATCACTGATGAAGTTACCATTAGTAAA CGGCTTTTCTCGTTCTACCATCTTATATACTATTTTGTAACTTTTACGAG GGATAAATTCATTTTCAGCTAACTTTCTCGTGAAGAAGTTTCTTTGAGTT TCTAAACCACAATACAGGTGTGCGCGTCTAAACCTGAACACTCTGAAATT TTTAAAAATAGTAAAATAATTGTATAATTTTTTACGTGGCCGACGAATTA ATTTATTTAACATGAAAGATAAGAGTCTTAGACATATTTCTATTCAATAT TGCCGCCAATGTTCTCCACTACCAGCTCTAATCTGGACCGGAACTAGCTG CATGACTTGGTGATGAAGCTGTGGTCGAGGTTGGTTCAGGTATTCTTGAG GGCAGACTTCAGCTGGCCCTTGGACTTCTATTGTACTCCGGACAGCATCC CCTTTAAACCCCCAAACACTGCTAAGTCAAGTGGCGAACAATCAGGCGAG TGAGGCGGCCAAGAATTCCGATCGAAGAAGGCTGGAGTCTCTATCTGAAG GGAACACTTAAACGATAAACTATTACTTCATAAGACTTTGTTTGTCACTG TGTTTGTAAATAATTATTAAATTGTTATGTGCTACATATATCGAGCAGCA CGCTCCTTATTACATATTATGATTCTTCATCTGGTGGGGGTCTTATGTTG CGACCTATCTAATGTGTATATATAAAATGAACAGGTACTGAACATTAAAG 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GTTAAAATATGTTTGTCTTGCCTAGCAGTCGGTACGATACTTAAATGGGA AATTCTAGCAAGCCTGATTACATGATGGCCTAACTTTGATTAGTACTTTA TATAAATTTTATTATAGTCCTACTCTTATATTTGTATATTTATAATTATG AGATGCCTTTGTATGAACCTGTATAATAAACTAAGTTGTAAATACTCAGT CATCTTGAGAACTATACATGCCCAGTAGGCAGTTCGAATTGAATAATACT TCCATATTTAATATTTTTTCAACTGCAATTCAATTTAATTACATTATATT CTACAAAATGCCTGGCAACAAAGATTCATATGGTGGTGTCAAGGCTAAGT TAACGATAAATATAGCCAATTGCCAATACTGGCTCGGAAAACTGGAGAGC TTTGAACCATCTGCAATATGCACCAANGTTCTAGAACATGTTGATTAATC AATATTTAAAATGGAAAAATCATAAAATAATCTTTTAAACTCAACTCAGT TGATGTATGAATATGATTTGTGTACTGGGGAAGAATTTACATAATAGGAG ATCTAGCTACAAAAGTTCATGAACACTACCAGAAAATTATATTCAAGCTA TGGTAAATTATGTCAAAACATAATCTTGTAAATGTATCCTCTGTATGGTA ATCTACAGACTCTGTTTTGTCAACCTAGAAAGAAAGGACCCGTGAAAGGA CGTTTGCTAACAAAGTAACGGATGTTGAGTCTATTTTTCAAAAACTGAAC TAAAAAAACAGCGTTCATAAACTGACTGCTAGGAACGTTCCCCTTGCTTA CCGTATATATGAATAGTATAGATGAATTAGAGTTTATGGCTTRAAGTCCA GATCAGCCATTGAACGAACTCGAGATGTTTTGATAAGATGTACAATTAAT AACTCGTAAAAAGTTTAAATTTGGAACCAATGGTATTTCTGTGACACAAC 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