EMLSAT00000006195, EMLSAT00000006195-702042 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006195
Unique NameEMLSAT00000006195-702042
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s339supercontigLSalAtl2s339:168354..194952 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006195 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006195EMLSAG00000006195-688961Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000027027EMLSAE00000027027-735955Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027028EMLSAE00000027028-735956Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027029EMLSAE00000027029-735957Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027030EMLSAE00000027030-735958Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027031EMLSAE00000027031-735959Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027032EMLSAE00000027032-735960Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027033EMLSAE00000027033-735961Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027034EMLSAE00000027034-735962Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773749auto773749Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006195EMLSAP00000006195Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006195

>EMLSAP00000006195 ID=EMLSAP00000006195|Name=EMLSAP00000006195|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=512bp
MATLEVLQSGLNSLYNMGQGAMRPLDGFTHSRFLPGKEVNYRQEEKKILD
SVLGPDVYDKRIRPSGLNSTDSASLVTVNIFVRSFSNIDDVKMEYSFQIT
LRQQWNDGRLRFKDKLLSMEGIVIDFDFNIIPFYPDAASSGGLFQKDKIR
YLTMTDSSKVWMXDTFFXNEKIGRFHNILQDNLYVRVFPNGDVLYSIRVS
LTCACSMHLALFPLDKQTCNLDVASYGWTMNDLIYQWKETNPVQMVANLS
LPGGFKLDGFTNHNCDVKXATGSYSCLRVEITFARQLSFYVLTIYIPCFM
IVLVSWMSFWIDHKAVPARVSLGITXLLAMSTTQASINSSLPPVAYTKAI
DVWCGVCVTFVFSALLEYALVNYASRSDAQRAAKQKEAKERELEQCAFST
ERIEDGGFPLSMVNRLPYDRTENMSHSHFLFKDPLMRRIEGAPMIPPGGL
LQNEIPLQVRRNPISDWCQRFQFRAKKIDVISRFLFPSTFAFFNILYWSY
YLTQEQQTSKKK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s339:168354..194952-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006195-702042 ID=EMLSAT00000006195-702042|Name=EMLSAT00000006195|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26599bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s339:168354..194952- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCAACCCTCGAGGTATTACAAAGGTAGGATCATTTTTCAAATATGAC TAAAATTTTGTGTTTTCCTGGTTTATTTAATCATTGTGCTTTAATCAATG TGTTGTGTACGAGTCTGTAATTAATTCACAATGGCCACGAGGCTGACCCG ACAGAAGGTCCTTCTGAAATTTATCAATTCTTGTACGCACGTTTCAACCA CTTATACTAACGAGAAGATCTTCCCCTTAGRGCTGGCTTACAMCAGCCAC AACAACCGAGTGCTGGGTCGGAGTATCAAGGAAATTTCCTTGAACGAGAG CAGCTTGTTAAGAAACAAAAAAAAAGGCTTCGTTAATGGCCTTTGCAGTT TTACCTCGTACTGGATGAAGACGCCCTTGATCTTCATTCCTAAGRGTATG AAGAACAATCAACAGGTCTATCTGGACATGTTATTGTCCCAAGTACTCCC CTTGATCAAGAAACAGAACTTGAAATGGTTTTATTGCTTCCGGCAGAACG TGGAACTTTCAAATACTGTAAAGTCTGTCCAAGAGTGGTGCGAATCTAGT TTGGAGCCCTTTTGGAGCAAGAATTTGTGTTCTTCTTCTTCCCTAGAATT CAACGTAATGTACTTCTCCATATAGTCCATCATGGAGAGGAAGGTTAGTG TGACTTCCTACCGCAGTGTCGTAAAAACCATCATGGTGTCTCATAGGATA ACATGTCGAAGAAGACTATCCTTACAGCTTTTAAAGTAGCTACGAATTGT CTGTAAGCTGTAGTTGCCACAAATAGTGGCGTCCCTCTGGAATAAACTGA CATTAATTTTATAGGAAGTTTATAGGAAGTTAATTGAAACAGTGTAGATG GATGTTGAGATATAAATATTCGTGTACTTTCTTGGCTGTTGAGTTGCCCT GTCACCCTGTATATGCTTGAGGAAGAAAACAATTAGATTGTCTTCATGAA AATAGGATAATACAATTTATTACACAATTTTAATTTTATATATTTATGTA AAATCATCCTGAAAAACAAACGTTGTTTTTTTAAAGTCCTTTTTTAGAAA GGGTTCTTTTTGGATCATCAGAACAACTCGGTTTTTATTTGCTTTAATAA AATGGTAAAATAATTATTCATTTTTGGAAATATTTCATTATCAACAATGT ATTTGCTTATAAAGAGACATAGACATATGTAGTTCAATGCTGATTTGATT TCAATTATAATTGGGGTACAAATCACTCGTGTTTCAGTGTGGATTTTTTT TATAAAATATACATTCAACCAAATAGATTTTCTGTAAATTATACTCTAAT TAAATTTAAGAAACATTTTGGTGTGCTTCATGTATTTTGCAGGCAATAGA TAGGGGTTTTTTTCTTTTTTTATAGTACGACTATATTTCAATTTATTTTT ATATCATTAATCACATATTATGTGAATATAAACTCAAACCCAAAACAGAA CAAACACACACACACAAAAGGAAATAAGACTCATATAAAAATATCTTTAT ACATTTATCAATAATTTGGACATAATTATCAGGTAATGGCGTTCTAGTGG ATCTGAATTTGCATAAAATGATTTGAACTTGTATGTTTATTAAATAAATC TATTTTCGATTATATATAATATTTTAAAATTAAAAAAAAAAAAACAACAC ACACTATAAAAAAAATACCAGACCTTTGTTATTTCTTCACATTCAAATAA AAAATGTCTAGCCATTTCCCTTGACACTTTAATAAAGAAGCAATTTGTTA TTGGTTAGTCTTCCCATACACACTACCCAGAGACAAAATATTGTTAGATA GTTGTTTTCTTGATAAGGTGTTTGTATAATAGATGACATGAGTAACAACC TACGTCATGCTTAAGAACATAAATATTTTAAGTCATACCCATTATGCACT TGGAGATTTTTAGATATTTCAAAACTGTTTCCTTTTGTGTTGAGCCTTAT ATTCATTTTGGAAATAGAACGCATAACTGCATAATTTTGTGTTCTAATTC TTAAGCCCTCTCTAAAATATCCCCCTTTCCCTCTCAAACAACACGTTACA CAACTTATACTAATTAAAATAAAATAATATGGTTATATTTTGAGGAGTAG AAAAGAAGGGTATGCAGAGTGGTAGGATTTAAAATATAATACTTGAAGAA AAAACACACACAAAAAAGTTGATAACAAAAATGCACTCAACAAAATTCAA CTTTGTTGTCCCTTTCTGTTTTTGTTTTCGCTATTATTGTTTTAGAAAAT GAATGCAGAAAATACTTCTATAGGTATGCATGCATATATAAAATTAAATT AATTGAATATTTTATATTAACGACATGCCTACGAAAGCCATGTGTTTTTA ACGATTCCTTTTCACAGCAATCTTTTTAATTCTAAGCATGTTCTCGCGTA CTAGATTTTTGGTAGTTGGTAATATGAACAGTTTTTTTTTCATTCCAAAG CTCCTTTCATTATTCTTTAATGACTAAGATAATAACATGCACACAGATAT TAATACTGAGGATTGGTTCGGGAGTTATAATTGGAAGTTTTTGTTAGACT CAGCGTAGAGCTGAAAATCTTCAAATTATCTGGGTTATCAAGTTGATTTT TAGGATTTTGAATATTGAAAGTTTAAAGAGTTTAGAACCCTTAATTATGT ATATACATATCTTATATGTAAGAAGATTGTAGGCAGAGGGATTTTATACA AGTACTCCACTAATATGGATGGTTTGGAATCAATACTTATGTCATTATTT AGAAGTAAACAAGTAGGCAACCGATTCATTGGTGGACTTTTTTTTTCAAC TAACTTGTTCTAGAAAATACTGAAATAAAATAACACAAAAGTTTAAGACT 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