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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s339 | supercontig | LSalAtl2s339:168354..194952 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006195 >EMLSAP00000006195 ID=EMLSAP00000006195|Name=EMLSAP00000006195|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=512bp
MATLEVLQSGLNSLYNMGQGAMRPLDGFTHSRFLPGKEVNYRQEEKKILD SVLGPDVYDKRIRPSGLNSTDSASLVTVNIFVRSFSNIDDVKMEYSFQIT LRQQWNDGRLRFKDKLLSMEGIVIDFDFNIIPFYPDAASSGGLFQKDKIR YLTMTDSSKVWMXDTFFXNEKIGRFHNILQDNLYVRVFPNGDVLYSIRVS LTCACSMHLALFPLDKQTCNLDVASYGWTMNDLIYQWKETNPVQMVANLS LPGGFKLDGFTNHNCDVKXATGSYSCLRVEITFARQLSFYVLTIYIPCFM IVLVSWMSFWIDHKAVPARVSLGITXLLAMSTTQASINSSLPPVAYTKAI DVWCGVCVTFVFSALLEYALVNYASRSDAQRAAKQKEAKERELEQCAFST ERIEDGGFPLSMVNRLPYDRTENMSHSHFLFKDPLMRRIEGAPMIPPGGL LQNEIPLQVRRNPISDWCQRFQFRAKKIDVISRFLFPSTFAFFNILYWSY YLTQEQQTSKKK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s339:168354..194952- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006195-702042 ID=EMLSAT00000006195-702042|Name=EMLSAT00000006195|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26599bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s339:168354..194952- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCAACCCTCGAGGTATTACAAAGGTAGGATCATTTTTCAAATATGAC
TAAAATTTTGTGTTTTCCTGGTTTATTTAATCATTGTGCTTTAATCAATG
TGTTGTGTACGAGTCTGTAATTAATTCACAATGGCCACGAGGCTGACCCG
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TAGAAGTATTTAGTAGTTATATCTCATCCGAAAATTACAAATTTTAAATT
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GACTGCAAATGAATTTCTACGTCGAGCCTATTCTTATAAAATTGGTAAAA
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GATAGATGTTAATGCTAATTCTTGTCATAATAGCAGTAGCACATATTATA
GTCGTTTATCCCATGACGAACTCAAAAGTATTAGCTATTTTTCTTTGAAA
AATCTTGTTTAAAAAAAGTGGACGCTATACCTGGTACAATATTACATTAT
TTATCATTTTAGGGGAACACTATTAATAAGCTTTTGGTAGATTTTTTACT
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ACGTTATTTTAAAACTGTTTTTGAGCGATAAAAATAGTTGTTTAAAAGAG
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TCTTGATGATGAAGGGCGTGTTCATTGTGTACCACGCTGTCATGACTGCA
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ACATCTTTCAACACCATACCCATACTAAATGGTCTTTCTCAAGTTGTAGA
CAGTCTGGATGGAGATGGAAGCGTCTCTCTTTACTTCTCAGTACTGAAAC
AGGCGTGAAGGAGATCAAACAGTCGTTGCCTTTTTAGTTTTTTTCTCCAA
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TTTCAGCTGTCGTTTGTTTAGGTAATGAAGTCTCGTACAAAAAAATAACG
ATTATAAAACCTTTATTAAATGCTATAGCATGTTTTGGGTCCCCACTTTG
TACTTATTCAACATCATAAAAAGTTCTAATTATTTATTCATCAACAAATA
TAATTAGTAACATTTTTTGAATTTCTAACTCAAATTTAATATTATATTTA
TTGTTGCAACCATCCCTAGTTATTGAAGCAGCTGCAACATTTGACAAGTT
GCATTCAAATGGAATTTGTAGTATACTAAAGGCGAGCATACCCTATAAAT
ACGTAGATTCAAACAATGAAAATGCTCTACTATGCATATGCCATTTGTGT
GTTTTGCCATATAAAATAACTAATTCCATGGTTTTTATCATCCGGCCTTT
CATTTCAAAATATATTTATCCTGTAATGTTGTAAATTATACAAGATTGTC
TATTATTTGTGTACTTCACATGTAATAAATAATAAATTGGATGTCAAATA
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GAGATTTACAGTGAAATATTGAAAAACAAATTAAATTTTCCATACCCTAT
TTTTATTTTTTTTTATTTTTTTTGTGACCTGCGTTTTTATCCTTCCCTCT
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TATGATTATTATTTCTCACTCCCTTTTCTCCCAAACTCTGTGACAACTTT
TTCTTTCTTTAACACCACTTTTTAGTAGAATCCATTTTGCCTAATAAAAA
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GAAAATGGACGTTGTTTTAAAGGATTAAGGGGAGAAAAAGAGAAATATGG
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ATCTTTTACAATTTTCACATGATAAAGGAATAATGCTATTATAAAAATAG
ATAAAACTGAACAACGTACCTATTGAAAACCCCCATCATAAATCTTCTAA
AGGTCATTAACTACTTAAATCTATGACAAAGAACTCCCGAAGAACTCTTG
AACTAATTCATTCTTTGCTCATAATCAGCTAGTTTTCCTATTACTGAATA
TCTTTGTAATGCCTACCAGAAAATATGTATTGATTCCCAACTAGGCCCAA
AAGAAATTCCATGTTTCTACATCAAATAGGTTGAAAAATTCTCTAGATTA
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AACACCATTTATATATCTGTGCAATATTGAATGTTTGCACTTCCAAGATA
AATTTACAAATACGTCATTTGCAAATATCTAGCGGCGAGGATTTTTATTA
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AGAACCTACCAATTTAAAATTATTTTTGTAAGGAAGACTGCACAACAAAT
TTTTGGAAAACATTTGTAACAGTTTACAAAATTGAATTTGAGCTATAAAT
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TGACTGATTTAATTATTTCTATTAAATTTTGTAGCTATAGTTAATATGAT
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GGAAAAAGAAAGTAGCCATTTATCATGACAACTCAGGTTTATTTATTATT
TTTCACAACATACGATATTACCTTGGAATCTGAAGTATGTATGTTTTTAT
GATTTATAAAGCCTCTTTTCCTGCACTAAACAAGTAACCAGGGATGATAA
TTGAAGCAGGGGACACATTAATGTGCGTATACGAGACCTTTTTTCTTCAA
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ATAGAGGCTCTTTTATTCCAGAGAAAGAGTCTTTGAATAGGGAATTGAAA
CCTAAAGGAGTAGAAAAAGAAGATGAATAAAATAAGATTATGTGCCAAGA
AGTTTATTGAATAGGAAGTCTAATGGCCTTTTTTTTTTAATAGATACATT
AAATCTATGTGTAGATTGGGTAAAGAGAGGTTCTGTGATTTTTCATCAAA
CTATTTCTTCCTTTCTCCTTCCTCTCAAGAAAATAATATAATATATATGT
GCACTGCATATATAAGAAAATATAGATATAAATATGGAGATCGATTTATC
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ATGTACAAAATATTTTATAATAAAAATTCATGCTGTAAGCATATATATAC
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AAATTGTCTTTGATGTGTATCAGTAGTATACATATGTGCTCGTAAATGCA
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TCCATTCCATTCCTTTCTAAGTTAATCAATCGCTCCTGTCCTGGAAGTGA
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GAACAACTCCCATCAATTATTCTTTAGGTAGAATTGATTTTGGCCTTTTT
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CGAAAACACGTAATTTTGAACAAATTGATATCATAGATATTCGTACTTTA
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TTTTGTAGAAGGTCTTCCTATATAAAAGTACGTTTTTTCCGAAAAAAAAT
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GAATTGGTAAGACTTCTAGAGTTTTGGAGGTGTTTTTGTTTCTTTTATTT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTAA
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AATGATACTTCCAGGCGGCGACAGAAGGCCTAGCACCCACTGCAAATGTA
GTCCTATGTCATTGCGTCCCAATCTGGGCTGACAGTGGCTTTGAGTACCT
CAGTGTTTGGATAACGGACACTGCAGGCTTTCTCCTCGACATGCGCTTAA
AAGATTTAGTCAAGGAGGTTTGCATCAGGACTGTAGTGGGGCTAAAAGTG
TCAAAAAAGGGTTCAAAAGAACTCAAAAGACTAATTCAAAATATTCTTGT
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TTGTGGGAAACTCCGAGATCTCTTTCATGAGTCCTCATGAACGTAAGGAG
ATTGGTCTGGGCTTTTTTAGTTAACTCCTCCGGGTCCAGTTTGAACTTTT
TGAAGGAGCCCTTCTTCCTCTCCAACGTTTTGGACTTGCTGATGGTGACG
CCGAACTGCTTGGAGTGTGCGAATGTAAATTTGTCAATCACGTTCAAGGA
TTCTCGTTCTCGACTTGTACGTAAGCTAGAGAGCGCATGTGTGTTTGTTT
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AAACATCCGGTCAATATTTACGCTCAAGAAAGCAATATATATCTATTATG
GTCGACTGAAGATAGGAAGTTCTCTTTAAAAGGGTAATACAAATATGAAT
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ATTTGTATCCTTTATTTTTGTTTAAGGTAAAGTCGATTCTATAAAAAAAT
TAGCCCCATGTTTTTGGGAACCTAGGAAACATGGGGGTGTTTATACAAAA
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ATTTCCATCGAGAAAAACATATGATTAAGTTAATAAGTCAAAATTATTTA
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AGTAAATTCATTATTGAGGACAATTATAAAATCCCACGATTAAATATCAA
TATACTGTTTAATAAGTTGTTTTTTTTTAAAGTGCAGTATTTTACTTTTT
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TTTTCCCATAGGGTTGTTGAGTTGGAGGGGCAGGGGGGGGGGGTGATTTT
CCTTTCTTAGATCTCTATTAAGAAGTCAATGAGAAAAAAAGTTGGTATGA
ACTTTGTTCTTGCGTTACGAGCAATTATTTGTTGGGGCTTTGATGCTTGT
TGGATTTATCCGTATATACGTCATAGTTAGAGTTGTAAAATATATGACCT
GGATGTTTAAAAAAAAAAAAGAAGAGATTGGTAACCTTGACAATTTGAAA
AATATTTGAAAGGTGAGAAGCTTACTTATGATAAAATTGGCTGTGAGCAG
CATATATAAGACAGGAATTACACTGATGTGTTCAACAAGGACTTATAATT
ATAACTTCTCAGCAAAAAATCAGTGTTACTCTTTGTCATTCCTGAGCACA
CGCGCACTATAAACTTAAATGTTCCCTCCTGCAAAATTAAAGTATAGTTA
TCATAATGCAACTATAAAAAATATCATCGATCTCGTCTATGCCATACTTT
AAACAATTTTTGTCATATAGACAATAAGAGAGGTTCATTCAACTTATTTC
ACACTCATTTATTCTATTAACGGAGAAGAAAATGAGGGGGAGGGGGGACT
TTGTTCCATCTCTAATAAACTTTATGAGTATATTAGAAATAATATATATT
ATTATTATTGAAATAACTTCCATTTCCTCTTTCTTTCTCTTCCTTCCTCC
CTTTTCATAAAAAGCCACAATTAGCATTTGCGGTTCCTTCCTTTTCAATG
AAAAATATATAAACGCACAGGATGCGACAACTTAACTTCCTTTTTTATAA
CGGGTATCAATCAGGCTATAAATTTAGTAGCGGGAAATTCGTGGTTTCAT
TCTAGAGATGAGATTCTAAAGTTTTATTACAAGTACAGTTAGGTACTATC
ATGCGTTGGAGTATTGAGGAACGTGTTTTTGTCGTCGAAAATAAATATTG
CCAAAAATTGGGTTAACTGGATATCTTAGCAAATTATACTACTGGGAATT
TAGCTCTCGAGGTTTATTCTTAATTGCTTCAATTCTTAATTATCACGAAA
CGCTTTTTTCAATTCATTTCCATTTTGAAATTCTTTGAACATATGTATAT
AATTCCATAAAACTGGTTTAATTAAATTTGATTCTATGCAAAAATTCGAA
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TGTAATCGACTCCACAGCTACAAAGTCAGAATTTTTGTTAATTTAATGTT
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AATTTTAAAAAATATGATTAATAAAATTTGTTTTATTGTCTTTTGGAAAA
AGGCAGATATGTTACCGCACCATGTATATTATTAAAAAATACTCAAATCA
GACATATAAGAACCAACAATGGACATAACTATGTTTGATAATCTATATAC
ATAAAGATTCTCTAGCTTCAGATTAATATTTCACTCTTCTATGATCAAAA
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CTTCTCAATGCGTTTTTGTCGAGTTACAGGGGATTTTAAAACGTAACATG
TGTTCAGTTTTCTACAGGTTTGGGGAGCTAAACGTATACTTGAGAGGTTG
TTTTACAAATACTTCAATATTTTTTCATTTTCAAAATTTACAAAAAATAA
TCATTTTAAAAAAATTTCTAAGGATTGCCTTTGCAGACTTTTTCATTCAA
TATGACCACCTTTAGCATCAATCAAAGCCTTCGCACGTCAACGCAGGAGT
TAATGACAAATTTTGTCCCAGGCTGCCAATATGGCAGCTTTCAACGTGTC
TAGCTTTGGGTGTGGAGTTTCGTTGGTTTTCTTCTTCAAAGTGCCCTACA
CAGCAGAGTCCAGTGGGTTCAAATCTGGGGAAAATCTTTGCCTATTTACC
TCTTGAGCATACTGTCCTTCATGACCTCTTTTCGAAGGTGATGTGGGGTT
TTGTRCATGGGTAAAATGCCAAGTCGCCCTTCACGGACCTCTTGATGGTT
CTAGCAGGCACAGAKAAGTCGTTTGGGAGGTGATTCATCGATTTAGTGGG
GTCCTCCTTGGTATTCTTCGTCTGAAATGAACTCTGGATTCTTCATTAAA
ATGTGCCCTCCRCTTCCTCGAGAGGGTTTCTCATCATTCTTCATCCTAGT
CACCTTAAAAACTAGGATCCTGGAGCACTTCATAATRTCCATCATCCTCA
CTATCACAACGTCAGCAACTAAGAGATCTGAGAGGCGCTGCCTTTTGGTT
TCTTTTTCTTGCTCGTCATAACGAGATGATGAAATGTTTTTTTTTAATAT
TTTATTTATGCACAATGCATGACTGAACCCGAATGTCAAAAATAATCACT
AAGCCCTACTATATTATTGAGAAACATTGTTTTAGTATTATTTTTGAAGA
AGTCTCCTATGGAGACGAAATCGATGAAATGATAATGATTCTCTATACCT
CTATGTTTTATTGTGTTGCTTGAGCCAAGTCYGTCTTCTTTAAAATTAAT
GAAAAAATCAAAATTAATTTACAGTACACGTTTTGCTGCCCATGCCNNNN
TGTATATTTTTTTTAGTATTTGGCATATCAGGAAAAAATATTGCACTGAA
AAATTTAGAATTTCCTTGTTATATTAAACGTAACATATCAAAATTTAACA
ATAGTTAAAGTGATGGCTGTTAAACAAAAAGAAGGACCATTATCCTTGAG
AAAATAGGAAAATCCTAAAAACAAGGTGTAAAATATTTTTACTAAGAAAT
CAAACACTAATTAACATGAAAGGTAGAATTTTGGACTCATAACACCCTAT
TTAGAAGCCAAAAAAATTTAGCCGCCTAAAAATGTACAATTTTGAGAGGA
AAGTAAGATTTTTTTCAACTATAATTAAGGTATCAAACTTTGTCAAGTAC
AACTTTTGAATGTTCCAAGCAGAAAAGGGGGGGAGAAGGGATGTATATTA
ATCTGTAAATGAGACATTTTAATGATATATATATATATAGCACAACCTTA
AAAAATAATTGGTTTATTTTAGACTAAATTTTGATCTCTACTATTCTATT
TTTCTTTATTTCATATTGATATAAAAGAAAAAAGCCATTATTTACCTATA
CTTAATGCACCAATTTTGACTTAGAGGAGAGAAGAGTGTGAATGAGGAGG
AAAGTAGCTAGAAAAGTTAATTGAGCGAGAATTAAGAAGGCTAAAGAAAT
TATATTTCAAGAAAAAATCTATCTTATTGGYAATCTTATTATGATGTTCA
TGTTACAAATGAATCCGCAATTTCATGGACGGATTATTTCTACTCCTTTT
GAAGATATGGGAGGGATTGGGAGAGAGGGGGGGGGGGGATTTGAAAGMTT
TGCTTTTACAAATATATATAAGAAAGTAATAATAAGAAAAAGATACATTT
CCACAAGAGATAAATAAAGAATTTTAATTATTTTTTGTGAGTCTTTTTAG
AATGGAAGAAGAGAGAAATATATAAAGGGATTTAGTGACKATCTTTTTTT
TTCCAACTGATTAAAAAAAAAATTCCAAGAAAAAATATATTTCTTTTGTC
TTTAGCTTCATGTCAATTAGGATATAATGACTTATGTATACACAACTTAT
GTTTTTATTGATGACGTTGATTTTGTTAGTCTAACAGATCCTTTATAACT
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GCACGTGTCTCACTTGGAATCACAKCTCTTCTGGCCATGAGTACAACTCA
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TACGCCCTCGTGAATTACGCCTCTCGGTAAGTACAGCACAATGACGATTC
ATGATATAAATCAGTCACGTTTTACTTCTTTATTTAGGTCGGATGCTCAG
AGGGCTGCCAAACAAAAAGAGGCCAAAGAAAGGGAGTTGGAACAGTGCGC
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TTTAAGGATCCTCTAATGAGACGCATTGAGGGAGCTCCTATGATACCTCC
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