EMLSAT00000007597, EMLSAT00000007597-703444 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007597
Unique NameEMLSAT00000007597-703444
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s439supercontigLSalAtl2s439:213145..230675 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007597 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007597EMLSAG00000007597-690363Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000033402EMLSAE00000033402-742330Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033403EMLSAE00000033403-742331Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033404EMLSAE00000033404-742332Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033405EMLSAE00000033405-742333Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033406EMLSAE00000033406-742334Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033407EMLSAE00000033407-742335Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774626auto774626Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007597EMLSAP00000007597Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007597

>EMLSAP00000007597 ID=EMLSAP00000007597|Name=EMLSAP00000007597|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=575bp
MCFRSHQASRQCCQLISGSMSLWPGITRLPILEGEVSHVEIPRTNSSLGI
TIVGGADTPLVCASLRKMSSVLRLGVYRERIEKYGARPNSTGSSNVSRQS
MKRKKLKHVNESKDEEGLFSFTLERLPGKQLGLRLSGNCSETGIFIVDIQ
KGSTMGADGRLQIFDRILYINGTDVRNAGIAQASALIQNNDKVSLVVVRR
KPTDPVLYNYDKENSSTSENTSSNGSCHTRSKSAPAPMHNDRLGTVLSNK
NSNQEENGQCEVASSTEELDEPYYDNLDGDDLMGIYETLDRKRQESKEIA
KSHSMEALETPDKKNEALKARPKIPCKTSTQSQQSKRQSFHEIPAPSISN
ALSVEKSPSFGEDLSNTDGNSSMAAFIKRALRIQGPCLLQKTVIVKKNPR
ESLGMRIGGGIGSNEGDTPIYIANIHPHGCIGKSKQMKVRTTINLSQVSL
GILDGPETSFGASNFIPSWMYWQKMPRELQYPKTVILHRREHASWGFSIV
GGTDSNGRPTEPIHVLFVVPDSPAAKDGRIRCGDRLLAVDGHTLENIPHS
VAVGMLKQTSTRVVMEVVSWMGTEL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s439:213145..230675+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007597-703444 ID=EMLSAT00000007597-703444|Name=EMLSAT00000007597|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17531bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s439:213145..230675+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGTTTTCGATCCCACCAAGCAAGTAGACAATGTTGTCAATTGATTTC AGGATCAATGTCACTGTGGCCAGGTGTCCTGTCTACCATTGCTCAAGTAA CCTCTTTAACTTATCTCCCGTGTACAATSCAGCCACTATAGGTCTCTTGA AGTACTTGTAGAGTGAGGTGCATACACTGAAAAAGTATTCCAGAGCGAAA TCAGGAGATATGGCGTGCACCACAACCAAATGCAACTGATAATTAAAGCA AAAATACGTATGGCACCTCTCTCAGCAATTCTTTCTGCATCTTTGCTGTA TGTAGCCCAATGTCTCTCAACTGTGCCAAAAAACCAGCTGAGTCAGAGAC TTGGCATCACATTGTTTGATAGTGGTCATTGAGACAAGTCGCTCCTTTAC ACTGTTGCTCGTGTCTACCTAGCGAAGCAGTATAGATATATTTTCGCATC CAGTGGGATCCTTGGTACCATCAACCTTAATGTGTACCAAGCCTCTCCAA TATCTTTCCCTATTCCCTCTGTGATGGTAATACTAATGATTTCAATCATT TCATTTTGTATGTGATGTGATGTGTAAGTGACATTCGCAGTGATGGTGCT AAAAATCTTAGCCAAGTCCTTGTCCTTTTTATTGGTATAGTCCATCAGAT TTTATTATTTTCATCATACTTATATTTAAAAATCTTTTTTTATTATATTT ATATATTTTTTTCAATTGAGGGTGCAACCAATTTTTTTTGGGAGTGCAAT GCATACTTATGCACACCCGTAGAACCGGGACTGTATGGGGCCAGTAAAAG TATTTTAAATCAAATAAAAATTCTAAGCTATAGCTAAAGTTATGTGGTAT CTTAACTCAAGCCAAAAATTTCGAAACAGAGCCAATAATTGACTCAAATA TGTCTATAAATTATTGGCTGGMATGGTTATACACACNAAGMAAAAAATAA ACTGGGATTTATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTGGAGATAT TTTTTCTGTTGACGCACCCCATATCATCTCCATATTTACAAGTTTTCTAG ATCTTTTGGTTATGGGGTCATACTTATACCTTTATAACGTCCGGAATAAA GTACAATTTTACGAAATACATAATGAATATGTATGACTTTAAAAAAATGG GCTTAATTGATAGATATTGCTTTCTTGAGTGTGAATATATAGTCATAAAA AATAAGAATTGCCTAGAAAATCAGTCCTTTTTAAATTAAATTTTGATAGT TGGTGACTAGATGCCACCTTGATTATTCTCTATTTAATATGACGTCATGC CTTGATATTAAAACTAAGCGCATGGTATTTGTTTACTTAATTCCAGCGCT TATAAATTTAAATGAATATCTCGGTGTAAGGATCGTTTTTACTTTTTAAT CAATTTAAAACAAAACCCAAAACTGGTTAGGATTATTGCTTTATTTGACT AATACTTACATATATACTACTACTATCAAATATACGCGTTTTATCCATTC TACACCAAGAACTCTTAAGAGGCGTGCTGAAGTATTATTATTTTTATGTA AGGACTAGGAATGTATATAAAATGCATATAAAAAGCCTTTCATTTTTTGT CTCTCTCCCTCTTCRCCGCCTCTTTTTATTCTTTATTCCTTTACCCCCCC CCCCCCTAATGTTCTTGTCCATCGTTGATTTTTGAGAGAAATGAAGTAAA AGGACTCCTTCGTTCCCCTTTTTTATTATTATTTACATACATTATTTGAA CAGTACAACATATCAGTCGTGCGAAATCCACGCTACGATCGAGACTTCAG AATATGAGTGATGAAATTGTGTGACAATGATGATGACGAAGAAACTGCTG AAAGGTCCCACATCCCTAGCTCTTATATATACTACTAGAATCTAACAAGT GAACTGAAAAAAATCTCTACAAAACCAGTATTTTTTACTTATATGTTTTT ATATGTCTTGATTCTAACCATAAAGGGAGGGGTTTGAATGGAAAAGATGG AATTACATATGGGTGACTTTCCTTTCATATTCAAATAAATATGAATTTTT TCATCATCTCTCATATTGTTACGAATGAATTCTAATTGAGGCGTTTAATG TACAATTTATAATACATGCAATTGCAATTTACTGTGTAATAGAAGCTGAG TGGAGCTTATGGAGCTGTGTAGGTTAAATAACTTTATTTTTATGACTAAT AATAAGAATGGTAATGAATCAACTGTATTTGTGTGAAGAGCCCTATTGGT CTAAATATGATGATCGAACTGTGTCACTGTCACTTCATATCAACGTCATA AGTGATGGTGAGAAGTGTGCCGTTGTTTTGTTGTTGATTTCTTAATATAT TGACTTCTATTTCAATAACTCATTCATTAGTAATTACGTTTCATTAATTT TCTATCCCTTGTTTCAGGTATTACACGTTTACCTATTTTGGAGGGAGAGG TCTCTCATGTGGAAATACCCCGAACAAACTCATCTTTAGGCATCACAATT GTTGGAGGGGCAGATACTCCATTGGTAAGTGCACTGCATATATATATATT ATACAATTATGAAATAGGACTTTAATTACGTTAAAATCCAGAATATCGGA ATCAAGGGTAAAGCGACATGACCAAGGACCCATATGTACTCCCTAGCCTC AATTTTAGCCCCTAGCTTAAAATAAGTATAGAGCATAACTTTTCCATCAG ACGCTATTACTCAAAGGACCATTATTTTGTCCTAAAAACTTTGTTTAACA CGAATTGTTGTGGAAGATACCTTCAAAGCCCTTGCAATATCGCGAATTTT TAGCTATGTAGAAAATTGCGTCCTCTAAACCGGTCATCTTGTTCCGACCT TAACCTAAGGACCGTTTTATAATGCCGTCCAGATCCATTCTTTTATCAAT TTAATACGCAGTTCGAATGCATACGCCAACAATGCAAGGTATGCAAGTAG TATATACTACTTGGGTGTTGAAGCATATTGACTACCCGTCTTCTTTAATA CTCCTGTAGTACATTCTTTATTCAACTGATAAAACTAACCCCTCGTTAAA AAGCTTTTATACCCCTCTGAAGGATTCCGTATTTTGATTGGGCAAATATT GAATGAATTATATAAATCTGTAGTATTTTTTATTTTTTCCGTATCCACTC TGTATATAATACAATTATGAAGTTGTACTCTTCATTGTGTTAAAATATTG TGTCTTGTTCTTTGAGTAATTAAGCTTATAAGAAAAATTAAATCTCTATT TTTATCAAGTGAAAAGGGATTTACTGCCTTCATATACAACTGGAACCCAA TTTTATTCTTATTTAAGAACAAAATCTGATTTATTTATTTTTCCCATCTA CAAGAATTAATATGCATAAATTTGTTTGGTTAAGGATCCTTGGTTCAGTG TGTAGATAAGAGGAGGAAAGTTCTTTAGTTGTTCAATATAATAATTATTT TCCTTCACTGTTTACAAAACCCTCTTTCTCTTTAAGAATCTTATGCTGAC TTAATTTCAAGTAATTCATACATTTGTATGAATAGAACATAGCCTTTTGT TTAACGTGCATCGATAAATGGATTATTTCATTGATTTTGGTGAATGTGTT ATACAAGGTGCGACATAACTTCCTTTTCCCAAAAAGCAATCAAACAAGTC TTATAAATCAGAAAAGTTTATTTTTGTTTCTGAATGATATGGTACATATT TAAAGTTTTGTTTTATACAGTTTTAAAAATCATATTAGATAGGTGACGTC CTCCCATTGTTGATAAACTGAACCCGGTGATTTTTTTGATTTATCTTTAT ATAATTTTTCATTGGGAGGTTTTAGAGGGATAGTTGTTTTATAAAAAATT TCATTTTTCACATCTTTTCATAAATGTATGCATTCTAAGGAAGTACGAGA GAAGATTAATTTCCTTAGTAGTACTTAAAGAAATGAAACGTGAGAGGTTC TTATAAGAGTTAATTTTTTTTTTTTTTGTATATATCTACGTATAAAAGGA GTGAACGATACATGTTATTAGAGAACATAGGTGCGTGTTCATCTTTACTC TTTGTTTTTTCCCAATAATTCATATATTATATTACATTCTGACTAAATGT ATCCTTCATGTTCATACTTATCTTTGAGTCCATTTTTTTCCTGTCTGGGC TTAAAACTCACTGAGAGAAATGGTTGTTTCTTGAAGCTGAACTCTAAAAG GGTACTTTTAAGGACTACTACATTTGTACGTTTTTTTATGACATAACATA GCCTTTCTAAAACGTTTTTATCACAATAAATGATGTTACCATTGGTAATT AAAATAATTGTCGTCGTGTCTTCGTTTCATTTAAACATATGTTCATAATT GCCTTATTTATAGTATTTTCCATTCTCTTATGTTAATAAAACAAATTTGA TGTGGTTAATATTTTGAGACATTTATCTGTAACATTCTATATTTATTTAG TGGGTGAATAATCAAATTTGTAGGGTTCTGATTTGTGTAAATAGTCCTGT TTTTATCACATTATCAAATGTGTTGCATAAAATAACAGTTATTTCTACGT ACGTTATTTAGCTGTCTACAAAATAAAACGGGGAAAATATCAGATAAGAA ATGACGAAACTAGGGGAGAAAATGCAACATATATAAACTCTCTTGAATAA CGGACTGAGGCAAAAAGAGATATTTCTGGTAGGTATCATAGAGAGCAAGG ACGTCAATTCTTCCCTGAATAGTCTTTCTTTGATGTAAATCCCCCCAAAA 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TCTTGTTTCAGGTGTGTGCTTCTCTTCGTAAAATGAGTTCAGTTTTGAGA TTAGGAGTGTATCGCGAAAGGATTGAAAAATATGGTGCACGTCCTAATTC AACTGGCTCCAGTAATGTGAGTCGACAGTCAATGAAAAGGAAGAAGTTAA AGCATGTTAACGAATCTAAAGATGAAGAAGGCCTTTTTAGTTTTACTTTG GAGCGCCTCCCTGGAAAACAGTTAGGTTTACGTCTCAGTGGTAATTGTTC TGAGACTGGGATTTTTATCGTTGATATACAAAAGGGTAGCACAATGGGAG CCGATGGAAGGCTTCAAATTTTTGATCGAATACTTTACATTAACGGTACT GATGTCCGAAATGCAGGAATTGCACAAGCATCTGCCTTGATTCAGGTGAG TTAAGAGTTAATTATCTCTATTTCCCTTTTTTAGACACTAGAAAAACATA ATTTTTCAACTTAAAGATAAGTGAGATATATTTTATGTTGGATTTATATA TTTTATAGAACAATGATAAAGTAAGCTTAGTTGTGGTCAGGAGGAAGCCC ACCGATCCAGTTTTGTATAATTATGATAAAGAGAATTCTTCGACCAGTGA AAATACATCAAGTAATGGTTCATGTCACACAAGATCAAAATCTGCTCCGG CTCCTATGCATAATGATAGATTAGGAACTGTTTTAAGCAACAAAAATTCA AATCAAGAGGAAAATGGACAATGCGAAGTAGCTTCATCTACAGAAGAACT TGATGAACCTTACTATGATAATCTTGATGGTGATGATCTGATGGGAATAT ATGAAACTCTAGATAGGAAGCGACAAGAATCTAAGGAAATTGCTAAGAGT CACTCCATGGAAGCATTAGAAACTCCGGATAAGAAAAATGAGGCTCTCAA GGCCCGTCCAAAGATTCCATGTAAGACTTCTACACAAAGTCAGCAATCAA 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AATAAAATCATGGATGTATATGTATTAGTCTGGTCCCTTTTTAACTTTTT TTTTCTACAAATATTGAACTATCATAAGCTGAAAATATTCATTCCAATAA AACTATCTAACAAAAATAGCCTATGTACCTTATTGAACAAAACCTTTATT GAAGGATCAAAGTCCCTCTGATGATATTGTGTATTTTTTTAGTATAAAGA TTTGGTAATATTGCTGTTAAAATTTAAAAATAAATAAAGATAGATAATGC GGCTGTGAGTAATAGATTTAAAAAAACATTCTTCACTCTTATTCTATTTA AAATAATAAAAAAACTAATTTAAGAACAAAATAGTTTTAATATTTTTGTT AAAACACATTTGATCATATTATTTGCATGTGGTTAAAACATAATAAAAGG AGAGGGCTATATTTTTCGTTTCAAAACTTTAAGAGTGTTGAGCGACCGAT AAAACTTTTTCAAAATTGTTCAAAATTTATTAGTCATTATTTATAATCAT AAATATACCAGTCTAATATGTAGTGATGTAAATCGTGTTAATTTTTTAGC TGGTTCATATTTTTTGAAATTGGTAATCTGAAGAATGAATTTTCTTTTCT ACAGCTATTGTCATTATTAATTATTTAATTTCTGAGTAGTGAACTTCCTT TTTACTACATTCAATTTTATTCAAACCCTGATTAAACATTCGTGTTTGCA CATAAAAACAGAGAGTAGCCCTTAGAATTTCTTGAATACTTATAATTGGA AGTCCTTCTTTGGACTCATAGTAGAATTGAGGCCATGGGACACTGAAGGA ATTCTTGCCCATGTACTTGTTTATTTTCTTTTCCTCCTCACCCCTTTTCA CATCTGATAGTAGCTGATCTGATGAAAAGTAATGACTGGCATCCTCTAGA ATATTCTTCAAATTGTCAAGGCTAACATGCTGATTTTCGTTTTTGTTTTT TGACATCCCCAAAATATAGACGATTTTCATTTTTTCCACTATGTACATAT CCATGAATTTCTTCTTTTATAAAATTCATGCTATCCAACTATTAAGTAAT TTTTAATTAATTAGCTACATTGCTAATACTATTAAAAATAGTCATATTTT TTGAGAAATATTCTATGATTCTATGTTAACAATTAAAAAGAATATTTCAA TTAATTCCAATTGTACTTAAAAACATATGGAGTAGGTATCTCACAAAGAA AAAAACAAACATTGTTTATCTATTTTTGCATTTTTAAATTCATCACATGA GCAAATACAATGCTGGGTCCTTATAAAACTAATTAATCGATGTTTATACA TTGAAGTACAATCCAACTGCGCTTAAAGACTCATATTTGCTTAATGTTTT TGTTAATTGTCGTAATTACATGTATTGCTGTTAAAAATGATGCAATGTTT TTTAACGAAATTTGGTGTTATCAAATTTAATTGTTATAGGGAAACATTAT AACAAAATATGAATAAAAAATACATGAAAAAAACTTTTTCGTATTTCTAA GCAATTGAATAGGCGTTTAATCTGTCGTTTTTTGCTTATGTTTGTATATA TCCATTTATATTACATTTTCCTACTGGTCATTAGGACCCGGCATAATTAA GTGTCGAAGGGTAGACCCACTTTGCTTTAATAATATGAAATATAATTCTC CAAAAAATCATTATTTTTACTCTATGTTTTCATAGACATACTCACTCATA GTTGCTCAATACTTTGACGTTCTCTCCTCAAGATTAAAAGAACAATAATA ACAGCTTGAGAAAGTAAAAAAAAATAATATTTTTTTCAGGTCGCCAACAA CAAAAGGACTCCTACACTAAATAATTTGCAACCCTAAATACAAGTAATCC CTTATTCTTTTTCTTTTTAATGCAACACGATGAGTCAGAGAGTACTTTAA 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