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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s439 | supercontig | LSalAtl2s439:213145..230675 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007597 >EMLSAP00000007597 ID=EMLSAP00000007597|Name=EMLSAP00000007597|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=575bp
MCFRSHQASRQCCQLISGSMSLWPGITRLPILEGEVSHVEIPRTNSSLGI TIVGGADTPLVCASLRKMSSVLRLGVYRERIEKYGARPNSTGSSNVSRQS MKRKKLKHVNESKDEEGLFSFTLERLPGKQLGLRLSGNCSETGIFIVDIQ KGSTMGADGRLQIFDRILYINGTDVRNAGIAQASALIQNNDKVSLVVVRR KPTDPVLYNYDKENSSTSENTSSNGSCHTRSKSAPAPMHNDRLGTVLSNK NSNQEENGQCEVASSTEELDEPYYDNLDGDDLMGIYETLDRKRQESKEIA KSHSMEALETPDKKNEALKARPKIPCKTSTQSQQSKRQSFHEIPAPSISN ALSVEKSPSFGEDLSNTDGNSSMAAFIKRALRIQGPCLLQKTVIVKKNPR ESLGMRIGGGIGSNEGDTPIYIANIHPHGCIGKSKQMKVRTTINLSQVSL GILDGPETSFGASNFIPSWMYWQKMPRELQYPKTVILHRREHASWGFSIV GGTDSNGRPTEPIHVLFVVPDSPAAKDGRIRCGDRLLAVDGHTLENIPHS VAVGMLKQTSTRVVMEVVSWMGTEL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s439:213145..230675+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007597-703444 ID=EMLSAT00000007597-703444|Name=EMLSAT00000007597|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17531bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s439:213145..230675+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTGTTTTCGATCCCACCAAGCAAGTAGACAATGTTGTCAATTGATTTC
AGGATCAATGTCACTGTGGCCAGGTGTCCTGTCTACCATTGCTCAAGTAA
CCTCTTTAACTTATCTCCCGTGTACAATSCAGCCACTATAGGTCTCTTGA
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AAAATACGTATGGCACCTCTCTCAGCAATTCTTTCTGCATCTTTGCTGTA
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CTCTCTCCCTCTTCRCCGCCTCTTTTTATTCTTTATTCCTTTACCCCCCC
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GTTGGAGGGGCAGATACTCCATTGGTAAGTGCACTGCATATATATATATT
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TTAATACGCAGTTCGAATGCATACGCCAACAATGCAAGGTATGCAAGTAG
TATATACTACTTGGGTGTTGAAGCATATTGACTACCCGTCTTCTTTAATA
CTCCTGTAGTACATTCTTTATTCAACTGATAAAACTAACCCCTCGTTAAA
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TGTCTTGTTCTTTGAGTAATTAAGCTTATAAGAAAAATTAAATCTCTATT
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TGTAGATAAGAGGAGGAAAGTTCTTTAGTTGTTCAATATAATAATTATTT
TCCTTCACTGTTTACAAAACCCTCTTTCTCTTTAAGAATCTTATGCTGAC
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TCATTTTTCACATCTTTTCATAAATGTATGCATTCTAAGGAAGTACGAGA
GAAGATTAATTTCCTTAGTAGTACTTAAAGAAATGAAACGTGAGAGGTTC
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TTTGTTTTTTCCCAATAATTCATATATTATATTACATTCTGACTAAATGT
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GGTACTTTTAAGGACTACTACATTTGTACGTTTTTTTATGACATAACATA
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AAAATAATTGTCGTCGTGTCTTCGTTTCATTTAAACATATGTTCATAATT
GCCTTATTTATAGTATTTTCCATTCTCTTATGTTAATAAAACAAATTTGA
TGTGGTTAATATTTTGAGACATTTATCTGTAACATTCTATATTTATTTAG
TGGGTGAATAATCAAATTTGTAGGGTTCTGATTTGTGTAAATAGTCCTGT
TTTTATCACATTATCAAATGTGTTGCATAAAATAACAGTTATTTCTACGT
ACGTTATTTAGCTGTCTACAAAATAAAACGGGGAAAATATCAGATAAGAA
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GTTTTATATTTGTGTAACATGTATGTACTATATACTCGTATGTACAATAT
TCACAGTATTAATAAATTCATTAGTTTGATTTGAATTTGTTTCTCTTTTA
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AGATGGCCGTCTTCAACCCGGTGATCAAATAATCGAAATAAATGGAATTG
ATATGACATGTGCTTCTCATTCTCAGGTAATTACTCATTTAAAAAAGATA
TATAACAACTATTCTATGAGACATTTTCACGAAGAACCAGATTAGTCTCA
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AATTCAGATTTTGATTAACACATCATTAAAAAGCTATCAAATATGTAAAA
AATTATTATATAACTTAAAAAACTTTTGTTATAAATTAAAAAAAAAWAAK
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GCTTTTTGATTCTATATAATGCTTGCCTATTATTTCCCTGGTTCACGATA
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CCTAAAACTAAGAGTTGGATTGAGTTACTGATCTAATATTTAATTTCTTA
GTAGGAATACTATATATTATACCACTCATTCAATTTAAGTCACATTCATT
TCCTTGTAAAAATTTCTCGTGGAATTATCAATTAATAGATATACTAGGGG
TAGTACTCAGCATTGCCCAGAGTGCTTTAATAATATAGAAGTTAATTTTC
CAACATATACTCAGTATTGCTCTCCTTTTTCATATGTAGCTACTCAATAC
GTATATGTTATCTCCTGGAGAATGAAAGAATACTAACAATAGCTTGAAAA
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GCGCTCACTGGTTTTGCTTTACCTACACATGATCGTTCCTCAACTTCATG
TAAAGTCGCATTAATGTGAATCTCAGTATTTTTTTACTACTATGTACTTC
CCTTTTCTTTTCTTTTTTAATATTTGCTCTTTGTTAATAATGAGTTCTCA
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ATCAATATATATTCATCCATAACCACCACCATTTCTCAAAAAATAATTAT
TAGTCGAGTTCAAAGTTAAGTGGGAATAATTCTATAAAAAAAAAATAGAT
AATATCATTGATAACGTCATATCGTTTCTATTTAAAACCTTTAAATATTG
ATCATTTCACTACTTTCAAAACCTTTCCTACTAAAGCTTTTTTCTCTTTA
ATATAAATATAATAACCTGTGTAAGTTTAAGTTGGATAAAATAACCTCAA
TTCCTTTATAATATGATACTTTGAATCAATGTTTTATTTTTATTTTATTG
AAATGTAATTTTCTTTTTAATTTATCATTGTATATGCAATGTTTTTTTGG
CCGTTTCAAAATTATATTCAAAATAGGTATTCGAGTTTCATGTTCTAATC
TCTTGTTTCAGGTGTGTGCTTCTCTTCGTAAAATGAGTTCAGTTTTGAGA
TTAGGAGTGTATCGCGAAAGGATTGAAAAATATGGTGCACGTCCTAATTC
AACTGGCTCCAGTAATGTGAGTCGACAGTCAATGAAAAGGAAGAAGTTAA
AGCATGTTAACGAATCTAAAGATGAAGAAGGCCTTTTTAGTTTTACTTTG
GAGCGCCTCCCTGGAAAACAGTTAGGTTTACGTCTCAGTGGTAATTGTTC
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AATCAAGAGGAAAATGGACAATGCGAAGTAGCTTCATCTACAGAAGAACT
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TCTGTAGAAAAAAGTCCGAGTTTTGGTGAAGACTTATCCAATACGGATGG
AAATAGTAGCATGGCTGCTTTTATAAAAAGAGCCCTTCGAATACAGGGCC
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CTTGGAATGAGAATAGGAGGAGGAATTGGTTCAAACGAGGGTGATACACC
TATATATATTGCTAATATACATCCTCATGGATGTATTGGAAAATCTAAAC
AAATGAAGGTAAGAAGTAATCTCTTCTCTTTCCTCTTCTTTTGACAATAC
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AGAGAAAATAATATCAATTAACTAATTTTTAGTGTCTACATCTTACATCT
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ATGACTTCATGACGAGATAATAAAACATGGAGTAAATGTCGTTATGTATG
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AATTGATATTGACCACATCACGAGTTATCAAATTATAATATTATTAAGGA
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ATCGTATATGAGGCTAAGATTCTAAGAATCCAAAAATGATATGGACATAT
TTCTAGATAATCTATTTGGGTCATTAATGGTCTATCCAATTAATTCCTGA
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AAAACACATTTGATCATATTATTTGCATGTGGTTAAAACATAATAAAAGG
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TGTTAATTGTCGTAATTACATGTATTGCTGTTAAAAATGATGCAATGTTT
TTTAACGAAATTTGGTGTTATCAAATTTAATTGTTATAGGGAAACATTAT
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TCCATTTATATTACATTTTCCTACTGGTCATTAGGACCCGGCATAATTAA
GTGTCGAAGGGTAGACCCACTTTGCTTTAATAATATGAAATATAATTCTC
CAAAAAATCATTATTTTTACTCTATGTTTTCATAGACATACTCACTCATA
GTTGCTCAATACTTTGACGTTCTCTCCTCAAGATTAAAAGAACAATAATA
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CAAAAGGACTCCTACACTAAATAATTTGCAACCCTAAATACAAGTAATCC
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TCTCTAGAAGGCTCCCTAGCTGAGCTTTAGCCACACACGCTCGTTGTTCA
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TATGTTTTAAGCTAACCCTCGGCTAGATTTAATTCATTTTGATATACCGT
TCTTATACAACTCTATACACAGATTCCCTTTTTCTTTGAATATGACGTGT
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GTTTTATTTATAGATATATTTTACTACAGCTTTGTTTCTTTATTATTTAA
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AAAACATCCCTGAAACCGAGGCCTAAACTTGATAAATACCATGGAGATGT
TGCACCATCAATTTCAATGGTAAAAAAAGTGGGTTATCTTTCATGTTGTG
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GCTACCACCAAAACAATTTAAAAAAATTACAATATGTTCTTGGTCGATTG
GGGATTTAAAGTTTGGAAGATTCTGGAAGCCATGTACATGTCATATGGCT
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GATGGATGCCGCATTTGCACACAATCGACCATAATCGTTAGCGTTTGACA
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GTTTGGGTACAAATGGCTCCCTCATCTACCATTTTCTCCAAATTTGCCCG
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TACTTAGCCTTGCACAAATGTCTAATGGTTTCTAAGCTAAACTTTTTTCA
ATAAAAATGTTGAGAAATGTACCTAAGAATTTATTTTTTTCTTAAAAAAA
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GAAGGAATTTCAAATTATTTTAAAATAGGCTGATTGATAGTTGGGATCAC
CATGTGATGTATCACTTAAATTATCTTAACTTTTATACACGTTTAGCAGC
TCCCCAGTAAAAATATGAATGAATTTGTAAAAACCCCTTTTATTATTATT
TAATTTTTATGTGCTTATGTGTATTTTATTATTCATATGGACTTGTTTAC
TTATTTATTATTTATATGGACTTATTTATTAATAATAATTATATTGCCTG
TTTTGGTTGGAAAATATTTTTGTTAAGAAAACAAAAACAAAAACAAANNN
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TTTTTGGAAGATATGATCTAAAAAGGACATAATATGGCTTTAAATATGGA
TCAATAATTTTCTTTAAAATCATTATTCTTAATAACTTAAAACAAAAAAG
TTTCCAGAATTTCTCATTTTTTCAAATACAGGATAATATAAAAATTTGCT
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TATACGTATAAATTTTAAGCTGACCTCCCACATTTTTGTTCTGTTTGTTT
TAAATTCATTTCACATTGCTTTTTAATCAATACAGATACATATCATGAGT
GCTGTCCAAAAAACATGTAAGCTTAATCCTAAAAGGACCAAATTATTTTC
GGGGAAATTTTTTAAACATGTTTGTAGCATTAATATTTGTAATTTATTAT
ATGACTGGGAGAAAATAAAAACAAATTCATTCACTTTTAGTAAAATGGAA
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GTACACAAATGCCATTACATATTATTATAATTTTTTCTTGTCGATAGCTT
ACCTAGAAGTGAAGTAAATAGACAAATTGGTGGAGTAAGACACAACTGAG
ATCTMCCGCCATTCCTTGTAATGAAAACGATGATTCCAGACGTTATGTAG
GGCGGTTTAAAAAAAACGATTGCGTTAGCGATAAAATTTTGAATAAAAGG
CTACTAGTCCAGTTGTAAAACTATCGTTTCACAAGTTATTTCTGCTTATA
TACACATTTGTTTGAAATGGAACATATCTGTTGCACTTGTCCTTTTAGGG
TTAAAGATAAGCTAAAAATCATCAATAATCGGTCAAAACAGGATCTAATT
ATACACTGGTTGCCTCTAAATGTGGAGTTTCAAAACTACTTATTTACATA
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TGTTTGTTGGTCACTAGGATTACGGCAAAAGTTTAATCAAACTTGGTTCG
AAGATTATTATATGGTCATAGTGAAAGGCCATTAAATTTTGAGAGTGCAA
GGTACCACAAAACGTTAAAAATGCGTAATCGGCCATAACTTTGGAATAAA
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GAATAATCATTTTATTTTTTTCTGTCCTTACAGGCTCCTAATTACAATGT
GTATAGAGCTGAAATATTCATTAGGGCCTATTTCTATTAAATAAAATTTA
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CTTATAAATTTTGATGTACATTTACGTGATATGAAAATATATATATAAGT
CTAAGATATTGTACTACTATAAATTTCAAATAATAAATATCTTATTATAA
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