EMLSAT00000008448, EMLSAT00000008448-704295 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008448
Unique NameEMLSAT00000008448-704295
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s518supercontigLSalAtl2s518:255092..278522 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008448 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008448EMLSAG00000008448-691214Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000037488EMLSAE00000037488-746416Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037489EMLSAE00000037489-746417Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037490EMLSAE00000037490-746418Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037491EMLSAE00000037491-746419Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037492EMLSAE00000037492-746420Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037493EMLSAE00000037493-746421Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037494EMLSAE00000037494-746422Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775382auto775382Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008448EMLSAP00000008448Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008448

>EMLSAP00000008448 ID=EMLSAP00000008448|Name=EMLSAP00000008448|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=574bp
MRTCKSFKFNFITSNNLRVXATRSFLAKLRELGDFEWNEDEKIPPKDVSS
EEWSEFLNTLKKPILETASERVGPISVTNNGFRSLQIENSNLEEEEDCDI
ILKNKEIDKISNTIVNIVAKVQFXSTSSEACNVFLSLDENRRIEILEMLN
LTETFLNDFYDVLFIPSCCWAYSLNFKMNKCCLLAIIFLTWGSIEGMDEF
MSAGYDTESFREGEDSPMTSSSSEESEAMVKWNSKEKRPPADSNISPNTW
NNFLKIAKPLVYRLGSSLMTEDFLSKHPSVDGPSNKINKIFTSDNKYRMG
EDMMEILEGQEIDTSRKKPNHHSSKSYRFIHLAKPLILGIGAKLLAGKLL
GGLHAKKXHHGSYHRPGYHRTLDVNQMDDERRSTKHYDQNTDADLKKLKP
QSYLKKTKETLLEIGKKLVSSFKDNEESDRFRAQCKKFQKNDYSMDITAS
LKDFLYDLVKNQDLCSSKEIFIGKFISFATQYFQKNDSSISKFKNDNQAT
ESTFNEQNDVFDPPENGHPEVFNQDNEGFSKYPKDAIDSSEELVTNESNY
YQGGDEKKIEHSITEEEKSSEELV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s518:255092..278522-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008448-704295 ID=EMLSAT00000008448-704295|Name=EMLSAT00000008448|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23431bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s518:255092..278522- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGAACCTGTAAATCTTTTAAATTTAATTTTATTACCTCTAATAACTT AAGTACTAAATTGTTCATCGCCTATTTATAAAGGWTTTCTTTGTAATATT CGCTTCTCAACTTTTGAAGGAGTCSGAGCCACAAGGTCCTTTCTAGCAAA GCTCAGTAATATATTTTTTGATTTGCAATTTAAAATAATAATATAAATCC TAGAAAACATTGATCATTACGTTTGAATTTAAAATTTGAAGTAAGACCTT AATTATTCGTTTTTGAAGAAATAAATTTATCAGTATTGTTCATTCCTAGC TGTGGTTGGGCCAACTCCGTAAATTTAAAATGAATAAGTGCAGCCTTCTT TTTTCAATCATTGTCCTTACTTCGAGATCCATTGAATGTATGGAGGATGA ATTTATGCCATCAAAATATGATGAAGGGAATTTTAGAGAGGAAGAAGATT ACCCATCGTCCTTAGAAGGTAAATCATTATAAAATCATTGATTTGTATGT GTCATAAAAAATATTAGGGCCCTAAAAGGATAGTTAGGTAAAATCCTTGT TCCATCTTGTTGGAAATTCTTGTTTTATTCATTCCTCCCAAAATTTCGGT GAAGGTCTCCTTCTTGGCCTTCAATATGTCTTCCTACAATCAAAATATAC GACAAACGATTGGTTATCTCAAATATTGATGAAACCGGATTATTTCATAC TAATTACTCGTACTTACATCGTCTAAAAACTTTGGAAAATGTTTATTATA GAGATTATGGTAAGTTTTGACTCATCATAGATTTATTGCTGTGCACTAAT CCCTTCAAAAAGTTGCGTTAAATTGGTTAAGGGAGGATTTCTGGGATTTT AATCCTATCATTTTGAGCGGTTAAACCCTAATACTTCATCAAAATGTGAA TGTGAGTTCAACCATAACTATGCAATTTAACTATGTACATACTTTGTTTT TGGAAGAATAGGTTCAAGTTCGGTATAAATATTGGCTTTATAATCCATGA CGATATTCCACTTACATAAAAATGTACTTCATACTTTTTTTGTCAGTTGT CGATCTTTATACTATGTATTCTACTTATTAGTGTTCTCAACATTCCTTTC TGCTGTTTTCATTAACTTTCATAGGTTGACTCTTGTATGATTTAAAATAT AATTAACTCAAAAAAGGTATTATATAGGATTTGGATTTTGATATCAATTT ATATCTATCATTGACCTTCCTTTATAATTTATAACAATTCATACTCTGTC ATTGATACTTCTTTTAATAAAGCTATCAATTCAAGGTACATAATAGTTAA TTAATATTATCTAAATAATTATTAACAGTTGATAAAAAGAAAAAAAACAG AAGACTAGCTAATATGAGCTTTTTCAAAAAATTTCAAAACAAAAGTCGGA ATTTTATAACTTTTCAAGTTATAAGAAGATCATCCATCCTATAGAGGTTC CGCTCTAATTTTTATGCACACATATGAAATATGAGTAGGTTAAAGTCTTC GAAAAAATTGGCGAGATTAATTTTGAAACATAGCTGGGGTGCTATTTTTT ATATTTTGCAATAATGTGTTCATAGTATTTTTTGGGCATATGTTATTTTT TTATGAAGTATGAGTTGAGGTTCGTAGTCTCAAAACTAATTTAAATGAAA AAAAGAAGAACAAAAAAGACATATTACATATTATTATACGTTCTAGTGAC ACACCTCCTACTTTTAATTTAAGGTATCTTTTCTATTTGAAAAAGGTTCC GAATTATAATGAAACATCAGTAAATCTAATGACGTAATTAAAAGCAAGGT TAATAGGAATACAAGGTTATACCATCATGTAATCGGGCTTGCTAGAATTT TCAATCTTTTGGGCAAGACAAGTAGATTTTGACAAAACACGCAGCCCCTT ATAGTCTATGACGTCACTATTGCTGGAGTTTTCAATTTAATGTATCGTAC CGACTGCTGGGCAAGAAAAACAGATATGGCACCACTCATATACTATGACG TCAATATTAAAAGCGTGATGGAAGTCAAACATCAGTCGTACACGCGTTAT GGTATACCCTTGTATTTCTATTAACCTTGATTGGAAGTAACTACTTAATT TCAGCTGTTGTAGTTTCCGTAAAAAACTGATAAGAACCTGTCCTAGGACT GATAGGACTGCAGTCTTTATAGTTTTTTTAAACCGATTTGACACTGCTAG GTACTAATAGATATTAAAATATCTATAATATTTTCAAAATTACAATCTGT GTTGCTATTACACGTTGTTACCTTTATTGTATGACGCAATCTTTACAACA AAAAGAAACAGAAAAAAGGCCAAAAATCATCTAATAGTTAGCCAAATAGG TCAATCATACAACCTGCTTTATATCTCTTACGTACTTCTATTCTATCACT GTCAGATTATTTCTACAACATTTTTAAAATGAATTACACATATAAAGAGC AGCAAAGCGTGGACTCGAGAGATGGATTTCGAAATTCATCAATAATTTCA TATTTTAAATAATAGGCAAAATAATAATACTCACAAAACATGTAGACAAG GTTTTTGCAAAACTTTTTTCACTCAATATGGCCACCTTCATTATCAATCA CAACCTTTCCACGTCGCCTGAAGGCCATGTAGGAGTTGATGATAAACTCC TCGGACAAGTTGTACCATSCAGCCACTAAGGAGGACTTCACTGAGTCCAC ATATGGGTGTGTGGCCCTGTAGGTTTTACACTCCAAATTGCCCCATATAG AAAAGTCCAGTGGGTTCAAATCCGGTGAAGAAAGGGCCATATCACTTTGG ACCAGAATCGAACCATGTTATCTGCACATAACTTTCGGCTGACTTGTAAG 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TCCCCTTCTAATTGTTCCCTTGTCTATTCAAAAAATCAGTTAACGTATTA AATTAATTCTAAATGAACTGAAATACATAAAATTGAGTTTAAAAATCAAA ACAAATGTCTAAAATACTTATGTATATATGTAAATATAAATAACTTATTT AACAGTTCTTAAAGTTATTTTAGTTGATGTACCTAAATTATTAAATTACT TGTGGTGTATAATATGTATTATGTGGTTCACAAACAACTAATCAATACTG ATTCATGAGTAATTGATCAGATATACATATCTAAATATTCAAATACTTTA AAACTTAGGAAAAAATCAAATAATGATTTTTCCCTTTCGCAATTTAGATA CTCGCAATTTATTTTTCTTATAGATAGTGAAGCCATGGTAAAATGGAAGA CTAAAGGAAAATGCCACCTACAGATATCAGTCCTAAGACCTAGAATAACT TTCATAAGATTGCCAAACCAAATGTATATAGACTTGGATCATCTCTCATG ACAGAACAATTATTTTTTACAAAACATCCAACTGATCACGGACCTTCAAA CGAGCTTGAACATACGTTTATAGCAAATAATAAATATTTCCTGGTTGAGA ATATGATGGATAAGGATAGCGAGATAGGAAATCACTGCAATATTTTCCAA TCTTCATTGACCTAAATATTAAGTTCAATAAAAGTTCTAAAATCATCTTT CAAGAGTTGTCCATATAATAGGGAACATATTGCCACAATCGAAGAAATTG ATAGTCTGGTCCACAAAATTTCGTCTAATATGGAAAAAGGATCGACAAAA TATATATGACATAAATCATCTTCCACTCTTTACAAAAATGATTATCATAG TTCAAGGCGAAGAAGGAATTACACCCCAGAGAAACGCGTATCTTTTAAAA TGAAAAAAATATTAGTAGATTAGATAAAGAAATTTAAAAGAGGTTTTTAA 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ATACATTCACCATTGAGCCTTTAAAACGTATCATCAAAGGTCAAAAAATT ATTAAACTAAATTACCAAGAGTGGCAAGACTTAAACAGGTGCTACAAATT TACTAAAGTCTATTGAAAAAAAGTTTCTTCTTGATTGGAGGAAGTGGGAT CTTGATTTCAGATCTTCTTTCCATTAGGCGCCTCTAGGCGACTGATTTTA AATTTGTTTTTCTCTTAAAAAATTAAGAGAAAATAAATTTTACTTCTTGT TTTTATTATAGTTATTATTTCTATAATTTAGCCACTTATCAAAGTTATCC TCAAAGTTCAAAATATAAAATTCTTGAAATTGGTAAAAAAACAATAAGCT CATTTAAAGATAACAAAGAAAAAGATAGATTTAATTGCAATATGAAAAGT TTAAAAAAAATAAAAATGACTATACTAATGAAATAACTGTATCACTTATA GATTTTTTTAGCAAGATCTCTGAGAAAATCATGATTTTTGTTCATCAAAG GAAATTTTTATTGTAAAAATGCATATCCTTTGCTACTCCATACTTCAAAA GAATGACTTCTCTAATTCCAACTTTACAACTCGTCAAGACACAACACAAA CAGCTGAGTCAACTTTAAATCAACGAAAGGATGTCTATGATCTCACTGAG AATAGTCACCCTGAATAAAGATTAAGAAGGTTTTAGTAAGTATCGGAATC GATAGCAATGTAGAGCTTATGATAAATGAATCCGAATACTAACAAGGAGG AGACGTAAAAAAAATTGAACACAGTATCACTGAGGAAGAGAAGAGTTAGT CTAGCAGAAGAATCCAAAATACTGCAATGAGTTGGTTAATCAAAACAGAC TTAAGTCTATGTTAATAATTTATGAATACTTGATGTTTATCTAGTTGTAA TTAAAGTCAAATACATATAACTTTTTCAATCTGATAACTATTTATTCTAA 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