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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s518 | supercontig | LSalAtl2s518:255092..278522 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008448 >EMLSAP00000008448 ID=EMLSAP00000008448|Name=EMLSAP00000008448|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=574bp
MRTCKSFKFNFITSNNLRVXATRSFLAKLRELGDFEWNEDEKIPPKDVSS EEWSEFLNTLKKPILETASERVGPISVTNNGFRSLQIENSNLEEEEDCDI ILKNKEIDKISNTIVNIVAKVQFXSTSSEACNVFLSLDENRRIEILEMLN LTETFLNDFYDVLFIPSCCWAYSLNFKMNKCCLLAIIFLTWGSIEGMDEF MSAGYDTESFREGEDSPMTSSSSEESEAMVKWNSKEKRPPADSNISPNTW NNFLKIAKPLVYRLGSSLMTEDFLSKHPSVDGPSNKINKIFTSDNKYRMG EDMMEILEGQEIDTSRKKPNHHSSKSYRFIHLAKPLILGIGAKLLAGKLL GGLHAKKXHHGSYHRPGYHRTLDVNQMDDERRSTKHYDQNTDADLKKLKP QSYLKKTKETLLEIGKKLVSSFKDNEESDRFRAQCKKFQKNDYSMDITAS LKDFLYDLVKNQDLCSSKEIFIGKFISFATQYFQKNDSSISKFKNDNQAT ESTFNEQNDVFDPPENGHPEVFNQDNEGFSKYPKDAIDSSEELVTNESNY YQGGDEKKIEHSITEEEKSSEELV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s518:255092..278522- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008448-704295 ID=EMLSAT00000008448-704295|Name=EMLSAT00000008448|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23431bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s518:255092..278522- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGAACCTGTAAATCTTTTAAATTTAATTTTATTACCTCTAATAACTT
AAGTACTAAATTGTTCATCGCCTATTTATAAAGGWTTTCTTTGTAATATT
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GATTTTCTTGCATCTCTTTAGCCTCATTGTTTTCAAGCCCTGTCAGAATA
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TCTTTATATTCTTATCCAAATTTAAAAAGAACATTTTATACCTCTTGAAA
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CTTTTAGCCTTTTTCTCGCTCATGATGATGAAATGACTAAATGATTAGTA
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AAAATTTTGTTTATTTGGTAGTTTATTTGCTAAAGCTCCACTACAAAATT
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TGTGGTGTATAATATGTATTATGTGGTTCACAAACAACTAATCAATACTG
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CTCGCAATTTATTTTTCTTATAGATAGTGAAGCCATGGTAAAATGGAAGA
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TGAAAAAAATATTAGTAGATTAGATAAAGAAATTTAAAAGAGGTTTTTAA
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CGTAAATATTGTTGCAAAAGTTCAATTTSCATCCACAAGTTCGGAAGCCT
GCAATGTCTTTCTTTCTTTGGATGAAAATCGAAGAATAGAAATCTTGGAA
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TGTTACACATAAATAACGATAATTGATTGAACATAATATCATTCAGAGTT
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TTTTTTATGATTACAGAGAATTCAAAAAGCTCAACYCCAGCAGCAATTAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAAACAAAATTTGTTGGAAAAC
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ATGAAGGAATGTTCTACATCAGAGTTTTATGATAAAAACCAGAAGACATT
TGAAAACATATCCAAAATCAACAAAATCTTAGAAAATATTAATAAATTGG
ATAATATCTAAATGTTATTTGGATTACATATTTCATACTAATTGTAACCA
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CTTGTCTCATTAGCTTTTCTTCTATTGTATATAGTTATAACCAGAAGTAT
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GAAAGTTTCTTCTTAAAAAAATATAATTCAAACAAACTGAGTTACAATAC
ATACATTCACCATTGAGCCTTTAAAACGTATCATCAAAGGTCAAAAAATT
ATTAAACTAAATTACCAAGAGTGGCAAGACTTAAACAGGTGCTACAAATT
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CTTGATTTCAGATCTTCTTTCCATTAGGCGCCTCTAGGCGACTGATTTTA
AATTTGTTTTTCTCTTAAAAAATTAAGAGAAAATAAATTTTACTTCTTGT
TTTTATTATAGTTATTATTTCTATAATTTAGCCACTTATCAAAGTTATCC
TCAAAGTTCAAAATATAAAATTCTTGAAATTGGTAAAAAAACAATAAGCT
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GATTTTTTTAGCAAGATCTCTGAGAAAATCATGATTTTTGTTCATCAAAG
GAAATTTTTATTGTAAAAATGCATATCCTTTGCTACTCCATACTTCAAAA
GAATGACTTCTCTAATTCCAACTTTACAACTCGTCAAGACACAACACAAA
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AATAGTCACCCTGAATAAAGATTAAGAAGGTTTTAGTAAGTATCGGAATC
GATAGCAATGTAGAGCTTATGATAAATGAATCCGAATACTAACAAGGAGG
AGACGTAAAAAAAATTGAACACAGTATCACTGAGGAAGAGAAGAGTTAGT
CTAGCAGAAGAATCCAAAATACTGCAATGAGTTGGTTAATCAAAACAGAC
TTAAGTCTATGTTAATAATTTATGAATACTTGATGTTTATCTAGTTGTAA
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CTATGGGCTCTTACGTTATACTTATAGCAATTAGTTTTAAAAAACTTTCA
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TATTCTATGTATTGTTCATACCTAATTGAGGTTATCGCAAGGAATGATTC
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ATCAAATTCACACTTTTCGATAAATGTCTGGCTTTAGGTAATCATATATA
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GTTTTTGAAATCAATTACATTGATCAACAATTCAATTTATTTGTCTCTAA
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GCACAGGGNGAGTTGTACCCCCCCCCCCCCCCAATCAAGGAACTTTCGTT
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TGCATACTTTCCAAATTATGAATATGAACAATTKTGATTTTATAAAAACT
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ATGATATTCTTAATAATATGGACTCCATGAATGATCATAGCTTAAATAAA
AATATGTTGGATATATTTGCCCGAAGAAATTTGAATGCAATCTCTAATAG
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AATGCGATAAATACAACAATTTAGTANCCTGTAATACCAGAAAATCATCG
TTTGAATGCGATAAATCAACAATTTAGTAAATAAAAATAATAAAGCAAAA
GGCCAAGGATGTTGATAAAAAAACTTTTTTTGTCTTTAACTCTTGGTTAT
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GGAAGACATGCAATTATAAATTGTGTTAATAACCCTAACCAAGTTAAGAA
TTCGTACATGATTTTAATTATTATGACAACAATGCAAGACAATTTTTTGA
AAAAAAAGGAATATATTGTTCTGCGTTTTGAAATTCAATGTGATAATTGT
GGGTAAAAAAGTTAGAATAAGATAGGAATTTTTGCCATATTTCACGATTG
ATTTTCTTTTAGAGGGTAGAATAAAAATTATATAATTATTGATATATTAT
CAAATATGTAAAAGACAAAAAATTAATAACTACTTGATATTTTTAAGTAT
ATTGTCCTTAAATTTCCTTAAATCCTGTAACTTGTTTCTCGTTTTCTTAC
AATAAAGAATTCAGAAACAACTTATCTACTGAACTCCTTATACTCAACTA
AAGCATATATTTATATAGATAAAAATTATTTACTTGTATGTTGAAAAATG
AAACCGAAAATTAACCTGGTCACTATGATAATTTGAAGAATATTTGGGAG
AATAAGTGCATAACCGTCATGACGTTTCATTAAATTACCTGAGAGCAGCT
TTGGGGTGAAGGAAATAAACCCAAACCCTACTCCGTATCCGGCAATGACA
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ATTCAGATAGCAAATACAAAAAACCGGTTTTTTTTCAATATCATATTATT
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AACATTCGTGTGTGCGGACGTAGAGTAATCTTGAGAAACATCATGACAGC
TAAGCTGCTCTCCTCCAAAACATTTTTCAAATTGTCAAGGGTACCATGTT
GATTTTCGTTTTTTTTACATTCTCAGGGGAGCTCGTACTCTCGGAGCAAC
ATTCACCCATGATTTTCATAACAATTACAAAGTTTCTAAATCTGTCACGC
CTCCTTCTTGTTCTTAACGTTCTCCTGTGACTACGATTTACAAAACTTTC
TTTTGATGTTACGAGACAGTCAGGGTCCACAATCCTTCGTTCTCTTCAGG
TCTCTAACATGCCGAGGGACCCTGTGAACAGCAAAATTTAAGTGGCATTT
GAGAGTTGTAACAACCCAATCCTCCCATTTTTCCATACACCCAGGGAGTC
ATTTACGAGTGTATATTGCTTCATATAAGAGGTCTTCGATCTTGGGAGAC
GTTGCACCAATACACACACTAATTGATCGACTTTCGAGTTCTTGCAGTTA
TTGAGTTAATTGTTCATTGATTCTTCTCCACAATTCCGCAACCTGAGGGT
TTAAGACACTTTCAAATAGAATGTTGACTCTCCATTCGCTCAGGCAATAC
AAAACATTTTGACCTAAACTTCATCCCATTATCACACACAATATCTTCGG
AAGGTCCTATCTGACTTAACCCTTATCCCATTCTTTGGCACACTTCCACT
TCATTCTCACTTTCTAACACTTTTCATATGACGAATCTGTTCGGTCTACC
ATCGACAATGGTTTCGAACTTTTTATACCCGACATGCGTATTGTCGACTG
TAATTCTATGTCATACCTTTTCAGCGTTGGGCAAGTTACTTTCAAAATGT
AATATATTTCATATTACTAGTTACTTGCATTTGAAAGTAATACGTTTCTT
TACAGTATTATCATCTGTATAGAGTAATAAGTTTTCTCTGATAAATTGAA
AACAATGCGAGTATAACCACTTAAAAAATATTGAATTATCCTTCGTTCTT
GCCATCTTAAAATCTCCAAACCAAATAATCTTCTTCTTGTGTTGATTTAA
AACAGTATTCTTCTCCTCATTATTTACGGCTGMTGCGTCTGAATGTTTCT
TCTTAAACACCTCGCCTGTGAGACAGCTCGGATTATAATGTGCGTTACCG
GACTCAGTAACTGTAGTAATATTACAGTAGTGATTTACATTACTCAGTTA
CTGCCTAATGTAATGTATTAGAGTAACGCGTTACGCCCAATACTGTACCT
TTTCCAATGATAATAACCCGCTTTCGTTCCTTTTGGTTATATTATCAATC
GAACGGTCTCCACCTCATTGTCATTGACCATTGCAATGAGATCCATTGTG
ATGCCTGTATCATAGGTGGCAAATCTGCTCTCAAGCTCCGATACAATATC
ATTGATTGACTTGTTTTCGGGCCATTGTTAGTCAACTTTTCTGCCTTGAA
ATTCACCTGACAAGCAAGATGTGTGTCTTTGGAGTGTTTTCAACAATTCA
ATGACGAAAAAAAAATCATGATTAAAGATGCTGTCGAGCGAAGAAGTTGC
TGTTGAACTAGACAATGTATTTTTATCTTTTCTCATTATTATGAGGGTTT
TCATGATTCTGATCATCCCTAAAGATACAACGTGTATAGCATTGTAGCGG
AGACTCCAGCGGGTGGCAGAGMAGTTCTTCTGGGTCATCATCTTTGCAAG
GTCCTCATCTTCACTTGTTATCTTCACCGACTTGTAGATTGCCAACCTCT
TTGGTGACCCTTCAATGAAGTTGTATAAAATTTGCACTGTCCTCGTTGTA
TTTTTCAATAGGGTTATATCTGAGAGAAGATCCTTGACTACTGGGCGTCA
GCAATGGATGTAGACACACAGGCTCCTTCCACCRAGTGACGAGACCTTGC
TTGATACCGGATATGTTAGAAGTACCATTCACGGCCAGGGAGATAGTGTG
GGCGGGAGTAACTTTAAAAAACTTGAGGAAGCTCCCTTTCTTGATCCCTT
CACTCGTCAGATATCCCAGTGACAGACTGAACTACTCTGTATTTTATATA
TCTGATGATGAACAACAATCCCAGAGAACCAGTAGTCATCATCGCTAGCA
CAAGTCTTGACATCTTCATTTATATTCTCTGTCACTTTGGATGCTTTAAT
CTCTGTCAGTTCATTTCGGATGTAAGGTGAAGTCCACTTGGTAAAACCTG
CCCCAGCTGAACCAAATTTTTGACCTCGGCCTACAGTTTATATTCGGGAA
TCTGTGTGAACGTAGGGACAAAAGCTCTAGGAAGTTTCTTCGATTGCTTT
CAGTAAATTCTGTTAACTTTTCTCATGTTTCGGAATCGCCCCTAAAAGCC
AATCCTAGCTTTACGAGGAGCCCAACAGTATTGAAAAGATGCTTCAAATA
AGTTCTCCACTTCACGACTTCCTCAGCATGTTAAGACTGAACCTGGTCGA
GAACCAAAGTATTCTTTCTCTTTGATGTGAGGAAATTGATCCATTTTTCC
ATCTACTAGTTTTTTTTTTTTGTTTGAATGAACTTTCAACGAGGAACTGT
TTTTCCATGTTTTAAACAAAAAATTTCACATGGAAATGGAAAATTTGGAA
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