|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s612 | supercontig | LSalAtl2s612:286575..292619 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009520 >EMLSAP00000009520 ID=EMLSAP00000009520|Name=EMLSAP00000009520|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=230bp
MDLKLYPLDRQVCEMRIASYGWTTDDLIYRWKSKDPVQFVQDLNLPRFKL ESFSTSYCNSKTNTGSVILYTEFPIVKLVFFNSGEYSCLKINLVFKREFS YYLLTIYVPSCMLVIISWVSFWLDSKSVPARVALGVTTLLTMSTQTAGVN RSLPPVAYTKAIDVWSGACVIFVFSALLEFAFVNYASRHDRRKGRKSRSA MNYNMDDDEIDYDQGLDCTSRIRSHYGKFE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s612:286575..292619+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009520-705367 ID=EMLSAT00000009520-705367|Name=EMLSAT00000009520|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6045bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s612:286575..292619+ (Lepeophtheirus salmonis) ATTGTAATCTCTACTAGGAGAATCAACGATTCTACTGGATTTAATTTTTT
GGACCGATCCAACACTAGGAGCATTATATAAAATATTAATTATAATTTTC
CCCTACAAAAGGTGTGTTTTTATTGAGCCTTAACTTTCCTGCATTAACGC
GTTTTTCATAATACATTAATGATAAAAATGTATACATATTTCATGGTTAT
TACAAGATTAATTTGATATGTATAAGCCGTATGAACCTAAGGGTCAATTG
TCCCTCGTACCCCAAATAATTAAGCATTATATGAAAAATTTTACTCTTAC
ACATTTATTCCTCTGAAATTCCAGCACCTTCATGCTAAAAATTGCTCCAT
ATCAGCGTTGATTCCCAGGGATTATCCAGTCAATAATTCCCAGTGATTCC
AAAAAATTTGCATTATCGATTGTCTGGTATTTTTTTAACCATTTCTGAGG
AACAATGCATTTAATTTTATAGTGCTAATGAATGTCTAGCATATTTCTAC
ATATTAAAACAAGCTTTTAATGGAAGATTAATATATAAAAAAAGAGTCAA
TTCTGAACCTTGATAAATCGCATTCAATATTTGCGTTACGGAGTATTTGA
GTGAAATTGAAGTCCAAGTACATTTGAGAGAGGATCCTCTTACAATTTTA
CCCACATCAACTGAATCAGATCGTAGTTTTTCAAGTCTGTGAATCTTTTT
AAAGGGGAGACAGGTACCACGTCTATTCTCGTTGGGGAGGGTGTGGTTAA
ACTTAAAACGATGTAATCTTGAATAATATATGAAGATGGAATAAATGACG
TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNCAACACGAGGTTCTATGGGGGGGGGGGTTACTGAACTGAA
AGAACCACGTTGATTATGAATGACCTTTTCTTCTTGTTACGAACAAATTA
AAAATTTTAATAAGAAAGAAAAACTGAAATCTACATAGTCGATAATTTTC
TTGGAAATTTTCGATAATTAATTTAGAGTTAGTTGAATGATCATCGATTC
CCAGAATTCCTAAAAACAAGAATAATTATTTTTCAACCATGCTTCTAATG
CCCCAGTATATTTTAAGTTGAATTTATTTTTTTGTTTGTCTATATATCTC
TAGGTTATAAAGATTTAATGTCCATCAAAATATAATGGGGAAACGTTCAA
TTTGGACAAGCATTTTCCTTTTTCTTCTCGTGTATTTTAAGTGAGATATT
TTTTACTTAAAAAATCCCTATATTTGTTATGTTATTAAAAATGTTCCTTT
ATAGCTCAACAGCCCTCCAAAATAGACGAGATAAGATAGATTATCGTTTG
AAGGAAAAACAAATCCTAGACCATGTTTTAGGGCCACTCCGATATGACAA
AAGGATTCGACCACCTGGATCCAGCAATTTGACAGGTTATTTACTATAAA
ATTGTCTTTGTTATTGATTAAATGTAGGGTGATCATATTTTGTTTTCTAA
AAAAGAGGACACGTGGCGGGATATCAGTGTCGAGTTTTGTGTTTTTTCAA
ATATTTTTGAAATGAATCAAATTGAAGAATCAATTTTGAGTATGTACATT
ATGATTCTTATTTTATTTTTGGAAAATATGTTTAGAATCTTCTATTTCTA
TTTCTTCAATGGATTTTTTTTGGGGGGGGGGGGATTTTAAACTTTTTTAT
ATATCTTTTTACTTTTATTAAAAAAACATAAAGTCTTCGGCAATTTGTCC
GACAAAACGCTGTACATTTCATGAATTTATAAAAAAAAAGTCCCGGATAC
TCCGTATAAAATATAAAAGTGTATATGTCCCGGGGAAACGGAGATTTGGT
CCTTATGTGACAAATTAAAGCAATACTTAAATATGAAACATTTTATTACT
TAATTTATATTTCCAGTTAGTGTGGGACGAACATGGGCGTTCAAATAAGA
TTTTACTTTATTTCTCATTTAATTAATTTTTTTGATATTTATCATATTAG
GCCCATCTCCTACAGTTGTCTCAATAAACACGTATCTCCGTGCTATAGAT
CGCATAGATGATTATAAAATGGTAAAGTACCTCTTTCAATCCAGCTTTTC
CTCATTTACCTACAGGGCCGGTTATAAAGAGCATTTGGTGTTTATTTCGC
TCGACCACAATCTTGATAATATAAAATAGAGGCTCTGCAAACTTTTCATA
AATTCAATAAATATTTTCTAAAAAAAAAAGTCATTTGAATAAATAAAAAT
GTGAAAAGGTTTCCCACAATTTATTTTCAAAGAAAATGAGGATTCAAAAT
TTATTTTCTCAAAACCAAACCATTTCAAAATAAAATTCAAATTTAAAAAA
AGGAAAGAAAGTGCTTCAAATATTTATCTTTGCTCTATGCCCCGCTCAAG
ACAAAACCAGCCCTGTGATATACAATGCACAAAATAATTTGTATTCTTTT
ATTCCAGGAGTACAGTGTACAATTAACATTCAGAGAAAATTGGATGGATT
CGCGTTTAATGTTTAACGATTTGAACGGTAAGAATGGATATTAAATGGAT
AACAGTGTCGTAAATCGTAATCACAGTTTTTTTTATTGCGGGCGGGGGTT
AATGTAATCCAAGGTTAATAGAAATACAAGGTTAAACCATCATGTAATCG
GGATTGCATAGAATTGTCAATTTGATGTATCGTACCGACTGCTCGGCAAG
ATAGAGATATTTTGACAAAACACGCAACCACTCATAGTCTATGACGTCAC
TATTCACAGAATTTTCAATTTAATGTATCGTACAGACTGTTGGACAAGAA
AAACAGATTTTGAGAAAACACAGGACCACTATTACACTATGACGTCAATA
TTAAAAGGCGCGGTGGAAGTCAAACATCAGTCGTACACGCATTATGGTAT
AACCTTCTATTTCTATTAACCTTAGTGTAATGTATCATAAATTTTTGAAT
ATTAACTGAGAAAAAAGAATTTTAATTCGGTAGATTATATATAAATAGGG
TAGATTTCCCTGGCGTTGCCCGAGACATTAAGCAATTAAAATTAATTCTG
AACTCTTCTGCTTTATATAAAACAAAAAATTACGACCGTAAAATTCGAAG
AGTTATACTTGCAGCATATTACTTTGGTATCTTTGCACACTTTRTTRTAA
ACGGYGATTAWAAGGTTTAGAGNGGGGGAATATTCAAATTGAACCGYCAT
TCSCTCAATCAAAGARTTCTAATTGGCTATATTTAATATTATAATGCAAT
ATGAAAATTGAATTGTCAAATCCATGCTTAGGTATACTTTAAGGTATATT
ATAAAGTTTATTTTAACTTGTTAGAAAAAAACAATTATTTACTTTTTAAC
TTATCTTTAAACTTTTTATTTATTATATATTAAATTGAAAAAAAATATTG
GTATCTATATTTATAGCTAGCTATTGAAGCTCATCATTCCACTTTGGATA
ATCAAAAAAATTTAATTTTTTATTTTTCCATTTAGTTTCATATTGAATTG
GTGTTAATTTATTTTTAATATCGATACCAAAATAAAAATATTTTAACATC
ACTACTCTGAAGGAAAAGAAAACTGAATACTGTTAATGCTTCAACACTGC
CCATGAAAAAATGTTTGAACAGCTTATTGTGAGCTGAGATAGAGATTGCA
AAATCATCAAACCATTTGACAAAATAAAACATATTTTGAAATAAAAAATA
AATCATAGTCTTATGATGAAGATATCCCACATCAAAGAATGTGGAAAGTG
TGAGAAGTAGATAATCTTCGCACATTGCTTATTTTGATACAAAGCCTAAC
TAAAAAATTACTATTTTGATTAAATATGTATGAACATAAAATAAAGATGG
GGGGGAGTAAAAATTCATAATTTATCATCATAGGTAAAATAAAATACTTA
ACATTGACGGATGCTGAAAAAGTTTGGATGCCTGACACTTTTTTTCAAAA
TGAGAAACTTGGACATTTCCATAACATTATTGTACCCAATGTTTATGTCC
GAATATTTCCAACAGGAAGTGTTTTATATAGTATAAGGTAATCATATATT
TTCAAGACAAGATCAAACACAAAGCTTTTTATTTAGGATTTCCTTGACAT
TAGCTTGTCCAATGGATCTGAAGCTATATCCTTTAGATCGTCAAGTCTGT
GAGATGAGAATAGCTAGTTGTAAGTATTTATTTAATAAATAATTGAACAT
TTTGATCTAAATCTCTTTGAAAATCATTTTAGATGGATGGACAACGGATG
ACTTAATCTATAGATGGAAAAGCAAGGATCCAGTGCAATTCGTTCAGGAT
TTAAATCTTCCTCGATTCAAACTCGAGAGCTTTAGTACATCGTATTGTAA
TTCAAAAACTAACACAGGTTCAGTTATCCTCTATACCGAATTTCCTATCG
TTAAATTAGTTTTTTTTAATTCAGGGGAGTACAGCTGTTTGAAAATCAAT
CTAGTTTTCAAAAGAGAATTTTCCTACTATCTACTGACCATTTATGTACC
TTCCTGTATGCTTGTTATCATTTCATGGGTGAGTTTCTGGTTAGACTCGA
AATCGGTTCCTGCACGGGTAGCTTTAGGTGTAACAACACTTCTTACTATG
TCTACTCAAACAGCTGGTGTAAATAGATCACTACCTCCAGTAGCTTACAC
AAAAGCAATAGATGTGTGGAGTGGTGCATGTGTTATTTTTGTATTTAGTG
CCTTATTAGAATTTGCATTTGTTAACTATGCTTCACGACATGATCGAAGA
AAGGGAAGGAAATCTAGATCTGCAATGAATTATAACATGGATGACGATGA
AATAGATTATGATCAAGGTCTTGATGTAAGTTCGATTTCTATAAAATTGT
GAGGGAAAAAAAGATCAGAGGATAATTAATTTACAAATATAGAGAACATA
CGTAAATATATATATTATTAAGACAATAAAAAGAAATCTATAGTTAATTA
TTCCCTTTAAGGAATAATTTTTGAATATAATACTTATATTTATTTCAGTG
CACCTCACGAATTCGTTCTCATTATGGCAAGTTTGAGTAATAAATAATAC
ATATAGGTATATTATTTAACAGTGTCTTTTTATAAATAGGAAAACGAGGA
TCCTTTAACTACGGAGAGAACGGTAATATCCTTCTGAGCTATATTGCTGG
AGAGGGCGTGACGACGACTAAAAAAAAGTCCTGGCTTGCTGAAAGATTTC
CAAGGAGATCAAAAAGAATTGATGTAGTAGCTCGTATTTTATTTCCGGGC
ATATTTGCCATCTTTAATTTTAGCTATTGGTTGTATTATTTGTCCGCAGA
ACATGAATCAAGGATTTACAAATAATAGTTGATAAACTGGATGAATTATA
ATTGCAAACTTTTTTTCTCAAGATTTGAAAAGTACCAACACAATAAATAT
ATGATGGATCCATCCATCTTGTGTGTATACCAAGAAGTTTGTTTTATTTT
AAGAGAGTTCTATGAAATCATCATTTTAGCTTTGTTCAGACAATCCTGGC
AGAGCCTCCAAAGGGATTTGTATTTGCACAATTGGTGGATGATTGTTAAT
GTTTTGAGATAAATTTGTTGTCACGATTGAATGAGGATTAGAATTTTGCG
AAGCATTAAAAACTGGTTCGTGAATAGCTTTAATATGTTTTTGAAGGTTT
CCCTTTTCGGCAAACTCCTTGCCACAGAAAGCACAGCGAAAATCCTTCTT
CCCGTGATGAACGGCTTTTACGTGTCTGAAAAAAATAAAATTTGATAAGA
TTAGAAAATATATGATTATATGATGAGGCTATCCATATTATAATGAGATG
TATGCCTTCTTTGGCATACCAGAAATAAGAATTATAATTTTTTTTCTAAT
CTTTATATGTATGGATAGACAAGGGGAACAATGCCATTGACAAATTAGAA
TACATGACTTAGTGTTTGATTGGACACATTTTTTATTTTTTTTGCTGTTT
CATAAGATCTAAAACCTCTTTTTGCCTTTTAAATGATATACTTTAGTGAA
CATATGTAACAAAAGGGTTAAAAATGAGTTATTAGCCACTTTTTC back to top
|